The effects of low temperature on the growth and total protein amount of chickpea (Cicer arietinum) seedlings

In this study, shocks of cold at the levels of 5,3 and 1oC have been applied to the 6-days old chickpea (Cicer arietinumL.) plants. Next, having been left to grow for 72 hours under long day photoperiod circumstances 25oC, the length of their root and epicotyl have been measured at certain intervals. Moreover, the proteincontents of the plants exposed to low temperature shocks (1oC) have been indentified in connection with their controls. According to the results obtained, the low temperature shocks have prevented the length of the roots and epicotyl to a large extent. It is observed that the lower the temperature is, the more the plant's growth is prevented. It has also been observed that the cold sterss caused by the low temperature application might be reversible. The plants get rid of this stress later in low temperatures than in high ones. The low temperature application (1oC) has also considerably reduced the total protein amount

Effect of processing on the drying kinetics and functional value of dried apricot

Apricots can be considered as a good source of phenolic compounds, which are beneficial for human health. Microwaves may be an alternative to the conventional sun or hot air drying techniques used to obtain dried apricot. Nevertheless, their impact on the functional compounds must be taken into account if they are to be recommended as an attractive drying option. This work compares the drying kinetics and the change in the organic acids, phenolic compounds and antioxidant activity of dried apricot when using hot air drying and microwave energy. Empirical (linear and Page) equations can be used to model the drying kinetics in air, combined air-microwave and microwave processes. From the obtained results, it can be concluded that the industrial processing of dried apricots may be improved by using microwave energy, as the drying time is considerably reduced, and the obtained fruit had a higher phenolic content, particularly of chlorogenic acid, catequin and epicatequin. Nevertheless, as the contribution of these phenols to antioxidant capacity was not significant, microwave dried samples maintained the same antioxidant capacity as the air-dried ones. When sulphite is added previous to the drying processes, care should be taken with the total phenols and the antioxidant capacity quantified as it may interfere with the results depending on the methodology used. © 2011 Elsevier Ltd.Igual Ramo, M.; García Martínez, EM.; Martín-Esparza, M.; Martínez Navarrete, N. (2012). Effect of processing on the drying kinetics and functional value of dried apricot. Food Research International. 47(2):284-290. doi:10.1016/j.foodres.2011.07.019S28429047

A Numerical Study On Design Of Tall Buildings In Accordance With Tdy-2007 And Istanbul Tall Buildings Seismic Design Code

Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2010Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2010Yapı sistemlerinin deprem etkileri altındaki yapısal performanslarının belirlenmesinde, doğrusal ve doğrusal olmayan hesap yöntemleri kullanılabilmektedir. Doğrusal hesap yöntemleri dayanım esaslı, doğrusal olmayan hesap yöntemleri ise şekildeğiştirme ve yerdeğiştirme esaslıdır. Doğrusal teoriye göre hesapta, malzemenin doğrusal-elastik, yerdeğiştirmelerin çok küçük olduğu varsayılmakta ve bu varsayım ile süperposizyon ilkesi uygulanabilmektedir. Doğrusal olmayan hesapta ise malzemenin doğrusal-elastik sınır ötesindeki davranışı hesaba katılmakta, diğer bir deyişle, bünye bağıntılarının doğrusal olmadığı gözönünde tutulmaktadır. Bunun sonucunda, doğrusal olmayan teoride süperpozisyon ilkesi uygulanamamaktadır. Yapı mühendisliğindeki ve malzeme bilimindeki gelişmeler, bilgisayar teknolojisindeki ilerlemeler mühendislerin deprem hareketlerini ve depremin yapılar üzerindeki etkilerini daha gerçekçi ve aslına uygun olarak belirlemesine katkıda bulunmaktadır. Bu gelişmeler, yapı sistemlerinin deprem etkileri altındaki doğrusal olmayan davranışlarının daha yakından izlenmesine ve göçme güvenliklerinin daha gerçekçi bir şekilde belirlenmesine de olanak sağlamaktadır. Bu tez kapsamında, betonarme binaların can güvenliği deprem performansının 2007 Deprem Yönetmeliği’ nde tanımlanan doğrusal yöntemlerle ve henüz taslak aşamasında olan İstanbul İli Yüksek Binalar Yönetmeliği’ nde tanımlanan doğrusal olmayan yöntemlerle belirlenmesi amacına yönelik olarak, 42 katlı, üç boyutlu bir bina taşıyıcı sistem modeli boyutlanarak analiz edilmiş ve elde edilen sonuçlar karşılaştırılmıştır. Altı bölümden oluşan yüksek lisans tezimin birinci bölümü, konunun açıklanmasına ve konu ile ilgili çalışmaların gözden geçirilmesine ayrılmış, çalışmanın amacı ve kapsamı hakkında bilgi verilmiştir. İkinci bölümde, yapı sistemlerinin doğrusal ve doğrusal olmayan davranışları incelenmiş, doğrusal olmayan sistemlerin hesap yöntemleri gözden geçirilmiştir. Malzeme bakımından doğrusal olmayan betonarme sistemlerinin iç kuvvet-şekildeğiştirme bağıntıları verilmiş, doğrusal olmayan şekildeğiştirmelerin belirli kesitlerde toplandığı varsayımına dayanan plastik mafsal hipotezi ve doğrusal olmayan şekildeğiştirmelerin sistem üzerinde yayılı olduğunu gözönüne alan fiber eleman analojisi irdelenmiştir. Bu kapsamda bina taşıyıcı sistemlerinin doğrusal olmayan davranışları incelenmiş ve bu davranış üzerinde etken olan faktörler açıklanmıştır. Bunun yanında, dinamik analizde kullanılan deprem kayıtlarının seçimi ve ölçeklendirilmesi konusunda bilgi verilmiştir. Üçüncü bölümde binaların performansa dayalı tasarımı hakkında genel bilgi verilmiştir. 2007 Türk Deprem Yönetmeliği’ nde yer alan bina deprem performans düzeyleri ve kullanılan analiz yöntemleri gözden geçirilmiş, bu çalışma kapsamında kullanılan Zaman Tanım Alanında Doğrusal Olmayan Analiz Yöntemi açıklanmıştır. Dördüncü bölümde, yüksek binaların performansa göre tasarımı konusundaki çeşitli uluslararası yaklaşımlar irdelenmiştir. Bu bağlamda, İstanbul İli Yüksek Binalar Yönetmelik Taslağı ile özellikle Amerika’ da depremselliği yüksek olan Los Angeles şehri için hazırlanmış olan yüksek binalar yönetmelik taslağı hakkında bilgi verilmiştir. Beşinci bölüm sayısal incelemelere ayrılmıştır. 42 katlı bir binanın üç boyutlu bir hesap modeli hazırlanmış, DBYBHY-2007 de yer alan doğrusal yöntemle tasarımı ve İstanbul İli Yüksek Binalar Yönetmeliği Taslağı’ nın can güvenliği hedef performans seviyesine göre doğrusal olmayan analizi yapılmıştır. Altıncı bölüm bu tez kapsamında varılan sonuçları içermektedir. Çalışma kapsamında elde edilen sonuçlar bu bölümde açıklanmış ve değerlendirilmiştir.The performance of structural systems under earthquake effects can be determined by linear and non-linear evaluation methods. The linear evaluation methods are based on strength and the non-linear evaluation methods are based on deformation and displacement. According to the linear evaluation theory, it is assumed that the material is linear-elastic and the deformations are small, so that the principle superposition can be applied to the analysis. In the non-linear evaluation approach, however, the behaviour of material beyond the linear- elastic limit is considered; therefore the relationships are not linear. Consequently, the superposition principle cannot be applied in non-linear analysis. Developments in structural engineering, computer technology and the material science help engineers to be familiar to the earthquake motions and the effects of earthquake on buildings in a more realistic and accurate way. These developments with the observation of the non-linear behaviour of structural systems in an earthquake, enable engineers to accomplish more realistic designs. In the scope of this thesis, a 42 storey - tall building structure is designed for the life safety seismic performance, by means of the linear methods of TDY 2007. Then the seismic performance of the structure is evaluated by the nonlinear methods of Istanbul Seismic Design Code for Tall Buildings and results are compared. The present master thesis is composed of six chapters. The first chapter is designated for the brief explanation of the subject and the examination of the previous works done about the scope. The aim and the scope of the study is explained in this part. In the second chapter, information about the general principles of the linear and non-linear evaluation methods and the assumptions on which these methods are based on, are given. The strain-stress relationships of the non-nonlinear reinforced concrete material are explained; also plastic hinge hypothesis and the fiber member analogy are given. Moreover, factors that affect the non-linear behaviour of structural systems are examined. Furthermore, selection and scaling for real earthquake ground motion records are explained briefly. The third chapter gives information on the performance based design and assessment of structures. Performance levels and performance assessment methods are explained briefly. Also the method of Nonlinear Analysis Method in the Time Domain, which is also utilized for the numerical study introduced during this thesis, is explained. In the fourth chapter, international regulations and draft reports for performance assessment of tall buildings are explained. At this way, the Istanbul Seismic Design Code for Tall Buildings and the other tall building codes, especially for the city of Los Angeles which have high intensity for the earthquake hazard in the U.S.A are explained. The fifth chapter is devoted for the numerical investigations. A three dimensional structural model of a 42 storey building is designed by the strength based linear method given by the TDY-2007. Then, the non-linear method of the Istanbul Seismic Design Code for Tall Buildings is used for the Life Safety Performance Level evaluation of the building structure. The results are compared and evaluated. The sixth chapter is the final chapter and is devoted to the results of the study. Main findings of the study, the examination of the results of this study are explained in this chapter.Yüksek LisansM.Sc

Genetic engineering of Theileria parva lactate dehydrogenase gene: a new anti-theilerial target

ABSTRACT: Theileria parva is the causative agent of East Coast Fever (ECF), a tick borne disease, which results in major economic losses in cattle. Major problems in dealing with this illness are the high cost of drugs, development of resistance, and absence of effective vaccines. Thus, exploiting new targets for cost effective and higher therapeutic value drugs are imperative. Glycolysis is the main pathway for generation of ATP in T. parva, given its development inside erythrocytes. Thus, the enzymes of this pathway may prove potential targets for designing new-generation anti-theilerials. Lactate dehydrogenase of T. parva (TpLDH) has the highest activity of all glycolytic enzymes and thus we selected this enzyme as the potential therapeutic target. Our study is the first to report the isolation, removal of introns through directed mutagenesis, and cloning of TpLDH and showing that amino acid insertions or deletions most notably corresponded to a 5-amino acid sequence (Asn-91A, Glu-91B, Glu-91C, Trp-91D, Asn-91E) between Ser-91 ve Arg-92 of the enzyme. This region is also present in other apicomplexan such as Babesia bovis, a pathogen of cattle and Plasmodium falciparum, a human pathogen. Providing as the attachment site for the enzyme inhibitors and not being present in LDH of respective hosts, we propose this site as an attractive drug target. The work here is expected to lead new studies on detailed structural and kinetic aspects of apicomplexan LDHs and development of new inhibitors