Oligoarreglo de DNA para detectar los genotipos de virus de papiloma humano 16, 18 y 58

Introduction. Human papillomavirus (HPV) is the etiologic factor for cervical cancer (CC). At present, several HPV tests have been developed using expensive infrastructure and equipment. Objective. To develop and evaluate a single DNA oligoarray for HPV16, -18 and -58 genotypes detection.Material and methods. The design of system detects a small L1/HPV region by recreation of a tandem stable double-strand DNA strategy. This was evaluated for both DNA sources, cervical tissues or cells (fresh) or paraffin-embedded (fragmented), samples.Results. The system, creating a thermodynamically stable molecule at room temperature, successfully detected the HPV16, -18 and/or -58 sequences in both simgle and multiple infection manners after PCR reaction, comparable with DNA sequencing. In addition, it is shown that it is highly specific, sensitive, and able to discriminate between closely related sequences of 20-base length, by using different sources of DNA. The present work provides a reliable and efficient prototype system for HPV detection, showing technically a specific, and sensitive platform. Besides, it could be an important molecular tool for HPV tests in small or medium sized laboratories. Conclusions. This innovative customized system as proof-of-concept research could be used to detect some of the most frequent HPV genotypes, as well as discriminating against different viral loads.Introducción. El virus de papiloma humano (VPH) es el factor etiológico del cáncer cervicouterino (CC). En la actualidad, se han desarrollado varias pruebas de VPH utilizando infraestructura y equipos costosos. Objetivo. Desarrollar y evaluar un oligoarreglo para detectar específicamente los genotipos de virus de papiloma humano (VPH) 16, 18 y 58. Materiales y métodos. Su diseño detecta un fragmento del gen L1/VPH recreando la estrategia de estabilidad de doble cadena de DNA en tándem. Para evaluar el sistema, se utilizó DNA proveniente de células de tejido fresco o incluido en parafina (DNA fragmentado). Resultados. El sistema recrea una molécula termodinámicamente estable a temperatura ambiente y detecta infecciones simples o de multi-infección después de realizar la PCR; el resultado es comprobable con la secuenciación del DNA. El sistema es sensible y específico y que con solo un fragmento de 20 bases discrimina secuencias relacionadas provenientes de cualquier fuente de DNA. Así, el sistema provee un prototipo eficaz y eficiente para detectar específicamente el VPH. Además, podría ser una herramienta molecular para detectar el VPH en laboratorios pequeños o grandes. Conclusiones Este sistema innovador (hecho a la medida), podría ser considerado como una prueba-de-concepto en investigación para detectar y discriminar los genotipos de VPH y su carga viral

Perforación de intestino delgado secundaria a infección por citomegalovirus en un paciente con sida

Cytomegalovirus can cause disseminated or localized disease in people living with HIV with advanced immunosuppression, usually those with CD4+ T-lymphocyte cell counts <50 cells/mm3 who do not receive, complies, or does not respond to antiretroviral therapy.We report on the case of a patient living with HIV without antiretroviral therapy who was admitted to the emergency department for abdominal pain. During laparotomy, perforation of the ileum was found, requiring right hemicolectomy, ileotransverse anastomosis, and drainage due to fecaloid peritonitis. The report of histopathology documented multiple cytomegalic inclusions in stromal, epithelial, and endothelial cells, predominantly in the ileum, at the level of the perforation area. Although cytomegalovirus disease in the gastrointestinal tract is one of the most common complications of HIV, ileal perforation is an unusual manifestation with high mortality.El citomegalovirus puede causar enfermedad diseminada o localizada en personas con HIV e inmunosupresión avanzada, quienes, por lo general, son aquellos con un número de linfocitos T CD4+ menor de 50 células/mm3 que no reciben, no cumplen o no responden a la terapia antirretroviral.Este artículo reporta el caso de un paciente con HIV sin terapia antirretroviral, que fue admitido al servicio de urgencias por dolor abdominal. Durante la laparotomía, se encontró perforación del íleon, que requirió hemicolectomía derecha, anastomosis ileotransversa y drenaje por peritonitis fecaloide. En el estudio de histopatología, se documentaron múltiples inclusiones citomegálicas en células del estroma, epiteliales y endoteliales, con predomino en el íleon, en la zona de la perforación. Aunque la enfermedad por citomegalovirus del aparato digestivo es una de las complicaciones más comunes del sida, la perforación del íleon es una manifestación inusual con gran mortalidad

Controversias en neuroinmunología: esclerosis múltiple y otras enfermedades desmielinizantes

Multiple sclerosis is the most prevalent demyelinating disease affecting the central nervous system. In the past two decades, significant milestones have been achieved in this domain, including the identification of critical immunological pathways, novel biomarkers, and effective immunotherapies. Nonetheless, several areas of uncertainty and challenges persist. Globally, there has been a notable increase in multiple sclerosis cases. In Colombia, recent studies indicate a rise in prevalence from fewer than 5 cases per 100 000 inhabitants to 7.5 cases per 100 000. It is imperative for neurologists to stay informed about current treatments to offer appropriate guidance to these patients.This review analyzes eight pertinent controversies surrounding multiple sclerosis, and other demyelinating diseases, based on the most current scientific evidence. Topics explored include: 1) prevention of postpartum relapses, 2) neuromyelitis optica spectrum disorder, 3) the role of genetic testing in diagnosis, 4) risks of malignancy associated with immunotherapy, 5) discontinuation of treatment in older adults, 6) management strategies for lymphopenia, 7) what is the indication for stem cell therapy in multiple sclerosis? and 8) approaches to mitigate rebound effects after discontinuing disease-modifying therapy. Each controversy is supported by a thorough analysis and practical recommendations aimed at informing decision-making in daily clinical practice and adapting to the realities of countries like ours, where advancements in neurological training and access to treatments are crucial.La esclerosis múltiple es la enfermedad desmielinizante más frecuente del sistema nervioso. En las últimas dos décadas, se han logrado importantes avances, como la identificación de vías inmunológicas clave, nuevos biomarcadores y el desarrollo de inmunoterapias efectivas. Sin embargo, aún persisten áreas de incertidumbre y desafíos. A nivel mundial, se ha observado un incremento notorio de los casos de esclerosis múltiple. En Colombia, por ejemplo, los estudios más recientes han reportado un cambio de la prevalencia menor de 5 por cada 100 000 habitantes a 7,5 casos por cada 100 000 habitantes. Es esencial que los neurólogos estén al tanto de los tratamientos actuales para brindar asesoramiento adecuado a estos pacientes.Esta revisión aborda ocho controversias relevantes en esclerosis múltiple y otras enfermedades desmielinizantes, basada en la evidencia más reciente. Los temas incluyen la suspensión de tratamientos en adultos mayores, el uso de pruebas genéticas para el diagnóstico, las recomendaciones sobre planificación familiar, la prevención de recaídas posparto y el espectro de neuromielitis óptica. También se analizan la indicación de terapia con células madre, el riesgo de neoplasias malignas asociadas a la inmunoterapia, el manejo de la linfopenia y las estrategias para mitigar el efecto de rebote al suspender los tratamientos modificadores de la enfermedad. Cada controversia incluye recomendaciones para orientar la toma de decisiones en la práctica clínica diaria, adaptándose a las realidades de países como Colombia, donde son cruciales los avances en formación neurológica y acceso a tratamientos

Aumento inusitado del consumo de antibióticos en Colombia, 2020-2023

Introduction. Antibiotic consumption and resistance have increased worldwide. Antibiotic resistance results in longer hospital stays and higher healthcare costs. Objective. To describe the consumption of antibiotics and associated expenses in Colombia. Materials and methods. A meticulous descriptive cross-sectional study of antibiotic consumption and expenditure in Colombia from 2020 to 2023 was conducted. Between 2020 and 2023, a description of the consumption and expenditure of antibiotics in Colombia was made. Data were obtained from IQVIA™ (IMS Health and Quintiles). The prominent families of antimicrobials used in Colombia were selected. Twelve pharmacological families were classified, including 27 antimicrobials and three β-lactamase inhibitors. The defined daily dose was used to measure antibiotic consumption, identify variations, and evaluate medical prescription practices. The defined daily dose per 1,000 inhabitants per day wasestimated to obtain information from the population receiving daily antibiotic treatment. The amount of antibiotics used was estimated in grams and tons per year. Results. The top 10 most consumed antimicrobials by defined daily dose per 1,000 inhabitants per day in Colombia were amoxicillin, azithromycin, metronidazole, cephalexin, ciprofloxacin, trimethoprim-sulfamethoxazole, ampicillin, sulbactam, clarithromycin, cefazolin, and dicloxacillin. The total consumption of antibiotics was 2,139 tons, which represented an expense of USD$708,112,587, for an increase of 17 and 8$ 708’112.587, para un incremento del 17 y el 8 %, respectivamente, durante el período. Conclusión. El incremento progresivo del consumo y del gasto en antimicrobianos en Colombia requiere un conjunto de intervenciones que incluyan promover cambios en el comportamiento de la prescripción médica y una campaña de educación pública que conduzca a la adopción de una política de salud pública sostenible

Asociación entre patógenos periodontales y la demencia tipo Alzheimer: una revisión sistemática

Introduction. The most common type of dementia is Alzheimer\u27s disease. Recent studies suggest an association between periodontal pathogens and Alzheimer\u27s disease.Objective. To identify periodontal pathogens in saliva, gingival crevicular fluid, serum, cerebrospinal fluid, or brain tissue associated with Alzheimer\u27s dementia.Materials and methods. We conducted a search across four databases: PubMed/MEDLINE, OVID/Cochrane, Scopus, and Web of Science, using both controlled and uncontrolled vocabulary. We performed the selection by title and abstract, followed by full-text review, according to the eligibility criteria. We also assessed the methodological quality of the selected studies. Data synthesis was performed using tables and figures.Results. After the selection and eligibility process, we included 12 studies. The most commonly used method for identifying bacteria was measuring IgG antibody levels against periodontal bacteria. The results showed that the detection of periodontitis and periodontal pathogens such as Porphyromonas gingivalis, Campylobacter rectus (HR = 1.22; 95% CI, 1.04–1.43, p=0.012), Actinomyces naeslundii (HR = 2.0; 95% CI, 1.1–3.8, p< 0.05), Fusobacterium nucleatum (p=0.02), Prevotella intermedia (p<0.05), Veillonella parvula (p<0.05), and Prevotella denticola (p<0.05) were significantly associated with Alzheimer\u27s disease.Conclusions. An association exists between specific periodontal pathogens and cognitive decline. These microorganisms may be generating a systemic host immuno-inflammatory response in Alzheimer\u27s disease.Introducción. El tipo de demencia más común es la enfermedad de Alzheimer. Estudios recientes sugieren una asociación entre los patógenos periodontales y la enfermedad de Alzheimer.Objetivo. Identificar los patógenos periodontales asociados a la demencia tipo Alzheimer en muestras de saliva, fluido gingival crevicular, suero, líquido cefalorraquídeo o tejido cerebral.Materiales y métodos. Se realizó una búsqueda en cuatro bases de datos PubMed-MEDLINE, OVID-Cochrane, Scopus y Web of Science, utilizando vocabulario controlado y no controlado. Se realizó una selección por título y resumen, y posteriormente por el texto completo, siguiendo los criterios de elegibilidad. La calidad metodológica de los estudios seleccionados también fue evaluada. La síntesis de los datos se realizó mediante cuadros y figuras.Resultados. Tras el proceso de selección y evaluación de elegibilidad, se incluyeron 12 estudios. El método más usado para identificar las bacterias fue la medición de los niveles de anticuerpos IgG contra bacterias periodontopáticas. Los resultados mostraron que la detección de periodontitis y patógenos periodontales como Porphyromonas gingivalis, Campylobacter rectus (aHR = 1,22; 95% CI, 1,04–1,43, p = 0,012), Actinomyces naeslundii (HR=2,0;95% CI, 1,1–3,8, p<0,05), Fusobacterium nucleatum (p = 0,02), Prevotella intermedia (p<0,05), Veillonella parvula (p<0,05) y Prevotella denticola (p<0,05) se asociaron significativamente con la demencia tipo Alzheimer.Conclusiones. Se evidencia una asociación entre patógenos periodontales específicos y el deterioro cognitivo. Estos microorganismos podrían estar generando una respuesta inmunoinflamatoria sistémica del huésped en la enfermedad de Alzheimer

Segundos trasplantes alogénicos en niños: experiencia de doce años

Introduction. A second hematopoietic stem cell transplant is required when the first transplant fails, usually due to relapse or graft failure, and is associated with increased morbidity and mortality. Survival rates range from 74 to 82% in non-neoplastic diseases and from 39 to 58% in neoplastic conditions. Evidence on second hematopoietic stem cell transplant in children is limited, particularly in low- and middle-income countries.Objective. To describe the clinical characteristics, complications, and outcomes of children who underwent a second transplant at a high-complexity center between 2012 and 2024. Materials and methods. Case series study with descriptive and survival analysis using the Kaplan-Meier method in Stata 14™.Results. A total of 346 allogeneic transplants were performed, of which 20 patients underwent a second transplant. Of these, 17 received a haploidentical donor for their second transplant, and the primary indication was a neoplastic disease in 13 cases. The second transplant was performed due to graft failure in 11 of the 20 patients, and due to relapse in the remaining 9. The mean age was 10.7 ± 5 years, with a male predominance (14 out of 20). Haploidentical transplants accounted for 16 of the 20 cases, and 11 used the same donor. The most common complications were acute graft-versus-host disease in 7 cases, 2 of grade III, cytomegalovirus infection in 10 cases, and graft failure after the second transplant in 4 cases: 3 primary, 1 secondary. Transplant-related mortality was 31%. The 2-year overall survival was 54%, with a median follow-up of 11 months.Conclusions. Second hematopoietic stem cell transplant is a viable therapeutic option when no other alternatives are available, particularly in resource-limited settings.Introducción. El segundo trasplante de progenitores hematopoyéticos es un procedimiento de alto riesgo, indicado principalmente por falla del injerto o recaída de la enfermedad. La supervivencia global varía entre el 40 y el 82 % en las enfermedades no neoplásicas y entre el 39 y el 58 % en las neoplásicas. La evidencia en la población pediátrica es limitada, especialmente en los países de ingresos bajos y medianos. Objetivo. Describir las características clínicas, complicaciones y desenlaces en niños que recibieron un segundo trasplante en un centro de alta complejidad entre el 2012 y el 2024. Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio de serie de casos con análisis descriptivo y de supervivencia mediante el método de Kaplan-Meier, utilizando el software Stata 14™.Resultados. De 410 trasplantes practicados, 346 fueron alogénicos; 20 pacientes recibieron un segundo trasplante alogénico. La mayoría (13/20) presentaba enfermedad neoplásica. Diecisiete de estos trasplantes fueron haploidénticos. Las indicaciones del segundo trasplante fueron por falla del injerto (11/20) y recaída (9/20). La edad media fue de 10 ± 5 años; 14 eran varones. Dieciséis segundos trasplantes fueron haploidénticos, y en 11 se utilizó el mismo donante. Las complicaciones frecuentes incluyeron la enfermedad aguda de injerto contra huésped (7 pacientes, 2 con grado III), la infección por citomegalovirus (10 pacientes) y la falla de injerto posterior al trasplante (4 casos). La mortalidad relacionada fue del 31 %. La supervivencia global a 2 años fue del 54 %, con una mediana de seguimiento de 11 meses.Conclusiones. El segundo trasplante de progenitores hematopoyéticos puede ser una alternativa viable en niños cuando no existen otras opciones terapéuticas,  especialmente en contextos con recursos limitados

La implementación del arreglo CRISPR 2.1 para la genotipificación mejora la identificación de Escherichia coli uropatógena en pacientes pediátricos colombianos.

Introduction. The emergence of antibiotic resistance in Escherichia coli has contributed to the increasing incidence and lethality of urinary tract infections. Objective. To characterize uropathogenic E. coli isolates obtained from patients with urinary tract infections in two hospitals in Bucaramanga, Colombia. Specifically, we assessed the significance of CRISPR 2.1 locus elements as a target for genotyping.Materials and methods. We combined phylotyping based on the Clermont classification, antimicrobial susceptibility testing approaches, and PCR amplification of the CRISPR 2.1 array.Results. We found that the variation in the CRISPR 2.1 array, along with the presence of resistance and virulence genes, phylogroups, and antibiotic sensitivity patterns provide significant and reliable data for epidemiological studies. The analysis of 72 isolates revealed considerable resistance to ampicillin and trimethoprim/sulfamethoxazole, with rates of 80% and 60%, respectively. The isolates also demonstrated the occurrence of blaCTX-M, blaTEM, and blaSHV genes in 54.55, 18.18, and 4.17% of the cases, respectively. According to the Clermont classification, groups D and B2 accounted for 65.2% of all isolates. The CRISPR 2.1 array was present in most isolates except those in group B2 and exhibited length polymorphism.Conclusions. Our results emphasized the utility of CRISPR 2.1 array polymorphism in reliably identifying uropathogenic E. coli and enhancing distinction, which is a noteworthy advance in regional epidemiological monitoring systems.Introducción. La aparición de resistencia a los antibióticos en Escherichia coli ha contribuido a la creciente incidencia y letalidad de las infecciones urinarias.Objetivos. Caracterizar aislamientos de cepas uropatógenas de E. coli obtenidos de pacientes con infecciones urinarias de dos hospitales de Bucaramanga, Colombia. Se evaluó específicamente la relevancia del locus CRISPR 2.1 como elemento informativo para la genotipificación.Materiales y métodos. Se combinó la filotipificación basada en la clasificación de Clermont y los antibiogramas, junto con la amplificación por PCR del arreglo CRIPSR 2.1. Resultados. Se encontró que la variación del arreglo CRISPR 2.1, así como la presencia de genes de resistencia y virulencia, filogrupos y patrones de sensibilidad a los antibióticos, proporcionan datos significativos y confiables para los estudios epidemiológicos. El análisis de 72 aislamientos reveló una resistencia significativa a la ampicilina y al trimetoprimsulfametoxazol, con tasas del 80 y el 60 %, respectivamente. Además, los aislamientos demostraron la presencia de los genes blaCTX-M, blaTEM, y blaSHV en el 54,55, 18,18 y 4,17 % de los casos, respectivamente. Los grupos D y B2 comprendieron el 65,2 % de los aislamientos según la clasificación de Clermont. El arreglo CRISPR 2.1 se encontró en la mayoría de los aislamientos, excepto en los del grupo B2, y exhibió polimorfismo de longitud.Conclusiones. Los resultados enfatizan la utilidad del polimorfismo presentado por el arreglo CRISPR 2.1 en la subtipificación de las cepas de E. coli uropatógenas, lo que contribuye a mejorar la identificación bacteriana

Pancreatitis aguda por Leptospira spp.: un informe de caso poco común de una zoonosis común

Leptospirosis, a widespread zoonotic disease prevalent in tropical and subtropical regions, causes over one million cases and about 59,000 deaths annually. It is transmitted through contact with infected animal urine, primarily from rodents, and worsened by poor sanitation and favorable climate. Although in Colombia there was a significant decline in cases from 2018 to 2022, severe forms of the disease, including rare complications like acute pancreatitis, still pose significant health risks.A 49-year-old male presented with symptoms including abdominal pain, jaundice, and severe thrombocytopenia. Despite initial normal tests, leptospirosis was eventually diagnosed after further testing revealed elevated lipase levels and medical imaging confirmed severe pancreatitis. The patient received antibiotics and intensive care, which led to recovery and confirmation of leptospirosis through serology.Leptospirosis can cause severe multi-organ complications, including rare cases of pancreatitis. This case underscores the need for early diagnosis and treatment of leptospirosis to manage such complications effectively. Environmental factors and rodent control are crucial for prevention, emphasizing the importance of comprehensive management and preventive measures.La leptospirosis es una enfermedad zoonótica extendida y prevalente en regiones tropicales y subtropicales, que causa más de un millón de casos y alrededor de 59.000 muertes anuales. Se transmite por el contacto con la orina de animales infectados, principalmente de roedores, y se agrava por la falta de saneamiento y un clima favorable. Aunque en Colombia se observó una disminución significativa de los casos entre el 2018 y el 2022, las formas graves de la enfermedad, incluidas complicaciones raras como la pancreatitis aguda, siguen representando riesgos importantes para la salud.Un hombre de 49 años presentó dolor abdominal, ictericia y trombocitopenia grave. A pesar de las pruebas iniciales normales, se diagnosticó leptospirosis tras pruebas adicionales que revelaron aumento de la lipasa y la confirmación, mediante imágenes, de una pancreatitis grave. El paciente recibió tratamiento con antibióticos y cuidados intensivos, lo que llevó a su recuperación, y la leptospirosis se confirmó mediante serología.Esta enfermedad puede causar complicaciones graves multiorgánicas, incluyendo casos raros de pancreatitis. Con este caso se subraya la necesidad de un diagnóstico y un tratamiento tempranos de la leptospirosis, para manejar de manera efectiva sus complicaciones. Los factores ambientales y el control de roedores son fundamentales para la prevención, destacándose la importancia de una gestión y medidas preventivas integrales

Elaboración y evaluación de un antisuero para la detección inmunohistoquímica del virus del Zika en tejidos fijados en aldehídos

Introduction. The nervous system is one of the main targets of the Zika virus. It is essential to have biological reagents to use as diagnostic support and in pathogenesis research that requires aldehyde-fixed tissues.Objective. To determine the utility of two types of antiserums prepared for the detection of Zika virus antigens in cells and tissues fixed in aldehydes.Materials and methods. The antiserums were produced in two New Zealand rabbits from a viral isolate from the 2016 Zika outbreak in Colombia. Freund\u27s adjuvant was used for boosting in one of the animals, while SEPPIC\u27s Montanide adjuvant was used in the other. Immunoreaction titrations were performed on Zika-positive cells and tissues. The Streptavidin-alkaline phosphatase and avidin-biotin-peroxidase methods were used. They were evaluated on experimentally infected samples for Zika and other related and unrelated viruses. Performance was evaluated with samples from other techniques used in the laboratory including vibratome sections, MOAR samples, and transmission electron microscopy.Results. Intense immunoreactivity to Zika virus antigens was observed with both antiserums, mainly in neurons of the cerebral cortex. Immunostaining was also demonstrated in cell culture samples and tissues from experimentally infected animals. There was cross-immunoreactivity with dengue and yellow fever viruses but not with rabies virus.Conclusions. The utility of the two antiserums for the detection of Zika virus in samples of human origin and from experimental animals obtained by different histological techniques used for the investigation of Zika pathogenesis was demonstrated.Introducción. El sistema nervioso es uno de los blancos del virus del Zika. Es fundamental disponer de reactivos biológicos para apoyo diagnóstico e investigaciones sobre patogénesis que requieren tejidos fijados en aldehídos.Objetivo. Determinar la utilidad de dos antisueros elaborados para la detección de antígenos del virus Zika en células y tejidos fijados en aldehídos.Materiales y métodos. Los antisueros se produjeron en conejos Nueva Zelanda a partir de un aislamiento viral del brote de Zika de 2016 en Colombia. En uno de los animales se empleó adyuvante de Freund para los refuerzos y en el otro el adyuvante Montanide. Se realizaron titulaciones por inmunorreacciones en células y tejidos positivos para Zika. Se emplearon los métodos de Estreptavidina-fosfatasa alcalina y avidina-biotina-peroxidasa. Se evaluaron en muestras infectadas experimentalmente para Zika y otros virus relacionados y no relacionados. Se evaluaron con muestras de otras técnicas utilizadas en el laboratorio como cortes obtenidos en vibrátomo, muestras para MOAR y microscopía electrónica de transmisión.Resultados. Hubo inmunorreactividad a los antígenos del virus Zika con ambos antisueros, principalmente en neuronas de la corteza cerebral. Se demostró inmunotinción en muestras de cultivos celulares y tejidos de animales infectados experimentalmente. Hubo inmunorreactividad cruzada con los virus del dengue y fiebre amarilla pero no con el virus de la rabia.Conclusiones. Se demostró la utilidad de los dos antisueros para la detección del virus Zika en muestras de origen humano y de animales de experimentación obtenidas mediante diferentes técnicas histológicas utilizadas para la investigación de la patogénesis del Zika