33 research outputs found

    Genotipificación de aislamientos del complejo Mycobacterium tuberculosis mediante MIRU-VNTR, Cali, Colombia, 2013-2015

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    Introduction: Tuberculosis continues to be one of the main public health problems in the world. Together with the HIV infection, it is one of the main causes of death due to infections worldwide. In 2016, 6.3 million new cases of the disease were reported.Objective: To describe the genetic patterns determined by genotyping using variable-number tandem repeats of mycobacterial interspersed repetitive units (MIRU-VNTR) in the study population and compare them with other studies carried out in Cali, Colombia, and the world.Materials and methods: We genotyped a total of 105 DNA samples extracted from sputum or culture isolates of the Mycobacterium tuberculosis complex, which were obtained from pulmonary tuberculosis diagnosed patients over the period 2013-2015, in Cali. We performed PCR amplification of 24 loci by MIRU-VNTR on the DNA extracted from the samples. The amplicons were visualized in agarose gel electrophoresis (2%) with SYBR Safe™ staining. Then, the alleles were designated by graphical analysis using the GelAnalyzer 2010 software. These results were analyzed using the UPGMA logarithm and compared with the registers from the MIRU-VNTR plus and SITVITWEB databases.Results: We genotyped 62 of the samples completely and we obtained 58 different MIRU-VNTR profiles. By comparing with the international databases, we determined the following distributions per lineage: LAM, 54.8%; Haarlem,25.8%; S, 14.5%; Beijing, 3.2%, and Cameroon, 1.6%. The MIRU-VNTR patterns corresponded to 17 different MITs; the most frequent were MIT 190 and MIT 110, with 22.6% and 6.5%, respectively.Conclusions: These results demonstrated previous observations about the predominance of the LAM and Haarlem lineages in the city, and the presence of the MITs found in another city of Colombia.Introducción. La tuberculosis continúa siendo uno de los problemas de salud más importantes a nivel mundial y, con la infección por el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV), constituye la principal causa de muerte por infecciones. En el 2016, se notificaron 6,3 millones de casos nuevos de la enfermedad.Objetivo. Describir los patrones genéticos determinados mediante la genotipificación del número variable de repeticiones en tándem de unidades repetitivas interespaciadas de micobacterias (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number of Tandem Repeats, MIRU-VNTR) en la población de estudio y compararlos con los hallados en otros estudios locales e internacionales.Materiales y métodos. Mediante MIRU-VNTR, entre el 2013 y el 2015 se hizo la genotipificación de 105 muestras de ADN extraídas del esputo o de aislamientos en cultivo de M. tuberculosis provenientes de pacientes residentes en Cali con diagnóstico de tuberculosis pulmonar. La amplificación de 24 loci MIRU-VNTR se hizo por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los amplicones resultantes se visualizaron por electroforesis en geles de agarosa (2 %) teñidos con SYBR Safe™. La asignación de los alelos se hizo con un análisis gráfico con el programa GelAnalyzer 2010. Los resultados obtenidos se analizaron con el algoritmo UPGMA y se compararon con las bases de datos internacionales MIRU-VNTRplus y SITVITWEB.Resultados. Se genotipificaron por completo 62 de las muestras y se obtuvieron 58 perfiles diferentes de MIRU-VNTR. Al comparar con las bases de datos internacionales, su distribución por linajes fue la siguiente: 54,8 % para el LAM, 25,8 % para el Haarlem, 14,5 % para el S, 3,2 % para el Beijing y 1,6 % para el Cameroon. Los patrones MIRU-VNTR correspondieron a 20 tipos internacionales de MIRU (MIRU International Types, MIT) diferentes, y los más frecuentes fueron el MIT 190 y el MIT 110, con 22,6 y 6,5 %, respectivamente.Conclusión. Estos resultados confirmaron hallazgos previos sobre el predominio de los linajes LAM y Haarlem en la ciudad y la presencia de los MIT encontrados en otra ciudad de Colombia

    APROVECHAMIENTO ENERGÉTICO DE RESIDUOS PLÁSTICOS OBTENIENDO COMBUSTIBLES LÍQUIDOS, POR MEDIO DE PIRÓLISIS

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    Este estudio da a conocer una forma eficiente de gestionar los residuos plásticos obteniendo combustibles a través del proceso de pirólisis de poetilentereftalato, polietileno de alta densidad y poliestireno, residuos plásticos de mayor generación dentro de la Universidad Politécnica Salesiana; en la investigación se determinó que el residuo que mayor porcentaje de fracción líquida produce es el poliestireno. sin embargo, de acuerdo a los análisis el de mejor calidad es el polietileno de alta densidad considerado como crudo mediano. De acuerdo a los análisis de cromatografía, se muestra que las fracciones líquidas del proceso de pirólisis de residuos plásticos contienen sustancias que forman parte de los combustibles y petróleos, lo que confirma la obtención de combustibles líquidos de características semejantes a los tradicionales y que se pueden usar para generar energía en motores de combustión. // This study, found an efficient way to manage plastic wastes obtaining fuels; by pyrolysis process at poetilentereftalato, high density polyethylene, polystyrene and high generation plastic wastes at the Universidad PolitÃc cnica Salesiana; in the investigation was determined that the highest percentage of liquid fraction residue was achieved by polystyrene. however, according to analyzes the best quality was the high density polyethylene considered medium crude. According to chromatographic analysis, this research demonstrates that the liquid fractions of pyrolysis of plastic wastes contain substances that are part of fuels and oils, which confirms the existence of liquid fuels with similar characteristics to traditional ones and can be used in combustion engines

    Comprensión del concepto de serie numérica a través del modelo de Pirie y Kieren

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    Diversas investigaciones han dado cuenta de las dificultades que tienen los estudiantes para la adquisición y comprensión del concepto de serie numérica. Los conceptos de límite e infinito, así como la diferenciación entre la serie y la sucesión de sumas parciales, son algunos de los obstáculos que han de superar. En este artículo, se analiza el proceso que sigue un grupo de estudiantes cuando resuelve una actividad sobre el cálculo de la altura y el volumen de una torre que involucra el trabajo con series armónicas mediante el modelo de Pirie y Kieren. Comenzando desde el nivel Image Making, los alumnos realizan conexiones entre diferentes elementos matemáticos del concepto de serie numérica. Las interacciones entre ellos les permiten avanzar entre los diferentes niveles del modelo para lograr la comprensión del concepto recurriendo al mecanismo de folding back.Several research studies have realized the difficulties faced by students for the acquisition and understanding of the concept of numerical series. The concepts of limits, infinity and the difference between the series and the sequence of partial sums are some obstacles to be overcome. This article analyzes the process that follows a group of students solving the activity about the calculi of the height and volume of a tower that involves working with harmonic series in the light of Pirie and Kieren model. Starting from Image Making level the students link different elements of the mathematical concept of numerical series. The interactions between them allow to advance between the different levels of the model to develop an understanding of the concept using the folding back mechanism

    Serological evidence of canine leptospirosis in the Kamentsá indigenous community, Putumayo, Colombia

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    El objetivo del estudio fue determinar la prevalencia de leptospirosis canina e identificar factores asociados con la infección en una población indígena Kamentsá del departamento de Putumayo, Colombia. Se evaluaron 154 caninos de ambos sexos localizados en el área rural del Valle de Sibundoy. Se identificaron variables demográficas, sanitarias y de tenencia responsable mediante una encuesta estructurada. Se colectaron muestras de sangre a los canes y se procesaron mediante la técnica de microaglutinación macroscópica (MAT) usando un cepario de referencia conformado por 24 serogrupos de Leptospira. La prevalencia de anticuerpos contra Leptospira sp fue de 79.9%. Los serogrupos más frecuentes fueron Gripotyphosa (10.2%), Hursbridge (8.4%), Sarmin y Australis (7.2%), Canicola (6.8%) y Tarassovi (6.4%). Los factores de riesgo asociados fueron la edad del canino, la presencia de aguas servidas y la tenencia de más de un canino en la vivienda (p<0.05). En conclusión, la alta prevalencia de anticuerpos contra Leptospira sp en los caninos sugiere que existe un riesgo potencial de transmisión de la bacteria al hombre y, por tanto, es necesario fortalecer las medidas de promoción, prevención y vigilancia por parte de las autoridades de Salud Pública.The objective of this study was to determine the prevalence of canine leptospirosis and identify factors associated with the infection in an indigenous Kamentsá population of the department of Putumayo, Colombia. Blood samples of dogs of both sexes (n=154) located in the rural area of Sibundoy Valley were collected. Demographic, sanitary, and responsible tenure variables were identified through a structured survey. Blood samples were processed by the macroscopic microagglutination test (MAT) using a reference strain collection composed of 24 serogroups of Leptospira serogroups. The prevalence of antibodies against Leptospira sp was 79.9%. The most frequent serogroups were Gripotyphosa (10.2%), Hursbridge (8.4%), Sarmin and Australis (7.2%), Canicola (6.8%) and Tarassovi (6.4%). The associated risk factors were the age of the dog, the presence of sewage and the possession of more than one dog in the house (p<0.05). In conclusion, the high prevalence of antibodies against Leptospira sp in dogs suggests that there is a potential risk of transmission of the bacteria to man and, therefore, it is necessary to strengthen the promotion, prevention and surveillance measures by Public Health authorities

    Implementación y evaluación de una estrategia combinada de educación en salud y quimioterapia masiva para el control de las geohelmintiasis, en una zona rural de Colombia

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    Introduction: Geohelminthiasis is an infection which is prevalent in developing countries, and primarily affects schoolchildren. Control strategies that combine massive chemotherapy with health education can produce significant reductions in this infection that are sustainable over time. This study implemented and evaluated a comprehensive intervention combining a health education strategy and massive chemotherapy in a rural zone in Colombia. Methodology: Quasi-experimental design performed in La Virgen, Cundinamarca (Colombia). The entire school population participated in the health education strategy, in conjunction with biannual treatments with albendazole, between late 2010 and the middle of 2013. The analytical sample consisted of 119 children (median = 11, interquartile range = 8-13 years of age). Yearly changes in the presence of geohelminthes were evaluated using non-parametric tests for related samples and fixed-effect logistic regression models. Results: Prevalences of geohelminthes at baseline were: 22,28% (CI 95% 16,36%-28,20%) for Ascaris lumbricoides; 37,31%( CI 95% 30,42%-44,19%) for Trichuris trichiura and 13,47% (CI 95% 8,61%-18,33%) for Uncinaria sp. The final measurements of these prevalences decreased to 5,30%(CI 95% 1,68%-8,91%) for A. lumbricoides; 16,55% (CI 95% 10,56%-22,55%) for T. trichiura and 4,64% (CI 95% 1,42%-8,03%) for Uncinaria sp. Conclusion: Although the present study does not constitute an actual impact evaluation, it provides an apparently successful experience with implementing a comprehensive strategy to control geohelminthiasis, which could serve as a model for other interventions in rural areas in the country.Introducción: Las geohelmintiasis son infecciones prevalentes en los países en vía de desarrollo, que afectan principalmente a la población escolar. Las estrategias de control que combinan quimioterapia masiva con educación en salud, pueden producir reducciones significativas de estas infecciones, sostenibles en el tiempo. En este estudio se implementó y evaluó, una intervención integral basada en una estrategia lúdica de educación en salud, más quimioterapia masiva en una zona rural de Colombia. Metodología: Diseño cuasi-experimental, realizado en La Virgen, Cundinamarca (Colombia). Toda la población escolar fue sometida a la estrategia educativa en salud, acompañada de tratamiento semestral con albendazol, entre finales del 2010 y mediados del 2013. La muestra analítica fue constituida por 119 niños (mediana= 11; Rango Intercuartílico = 8-13 años). Se evaluaron los cambios anuales en la presencia de geohelmintos usando pruebas no paramétricas para muestras relacionadas y modelos de regresión logística de efectos fijos. Resultados: En la medición basal, las prevalencias de los geohelmintos fueron: 22,28% (IC 95% 16,36%-28,20%) para Ascaris lumbricoides; 37,31% (IC 95% 30,42%-44,19%) para Trichuris trichiura y 13,47% (IC 95% 8,61%-18,33%) para Uncinaria sp. Para la medición final, estas prevalencias cayeron significativamente a 5,30% (IC 95% 1,68%-8,91%) para A. lumbricoides; 16,55%  (IC 95% 10,56%-22,55%) para T. trichiura y 4,64% (IC95% 1,42%-8,03%) para Uncinaria sp. Conclusión: El presente estudio, pese a que no constituye una evaluación real de impacto, provee una experiencia aparentemente exitosa de implementación de una estrategia integral para el control de las geohelmintiasis, que podría servir como modelo para otras intervenciones en áreas rurales del país

    Implementación y evaluación de una estrategia combinada de educación en salud y quimioterapia masiva para el control de las geohelmintiasis, en una zona rural de Colombia

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    Introduction: Geohelminthiasis is an infection which is prevalent in developing countries, and primarily affects schoolchildren. Control strategies that combine massive chemotherapy with health education can produce significant reductions in this infection that are sustainable over time. This study implemented and evaluated a comprehensive intervention combining a health education strategy and massive chemotherapy in a rural zone in Colombia. Methodology: Quasi-experimental design performed in La Virgen, Cundinamarca (Colombia). The entire school population participated in the health education strategy, in conjunction with biannual treatments with albendazole, between late 2010 and the middle of 2013. The analytical sample consisted of 119 children (median = 11, interquartile range = 8-13 years of age). Yearly changes in the presence of geohelminthes were evaluated using non-parametric tests for related samples and fixed-effect logistic regression models. Results: Prevalences of geohelminthes at baseline were: 22,28% (CI 95% 16,36%-28,20%) for Ascaris lumbricoides; 37,31%( CI 95% 30,42%-44,19%) for Trichuris trichiura and 13,47% (CI 95% 8,61%-18,33%) for Uncinaria sp. The final measurements of these prevalences decreased to 5,30%(CI 95% 1,68%-8,91%) for A. lumbricoides; 16,55% (CI 95% 10,56%-22,55%) for T. trichiura and 4,64% (CI 95% 1,42%-8,03%) for Uncinaria sp. Conclusion: Although the present study does not constitute an actual impact evaluation, it provides an apparently successful experience with implementing a comprehensive strategy to control geohelminthiasis, which could serve as a model for other interventions in rural areas in the country.Introducción: Las geohelmintiasis son infecciones prevalentes en los países en vía de desarrollo, que afectan principalmente a la población escolar. Las estrategias de control que combinan quimioterapia masiva con educación en salud, pueden producir reducciones significativas de estas infecciones, sostenibles en el tiempo. En este estudio se implementó y evaluó, una intervención integral basada en una estrategia lúdica de educación en salud, más quimioterapia masiva en una zona rural de Colombia. Metodología: Diseño cuasi-experimental, realizado en La Virgen, Cundinamarca (Colombia). Toda la población escolar fue sometida a la estrategia educativa en salud, acompañada de tratamiento semestral con albendazol, entre finales del 2010 y mediados del 2013. La muestra analítica fue constituida por 119 niños (mediana= 11; Rango Intercuartílico = 8-13 años). Se evaluaron los cambios anuales en la presencia de geohelmintos usando pruebas no paramétricas para muestras relacionadas y modelos de regresión logística de efectos fijos. Resultados: En la medición basal, las prevalencias de los geohelmintos fueron: 22,28% (IC 95% 16,36%-28,20%) para Ascaris lumbricoides; 37,31% (IC 95% 30,42%-44,19%) para Trichuris trichiura y 13,47% (IC 95% 8,61%-18,33%) para Uncinaria sp. Para la medición final, estas prevalencias cayeron significativamente a 5,30% (IC 95% 1,68%-8,91%) para A. lumbricoides; 16,55%  (IC 95% 10,56%-22,55%) para T. trichiura y 4,64% (IC95% 1,42%-8,03%) para Uncinaria sp. Conclusión: El presente estudio, pese a que no constituye una evaluación real de impacto, provee una experiencia aparentemente exitosa de implementación de una estrategia integral para el control de las geohelmintiasis, que podría servir como modelo para otras intervenciones en áreas rurales del país

    Análisis de los factores determinantes para establecer políticas de almacenamiento considerando tiempo de permanencia de contenedores de importación en el puerto de Arica

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    81 p.Esta investigación busca identificar las políticas de almacenamiento que permitan reducir el número de despejes de los contenedores de importación en puertos, para lo cual se utilizan herramientas de Minería de Datos. De esta forma, se aplican algoritmos de clasificación online, offline y un multiclasificador para predecir el dwell time de los contenedores, en función de las características de éstos. El caso de estudio corresponde al patio de stacking de importación del Puerto de Arica, Chile, considerando tres periodos en conjunto (desde el año 2011 al año 2013). Los mejores resultados obtenidos con los algoritmos de clasificación y, el ulticlasificador se utilizan en un modelo de simulación del patio de stacking, con el propósito de evaluar diferentes políticas de almacenamiento: secuencial, aleatoria y segregada. A partir de la simulación, se observa que el modelo segregado obtiene un menor número de despejes promedio y, por ende, permite disminuir el costo operacional./ABSTRACR:This study aspires to identify the storage policies which will allow to reduce the number of container clearances during importation at ports by using data mining. This methodology allows to apply online, offline and multiclassifier classification algorithms to predict the container's dwelling time depending on their characteristics. The case in study develops in the imports stacking yard in the port of Arica, Chile, considering three periods (from 2011 to 2013). The best results obtained with the algorithms are later used in a simulation model for the stacking yard, with the ultimate purpose of measuring and evaluating the different storage policies: sequential, random and segregated. From this simulation, we can infer that the segregated model gets on average fewer clearances and thus, if implemented, would certainly reduce the operational cost altogether

    Perfiles de poliparasitismo intestinal en una comunidad de la Amazonia colombiana

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    Introduction: Intestinal parasite infections and polyparasitism are highly prevalent in the most vulnerable populations of developing countries due to environmental, biological and social determinants common in the transmission of parasites. Children between 1 and 15 years of age are the most affected population.Objective: To describe the prevalence and profiles of intestinal polyparasitism in 1 to 15 year-old children from native communities in the Colombian Amazon region.Materials and methods: We used a non-probability sampling of 300 children between 1 and 15 years of age from several rural settlements and the main urban area of Puerto Nariño, Amazonas, Colombia, who participated voluntarily in the study. We obtained fecal samples that were analyzed by the direct method (0.85% saline solution-lugol) and the Kato-Katz technique. The most prevalent polyparasitism profiles were identified using Cohen’s kappa coefficient with a 95% confidence interval.Results: The prevalence of polyparasitism, defined as the presence of at least two intestinal pathogenic parasites, was 84% (95 % CI: 79.35-87.96). Polyparasitism by two or three of the following parasites: Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Blastocystis sp., Ancylostoma duodenale and Necator americanus from the Ancylostomatidae family, and Entamoeba histolytica, E. dispar and E. moshkovskii of the Entamoeba complex, had the highest prevalence.Conclusion: Several intestinal polyparasitism profiles were found, although in most cases fewer than six parasites were involved. Better prevalence estimations and identification of determinant factors will allow to priorize and direct resources to control these infections.Introducción. Las infecciones parasitarias y el poliparasitismo intestinal son muy prevalentes en las poblaciones más vulnerables de los países en desarrollo debido a la existencia de factores ambientales, biológicos y sociales determinantes en la transmisión de parásitos. La población entre uno y 15 años de edad es la más afectada por dicha situación.Objetivo. Describir las prevalencias y los perfiles del poliparasitismo intestinal en la población de uno a 15 años de edad de comunidades indígenas de la Amazonia colombiana.Materiales y métodos. Se hizo un muestreo no probabilístico de 300 niños entre uno y 15 años de edad, procedentes de varios asentamientos rurales y de la cabecera urbana de Puerto Nariño, Amazonas, quienes participaron voluntariamente en el estudio. Las muestras de materia fecal se analizaron mediante el método directo (solución salina al 0,85 % y lugol) y la técnica de Kato-Katz. Se determinaron los perfiles más prevalentes de poliparasitismo intestinal con el coeficiente kappa de Cohen y un intervalo de confianza de 95 %.Resultados. La prevalencia de poliparasitismo, definida como la presencia de, por lo menos, dos parásitos intestinales patógenos, fue de 84 % (IC95 %: 79,35-87,96). Los casos con presencia de dos o tres agentes incluyeron los parásitos Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Blastocystis sp., los ancilostomídeos Ancylostoma duodenale y Necator americanus, así como Entamoeba histolytica, E. dispar y E. moshkovskii del complejo Entamoeba, y fueron los de mayor prevalencia.Conclusión. Se encontraron varios perfiles de poliparasitismo intestinal, aunque la mayoría de los casos involucraron menos de seis especies. Una mejor estimación de la prevalencia y los factores determinantes del poliparasitismo intestinal permitirían priorizar y orientar los recursos para su control
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