Escherichia coli EHEC Germany outbreak preliminary functional annotation using BG7 system

We have annotated the European outbreak E. coli EHEC genome sequenced by BGI (6-2-2011) and assembled with MIRA by Nick Loman (6-2-2011 ). Our system BG7, Bacterial Genome annotation of Era7 Bioinformatics, predicts ORFs and annotates them based on fragments of similarity with Uniprot proteins. We have predicted 6327 genes, 6156 encoding proteins y 171 corresponding to ribosomal and tRNA. Based on the preliminary results of our semi-automated method of annotation we have selected some predicted proteins with potential implications in pathogenicity and virulence.
There are 33 predicted genes annotated as toxins and we have found three putative hemolysins: Hemolysin E, a putative hemolysin expression modulating protein and a channel protein, hemolysin III family. We have found 31 predicted genes that could be related to specific antibiotic resistance: beta-lactamic, aminoglycoside, macrolide, polymyxin, tetracycline, fosfomycin and deoxycholate, novobiocin, chloramphenicol, bicyclomycin, norfloxacin and enoxacin and 6-mercaptopurine. This strain is rich in adhesion, secretion systems, pathogenicity and virulence related proteins. It seems to have a restriction-modification system, many proteins involved in Fe transport and utilization (siderophores as aerobactin and enterobactin), lysozyme, one inhibitor of pancreatic serine proteases, proteins involved in anaerobic respiration, antimicrobial peptides, and proteins involved in quorum sensing and biofilm formation that could confer competitive advantage to this strain

Caracterización de la actividad de lodos de digestión anaerobia y su influencia sobre la reducción de produccción de lodos

La producción de lodos en el proceso de depuración de agua con tecnología de lodos activos es un problema de gran envergadura por razones económicas, medioambientales, legales y sociales. Se ha verificado en ensayos previos la influencia que tiene sobre la reducción en la producción de fango la adición de lodos de digestión anaerobia en un proceso de depuración de lodos activos. Es preciso sin embargo, dado el carácter heterogéneo del producto de digestión, poder determinar en los lodos qué parámetro es el que le hace más interesante para este fin. Para ello se recurre a medida de actividad enzimática y microbiológica.59 página

ExtraTrain: a database of Extragenic regions and Transcriptional information in prokaryotic organisms

BACKGROUND: Transcriptional regulation processes are the principal mechanisms of adaptation in prokaryotes. In these processes, the regulatory proteins and the regulatory DNA signals located in extragenic regions are the key elements involved. As all extragenic spaces are putative regulatory regions, ExtraTrain covers all extragenic regions of available genomes and regulatory proteins from bacteria and archaea included in the UniProt database. DESCRIPTION: ExtraTrain provides integrated and easily manageable information for 679816 extragenic regions and for the genes delimiting each of them. In addition ExtraTrain supplies a tool to explore extragenic regions, named Palinsight, oriented to detect and search palindromic patterns. This interactive visual tool is totally integrated in the database, allowing the search for regulatory signals in user defined sets of extragenic regions. The 26046 regulatory proteins included in ExtraTrain belong to the families AraC/XylS, ArsR, AsnC, Cold shock domain, CRP-FNR, DeoR, GntR, IclR, LacI, LuxR, LysR, MarR, MerR, NtrC/Fis, OmpR and TetR. The database follows the InterPro criteria to define these families. The information about regulators includes manually curated sets of references specifically associated to regulator entries. In order to achieve a sustainable and maintainable knowledge database ExtraTrain is a platform open to the contribution of knowledge by the scientific community providing a system for the incorporation of textual knowledge. CONCLUSION: ExtraTrain is a new database for exploring Extragenic regions and Transcriptional information in bacteria and archaea. ExtraTrain database is available at

Diseño, ejecución y análisis de un plan de seguimiento del tamaño de la población de ciervo (Cervus elaphus) y gamo (Dama dama) en la reserva valenciana de caza de la Muela de Cortes

Después de llevar a cabo muestreos diurnos por distancias en la Reserva Valenciana de Caza de la Muela de Cortes (R.V.C.M.C.) dirigidos a las poblaciones de especies de caza mayor, principalmente muflón y cabra montés, se observó que este método no era adecuado para las poblaciones de cérvidos. El objeto del presente Trabajo es definir una nueva metodología de muestreo, específicamente adaptada a las poblaciones de cérvidos, capaz de estimar con un esfuerzo moderado el tamaño de sus poblaciones de forma regular. Los hábitos crepusculares de los cérvidos son un factor limitante para la obtención de resultados precisos mediante recorridos diurnos. Por ello, en el presente Trabajo se plantea la utilización de un método alternativo como son los muestreos nocturnos por distancias desde vehículo. Tras la ejecución de unos transectos y su análisis, se obtendrá una nueva estima de la población de cérvidos en la R.V.C.M.C. lo que conllevará modificaciones en la gestión relativa a los aprovechamientos cinegéticos de ambas especies. La nueva densidad estimada fue de 0,91±0,0455 ciervos/ 100ha, y 1,05±0,0525 gamos/ 100 ha siendo el área muestreada de 13.449 ha. La eficiencia de este método en comparación a los utilizados hasta ahora es mayor, ya que se obtiene una mayor precisión empleando muchas menos horas de trabajo, a la vez que el coeficiente de variación obtenido es menor que el obtenido con la metodología anteriormente empleada.After sampling the population of big game hunt, mainly muflon and iberian ibex, it was observed that daytime sampling by distances in the R.V.C.M.C wasn¿t succesful for the population of cervidae. The aim of this Work is to describe a new sampling methodology, particularly adapted to the cervidae population, capable of estimating the size of its population in a regular way. The crepuscular habits of the cervidae are a limiting factor when trying to obtain precise results using day time routes. This is why, in the present work, the alternative of using night distance sampling from a vehicle is presented. After the realisation of some transects and its analysis, a new result will be obtain from the cervidae population in the R.V.C.M.C , which will involve modifications in the work done in relation with the hunting exploitation of both species. The new estimated density was of 0.91±0,0455 deers/100ha and 1,05±0.0525 fallow deers/100ha, being the sampling area of 13.499 ha. The efficiency of this method in comparison to the most common ones, is higher. A better precision is obtained using less work time, in addition the variation coefficient is lower than the one obtained with the other methodology explained before.Després de dur a terme mostrejos diürns per distàncies en la R.V.C.M.C. dirigits a les poblacions d'espècies de caça major, principalment cabra montés i mufló, es va observar que aquest mètode no era adequat per a les poblacions de cèrvids . L'objecte del present Treball és definir una nova metodologia de mostreig, específicament adaptada a les poblacions de cérvids, capaç d'estimar amb un esforç moderat la grandària de les seues poblacions de forma regular. Els hàbits crepusculars dels cèrvids són un factor limitant per a l'obtenció de resultats precisos mitjançant recorreguts diürns. Per açò, en el present Treball es planteja la utilització d'un mètode alternatiu com són els mostrejos nocturns per distàncies des de vehicle. Després de l'execució d'uns transectes i la seua anàlisi, s'obtindrà una nova estima de la població de cèrvids en la R.V.C.M.C. el que comportarà modificacions en la gestió relativa als aprofitaments cinegètics d'ambdues espècies. La nova densitat estimada va ser de 0'91±0,0455 cèrvols/100ha, i 1'05±0,0525 daines/ 100 ha sent l'àrea mostrejada de 13.449 ha. L'eficiència d'aquest mètode en comparació als utilitzats fins ara és major, ja que s'obté una major precisió emprant moltes menys hores de treball, alhora que el coeficient de variació obtingut és menor que l'obtingut amb la metodologia anteriorment empleadaPareja Benet, P. (2018). Diseño, ejecución y análisis de un plan de seguimiento del tamaño de la población de ciervo (Cervus elaphus) y gamo (Dama dama) en la reserva valenciana de caza de la Muela de Cortes. Universitat Politècnica de València. http://hdl.handle.net/10251/106350TFG

La recuperación de oficio de los bienes públicos

En el presente trabajo nos vamos a ocupar de desarrollar en profundidad la recuperación de oficio de los bienes públicos. Comenzaremos realizando una explicación de justificación, es decir, cuál es su naturaleza y su fundamento. Posteriormente, profundizaremos en los requisitos de la misma, dividiéndolos en objetivos y temporales. Acto seguido, acometeremos la tarea de la descripción del procedimiento legalmente previsto. Finalmente, concluiremos exponiendo las principales conclusiones a las que hemos llegado después del abordaje de dicha potestad

Metodología para mejorar la estabilidad transitoria en sistemas eléctricos de potencia ante escenarios de contingencias N-M

Los sistemas de energía están cada vez más estresados debido al mayor consumo de potencia y al cierre operativo a su margen de estabilidad transitoria y de voltaje. En consecuencia, estos fenómenos han llevado a un mayor riesgo de inestabilidad al sistema eléctrico (SE) y a operar en sus límites de estabilidad transitoria y de voltaje. Para preservar la seguridad del SE, es necesario aumentar los márgenes de estabilidad y evaluar los límites máximos de transferencia de potencia eléctrica. El estudio de conmutación de líneas (CL) de transmisión tiene como objetivo abordar temas de estabilidad de voltaje antes, durante y después de la conmutación, congestión de líneas de transmisión, optimización de costos operativos, análisis de CL de transmisión durante múltiples contingencias, reestructuración dinámica de la topología de la red eléctrica de transmisión y como impacta en la estabilidad transitoria del SE. Por lo tanto, el problema de optimización que se pretende resolver es lineal entero mixto (MILP). Además, se usa flujos potencia continuo (FPC) para evaluar la máxima capacidad de transferencia en sistemas congestionados debido a la CL de transmisión. Se estudia múltiples contingencias N - M con la finalidad de predecir acciones necesarias para mantener la estabilidad en el SEP.Power systems are increasingly stressed due to increased electrical power consumption due to deregulation of the electrical power industry and operating shutdown to its voltage and transient stability margin. Consequently, these phenomena have led to a greater risk of instability to the electrical system (ES) and to operate within its limits of transient and voltage stability. To preserve the safety of the SE, it is necessary to increase the stability margins and evaluate the maximum limits of electrical power transfer. The transmission line switching (LS) study aims to address issues of voltage stability before, during and after switching, transmission line congestion, optimization of operating costs, analysis of switching of transmission lines during multiple contingencies, dynamic restructuring of the topology of the electrical transmission network and how it impacts on the transient stability of the SE. Therefore, the optimization problem to be solved is linear mixed integer (MILP). In addition, continuous power flows (CPF) are used to evaluate the maximum transfer capacity in congested systems due to the switching of transmission lines. Multiple N - M contingencies are studied in order to predict actions necessary to maintain stability in the SEP

Análisis y diagnóstico de la planificación y control de materiales en una empresa ubicada en Chimbote

Actualmente, en un mercado con gran dinamismo y altamente competitivo, la búsqueda de una rentabilidad sostenible en los negocios a motivado a encontrar o replantearse nuevas estrategias corporativas y competitivas. Ante esto, muchas empresas han ido cambiando o mejorando sus sistemas de operaciones para hacerlos más eficientes al mercado, implementando herramientas y metodologías de planificación y control de operaciones; como las de mejora continua, mejora de la producción, entre otras. Asimismo, las empresas están en la búsqueda de hacer sus procesos productivos más óptimos, con el objetivo de incrementar su superávit y poder sostenerse en el tiempo. Por ello, el presente trabajo de investigación tiene por objetivo exponer las herramientas de planificación y control de materiales; las cuales son, planificación de requerimiento de materiales (MRP), sistema ABC y las 5 “S” japonesas. Además, se analizarán y detallarán casos de empresas de diferentes rubros las cuales utilizaron estas herramientas en sus procesos para lograr los objetivos propuestos. Por un lado, se presentan 3 casos de micro y medianas empresas que ante la problemática que existe en sus estrategias de planificación utilizaron la herramienta MRP para mejorar y lograr ser más competitivos, obteniendo resultados como reducir sus tiempos de producción, cumplir con las fechas de entrega, dar un buen servicio a los clientes y, sobre todo, reducir sus costos de aprovisionamiento de materias primas y producción. Por otro lado, se analizan 2 empresas que presentan problemas en sus inventarios, lo que se refleja en el exceso o escasez de sus materias primas e insumos, es decir, no tuvieron un plan para el control de estos; y que para tener un correcto control se implementaron las herramientas de 5S y sistema ABC. Finalmente, se exponen las conclusiones del trabajo de investigación donde se detallan los beneficios de usar las herramientas de planificación y control de materiales, y las ventajas que presentan estas herramientas en el mercado competitivo actual.Trabajo de investigació

A finite element method for partially erodible bed evolution coupled with multiphase flows

This paper introduces a continuous finite element model for two phase flows coupled with evolving bedforms. The method extends the positive definite non-oscillatory finite element algorithm (NFEM) capabilities to predict sediment transport, multiphase flow, and evolution of the resulting interfaces limiting fluids, erodible sediment layers and non-erodible strata. Free surface hydrodynamics is simulated by the integration of the governing equations for incompressible multiphase flows, including the advection and reinitialization of a phase function to update the interface location. Sign preservation of the algorithm is essential both for fluid interface tracking procedure and for the landform tracking. In the first case, the property avoids unphysical overshoots along the free surface. In the second case, a positive definite thickness of the erodible layer of sediment is mandatory to account for interaction between evolving cohesionless sediment layers and rigid beds. To compute sediment layer thickness, the method incorporates a conservation law to balance evolution of the bed position with sediment mass flux, including a general template for saturated flux calculation. The framework permits the simulation from bed load dominant transport to saltation dominant transport. Fluid/terrain interface is explicitly captured by a surface tracking methodology whereby the mesh is adapted to the bedform. Numerical experiments explore several saturated sediment flow formulae for interactive evolution of dune/atmosphere system, as well as stringent dam-break type problems on channels with dry beds and partially and totally erodible beds.#PID2020-115778GB-I00 MCIN/AEI/10.13039/ 501100011033Universidad de Granada / CBU

Prospectiva sectorial de los servicios ambientales para el secuestro de carbono en Colombia 2035

Este estudio prospectivo se enfoca en el sector emergente del secuestro de carbono en Colombia, con énfasis en tecnologías de emisiones negativas (NEn. A pesar de los compromisos ambientales, las emisiones de carbono continúan aumentando a nivel mundial y en Colombia debido al consumo de combustibles fósiles y a obstáculos socioeconómicos como la "Greenflation". Se han identificado actores relevantes a nivel mundial, incluidas compañías petroleras, en el desarrollo de tecnologías de captura de carbono. En Colombia, la asociación ASOCARBONO se enfoca en los certificados de carbono, con énfasis en bonos de reforestación, pero no utiliza tecnologías NET. Aunque existen actores a favor del desarrollo de tecnologías de captura de carbono y el cumplimiento de los acuerdos del COP26, algunos enfrentan obstáculos debido a la necesidad de transformaciones radicales en sistemas productivos y formas de vida. El escenario propuesto, "Si puedes soñarlo, puedes hacerlo", plantea una visión ambiciosa y alcanzable a través de la implementación de proyectos y políticas adecuadas. Esto implica fortalecer incentivos y desarrollar tecnologías de captura y secuestro de carbono en linea con los desafíos ambientales planteados y los enfoques estratégicos propuestos.This prospective study focuses on the emerging carbon sequestration sector in Colombia, with an emphasis on negative emissions technologies (NET). Despite environmental commitments, carbon emissions continue to rise globally and in Colombia due to fossil fuel consumption and socioeconomic obstacles such as "Greenflation." Relevant actors, including oil companies, have been identified globally in the development of carbon capture technologies. In Colombia, the ASOCARBONO association focuses on carbon certificates, particularly reforestation bonds, but does not utilize NET technologies. While there are stakeholders supportive of carbon capture technology development and compliance with COP26 agreements, sorne face obstacles due to the need for radical transformations in production systems and lifestyles. The proposed scenario, "lf you can dream it, you can do it," presents an ambitious and achievable vision through the implementation of appropriate projects and policies. This involves strengthening incentives and developing carbon capture and sequestration technologies in line with the environmental challenges and strategic approaches proposed.MaestríaMagíster en Pensamiento Estratégico y Prospectiv