Software assembly and open standards for driving simulation

International audienceDriving simulation systems involve a combination of different computation codes. Although some of these modules are application-specific, their majority is reusable and state-of-the-art implementations are readily available in the open source community. This study investigates whether these open source libraries can combine to build a driving simulation application with reasonable performance. To this end, a component-oriented architecture is proposed, in which modules encapsulate relevant libraries behind a standard interface and exchange simulation data through a message passing interface. By integrating a render engine, a physics library and a simple vehicle dynamics model, we were able to rapidly build a functional minimal simulation application supporting distributed execution over a cluster of computers. As this architecture allows the transparent modification of module code and simplifies the addition of new modules, this kernel represents the foundations of an extensible and reconfigurable open source system dedicated to driving simulation. Details on this kernel application and ongoing development of this platform can found at http://open-s.sourceforge.net.Les logiciels de simulation de conduite reposent sur une combinaison de différents codes de calculs. Bien qu’une partie de ces modules soit extrêmement dépendante d’un usage particulier, leur majorité est réutilisable et certaines implémentations de pointe sont disponibles dans la communauté du logiciel libre. Cette étude vise à déterminer s’il est possible de combiner ces bibliothèques libres afin de construire une application de simulation de conduite atteignant de raisonnables performances. A cette fin, nous proposons une architecture orientée composant, selon laquelle ces bibliothèques sont encapsulées dans des modules s’échangeant des données relatives à la simulation au travers d’une interface d’échange de messages. En intégrant à cette architecture un moteur graphique, une bibliothèque de simulation de physique et un simple modèle de dynamique de véhicule, nous avons pu rapidement mettre en place une application de simulation minimale, pouvant s’exécuter de manière distribuée sur un cluster d’ordinateurs. Cette architecture permettant de modifier le code d’un module de manière transparente et simplifiant l’ajout de nouveaux modules, ce noyau constitue la base d’un logiciel libre extensible et polymorphique dédié à la simulation de conduite dont les détails peuvent être consultés sur le site : http://open-s.sourceforge.net

Software assembly and open standards for driving simulation

Driving simulation systems involve a combination of different computation codes. Although some of these modules are application-specific, their majority is reusable and state-of-the-art implementations are readily available in the open source community. This study investigates whether these open source libraries can combine to build a driving simulation application with reasonable performance. To this end, a component-oriented architecture is proposed, in which modules encapsulate relevant libraries behind a standard interface and exchange simulation data through a message passing interface. By integrating a render engine, a physics library and a simple vehicle dynamics model, we were able to rapidly build a functional minimal simulation application supporting distributed execution over a cluster of computers. As this architecture allows the transparent modification of module code and simplifies the addition of new modules, this kernel represents the foundations of an extensible and reconfigurable open source system dedicated to driving simulation. Details on this kernel application and ongoing development of this platform can found at http://open-s.sourceforge.net.Les logiciels de simulation de conduite reposent sur une combinaison de différents codes de calculs. Bien qu’une partie de ces modules soit extrêmement dépendante d’un usage particulier, leur majorité est réutilisable et certaines implémentations de pointe sont disponibles dans la communauté du logiciel libre. Cette étude vise à déterminer s’il est possible de combiner ces bibliothèques libres afin de construire une application de simulation de conduite atteignant de raisonnables performances. A cette fin, nous proposons une architecture orientée composant, selon laquelle ces bibliothèques sont encapsulées dans des modules s’échangeant des données relatives à la simulation au travers d’une interface d’échange de messages. En intégrant à cette architecture un moteur graphique, une bibliothèque de simulation de physique et un simple modèle de dynamique de véhicule, nous avons pu rapidement mettre en place une application de simulation minimale, pouvant s’exécuter de manière distribuée sur un cluster d’ordinateurs. Cette architecture permettant de modifier le code d’un module de manière transparente et simplifiant l’ajout de nouveaux modules, ce noyau constitue la base d’un logiciel libre extensible et polymorphique dédié à la simulation de conduite dont les détails peuvent être consultés sur le site : http://open-s.sourceforge.net

Priority use cases for antibody-detecting assays of recent malaria exposure as tools to achieve and sustain malaria elimination

Measurement of malaria specific antibody responses represents a practical and informative method for malaria control programs to assess recent exposure to infection. Technical advances in recombinant antigen production, serological screening platforms, and analytical methods have enabled the identification of several target antigens for laboratory based and point-of-contact tests. Questions remain as to how these serological assays can best be integrated into malaria surveillance activities to inform programmatic decision-making. This report synthesizes discussions from a convening at Institut Pasteur in Paris in June 2017 aimed at defining practical and informative use cases for serology applications and highlights five programmatic uses for serological assays including: documenting the absence of transmission; stratification of transmission; measuring the effect of interventions; informing a decentralized immediate response; and testing and treating P. vivax hypnozoite carriers

Natalizumab treatment shows low cumulative probabilities of confirmed disability worsening to EDSS milestones in the long-term setting.

Abstract Background Though the Expanded Disability Status Scale (EDSS) is commonly used to assess disability level in relapsing-remitting multiple sclerosis (RRMS), the criteria defining disability progression are used for patients with a wide range of baseline levels of disability in relatively short-term trials. As a result, not all EDSS changes carry the same weight in terms of future disability, and treatment benefits such as decreased risk of reaching particular disability milestones may not be reliably captured. The objectives of this analysis are to assess the probability of confirmed disability worsening to specific EDSS milestones (i.e., EDSS scores ≥3.0, ≥4.0, or ≥6.0) at 288 weeks in the Tysabri Observational Program (TOP) and to examine the impact of relapses occurring during natalizumab therapy in TOP patients who had received natalizumab for ≥24 months. Methods TOP is an ongoing, open-label, observational, prospective study of patients with RRMS in clinical practice. Enrolled patients were naive to natalizumab at treatment initiation or had received ≤3 doses at the time of enrollment. Intravenous natalizumab (300 mg) infusions were given every 4 weeks, and the EDSS was assessed at baseline and every 24 weeks during treatment. Results Of the 4161 patients enrolled in TOP with follow-up of at least 24 months, 3253 patients with available baseline EDSS scores had continued natalizumab treatment and 908 had discontinued (5.4% due to a reported lack of efficacy and 16.4% for other reasons) at the 24-month time point. Those who discontinued due to lack of efficacy had higher baseline EDSS scores (median 4.5 vs. 3.5), higher on-treatment relapse rates (0.82 vs. 0.23), and higher cumulative probabilities of EDSS worsening (16% vs. 9%) at 24 months than those completing therapy. Among 24-month completers, after approximately 5.5 years of natalizumab treatment, the cumulative probabilities of confirmed EDSS worsening by 1.0 and 2.0 points were 18.5% and 7.9%, respectively (24-week confirmation), and 13.5% and 5.3%, respectively (48-week confirmation). The risks of 24- and 48-week confirmed EDSS worsening were significantly higher in patients with on-treatment relapses than in those without relapses. An analysis of time to specific EDSS milestones showed that the probabilities of 48-week confirmed transition from EDSS scores of 0.0–2.0 to ≥3.0, 2.0–3.0 to ≥4.0, and 4.0–5.0 to ≥6.0 at week 288 in TOP were 11.1%, 11.8%, and 9.5%, respectively, with lower probabilities observed among patients without on-treatment relapses (8.1%, 8.4%, and 5.7%, respectively). Conclusions In TOP patients with a median (range) baseline EDSS score of 3.5 (0.0–9.5) who completed 24 months of natalizumab treatment, the rate of 48-week confirmed disability worsening events was below 15%; after approximately 5.5 years of natalizumab treatment, 86.5% and 94.7% of patients did not have EDSS score increases of ≥1.0 or ≥2.0 points, respectively. The presence of relapses was associated with higher rates of overall disability worsening. These results were confirmed by assessing transition to EDSS milestones. Lower rates of overall 48-week confirmed EDSS worsening and of transitioning from EDSS score 4.0–5.0 to ≥6.0 in the absence of relapses suggest that relapses remain a significant driver of disability worsening and that on-treatment relapses in natalizumab-treated patients are of prognostic importance

Approches de

La maladie de Huntington est une maladie neurodégénérative rare causée par une expansion pathologique de triplets CAG sur le premier exon du gène codant pour la huntingtine (HTT). La formation d’agrégats de HTT ainsi qu’une modification pathologique de la fonction de la protéine, sont à l’origine de symptômes moteurs, cognitifs et psychiatriques causant la mort du patient en 15 à 20 ans. Il n’existe actuellement aucun traitement de la maladie de Huntington. Des études expérimentales de stratégies médicamenteuses, cellulaires et géniques sont en développement ou en essai clinique. Parmi celles-ci, les approches basées sur le blocage de l’expression de la HTT mutée par des petites séquences d’acides nucléiques non codants montrent d’importants bénéfices thérapeutiques dans des modèles expérimentaux de la maladie

Traitement chirurgical par ostéosynthèse par plaque verrouillée des fractures malléolaires latérales (résultats préliminaires d'une étude rétrospective de 25 cas)

Les fractures de la pince malléolaire font parties des fractures les plus fréquentes. Quand l'indication chirurgicale est posée, elles nécessitent le plus souvent une réduction anatomique à foyer ouvert avec ostéosynthèse de la malléole latérale à l'aide d'une plaque standard type 1/3 de tube. Depuis quelques années est apparu le concept de plaque verrouillée et certains ont élargi les indications aux fractures malléolaires latérales notamment celles du sujet âgé. Ce travail a pour but d'évaluer les résultats cliniques à moyen terme et les éventuelles complications liées à l'utilisation des plaques verrouillées dans l'ostéosynthèse des fractures malléolaires latérales. Il s'agissait d'une série rétrospective bi-opérateurs de 25 patients ayant bénéficié d'une ostéosynthèse par plaque verrouillée pour toute fracture malléolaire latérale et revus avec un recul moyen de 20 mois. Les patients ont été évalués cliniquement et sur le score fonctionnel de Olerud et Molander. Parmi les 25 patients, il n'a été déploré que 2 complications infectieuses, une profonde et une superficielle, la gêne causée par le matériel s'avérant la principale plainte des patients. Les résultats cliniques étaient relativement bons, notamment chez les patients ayant pu bénéficier d'une rééducation précoce à 4 semaines, avec un score moyen de Olerud et Molander de 79,8 pour une moyenne d'âge de 59 ans. Malgré un rapport cout-efficacité qui parait être en leurs défaveurs, les plaques verrouillées semblent désormais faire parties de l'arsenal thérapeutique des fractures malléolaires latérales notamment chez le sujet ostéoporotique sans état cutané précaire mais cela est à confirmer par des études comparatives à plus grande échelle.POITIERS-BU Médecine pharmacie (861942103) / SudocSudocFranceF

Machine vision system for surface inspection on brushed industrial

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Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity among Plasmodium berghei sporozoites

International audienceIn the malaria-causing parasite's life cycle, Plasmodium sporozoites must travel from the midgut of a mosquito to the salivary glands before they can infect a mammalian host. However, only a fraction of sporozoites complete the journey. Since salivary gland invasion is required for transmission of sporozoites, insights at the molecular level can contribute to strategies for malaria prevention. Recent advances in single-cell RNA sequencing provide an opportunity to assess sporozoite heterogeneity at a resolution unattainable by bulk RNA sequencing methods. In this study, we use a droplet-based single-cell RNA sequencing workflow to analyze the transcriptomes of over 8000 Plasmodium berghei sporozoites derived from the midguts and salivary glands of Anopheles stephensi mosquitoes. The detection of known marker genes confirms the successful capture and sequencing of samples composed of a mixed population of sporozoites. Using data integration, clustering, and trajectory analyses, we reveal differences in gene expression profiles of individual sporozoites, and identify both annotated and unannotated markers associated with sporozoite development. Our work highlights the utility of a high-throughput workflow for the transcriptomic profiling of Plasmodium sporozoites, and provides new insights into gene usage during the parasite's development in the mosquito

Synaptic scaling up in medium spiny neurons of aged BACHD mice: A slow-progression model of Huntington's disease

International audienc