FREE SPACE LASER COMMUNICATIONS AND APPLICATIONS

Optical communications offer many advantages over radio frequency communications. Lasers are very efficient in establishing a communication link; however, they have a major drawback, which is background radiation, because background radiation limits the efficiency of optical communications. In this thesis, we analyze inexpensive lasers and their vulnerabilities to background radiation. We present a new way of calculating background radiation by using measured data and Planck’s Law. Next, we consider how to maximize the bit rate of a communication link for inexpensive lasers. We also investigate several modulation types for optical communication. We present M-ary pulse-position modulation (MPPM) and a novel method of direct detection. Next, we compare MPPM with on-off keying (OOK) in terms of power requirements. It is shown that MPPM is much more power efficient than OOK modulation; 32-PPM requires 7.6 dB less power than OOK to achieve the same probability of bit error. We use Simulink to model MPPM performance, and we compare analytical results with simulated results.Lieutenant Junior Grade, Turkish NavyApproved for public release; distribution is unlimited

Інтродукційні дослідження рідкісних видів рослин у Кременецькому ботанічному саду

More than two centuries ago the Kremenets Botanical Garden started scientifically based plant introduction, including a large group of rare species. The authors’ task is to make a comprehensive analysis of the rare plants collection of the Kremenets Botanical Garden and to exclude perspective species for their use in the reintroduction in order to support the quantity of destructive and formation of duplicating populations of rare and endangered species within their natural habitat. The rare plants collection includes 140 species of different conservation status, of which 40 are known in the Kreme nets Mountains’ flora. Groups of plants growing in the collection have different ecomorphs with the predominant share of sun-loving mesophytes represented mainly by perennial grasses typical of meadow and meadow- steppe communities. Due to the results of the research introduced species from perspective and particularly perspective groups are excluded. The key figures of their life condition indicate success of the introduction. Perspective and particularly perspective species, which by origin are representatives of the Kremenets Mountains’ flora, is valuable potential material for reintroductive studies in natural biocenoses.Понад два століття тому у Кременецькому ботанічному саду розпочато науково обґрунтовану інтродукцію рослин, зокрема великої групи рідкісних видів. Мета роботи — провести комплексний аналіз колекційного фонду рідкісних рослин Кременецького ботанічного саду, виділити перспективні види для реінтродукції з метою підтримання чисельності деструктивних і формування дублюючих популяцій рідкісних та зникаючих видів у межах їх природного ареалу. Колекція рідкісних рослин Кременецького ботанічного саду нараховує 140 видів різного охоронного статусу, з них 40 трапляються у флорі Кременецьких гір. У колекції зростають різні за екоморфою групи рослин. Переважають світлолюбні мезофіти, які представлені здебільшого багаторічними травами, характерними для лучних та лучностепових угруповань. За результатами досліджень виявлено інтродуценти з груп перспективних та особливо перспективних видів. Основні показники їх життєвого стану свідчать про успішність інтродукції. Перспективні та особливо перспективні види, які за походженням є представниками флори Кременецьких гір, є цінним потенційним матеріалом для проведення реінтродукційних досліджень у природних біоценозах

A Rare Cause of Fatty Liver and Elevated Aminotransferase Levels: Chanarin-Dorfman Syndrome: A Case Report

Chanarin-Dorfman syndrome is a rare, inherited metabolic disorder of neutral lipid storage characterized by ichthyosis, lipid vacuoles in leukocytes, and involvement of several internal organs, mostly the liver. Since the initial case was reported by Dorfman in 1974, nearly 50 cases have been reported, and the majority were from Middle East countries. Here, we report a 20-year-old patient with ichthyosis from Turkey, diagnosed as Chanarin-Dorfman syndrome presented with asypmtomatic elevated transaminases and hepatosteatosis, and also briefly review the updated clinical implications and management of this rarely seen syndrome. Prompt diagnosis of this syndrome avoids further unnecessary investigations in patients with ichthyosi

The Hidden Though Flourishing Justification of Intellectual Property Laws: Distributive Justice, National Versus International Approaches

Bu çalışmada, Gökkuşağı alabalıklarında enfeksiyonoluşturan Ichthyophthirius multifiliis’infarklı bölgelerden izole edilmiş saha suşlarının genotipik yapıları temelindeimmundominant özellik gösteren rekombinant immobilizan antijenlerini(i-antijen) kodlayan genlerin bakteriyel ekspresyon sistemine klonlanarakeksprese ve karakterize edilmeleri, antijenik profillerinin ortaya çıkarılmasıve aşı adayı olabilecek rekombinant antijenlerin elde edilmesi amaçlanmıştır.&nbsp;Çalışmada 2018 ve 2019 yıllarının Temmuz ve Ağustos ayları arasında Gökkuşağıalabalığı yetiştiriciliğinin yoğun yapıldığı Samsun, Rize, Kayseri, Elazığ,Burdur, Antalya ve Muğla illerinde bulunan işletmeler ziyaret edilerek balıkpopülasyonları üzerinde saha araştırmaları yürütülmüş ve I. multifiliis ile enfekte bulunan balıklardan ilgili protokolleregöre izolasyon gerçekleştirilmiştir. Laboratuvara uygun solüsyonlar ve soğukzincir altında intikal ettirilen örneklerden cDNA ve gDNA izolasyonlarıgerçekleştirilmiştir. I. multifiliis i-antijengen lokusunun amplifikasyonu amacıyla optimum primer dizaynı için ön çalışmalaryürütülmüş ve hedef gen bölgeleri uygun amplifikasyon koşullarında PCR’daçoğaltılmıştır. Elde edilen amplikonlar agaroz jel üzerinden saflaştırılmıştır.Multiple gen lokusu sekanslarının belirlenebilmesi amacıyla ilgili pürifiyeamplikonlar pJET 1.2 plazmit vektörüne CloneJET PCR cloning kit (Thermo FisherScientific) kullanılarak klonlanmış ve katı besi yerinde belirlenenkolonilerden rekombinant plazmid DNA izolasyonları gerçekleştirilmiştir. Rekombinantplazmidler spesifik primerlerle çift yönlü olarak sekanslanmış vekromotogramlar De Novo Assemble üzerinden işlenerek hedef insert sekanslarvektör plazmid DNA’sı içerisinden çıkarılmış ve konsensüs sekanslar eldeedilmiştir. İlgili primerlerin i-antijen gen lokusu içerisinde çoğalttığı fragmentlerinbelirlenebilmesi amacıyla PCR ürünleri ayrıca yeni nesil dizileme teknolojisi (NGS)kullanılarak işlenmiş ve elde edilen dizilimlerin gen veri tabanlarındakimevcut tüm i-antijen gen lokusları ile filogenetik ilişkileri araştırılmıştır.Tüm bu araştırmalar sonucu karakterize edilen i-antijen genlerinin ekspreseettiği proteinlerin rekombinant olarak eldesi için çalışmalargerçekleştirilmiştir. Aşı adayı potansiyeli olabilecek bazı lokusların bakteriyelekspresyon sistemine aktarımı için kodon optimizasyonları yapılarak pET-32a(+)ekspresyon plazmid DNA’sına (Novagen) klonlanması gerçekleştirilmiştir. Eldeedilen rekombinant plazmitler E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transforme edilerek optimum koşullardaekspresyon çalışmaları yürütülmüş ve ekspresyon etkinliği SDS-PAGE ve WesternBlot analizleri ile belirlenmiştir. Eksprese edilen rekombinant i-antijenproteinleri afinite kromotografi kulanılarak saflaştırılmış ve immunreaktiflikleri Western Blot analizleri ile tespit edilmiştir.&nbsp;Çalışmada,Elazığ, Rize ve Muğla illerinde ziyaret edilen işletmelerdeki Gökkuşağıalabalıklarında deri ve solungaçlarından hazırlanan preparatların mikroskobikincelemeleri ile I. multifiliisenfeksiyonunun yaygın olduğu görülmüştür. İlgili bölgelerden elde edilen I. multifiliis suşlarına ait cDNA vegDNA izolatlarının i-antijen gen lokusunun dizayn edilen pirmerlerle PCR’daamplifiye edilmesi sonucu 1200-1300 bp büyüklüğünde amplikonlar saptanmıştır.Pürifiye amplikonların klonlanması sonucu ilgili izolatlara ait açık okumaçerçevesi (ORF) sekanslarının analizinde birbirleriyle %38,3-58,8 arasındafarklılık gösteren 4 farklı i-antijen izoformu tespit edilmiştir. Bu izoformlararasında bir antijenik lokusun (ImulTR1-iant) her üç ildeki alabalıkpopülasyonlarından izole edilen I.multifiliis suşlarında da var olduğu NGS analizlerinde görülmüştür.ImulTR1-iant ORF sekansı ayrıca Amerika Birleşik Devletleri’nde alabalıklardanizole edilmiş bir i-antijen izoformuyla %83,3 identiklik gösterirken, diğertespit edilen izoformlara ait sekansların GenBank veri tabanında mevcuti-antijen sekanslarından oldukça farklı olduğu belirlenmiştir. Araştırmadarekaombinant i-antijen eldesi için yaygın belirlenen ImulTR1-iant izolatıüzerinden analizler yürütülmüştür. Bu izoformu kodlayan gen bölgesinin 1263bpbüyüklüğünde olduğu ve ORF’nin 420 amino asitten teşekkül ettiğibelirlenmiştir. ORF amino asit sekanslarının in-slico analizlerde 42,552 kDabüyüklüğünde bir proteini eksprese ettiği, bu proteinin sitoplazmik olduğu vetransmembran bölge içermediği tespit edilmiştir. Ayrıca ilgili ORF sekansıiçerisinde uzunluğu 7-22aa arasında değişen 21 antijenik bölge olduğubelirlenmiştir. Kodon optimizasyonu yapılmış olan ImulTR1-iant izoformuna ait pET-32a(+)rekombinant plazmitinin E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transformasyonu ve ekspresyonu sonrasındayapılan SDS-PAGE analizlerinde in-silico analiz sonuçlarına paralel olarakyaklaşık 43kDa’luk protein jel üzerinde görüntülenmiştir. İlgili rekombinantprotein afinite kromotografide HisTrap FF crude (GE Healthcare) kolonlarıkullanılarak saflaştırılmış ve pürifiye rekombinant antijenin immun-reaktifliğiWestern-Blot analizleriyle gösterilmiştir.&nbsp;ErciyesÜniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TOA-2017-7742 kodnumarasıyla desteklenen bu çalışma ile Türkiye’de gökkuşağı alabalıklarındasorun oluşturan ve ekonomik kayıplara yol açan I. multifiliis suşlarına karşı biyoteknolojik aşı geliştirilmesinoktasında aşı adayı olabilecek immobilizan antijenler üzerine özgün veriler sağlanmıştır.Elde edilen aşı adayı rekombinant antijenlerin etkinliğini ortaya koymanoktasında laboratuvar ve saha şartlarında immunizasyon ve çelınç enfeksiyondenemeleri için yeni proje çalışmaları planlanmaktadır.</style

Phenotypic, genotypic characterisation and antimicrobial susceptibility determination of Lactococcus garvieae Strains

In this study, phenotypic and genotypic features of 10 L. garvieae strains isolated from rainbow trout farms were examined with 3 reference strains (Spain, England and ATCC 43921) comperativly. Rapid 32 STREP and conventional microbiologic tests were used for determining phenotipic features of L. garvieae strains. Altough there are differences, in Rapid 32 STREP system, between strains in terms of beta-Glucuronidase, D-ribose, sorbitol, lactose, raffinose, alanyl-phenylalanyl-proline arylamidase, pyrrolidonyl arylamidase, hippurate hydrolysis, urease tests, all strains have been confirmed as L. garvieae by API web. In RAPD PCR analysis, in which ERIC 2 primer is used, L. garvieae isolates were genotyped within 3 separate clusters according to similarity coefficient index of 70%, and it was detected that a vast majority of isolates with Turkey-origin (8 isolates) belongs to predominant type LG1 genotype. In addition to this, antimicrobial tests of L. garvieae strains shows that there are resistance against gentamycin, neomycin, lincomycin, sulfamethoxazole-trimethoprim, oxytetracycline, erythromycin, amoxicillin, florfenicol and doxycycline, which are frequently used on fish in our country

Tüketici Davranışlarında Statü Kaygısı ve Sosyoekonomik Belirleyenleri

Bu çalışmada anket verileri kullanılarak tüketici davranışlarında statü kaygısının rolü, bu kaygının ön plana çıktığı alanlar ve determinantları incelenmektedir. Ampirik bulgular statü kaygısının fiziksel çekicilik, fiziksel yetenek, çocuğun eğitimi ve kimi tüketim kararlarında diğerlerine göre çok daha baskın olduğunu gösterdiği gibi özellikle yaş, eğitim ve gelir seviyesi ile statü kaygısı arasında güçlü ilişkinin varlığını da gözler önüne sermektedir. Son olarak elde edilen bulgular ışığında statü kaygısının bireylerin tüketici davranışı üzerindeki rolü ve bunun makroekonomik sonuçları tartışılmaktadır

Trace elements in pyrite from the Čukaru Peki porphyry Cu–high-sulfidation deposit, Serbia: implications for ore evolution in a polyphase hydrothermal system

Čukaru Peki is a recently discovered porphyry- high-sulfidation Cu-Au deposit located 5km south of the mining town of Bor in east Serbia. Three styles of mineralization are distinguished in the Čukaru Peki system: a high-sulfidation type with massive sulfides (named the Upper zone), a porphyry type (named the Lower zone) and a transition type (between porphyries and massive sulfides). This study investigates the concentration and distribution of trace elements in pyrite from these three mineralization zones of Čukaru Peki. The high-sulfidation pyrite contains elevated concentrations of V, Mn, Ni, Cu, As, Mo, Ag, Cd, In, Sn, Sb, Au, Hg, Tl, Pb and Bi, compared to pyrite from the porphyry zone. The porphyry zone pyrite contains elevated concentrations of Co and Se. The sample from the transition zone contains concentrations between the two other zones, with the exception of the relative enrichment of Co and Ag. This research also aims to separate different stages of ore deposition. The porphyry stage contains several types of veins: quartz A veins, quartz B veins, pyrite D veins, magnetite veins, purple anhydrite veins, sulfide veins and orange anhydrite veins. The high sulfidation stage also formed in several stages: pyrite1, pyrite-enargite veins, pyrite-covellite veins, pyrite2 veins and calcite-anhydrite veins. There are distinct differences between various vein generations found within each zone, notable examples are the enrichment of Se in quartz B veins pyrite and Cu in sulfide veins, compared to other veins from porphyry zone veins and the enrichment of several trace elements (Cu, Mo, Ag, Cd, In, Sn, Sb, Au, Hg, Tl, Pb and Bi) in pyrite from the Py-cov veins in comparison to the other high-sulfidation veins. The trace element data also indicates a change in fluid compositions; the earlier fluids responsible for the porphyry zone mineralization showing a slightly more magmatic fluid signature (higher Co/Sb and Se/As values) and the later high-sulfidation fluids bearing a more typical epithermal trace element signature, which indicates cooling and diluting of fluids. Some of the porphyry zone pyrite crystals (from B-type veins and Purple anhydrite-veins) contain elevated concentrations of elements attributed to the high-sulfidation zone (e.g. Cu, Ag, Cd, In, Sn, Pb and Bi), which suggests that these veins were affected by later high-sulfidation fluids