Fish and amphibians as bat predators

Although bats (Chiroptera) belong to the most diverse mammalian orders, study of diversity of their natural predators has been seriously neglected for a long time. While some recent reviews contain comprehensive overviews of our recent knowledge on these phenomena for some animal groups, such work is still lacking for anamniotes - fishes and amphibians. Here, I am summarising bat predation incidences by anamniotes that were published in scientific journals and public web domains. I found out that at least 14 species of fishes and 14 species of frogs were observed as feeding on bats. Moreover, 7 and 16 species of bats were recorded as victims of hunting activity of fishes and frogs, respectively. Majority of localised incidences came from the New World; frog (between latitude 49°N to 28°S) attacks were distributed mainly in tropical or subtropical areas < 30° from equator (70% of all records), fish (44°N to 20°S) incidences reach same proportion in colder areas (> 30° from equator) and warmer areas. In some cases, these predators can regularly feed on bats, especially when hunting near roosting places of bats; however, with respect to number of recorded cases (21 for fishes and 37 for amphibians), bat predation by anamniotes seems to be very rare and opportunistic with only very limited influence on bat populations or their behaviour

Laplacian regularized eikonal equation with Soner boundary condition on polyhedral meshes

In this paper, we propose a numerical algorithm based on a cell-centered finite volume method to compute a distance from given objects on a three-dimensional computational domain discretized by polyhedral cells. Inspired by the vanishing viscosity method, a Laplacian regularized eikonal equation is solved and the Soner boundary condition is applied to the boundary of the domain to avoid a non-viscosity solution. As the regularization parameter depending on a characteristic length of the discretized domain is reduced, a corresponding numerical solution is calculated. A convergence to the viscosity solution is verified numerically as the characteristic length becomes smaller and the regularization parameter accordingly becomes smaller. From the numerical experiments, the second experimental order of convergence in the $L^1$ norm error is confirmed for smooth solutions. Compared to solve a time-dependent form of eikonal equation, the Laplacian regularized eikonal equation has the advantage of reducing computational cost dramatically when a more significant number of cells is used or a region of interest is far away from the given objects. Moreover, the implementation of parallel computing using domain decomposition with $1$-ring face neighborhood structure can be done straightforwardly by a standard cell-centered finite volume code

Kenya’s fifth record of Arabian Bustard Ardeotis arabs in Sibiloi National Park

No Abstrac

Individual Professional Practice in the Company

Import 05/08/2014Táto bakalárska práca zhŕňa priebeh mojej bakalárskej praxe vo firme Tieto Czech s.r.o, ktorá poskytuje komplexné služby v oblasti IT pre súkromný i verejný sektor. Podáva základne informácie o kľúčových oblastiach, v ktorých firma pôsobí, popis môjho pracovného zaradenia a prostriedkoch využívaných počas praxe. Tak tiež sú tu uvedené informácie o získaných znalostiach a skúsenostiach.This Bachelor work summarizes the course of my Bachelor practice in the company Tieto Czech sro which provides complex IT services for the private and public sectors. It gives basic information about the key areas in which the company operates, the description of my job position and means used during practice. There are also provides information on acquired knowledge and experience.460 - Katedra informatikyvýborn

Makroekologie a makroevoluce ptačího zpěvu

Ptačí zpěv je jedním z nejúžasnějších zvuků v přírodě, který významným způsobem ovlivnil naše chápaní procesu evoluce od jeho formulace v devatenáctém století. Přes intenzivní vědecký zájem za posledních více než 100 let je naše chápaní ekologie a evoluce ptačího zpěvu na velkých prostorových a fylogenetických škálách značně neúplné. Odpověď na mnohé základné otázky by mohla přinést globální syntéza zahrnující velkou část světové diverzity ptáků a kombinující mezioborový přístup. V předložené disertační práci jsem proto spolu se svými spolupracovníky prozkoumal vzory v makroekologii a makroevoluci zpěvu pěvců (Řád: Passeriformes), které představují nejdiverzifikovanější a nejvíc rozšířený ptačí řád současnosti. Zvláštní pozornost jsme věnovali trojici klíčových zpěvných fenoménů: (1) komplexitě zpěvu, (2) výšce (frekvenci) zpěvu a (3) přítomnosti samičího zpěvu. Abychom vyplnili některé důležité mezery v našem současném poznání, využívali jsme v rámci řešení tohoto projektu "velká data" z volně dostupných databází založených na bázi občanské vědy a ostatních otevřených zdrojů. Tato data byla následně analyzována pomocí kombinace fylogenetických komparativních a prostorových makroekologických analýz. Od publikace Darwinova průkopnického díla jsou komplexní zpěvy obecně považovány za výsledek sexuální...Birdsong is one of the most astounding natural sounds which profoundly shaped our evolutionary thinking since the 19th century. Despite a strong interest in birdsong for over 100 years, our understanding of birdsong ecology and evolution over large spatial and phylogenetic scales is still very fragmentary. Answering many basic questions requires a global synthesis covering vast diversity of extant bird species and adoption of multidisciplinary approaches. In presented dissertation thesis, my co-workers and I have explored important patterns in macroecology and macroevolution of song in passerines (Order: Passeriformes), the most diverse and widespread bird order. We have focused on three key song phenomena: (1) song complexity, (2) song frequency and (3) the presence of song in female birds. We have exploited birdsong "big data" available on public citizen science databases and other open sources in order to fill several important gaps in the current knowledge. These data were analysed by a combination of phylogenetically-informed cross-species analyses and spatial macroecological approaches. Since the publication of Darwin's seminal work, elaborated songs are generally agreed to be the result of sexual selection. We developed a simple but reliable song complexity metric to explore a global diversity in...Department of ZoologyKatedra zoologieFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Image Compression Using Wavelets

Cieľom tejto diplomovej práce je implementácia diskrétnej vlnkovej transformácie ako kompresná metóda pre obrazové dáta. V prvej časti je moţnosť nahliadnuť do problematiky reprezentácie obrazu ako farebných modelov, či základných grafických formátov. Následne si rozoberieme kompresiu obrazu, najznámejšie kompresné metódy, aţ sa dostávame k hlavnej téme tejto práce a to je vlnková transformácia. Tu sú popísane pojmy ako vlnka, z ktorých je najznámejšia Haarová alebo Daubechies, dekompozícia, SPIHT kódovanie či realizácia samotnej vlnkovej transformácie. Taktieţ sme stručne oboznámení so spôsobom hodnotenia kvality výsledného snímku. V poslednej časti sú porovnané jednotlivé vlnky medzi sebou, ich vplyv na kompresiu a pod. Naše dosiahnuté výsledky sme porovnali s formátom JPEG2000 pomocou softwaru Kakadu. Formát JPEG2000 nebol prekonaný.The aim of this diploma thesis is the implementation of discrete wavelet transformation as a compression method for the image data. In the first part, it is possible to look into the problems of image representation as the color models or basic graphic formats. Subsequently, we analyze image compression, the best known compression methods, thus we get to the main theme of this work that is the wavelet transformation. The concepts of wavelet are described here, of which the best known ones are Haar or Daubechies, decomposition, SPIHT coding, or realization of the wavelet transformation itself. Thus we are also briefly acquainted with the way of evaluating the quality of the resulting image. The last part compares the individual ripples between each other, their effect on compression and so on. We have compared our results with JPEG2000 using Kakadu software. The JPEG2000 format has not been overcome.460 - Katedra informatikyvelmi dobř

Makroekologie a makroevoluce ptačího zpěvu

Ptačí zpěv je jedním z nejúžasnějších zvuků v přírodě, který významným způsobem ovlivnil naše chápaní procesu evoluce od jeho formulace v devatenáctém století. Přes intenzivní vědecký zájem za posledních více než 100 let je naše chápaní ekologie a evoluce ptačího zpěvu na velkých prostorových a fylogenetických škálách značně neúplné. Odpověď na mnohé základné otázky by mohla přinést globální syntéza zahrnující velkou část světové diverzity ptáků a kombinující mezioborový přístup. V předložené disertační práci jsem proto spolu se svými spolupracovníky prozkoumal vzory v makroekologii a makroevoluci zpěvu pěvců (Řád: Passeriformes), které představují nejdiverzifikovanější a nejvíc rozšířený ptačí řád současnosti. Zvláštní pozornost jsme věnovali trojici klíčových zpěvných fenoménů: (1) komplexitě zpěvu, (2) výšce (frekvenci) zpěvu a (3) přítomnosti samičího zpěvu. Abychom vyplnili některé důležité mezery v našem současném poznání, využívali jsme v rámci řešení tohoto projektu "velká data" z volně dostupných databází založených na bázi občanské vědy a ostatních otevřených zdrojů. Tato data byla následně analyzována pomocí kombinace fylogenetických komparativních a prostorových makroekologických analýz. Od publikace Darwinova průkopnického díla jsou komplexní zpěvy obecně považovány za výsledek sexuální...Birdsong is one of the most astounding natural sounds which profoundly shaped our evolutionary thinking since the 19th century. Despite a strong interest in birdsong for over 100 years, our understanding of birdsong ecology and evolution over large spatial and phylogenetic scales is still very fragmentary. Answering many basic questions requires a global synthesis covering vast diversity of extant bird species and adoption of multidisciplinary approaches. In presented dissertation thesis, my co-workers and I have explored important patterns in macroecology and macroevolution of song in passerines (Order: Passeriformes), the most diverse and widespread bird order. We have focused on three key song phenomena: (1) song complexity, (2) song frequency and (3) the presence of song in female birds. We have exploited birdsong "big data" available on public citizen science databases and other open sources in order to fill several important gaps in the current knowledge. These data were analysed by a combination of phylogenetically-informed cross-species analyses and spatial macroecological approaches. Since the publication of Darwin's seminal work, elaborated songs are generally agreed to be the result of sexual selection. We developed a simple but reliable song complexity metric to explore a global diversity in...Katedra zoologieDepartment of ZoologyFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Counting number of cells and cell segmentation using advection-diffusion equations

summary:We develop a method for counting number of cells and extraction of approximate cell centers in 2D and 3D images of early stages of the zebra-fish embryogenesis. The approximate cell centers give us the starting points for the subjective surface based cell segmentation. We move in the inner normal direction all level sets of nuclei and membranes images by a constant speed with slight regularization of this flow by the (mean) curvature. Such multi- scale evolutionary process is represented by a geometrical advection-diffusion equation which gives us at a certain scale the desired information on the number of cells. For solving the problems computationally we use flux-based finite volume level set method developed by Frolkovič and Mikula in [FM1] and semi-implicit co-volume subjective surface method given in [CMSSg, MSSgCVS, MSSgchapter]. Computational experiments on testing and real 2D and 3D embryogenesis images are presented and the results are discussed