Three Phages from a Boreal Lake during Ice Cover Infecting Xylophilus, Caulobacter, and Polaromonas Species

Although the important role of microbes in freshwater is well understood, studies on phage–host systems in such environments during ice cover are completely lacking. Here, we describe the isolation and characterization of three new bacteriophages infecting Xylophilus sp., Caudobacter sp., and Polaromonas sp. from freshwater samples taken under the ice cover of Lake Konnevesi, Finland. Lumi, Kuura, and Tiera bacteriophages have tailed icosahedral virions and double-stranded DNA. Lumi is a siphophage with a genome of 80,496 bp, and Kuura and Tiera are podophages, and their genomes are 43,205 and 45,327 bp in length, resembling viruses in the class Caudoviricetes. Their host ranges were very limited among the winter-isolated bacterial strains from Konnevesi, each infecting only their own hosts. They can infect efficiently at 4 °C, showing that they are adapted to living in lake water under ice cover. Analysis of the viral genome sequences showed that a significant number of the gene products of each virus are unique, indicating that there is unexplored viral diversity in freshwaters. To our knowledge, Lumi and Tiera are the first phages isolated on the Xylophilus sp. and Polaromonas sp. strains, allowing their exploitation in further studies of freshwater bacterial–phage interactions

Palvelukoordinaattorin toimenkuvan analysointi ja kehittäminen

Opinnäytetyö on portfoliomainen päiväkirjaopinnäytetyö, jossa seurataan palvelukoordinaattorin työtä kiertotalouden mallia toteuttavassa palvelumalliyrityksessä. Opinnäytetyön seurantajakso on aikavälillä 23.3-22.5.2020, jolloin keskitytään viikkokohtaisesti erilaisiin teemoihin ja näistä kerrotaan vielä lisää viikkoanalyysien muodossa. Viikkoanalyyseissä on kasattu yhteen viikon asiat ja nostetaan vielä kirjallisia lähteitä. Seurantajakson aikana korostui itsensä ja omien työntekotapojen tunteminen ja tunnistaminen. Keskittymällä yhteen viikkoon kerrallaan ja nostamalla sieltä kohtia kirjoittaja havaitsi kuinka itse työtehtävät ovat jo hallussa. Tulevaisuudessa kirjoittajalla on halu kehittyä lisää työtehtävissään ja edetä eteenpäin organisaatiossa

Mopoilun nurjat puolet: laittomat ulottuvuudet ja oikeudelliset seuraamukset

Mopoilun suosio on kasvanut huomattavasti 2000-luvun alusta alkaen. Sillä on monia merkityksiä osana nuorisokulttuuria. Tässä artikkelissa tarkastellaanmopoiluun kuuluvaa riskikäyttäytymistä, siitä seuraavia laittomiaulottuvuuksia ja oikeudellisia seuraamuksia 15–17-vuotiailla. Ilmiöitätarkastellaan tilastojen ja rekisteriaineistojen lisäksi nettikeskustelujenavulla. Tilastoihin perustuvaa, pääosin kuvailevaa prosentuaalista tarkasteluahavainnollistetaan poliisin kirjaamilla moporikkeiden teonkuvauksilla.Internet-aineiston temaattinen analyysi tuo puolestaan mopoilijoiden omaaääntä esille. Saatujen tulosten mukaan mopoilusta koituvat oikeudellisetseuraamukset ovat usein seurausta mopojen virittämisestä ja huonostakunnosta. Nettikeskustelujen perusteella virittämisen laittomuus ja siitämahdollisesti seuraavat oikeudelliset toimet olivat pitkälti nuorten tiedossa,ja mopoilijat pyrkivät aktiivisesti välttelemään sanktioita. Poliisin toimintanähtiin useimmiten silti oikeutettuna, tosin moni mopoilija koki, ettäpoliisilla olisi ollut mahdollisuus puuttua moporikkeisiin tehokkaammin.Lisäksi mopoiluun liittyvät sanktiot johtavat osan nuorista maksamattomienliikennevakuutusmaksujen tai sakkojen takia ulosottoon, millä voi ollapitkäaikaisia vaikutuksia nuoren elämään. Vauhdin hurma, virittämiseenkuuluva ryhmäpaine ja halu näyttää omaa osaamista painavatkin monennuoren merkitysvaa’assa enemmän kuin pelko onnettomuudesta, mahdollisetsakot tai muut maksuseuraamukset.Peer reviewe

Yrittäjyyden ja ammatillisen koulutuksen osaamisyhteisö: Arjen kokemuksia InnoOmniasta

Working life orientation and entrepreneurial thinking are pivotal in today’s vocational education. Through a case study, we discuss the multi-actor knowledge community of InnoOmnia in Espoo, Finland. By breaking traditional silos, education transforms into co-learning, where entrepreneurs, students, educators, and other parties can all contribute equally. However, the transition is not painless. Based on rich qualitative text and image data, we identify tensions pertaining to community boundaries, operational culture, structure, and leadership. There is no single shared view of a community, but rather, every participant seems to hold an individualised interpretation of InnoOmnia. Diverging expectations result in inter-actor conflict. Our analysis suggests that by default, an innovative, entrepreneurial community inevitably contains criticising and destructive forces. In terms of community support, enthusiasm and joy of work emerge as particularly meaningful forces. Further research focusing on work enthusiasm and tolerance of conflict in knowledge communities could advance vocational education substantially.Artikkeli käsittelee työelämälähtöisyyden ja yrittäjyyden vahvistamista ammatillisessa koulutuksessa. Esittelemme Espoossa toimivan InnoOmnian, jossa oppilaitoksen yhteyteen on syntynyt monitoimijainen osaamisyhteisö. Kun perinteisiä siiloja rikotaan, opetus muuttuu yrittäjien, opiskelijoiden, opettajien ja muun henkilöstön kanssaoppimiseksi. Muutos ei ole kuitenkaan kivuton. Laajasta, eri toimijoiden tuottamasta teksti- ja kuva-aineistosta nousee esille yhteisön rajoja, toimintakulttuuria, rakenteita ja johtamista koskevia jännitteitä. InnoOmnia ei näyttäydy osallistujille yhtenäisenä, vaan jokaisella toimijalla näyttää olevan oma käsityksensä yhteisöstä, “minun InnoOmniani”. Erilaisista odotuksista seuraa ristiriitoja toimijoiden välillä. Tutkimus antaa viitteitä siitä, että innovatiivinen, yrittäjämäinen yhteisö sisältää väistämättä myös repiviä ja ristiriitaisia voimia. Erityisen merkitykselliseksi nousevat myös innostuneisuus ja työn ilo yhteisön kantavina voimina. Ristiriitoja sietävän, innostusta ja työn imua lisäävien osaamisyhteisöjen tutkimus voisi tuottaa jatkossa merkittävää tietoa ammattikasvatuksen kehittämiseen

Pleolipoviridae, a newly proposed family comprising archaeal pleomorphic viruses with single-stranded or double-stranded DNA genomes

Viruses infecting archaea show a variety of virion morphotypes, and they are currently classified into more than ten viral families or corresponding groups. A pleomorphic virus morphotype is very common among haloarchaeal viruses, and to date, several such viruses have been isolated. Here, we propose the classification of eight such viruses and formation of a new family, Pleolipoviridae (from the Greek pleo for more or many and lipos for lipid), containing three genera, Alpha-, Beta-, and Gammapleolipovirus. The proposal is currently under review by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). The members of the proposed family Pleolipoviridae infect halophilic archaea and are nonlytic. They share structural and genomic features and differ from any other classified virus. The virion of pleolipoviruses is composed of a pleomorphic membrane vesicle enclosing the genome. All pleolipoviruses have two major structural protein species, internal membrane and spike proteins. Although the genomes of the pleolipoviruses are single- or double-stranded, linear or circular DNA molecules, they share the same genome organization and gene synteny and show significant similarity at the amino acid level. The canonical features common to all members of the proposed family Pleolipoviridae show that they are closely related and thus form a new viral family.Peer reviewe

BVOC Emissions From a Subarctic Ecosystem, as Controlled by Insect Herbivore Pressure and Temperature

The biogenic volatile organic compounds, BVOCs have a central role in ecosystem-atmosphere interactions. High-latitude ecosystems are facing increasing temperatures and insect herbivore pressure, which may affect their BVOC emission rates, but evidence and predictions of changes remain scattered. We studied the long-term effects of + 3 degrees C warming and reduced insect herbivory (achieved through insecticide sprayings) on mid- and late summer BVOC emissions from field layer vegetation, supplemented with birch saplings, and the underlying soil in Subarctic mountain birch forest in Finland in 2017-2018. Reduced insect herbivory decreased leaf damage by 58-67% and total ecosystem BVOC emissions by 44-72%. Of the BVOC groups, total sesquiterpenes had 70-80% lower emissions with reduced herbivory, and in 2017 the decrease was greater in warmed plots (89% decrease) than in ambient plots (34% decrease). While non-standardized total BVOC, monoterpene, sesquiterpene and GLV emissions showed instant positive responses to increasing chamber air temperature in midsummer samplings, the long-term warming treatment effects on standardized emissions mainly appeared as changes in the compound structure of BVOC blends and varied with compounds and sampling times. Our results suggest that the effects of climate warming on the total quantity of BVOC emissions will in Subarctic ecosystems be, over and above the instant temperature effects, mediated through changes in insect herbivore pressure rather than plant growth. If insect herbivore numbers will increase as predicted under climate warming, our results forecast herbivory-induced increases in the quantity of Subarctic BVOC emissions.Peer reviewe

Black box of phage-bacterium interactions : exploring alternative phage infection strategies

The canonical lytic-lysogenic binary has been challenged in recent years, as more evidence has emerged on alternative bacteriophage infection strategies. These infection modes are little studied, and yet they appear to be more abundant and ubiquitous in nature than previously recognized, and can play a significant role in the ecology and evolution of their bacterial hosts. In this review, we discuss the extent, causes and consequences of alternative phage lifestyles, and clarify conceptual and terminological confusion to facilitate research progress. We propose distinct definitions for the terms 'pseudolysogeny' and 'productive or non-productive chronic infection', and distinguish them from the carrier state life cycle, which describes a population-level phenomenon. Our review also finds that phages may change their infection modes in response to environmental conditions or the physiological state of the host cell. We outline known molecular mechanisms underlying the alternative phage-host interactions, including specific genetic pathways and their considerable biotechnological potential. Moreover, we discuss potential implications of the alternative phage lifestyles for microbial biology and ecosystem functioning, as well as applied topics such as phage therapy.Peer reviewe