Ciencia Abierta & Gestión de datos de investigación

Gestió de dades de recerca; Accés obert; Ciència obertaDatos de investigación; Acceso abierto; Ciencia abiertaResearch data; Open access; Open scienceTreball presentat durant la intervenció dels autors a la taula rodona: "Ciència Oberta: com gestionar i publicar en accés obert i suport a la gestió de dades de recerca en obert”. Exposa algunes de les accions realitzades per part del CSUC, des de la seva Àrea de Ciència Oberta, entorn als àmbits de la ciència oberta i la gestió de dades de recerca, dins el marc de les biblioteques universitàries a Catalunya

OncomiRs miR-106a and miR-17 negatively regulate the nucleoside-derived drug transporter hCNT1

High-afnity uptake of natural nucleosides as well as nucleoside derivatives used in anticancer therapies is mediated by human concentrative nucleoside transporters (hCNTs). hCNT1, the hCNT family member that specifcally transports pyrimidines, is also a transceptor involved in tumor progression. In particular, oncogenesis appears to be associated with hCNT1 downregulation in some cancers, although the underlying mechanisms are largely unknown. Here, we sought to address changes in colorectal and pancreatic ductal adenocarcinoma both of which are important digestive cancers in the context of treatment with fuoropyrimidine derivatives. An analysis of cancer samples and matching non-tumoral adjacent tissues revealed downregulation of hCNT1 protein in both types of tumor. Further exploration of the putative regulation of hCNT1 by microRNAs (miRNAs), which are highly deregulated in these cancers, revealed a direct relationship between the oncomiRs miR-106a and miR-17 and the loss of hCNT1. Collectively, our fndings provide the frst demonstration that hCNT1 inhibition by these oncomiRs could contribute to chemoresistance to fuoropyrimidine-based treatments in colorectal and pancreatic cancer

Estudi del metabolisme energètic i de recursos de l'aviari del Zoo de Barcelona : mesures cap a la sostenibilitat

En col·laboració amb el Zoo de Barcelona, s'ha realitzat un estudi sobre el metabolisme energètic i de recursos de l'edifici aviari. El fet que el Zoo només disposi de dades del conjunt del seu metabolisme -i en cap cas dels sistemes que el formen- a més de la particular situació geogràfica del mateix, ha estat determinant a l'hora de realitzar l'estudi. Aquest s'ha centrat tant en l'anàlisi dels vectors energètic -que engloba electricitat i gas natural- i hídric, com en els fluxos d'aliments i residus generats. Les dades obtingudes per a cada vector han permès conèixer quina importància té el sistema aviari dins del conjunt, així com plantejar les actuacions de millora més viables, destinades a la reducció del consum energètic i hídric del sistema estudiat per tal d'avançar cap a la sostenibilitat.En colaboración con el Zoo de Barcelona, se ha realizado un estudio sobre el metabolismo energético y de recursos del edificio aviario. El hecho que el Zoo solamente disponga de datos del conjunto de su metabolismo -y en ningún caso de los sistemas que lo forman- además de la particular situación geográfica del mismo, ha sido determinante para realizar el estudio. Éste se ha centrado tanto en el análisis de los vectores energético -que engloba electricidad y gas natural- e hídrico, como en los flujos de alimentos y residuos generados. Los datos obtenidos para cada vector permiten conocer la importancia del sistema aviario dentro del conjunto y plantear las actuaciones de mejora más viables, destinadas a la reducción del consumo energético e hídrico del sistema estudiado para avanzar hacia la sostenibilidad.The study about the aviary's energetic and resources metabolism has been done in cooperation with the Barcelona's Zoo. The fact that the Zoo only has metabolism data at its disposal as a whole -and in any case data from its systems- as well as the particularity of its localization, has been determined at the time to realize this study. This paper will be focused both on the analysis of the energetic (which includes electricity and natural gas) and hydrological vector, and on the nourishment and generated waste flux. The obtained data in each vector has permitted to know which is the importance of the aviary inside the whole Zoo, as well as to consider the most viable improvement actions, focused on the reduction of the energetic and hydrological use in the studied system in order to improve upon the sustainability

Recommendations for the Implementation of Article 37 of the Spanish Science, Technology and Innovation Act: Open Access Dissemination

Handbook defines the main aspects of the national policy of open access and specifies what new roles to be taken by the groups involved in the production and market management of scientific information. Contains a chapter of specific recommendations for managers of public support for R + D + i, one for universities and research centers, one for researchers and other institutions subscribing to scientific journals. This document has been coordinated by FECYT under RECOLECTA activities whose actions are part of the collaboration agreement with REBIUN

Recomendaciones para la implementación del Artículo 37 Difusión en Acceso Abierto de la Ley de la Ciencia, la Tecnología y la Innovación

Guía práctica que define los aspectos principales de la política nacional de acceso abierto y especifica cuáles son los nuevos roles que habrán de adoptar los colectivos implicados en la producción y gestión del mercado de la información científica. Contiene un capítulo de recomendaciones específicas para gestores de ayudas públicas a la I+D+i, otro para las universidades y centros de investigación, otro para los investigadores y otro para las entidades suscriptoras de revistas científicas. Este documento ha sido coordinado por FECYT en el marco de las actividades de RECOLECTA, cuyas actuaciones se enmarcan en el convenio de colaboración con REBIUN

Análisis de la supervivencia y del estado funcional al año de evolución de los pacientes neurocríticos tratados con craniectomía descompresiva por hipertensión intracraneal refractaria

1. Introducció L'evolució natural de les patologies neurocrítiques que presenten hipertensió intracranial (HTIC) refractària és la mort encefàlica per herniació cerebral. La craniectomia descompressiva (CD) és l'últim esglaó terapèutic per evitar-la. 2. Hipòtesi La CD millora la supervivència i el pronòstic funcional dels pacients afectes de HTIC refractària al tractament mèdic. 3. Objectius Objectiu principal: determinar en les diferents patologies neurocrítiques l'estat funcional, a l'any de seguiment, dels pacients afectes de HTIC refractària, tractats mitjançant CD. Objectius secundaris: determinar quins factors es van relacionar amb un estat funcional desfavorable i, quina patologia va presentar millor estat funcional als supervivents. 4. Material i Mètodes: Estudi unicèntric, prospectiu i observacional (UCI Hospital Germans Trias i Pujol, 2010-2017). Criteris d'inclusió: Pacients amb HTIC refractària que van necessitar CD. Variables analitzades. Variables epidemiològiques, de tractament i evolució clínica. Variable principal. Estat funcional a l'any de seguiment. Es va valorar mitjançant escala de GOSE dicotomitzada [Estat funcional desfavorable (EFD): GOSE 1-3 i favorable (EFF): GOSE 4-8)] i, mitjançant l'escala modificada de Rankin (mRS) dicotomitzada (EFD: mRS 4-6 i EFF: mRS 0-3). Quan es va analitzar l'estat funcional als supervivents es va considerar un GOSE 4 com a estat EFD. Càlcul mida mostra. Considerant un percentatge d'estat funcional desfavorable del 75% amb tractament mèdic, una reducció del 14% amb CD, assumint un risc α del 5% amb significació bilateral i una potència del 80% seran necessaris 93-104 pacients. Anàlisi estadística: Descriptiu: Percentatges amb IC 95% per a variables qualitatives. Mitjanes o Mitges amb IC 95% per a variables quantitatives. Bivariant: Regressió logística simple Multivariant: Regressió logística i determinació de la corba ROC. 5. Resultats Es van incloure 108 pacients. Ictus maligne artèria cerebral mitjana (IMACM): 25; Traumatisme cranioencefàlic (TCE): 30; Hemorràgia subaracnoïdal (HSA): 19; Hemorràgia intraparenquimatosa supratentorial (HIP): 15; Ictus cerebel·lós (IC): 4; Hemorràgia de cerebel (HC): 6, tumors: 9. La CD més freqüent va ser la dreta (48%). El 59,3% de totes les patologies van presentar un EFD (GOSE) a l'any de seguiment. IMACM: Homes: 52%. Edat: :46,5 anys. CD dretes: 68%. Mortalitat UCI: 16%. EFD: mRS (66,7%) i GOSE (62,4%). La variable relacionada amb un EFD va ser l'edat (RR: 1,2; IC 95%: 1,01-123,7; p= 0,03). TCE: Homes: 60%. Edat: 32,5 anys. CD dreta: 40%. Mortalitat UCI: 23,3%. EFD: mRS (58,6%) i GOSE (58,6%). Les variables relacionades amb un EFD van ser l'edat (RR: 1,09; IC 95%: 1,02 - 1,118; p=0,015) i la craniectomia bifrontal (RR: 14,5; IC 95%: 1,61-30 (66; p=0,017). HSA: Dones: 52,6%. Edat: 47,2 anys. HTA: 58%. HSA Fisher IV: 84,2%, Hunt i Hess 5: 73,7% i secundàries a trencament d'aneurisme d'artèria cerebral mitjana (54,6%). EFD: mRS (57,9%) i GOSE (57,9%). La variable relacionada amb un EFD va ser la HTA (RR: 13,5; IC 95%: 1,47 - 123,7; p=0,02). HIP: Homes: 60%. Edat: 44,5 anys. CD dreta: 46,7%. Mortalitat UCI: 46,7%. EFD: mRS (61,4) i GOSE (61,4%). IC: Homes: 83,3%. Edat: 49 anys. EFD: mRS (33,3%) i GOSE (33,3%). HC: Homes: 25%. Edat: 43,5 anys. EFD: mRS (50%) i GOSE (50%). Anàlisi de supervivents. TCE (55,6%) i HSA (58,4%) van tendir (p=0,1) a presentar millor estat funcional a l'any segons GOSE 5-8 que IMACM (22,2%) i HIP (33,3%) ). 6. Conclusions L'estat funcional, segons GOSE a l'any de seguiment, va ser desfavorable en el 59,3% dels pacients. El factor relacionat amb un estat funcional desfavorable en els pacients amb IMACM va ser l'edat superior a 48,5 anys i en el TCE van ser l'edat superior a 56,5 anys i la craniectomia bifrontal. En els pacients que van sobreviure, l'estat funcional va tendir a ser més favorable en els pacients amb TCE i HSA.1. Introducción La evolución natural de las patologías neurocríticas que presentan hipertensión intracraneal (HTIC) refractaria es la muerte encefálica por herniación cerebral. La craniectomía descompresiva (CD) es el último escalón terapéutico para evitarla. 2. Hipótesis La CD mejora la supervivencia y el pronóstico funcional de los pacientes afectos de HTIC refractaria al tratamiento médico. 3. Objetivos Objetivo principal: determinar en las diferentes patologías neurocríticas el estado funcional, al año de seguimiento, de los pacientes afectos de HTIC refractaria, tratados mediante CD. Objetivos secundarios: determinar qué factores se relacionaron con un estado funcional desfavorable y, qué patología presentó mejor estado funcional en los supervivientes. 4. Material y Métodos: Estudio unicéntrico, prospectivo y observacional (UCI Hospital Germans Trias i Pujol, 2010-2017). Criterios de inclusión: Pacientes con HTEC refractaria que precisaron de CD. Variables analizadas. Variables epidemiológicas, de tratamiento y evolución clínica. Variable principal. Estado funcional al año de seguimiento. Se valoró mediante escala de GOSE dicotomizada [Estado funcional desfavorable (EFD): GOSE 1-3 y favorable (EFF): GOSE 4-8)] y, mediante la escala modificada de Rankin (mRS) dicotomizada (EFD: mRs 4-6 y EFF: mRS 0-3). Cuando se analizó el estado funcional en los supervivientes se consideró un GOSE 4 como estado EFD. Cálculo tamaño muestral. Considerando un porcentaje de estado funcional desfavorable del 75% con tratamiento médico, una reducción del mismo del 14% con CD, asumiendo un riesgo α del 5% con significación bilateral y una potencia del 80% serán necesarios 93-104 pacientes. Análisis estadístico: Descriptivo: Porcentajes con IC 95% para variables cualitativas. Medianas o Medias con IC 95% para variables cuantitativas. Bivariante: Regresión logística simple Multivariante: Regresión logística y determinación de la curva ROC. 5. Resultados Se incluyeron 108 pacientes. Ictus maligno arteria cerebral media (IMACM): 25; Traumatismo craneoencefálico (TCE): 30; Hemorragia subaracnoidea (HSA): 19; Hemorragia intraparenquimatosa supratentorial (HIP): 15; Ictus cerebeloso (IC): 4; Hemorragia de cerebelo (HC): 6, tumores: 9. La CD más frecuente fue la derecha (48%). El 59,3% de todas la patologías presentaron un EFD (GOSE) al año de seguimiento. IMACM: Varones: 52%. Edad: :46,5 años. CD derechas: 68%. Mortalidad UCI: 16%. EFD: mRS (66,7%) y GOSE (62,4%). La variable relacionada con un EFD fue la edad (RR: 1,2; IC 95%: 1,01-123,7; p= 0,03). TCE: Varones: 60%. Edad: 32,5 años. CD derecha: 40%. Mortalidad UCI: 23,3%. EFD: mRS (58,6%) y GOSE (58,6%). Las variables relacionadas con un EFD fueron la edad (RR: 1,09; IC 95%: 1,02 - 1,118; p=0,015) y la craniectomía bifrontal (RR: 14,5; IC 95%: 1,61- 30,66; p=0,017). HSA: Mujeres: 52,6%. Edad: 47,2 años. HTA: 58%. HSA Fisher IV: 84,2%, Hunt y Hess 5: 73,7% y secundarias a rotura de aneurisma de arteria cerebral media (54,6%). EFD: mRS (57,9%) y GOSE (57,9%). La variable relacionada con un EFD fue la HTA (RR: 13,5; IC 95%: 1,47 - 123,7; p=0,02). HIP: Varones: 60%. Edad: 44,5 años. CD derecha: 46,7%. Mortalidad UCI: 46,7%. EFD: mRS (61,4) y GOSE (61,4%). IC: Varones: 83,3%. Edad: 49 años. EFD: mRS (33,3%) y GOSE (33,3%). HC: Varones: 25%. Edad: 43,5 años. EFD: mRS (50%) y GOSE (50%). Análisis de supervivientes. TCE (55,6%) y HSA (58,4%) tendieron (p=0,1) a presentar mejor estado funcional al año según GOSE 5-8 que IMACM (22,2%) y HIP (33,3%). 6. Conclusiones El estado funcional, según el GOSE al año de seguimiento, fue desfavorable en el 59,3% % de los pacientes. El factor relacionado con un estado funcional desfavorable en los pacientes con IMACM fue la edad superior a 48,5 años y, en el TCE fueron la edad superior a 56,5 años y la craniectomía bifrontal. En los pacientes que sobrevivieron, el estado funcional tendió a ser más favorable en los pacientes con TCE y HSA.1. Introduction The natural evolution of neurocritical pathologies that present with refractory intracranial hypertension (HTIC) is brain herniation. Decompressive craniectomy (CD) is the last therapeutic step to avoid it. 2. Hypothesis DC improves the survival and functional outcome of patients with HTIC refractory to medical treatment. 3. Objectives Main objective: to asses the functional outcome, at one year of follow-up, of patients with refractory HTIC, treated with DC, in the different neurocritical pathologies. Secondary objectives: to asses which factors were related to an unfavorable functional state and which pathology presented the best functional state in the survivors. 4. Material and Methods: Single-center, prospective and observational study (UCI Hospital Germans Trias i Pujol, 2010-2017). Inclusion criteria: Patients with refractory HTEC who required DC. Variables analyzed. Epidemiological variables, treatment and clinical evolution. Main variable. Functional outcome at one year of follow-up. It was assessed using the dichotomized GOSE scale [Unfavorable functional outcome (UFO): GOSE 1-3 and favorable (FFO): GOSE 4-8)] and, using the dichotomized modified Rankin scale (mRS) (UFO: mRs 4-6 and FFO: mRS 0-3). When the functional outcome of the survivors was analyzed, a GOSE 4 was considered as UFO outcome. Sample size calculation. Considering a percentage of unfavorable functional outcome of 75% with medical treatment, a reduction of the same of 14% with DC, assuming an α risk of 5% with bilateral significance and a power of 80%, 93-104 patients will be necessary. Statistical analysis: Descriptive: Percentages with 95% CI for qualitative variables. Medians or means with 95% CI for quantitative variables. Bivariate: Simple logistic regression. Multivariate: Logistic regression and determination of the ROC curve. 5. Results 108 patients were included. Malignant stroke of the middle cerebral artery (MSMCA): 25; Traumatic brain injury (TBI): 30; Subarachnoid hemorrhage (SAH): 19; Supratentorial intraparenchymal hemorrhage (IH): 15; Cerebellar stroke (CS): 4; Cerebellar hemorrhage (CH): 6, tumors: 9. The most frequent CD was the right (48%). 59.3% of all pathologies presented an UFO (GOSE) at one year of follow-up. MSMCA: Men: 52%. Age: :46.5 years. Right CD: 68%. ICU mortality: 16%. UFO: mRS (66.7%) and GOSE (62.4%). The variable related to an UFO was age (RR: 1.2; 95% CI: 1.01-123.7; p= 0.03). TBI: Men: 60%. Age: 32.5 years. CD right: 40%. ICU mortality: 23.3%. UFO: mRS (58.6%) and GOSE (58.6%). The variables related to an UFO were age (RR: 1.09; 95% CI: 1.02-1.118; p=0.015) and bifrontal craniectomy (RR: 14.5; 95% CI: 1.61-30 .66, p=0.017). HSA: Women: 52.6%. Age: 47.2 years. HTA: 58%. HSA Fisher IV: 84.2%, Hunt and Hess 5: 73.7% and secondary to ruptured middle cerebral artery aneurysm (54.6%). UFO: mRS (57.9%) and GOSE (57.9%). The variable related to an UFO was hypertension (RR: 13.5; 95% CI: 1.47 - 123.7; p=0.02). IH: Men: 60%. Age: 44.5 years

From Open Access to Open Data: collaborative work in the university libraries of Catalonia

In the last years, the scientific community and funding bodies have paid attention to collected, generated or used data throughout different research activities. The dissemination of these data becomes one of the constituent elements of Open Science. For this reason, many funders are requiring or promoting the development of Data Management Plans, and depositing open data following the FAIR principles (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable). Libraries and research offices of Catalan universities –which coordinately work within the Open Science Area of CSUC– offer support services to research data management. The different works carried out at the Consortium level will be presented, as well the implementation of the service in each university

FAIR x FAIR. Requisitos factibles, alcanzables e implementables para un repositorio de datos de investigación FAIR

InformeInforme encargado por los vicerrectores de Investigación que forman la Comisión Funcional del área de Ciencia Abierta del CSUC para determinar los requisitos funcionales razonables que debe tener un repositorio de datos para qué cumpla con los requisitos FAIR (Findable, Accessible, Interoperable y Reusable). Además de los requisitos, también se incluyen unas buenas prácticas y unas recomendaciones finales

FAIR x FAIR. Feasible, Affordable and Implementable Requirements for a FAIR research data repository

Report commissioned by the vice-rectors for research who form the Functional Commission of the Open Science Area of CSUC that would determine the feasible functional requirements that a data repository must have in order to comply with the FAIR principles (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable). In addition to the requirements, good practices and final recommendations are also included