A Disease With Many Faces

Can you diagnose this man with progressively worsening shortness of breath, mucous productive cough, weight loss, fatigue and a history of suspected pulmonary tuberculosis? http://bit.ly/2VUdnTr.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Descrição de uma forma autossômica dominante de síndrome de Kabuki por mutação no gene MLL2

Aims: Although there are more than 400 cases of Kabuki syndrome described in the literature, it is believed that this syndrome is under-diagnosed. Most cases occur sporadically, despite cases with autosomal dominant familial transmission being described. Here we describe three cases identified in the same family. Cases description: A family (mother and two children) was diagnosed with Kabuki syndrome. The three patients show the typical characteristics (facial appearance, musculoskeletal abnormalities, cognitive impairment, growth retardation and peculiar dermatoglyphic pattern) associated with other anomalies described in the syndrome (congenital heart disease and increased susceptibility to infections). Genetic studies revealed a nonsense mutation c.14710 C > T (p.Arg4904X) in the MLL2 gene in the three members of the family. Conclusions: With the description of another case of familial Kabuki syndrome, the authors wish to illustrate the autosomal dominant inheritance with variable expressivity, which are present in this situation, and to alert to the need for a rigorous clinical and molecular evaluation of the affected patient’s relatives, allowing appropriate genetic counseling

Mycobacterium bovis: polymerase chain reaction identification in bovine Lymphonode biopsies and genotyping in isolates from Southeast Brazil by spolygotyping and restriction fragment length polymorphism

Diagnosis of the Mycobacterium tuberculosis complex by direct PCR of mediastinal lymphnode DNA and microbiological tests were compared in cattle suspicious of bearing tuberculous-like lesions detected during slaughter. The PCR procedure applied on DNA samples (n=54) obtained by adding alpha -casein into the thiocyanate extraction mix was positive in 70% of the samples. PCR confirmed the identification of 23 samples (100%) that grew in culture, 9 samples (60%) that failed to grow in culture, plus 6 (37.5%) samples that resulted in growth of bacterial contaminants. Genotyping by IS6110-RFLP and DR-spoligotyping analysis of seven samples revealed the presence of several polimorphisms. Seven of the isolates contained multiple copies of IS6110, thus defining the existence of five singular genotypes.ICB Departamento de Bioquímica e Imunologia Laboratório de Biologia Molecular de Produtos NaturaisUniversidade Federal de Minas Gerais ICB Escola de VeterináriaUniversidade Federal de Minas Gerais ICB Departamento de FarmacologiaEscola Paulista de Medicina Departamento de Microbiologia e ParasitologiaLaboratório Central do Estado do Espírito SantoInstituto Biológico de São PauloCentro de Investigación en Ciencias Veterinarias Instituto de BiotecnologiaUNIFESP, EPM, Depto. de Microbiologia e ParasitologiaSciEL

Validity of Sit-And-Reach with Plantar Flexion Test in Children Aged 10-12 Years

El principal objetivo del presente estudio fue examinar la validez de criterio de los tests sit-and-reach clásico (SRC) y sit-and-reach con flexión plantar (SRF) para estimar la extensibilidad de la musculatura isquiosural en niños. Un total de 72 escolares (40 niños y 32 niñas) de 10-12 años de edad realizaron los tests lineales SRC y SRF, y el test criterio de medida elevación pasiva de la pierna recta. Los resultados de la correlación de Pearson (r) mostraron moderados valores de asociación de los tests SRC y SRF con la extensibilidad isquiosural (r = 0,71 y r = 0,74, ps < 0,01, respectivamente). Los valores de validez de criterio encontrados para el SRF fueron mayores que para el SRC, excepto para las niñas en el que fueron similares. Los hallazgos del presente estudio sugieren que la evaluación de la extensibilidad de la musculatura isquiosural mediante el test sit-and-reach debería realizarse permitiendo la flexión plantar.The main purpose of this study was to examine the criterion-related validity of classic sit-and-reach (CSR) and sit-and-reach with plantar flexion (SRF) tests for estimating hamstring extensibility in children. A total of 72 students (40 boys and 32 girls) aged 10-12 years performed the lineal tests CSR and SRF, and the criteria measure passive straight-leg raise test. Pearson´s correlation (r) results showed moderate values ​​of association between CSR and SRF with hamstring extensibility (r = 0.71 and r = 0.74, ps < 0.01, respectively). Criterion-related validity ​​values found for SRF were greater than for the CSR, except for the girls where the values were similar. The findings of this study suggest that the assessment of hamstring flexibility by sit-and-reach test should be performed allowing plantar flexion.El primer autor recibe una ayuda del programa de Formación del Profesorado Universitario (FPU) del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte (AP2010-5905)

Human paraoxonase gene polymorphisms and coronary artery disease risk.

Introdução: As doenças complexas como a doença das artérias coronárias (DAC), a hipertensão e a diabetes, são usualmente causadas pela susceptibilidade individual a múltiplos genes, factores ambientais e pela interacção entre eles. As enzimas da paraoxonase humana (PON), particularmente a PON1, têm sido implicadas na patogenia da aterosclerose e da DAC. Dois polimorfismos comuns na região codificante do gene, com substituição Glutamina (Q) /Arginina (R) na posição 192 e Leucina /Metionina na posição 55 influenciam a actividade da PON1. Vários estudos têm investigado a associação entre os polimorfismos da PON1 e a DAC, com resultados contraditórios. Objectivo: 1- Avaliar a associação dos polimorfismos da PON1 com o risco de DAC. 2-Estudar a interacção destes polimorfismos com outros situados em genes candidatos diferentes, na susceptibilidade para o aparecimento da DAC. Material e Métodos: Estudámos em 298 doentes coronários e 298 controlos saudáveis, através de um estudo caso/controlo, o risco de DAC associado aos polimorfismos da PON1, 192Q/R e 55L/M. Numa segunda fase avaliámos o risco das interacções polimórficas PON1 192 RR + MTHFR 1298 AA; PON1 192 R/R + ECA DD; PON1 192 R/R + ECA 8 GG. Finalmente construímos um modelo de regressão logística (no qual entraram todas as variáveis genéticas, ambientais e bioquímicas, que tinham mostrado significância estatística na análise univariada), para determinar quais as que se relacionavam de forma significativa e independente com DAC. Resultados: Verificámos que o genótipo PON1 55 MM tinha uma distribuição superior na população doente mas não atingia significância estatística como factor de risco para DAC. O PON1 199 RR apresentou um risco relativo 80% superior relativamente à população que o não possuía (p=0,04). A interacção da PON1 192 RR e da MTHFR 1298 AA, polimorfismos sedeados em genes diferentes, apresentou um risco relativo de DAC de 2,76 (OR=2,76;IC=1,20- 6,47; P=0,009), bastante superior ao risco de cada polimorfismo isolado, assim como a associação da PON1 RR + ECA DD (com polimorfismos também sedeados em genes diferentes), que apresentou um risco 337% superior relativamente aos que não possuíam esta associação (OR=4,37;IC=1,47- 13,87; P=0,002). Da mesma forma a associação entre a PON1 RR e ECA 8 GG, revelou um risco ainda mais elevado (OR=6;23; IC=1,67- 27,37; P<0,001). Após modelo de Regressão Logística as variáveis que ficaram na equação representando factores de risco significativos e independentes para DAC, foram os hábitos tabágicos, doença familiar, diabetes, fibrinogénio, Lp (a) e a associação PON1 192 RR + ECA 8 GG. Esta última associação apresentou, na regressão logística, um OR=14,113; p=0,018 Conclusões: O genótipo PON1 192 RR apresentou, se avaliado isoladamente, um risco relativo de DAC 80% superior relativamente à população que não possuía este genótipo. A associação deste polimorfismo com outros polimorfismos sedeados em genes diferentes, codificando para diferentes enzimas e pertencendo a sistemas fisiopatológicos distintos (MTHFR1298 AA, ECA DD e ECA 8 GG), aumentou sempre o risco de eclosão da DAC. Após correcção para os outros factores de risco clássicos e bioquímicos, a associação PON1 192 RR + ECA 8 GG, continuou a ser um factor de risco significativo e independente para CAD.BACKGROUND: Complex diseases such as coronary artery disease (CAD), hypertension and diabetes are usually caused by individual susceptibility to multiple genes, environmental factors, and the interaction between them. The paraoxonase 1 (PON1) enzyme has been implicated in the pathogenesis of atherosclerosis and CAD. Two common polymorphisms in the coding region of the PON1 gene, which lead to a glutamine (Q)/arginine (R) substitution at position 192 and a leucine (L)/methionine (M) substitution at position 55, influence PON1 activity. Studies have investigated the association between these polymorphisms and CAD, but with conflicting results. AIMS: 1) To evaluate the association between PON1 polymorphisms and CAD risk; and 2) to study the interaction between PON1 polymorphisms and others in different candidate genes. METHODS: We evaluated the risk of CAD associated with PON1 Q192R and L55M polymorphisms in 298 CAD patients and 298 healthy individuals. We then evaluated the risk associated with the interaction of the PON1 polymorphisms with ACE DD, ACE 8 GG and MTHFR 1298AA. Finally, using a logistic regression model, we evaluated which variables (genetic, biochemical and environmental) were linked significantly and independently with CAD. RESULTS: We found that the PON1 55MM genotype was more common in the CAD population, but this did not reach statistical significance as a risk factor for CAD, while PON1 192RR presented an 80% higher relative risk compared to the population without this polymorphism. The interaction between PON1 192RR and MTHFR 1298AA, sited in different genes, increased the risk for CAD, compared with the polymorphisms in isolation (OR=2.76; 95% CI=1.20-6.47; p=0.009), as did the association of PON1 192RR with ACE DD, which presented a 337% higher risk compared to the population without this polymorphic association (OR=4.37; 95% CI=1.47-13.87; p=0.002). Similarly, the association between PON1 192RR and ACE 8 GG was linked to an even higher risk (OR=6.23; 95% CI=1.67-27.37; p<0.001). After logistic regression, smoking, family history, fibrinogen, diabetes, Lp(a) and the association of PON1 192RR + ACE 8 GG remained in the regression model and proved to be significant and independent risk factors for CAD. In the regression model the latter association had OR=14.113; p=0.018. CONCLUSION: When analyzed separately, the PON1 192RR genotype presented a relative risk for CAD 80% higher than in the population without this genotype. Its association with other genetic polymorphisms sited in different genes, coding for different enzymes and belonging to different physiological systems, always increased the risk for CAD. After correction for other conventional and biochemical risk factors, the PON1 192RR + ACE 8 GG association remained a significant and independent risk factor for CAD.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Gene-gene interaction affects coronary artery disease risk.

Introdução: Existem vários estudos que comparam doentes coronários e controlos, no sentido de determinar quais os polimorfismos que apresentam risco acrescido de doença das artérias coronárias (DC). Os seus resultados têm sido muitas vezes contraditórios, mas apresentam uma limitação suplementar: avaliam os polimorfismos um a um, quando na natureza os polimorfismos não existem isolados. Põe-se a questão se serão mais importantes associações de polimorfismos mutados no mesmo gene ou em genes diferentes. Objectivo: Com o presente trabalho pretendemos avaliar o risco da associação de polimorfismos em termos de aparecimento de DC no mesmo gene ou em genes diferentes. Metodologia: Estudámos em 298 doentes coronários e 298 controlos sãos o risco associado aos polimorfismos (genótipos considerados de risco), DD da Enzima de Converaão da Angiotensina (ECA) I/D; GG da ECA 8, MM do Angiotensinogénio (AGT) 174; TT do AGT 235; TT da Metiltetrahidrofolato Reductase (MTHFR) 677; AA da MTHFR 1298;RR da Paraoxonase1 (PON1) 192 e MM da PON1 55. Posteriormente avaliámos o risco ligado às associações no mesmo gene (DD da ECA + GG da ECA 8; MM do AGT174 + TT do AGT 235; TT da MTHFR 677 + AA da MTHFR 1298). Finalmente, nos polimorfismos que isoladamente apresentavam significância, avaliámos o risco das associações de polimorfismos a níveis funcionais diferentes (ECA + AGT; ECA + MTHFR; ECA + PON1. Finalmente através de um modelo de regressão logística fomos determinar quais as variáveis que se relacionavam de forma significativa e independente com a DC. Resultados: Os polimorfismos isolados como: ECA DD [P<0.0001], ECA 8 GG [P=0,023], e MTHFR 1298 AA [P=0,049]), apresentaram uma frequência mais elevada nos casos, associando-se de forma significativa ao grupo com DC. A associação de polimorfismos no mesmo gene não teve efeito sinergístico ou aditivo e não aumentou o risco de DC. A associação polimórfica em genes diferentes aumentou o risco de DC quando comparada com o risco do polimorfismo isolado. No caso da associação da ECA DD ou ECA 8 GG com a PON1 192 RR, o risco quadruplicou (OR passou de 1,8 para 4,2). Após regressão logística o hábito tabágico, a história familiar, o fibrinogénio, diabetes, a associação ECA DD ou ECA 8 GG com a MTHFR 1298 AA e a interacção ECA DD ou ECA 8 GG com a PON1 192 RR permaneceram na equação, mostrando ser factores de risco independente para DC. Conclusões: A associação de polimorfismos mutados no mesmo gene nunca aumentou o risco do polimorfismo isolado. A associação com interacção de polimorfismos mutados em genes diferentes, pertencentes a sistemas fisiopatológicos e enzimáticos diferentes, esteve sempre associada a maior risco do que cada polimorfismo por si. Este trabalho levanta, pela primeira vez, a possibilidade de tentativa de compreensão do risco genético coronário em conjunto e não de cada polimorfismo por si.INTRODUCTION: Various studies have compared coronary artery disease (CAD) patients with controls in order to determine which polymorphisms are associated with a higher risk of disease. The results have often been contradictory. Moreover, these studies evaluated polymorphisms in isolation and not in association, which is the way they occur in nature. OBJECTIVE: Our purpose was to evaluate the risk of CAD in patients with associated polymorphisms in the same gene or in differen genes. METHODS: We evaluated the risk associated with ACE DD, ACE 8 CC, ACT 174MM, AGT 235TT, MTHFR 677TT, MTHFR 1298AA, PON1 192RR and PON1 55MM in 298 CAD patients and 298 healthy individuals. We then evaluated the risk of associated polymorphisms in the same gene (ACE DD + ACE 8GG; AGT 174MM + AGT 235TT; MTHFR 677TT + MTHFR 1298AA). Finally, for the isolated polymorphisms which were significant, we evaluated the risk of polymorphism associations at different functional levels (ACE + AGT; ACE + MTHFR; ACE + PON1). Multiple logistic regression was used to identify independent risk factors for CAD. RESULTS: Isolated polymorphisms including ACE DD(p < 0.0001), ACE 8 gg (p=0.023), and MTHFR 1298AA (p = 0.049) presented with a significantly higher frequency in the CAD group. An association of polymorphisms in the same gene did not have an additive or synergistic effect, nor did it increase the risk of CAD. Polymorphic associations in different genes increased the risk of CAD, compared with the isolated polymorphisms. The association of ACE DD or ACE 8 GG with PON1 192RR increased the risk of CA fourfold (1.8 to 4.2). After logistic regression analysis, current smoking, family history, fibrinogen, diabetes, and the ACE DD or ACE 8 GG + MTHFR 1298AA and ACE DD or ACE 8 GG + PON1 192RR associations remained in the, model and proved to be independent predictors of CAD. CONCLUSIONS: The association of polymorphisms in the same gene did not increase the risk of the isolated polymorphism. The association of polymorphisms in genes belonging to different enzyme systems was always linked to increased risk compared to the isolated polymorphisms. This study may contribute to a better understanding of overall genetic risk for CAD rather than that associated with each polymorphism in isolation.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

A Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems: Computational Creativity Evaluation Based on What it is to be Creative

Computational creativity is a flourishing research area, with a variety of creative systems being produced and developed. Creativity evaluation has not kept pace with system development with an evident lack of systematic evaluation of the creativity of these systems in the literature. This is partially due to difficulties in defining what it means for a computer to be creative; indeed, there is no consensus on this for human creativity, let alone its computational equivalent. This paper proposes a Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems (SPECS). SPECS is a three-step process: stating what it means for a particular computational system to be creative, deriving and performing tests based on these statements. To assist this process, the paper offers a collection of key components of creativity, identified empirically from discussions of human and computational creativity. Using this approach, the SPECS methodology is demonstrated through a comparative case study evaluating computational creativity systems that improvise music

Importância da genotipagem na terapêutica transfusional de doentes com drepanocitose

Introdução A drepanocitose é uma hemoglobinopatia autossómica recessiva com uma incidência na população portuguesa de 0,32%. A História, associada à actual imigração de países africanos de língua portuguesa, deram origem a alguns “hot spots” de portadores no centro e sul do país e à considerável incidência da drepanocitose. A fenotipagem alargada tem sido utilizada para transfundir com segurança os doentes com drepanocitose, prevenindo a aloimunização e as reacções transfusionais hemolíticas. Nos últimos anos, contudo, vários estudos demonstraram a importância da genotipagem na transfusão destes doentes. O fenótipo Fy(a-b-), comum em Africanos e raro noutras populações, na maioria dos casos tem como origem genética, uma mutação no promotor do gene FYB (FY*null01), que impede a transcrição do antigénio Fyb nos glóbulos vermelhos mas mantêm intacta a sua expressão noutros tecidos. Assim, sempre que se detecta essa mutação, o doente pode ser transfundido com sangue Fyb+ sem risco de imunização Objectivo Estudo molecular dos drepanocíticos relativamente aos principais antigénios dos Sistemas Kell, Kidd e Duffy para transfundir com maior segurança evitando a aloimunização. Métodos Foram genotipados 21 drepanocíticos politransfundidos durante o ano de 2014, com o Kit KKD-Type BAGHealthcare, Alemanha. Os doentes eram todos Afro-Portugueses, 13 mulheres e 8 homens, com idades entre os 2 e os 30 anos de idade. Resultados Os resultados serológicos dos fenótipos Kell, Kidd e Duffy foram confirmados pelos estudos moleculares. No Sistema Duffy foram identificados 3 fenótipos e a genotipagem revelou a presença de FY*null01 em 19 doentes (90%), sendo a maioria destes Fy(a-b-) (17 - 89,5%) e os restantes Fy(a+b-) (2-10,5%). Conclusão A genotipagem demonstrou ser importante para a selecção mais adequada de Concentrados Eritrocitários (CEs), evitando a aloimunização em doentes drepanocíticos. Os resultados demonstraram que 90% dos doentes drepanocíticos estudados possuíam a mutação no promotor do gene FYB, tornando possível a transfusão de CEs Fyb+ a doentes com os fenótipos Fy(a-b-) e Fy(a+b-). Esta característica permitiu-nos aumentar a base de dadores compatíveis com estes doentes pois a incidência de dadores Fy(a-b-) é muito baixa na nossa população