Proteomic analysis in nasopharyngeal carcinoma

Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a particular type of head and neck cancer with a strong ethnic and enigmatic epidemiology that long puzzles the scientific society. Despite present all over the world, around 80% of all cases are in Asia where it is endemic, followed by low incidence regions in all other continents. Portugal has the second incidence in Europe for women, and third for men (Globocan 2012) among all European countries. Many efforts have been made to clarify and understand this unique geographic and epidemiologic distribution. The onset and evolution of nasopharyngeal carcinoma is a complex multi-stage process and may take a long time to occur. Although the molecular basis remains uncertain, we know that environmental factors, Epstein-Barr virus (EBV) infection and genetic susceptibility are considered to be the three major contributors. Further examination of these genes’ expression in each tumor revealed that around 93 oncogenes are up regulated in each tumor, while the mean number of TSGs down regulated was 109. In Portugal, the works of Souza & Breda have identified important polymorphism markers that may play a role in the onset and NPC development on the Portuguese northern region population. Despite the efforts made, the molecular mechanisms of NPC carcinogenesis and progression remains to be understood. In this regard, current omics methodologies offer a different approach to identify unique miRNAs and proteins that expression signatures associated with the cancer phenotype, reflecting the biological and pathological grade of the disease. Thus, the discovery of useful NPC biomarkers will lead to new diagnostic and prognostic tools. Meanwhile, the treatment of NPC has evolved in the past two decades. Since 2000, intensity modulated radiation therapy (IMRT) has been widely used to treat nasopharyngeal carcinoma. IMRT provides better dose delivery to the target while sparing the surrounding normal tissues while local control reaches 98% at 4 years24-28. At least one prospective randomized controlled trial showed its benefit in salivary protection in HNC. However, despite the excellent local control, 43% of patients will develop distant metastasis before 5 years and die25-26. In Portugal, IMRT is used at the Instituto Português de Oncologia de Lisboa (IPOLFG) since 2009 and represents the current standard of care for HNC RT, including NPC. Until now, several prognostic markers were identified and investigated for screening, and prognostic tools for NPC, have been purposed, particularly in Asia. However, to our knowledge, there are no validated identified markers to predict distant metastasis or outcome. Moreover, the studies exploring this subject have identified a population-based variety of biomarkers stressing an omic translation of NPC ethnic distribution. At the present work, this research explored formalin-fixed paraffin-embedded samples of biopsied nasopharyngeal carcinoma tumors via proteomic analysis. The aim is to describe a tumor profiling from the studied cohort and discover biomarkers to predict distant metastasis. Secondary endpoints are the discovery of biomarkers related to tumor radioresistance and treatment toxicity. Label-free quantitative mass spectrometry was able to identify 12 up-regulated proteins on early-stage primary tumors that were not present on advanced-stage primaries. Moreover, EBV and HSV co-infection was detected. No signs of HPV-related proteins were seen. Although the clinical outcomes of early and advanced primary tumors were identical, this can be attributed to the known effectiveness of intensive chemoradiation. Moreover, the difference in tumor profiling may reflect that those earlystage tumors could benefit from de-escalation protocols. We were able to detect the presence of a pool of 10 proteins related to distant metastases. Among them, the significant presence of interferon and tyrosine kinase proteins generates the hypothesis that they may represent therapeutic targets. Validation is needed.O carcinoma da nasofaringe (NPC) é um tipo particular de cancro da cabeça e pescoço com um epidemiologia enigmática e forte cariz étnico que há muito intriga a comunidade científica. Apesar de presente em todo o mundo, 805 dos casos encontram-se na Ásia, onde é endémico, seguido de regiões de media e baixa incidência em todos os outros continentes. Portugal tem a segunda incidência em mulheres e a terceira em homens dentre todos os países da Europa (Globocan 2012). Muitos esforços foram realizados para esclarecer e compreender esta distribuição epidemiológica e geográfica. A instalação e evolução do NPC é um processo com múltiplas fases e pode demorar um longo período de tempo para ocorrer. Apesar da base molecular da sua origem permanecer incerta, sabe-se que factores ambientais, a infecção pelo vírus Epstein-Barr e a susceptibilidade genética do hospedeiro são os três maiores contribuidores. Análise aprofundada da expressão genética revelou que cerca de 93 oncogenes estão sobre regulados enquanto que o número médio de genes supressores de tumor down regulated é de cerca de 109. Em Portugal, o trabalho de Souza & Breda identificaram um importante marcador de polimorfismo que pode estar relacionado com a instalação do NPC na população portuguesa na região norte. À despeito dos esforços realizados, o mecanismo molecular da carcinogênese do NPC e sua progressão permanecem por ser esclarecidos. A este respeito, as actuais tecnologias de ômica oferecem uma abordagem diferente capaz de identificar miRNAs e proteínas únicos que expressam assinatura com um fenótipo do cancro, refletindo o grau biológico e patológico da doença. Assim, a descoberta de biomarcadores úteis levará a novas ferramentas prognósticas. Ao mesmo tempo, o tratamento do NPC evoluiu consideravelmente nas últimas duas décadas. Desde 2000, a radioterapia com intensidade modulada do feixe (IMRT) tem sido amplamente utilizada para o tratamento do carcinoma da nasofaringe. IMRT fornece melhor entrega da dose ao alvo enquanto poupa os tecidos adjacentes sadios ao mesmo tempo que o controlo local alcança 98% aos 4 anos (Lee et al, 2002). Pelo menos uma meta-análise demonstrou o benefício na capacidade de proteção salivar em carcinomas da cabeça e pescoço. Entretanto, apesar do excelente controlo local, até 43% dos doentes vão morrer devido às metástases à distância antes dos 5 anos. Em Portugal, IMRT é utilizada no Instituto Português de Oncologia de Lisboa (IPOLFG) desde 2009 e representa o actual estado da arte no tratamento da maioria dos carcinomas da cabeça e pescoço incluindo NPC. Até o momento, diversos marcadores prognósticos de NPC foram propostos, particularmente na Ásia. Contudo, até o momento não são utilizados marcadores validades para predizer metástases ou evolução do doente. Estudos avaliando esta questão identificaram uma população variada de biomarcadores distintos a outras regiões geográficas, ressaltando a diversidade étnica da população dos doentes com NPC. Neste trabalho, esta pesquisa explorou amostras de carcinoma da nasofaringe provenientes de biopsias fixadas em formalina e embebidas em parafina através de análise proteómica. O objectivo é descrever o perfil tumoral da coorte estudada e descobrir biomarcadores capazes de predizer metástases à distância. Objectivos secundários é a descoberta de biomarcadores relacionados ao tumor que determinem radioresistência ou toxicidade ao tratamento. Espectroscopia de massa por ressonância magnética foi capaz de identificar 12 proteínas sobre expressadas nas em tumores primários iniciais que não estão presentes em tumores primários avançados. Além disso, foi detectada uma coinfecção EBV e HSV sem sinais de proteínas relacionadas ao HPV. Apesar dos resultados clínicos terem sido idênticos em ambos os grupos, isto pode ser explicado pela efectividade e intensidade do tratamento combinado. Além disso, a diferença em perfil tumorais podem refletir um perfil de doentes que poderia se beneficiar de protocolos de desintensificação. Esta pesquisa foi capaz de detectar a presença de 10 proteínas relacionadas aos doentes com metástases à distância. Entre elas, a presença de interferon e inibidores da tirosina cinase geram a hipótese de que podem representar potenciais alvos terapêuticos

DEVELOPMENT OF API FOR AUTONOMOUS NAVIGATION OF ROBOTIC PLATFORM

The purpose of this article is to present the development of an Application Program Interface (API) based on the OpenCV library for RoboDeck. RoboDeck is a mobile robotic platform of Brazilian manufacture for the areas of education and research. This API was developed to facilitate to the students and researchers, the creation of new applications for the control of the mobile robot. To test this API was developed an application for the autonomous navigation using computer vision

As Relações entre o Executivo e o Legislativo na Elaboração do Orçamento Brasileiro: Considerações sobre a Emenda Constitucional 86/2015

This article aims to analyze the possible implications of the Constitutional Amendment 86/2015 in relations between the executive and the legislative power at establishing and implementing the Brazilian budget. It will be verified the autorizing and/or the enforcing nature of the budget, how did occur such relationships before the adoption of EC n. 86/2015 and if this constitutional  change  will be able to cause difference in the dynamics of this political and institutional relationship. To achieve the proposed objective will be used, predominantly theoretical sources, in a comprehensive-exploratory and critical-reflexive approach on the matter. Este artigo objetiva analisar as possíveis implicações da Emenda Constitucional 86/2015 nas relações estabelecidas entre os Poderes Executivo e Legislativo na elaboração e execução do orçamento brasileiro. Verificar-se-á a natureza autorizativa e/ou impositiva da lei orçamentária, como ocorriam as relações entre os poderes antes da EC n. 86/2015 e se e se tal alteração constitucional será capaz de mudar a dinâmica dessa relação político-institucional. Para alcançar o objetivo proposto, utilizar-se-á de fontes predominantemente teóricas, em uma abordagem compreensivo-exploratória e crítico-reflexiva sobre a matéria.

Conceitos de uma população local a respeito da leishmaniose mucocutânea em uma área endêmica

Uma investigação a respeito do que a população local pensa sobre vários aspectos da leishmaniose mucocutânea foi realizada em Três Braços, Bahia, uma área de alta prevalência de infecção por Leishmania braziliensis braziliensis. Os resultados obtidos indicam que essa população tem um entendimento razoavelmente bom sobre alguns aspectos epidemiológicos e tratamento dessa doença, mas demonstram seu pouco conhecimento concernente à etiologia e prevenção. Esses dados poderão ser valiosos, no futuro, em um planejamento do controle de transmissão da doença nesta comunidade.An enquiry regarding the localpeople's views on the nature of mucocutaneous leishmaniasis is reported from Três Braços, Bahia, an area of high prevalence of L. braziliensis braziliensis infections. The results of this survey indicate a generally good understanding by the population of the treatment of this endemic disease, with little knowledge regarding etiology or prevention. Such base line data provides valuable insight into how the group should proceed with plans to eventually control transmission in this rural community

Jahr i Potter: slučajne sličnosti?

With the science of survival article and lately the book “bridge to the future” Potter became famous releasing the neologism “bioethics” and then known as the founder of bioethics. However, 43 years before, Jahr had proposed a similar idea in the article “Bio-ethics: reviewing the ethical relations of humans towards animals and plants (translated from German)”. We propose to correct the idea that Jahr is merely a precursor—and not a founder—of bioethics, here speculating the bridge bioethics of Rensselaer Potter as close similarity with Jahr’s thoughts. Following the “content analysis” method, a table was built to compare the theoretical schemes of Potter and Jahr, correlating by qualitative meta-analysis, each paragraph of Jahr’s base text (1927) with Potter’s analogous (1970). The similarity of the texts reveals that, in theory, Potter benefited from Jahrist utopia, imposing it a reductionist lineage. Potter expresses, therefore, an ethnological capture of jahrism.Člankom o znanosti preživljavanja, a kasnije i knjigom „Most prema budućnosti“, Potter je postao slavan upotrijebivši neologizam „bioetika“ i nakon toga poznat kao osnivač bioetike. Međutim, 43 godine prije Jahr je imao sličnu ideju i iznio je u članku „Bioetika: preispitivanje etičkih odnosa ljudi prema životinjama i biljkama (prevedeno s njemačkog)“. U radu predlažemo ispravljanje ideje da je Jahr samo preteča, a ne osnivač bioetike. Razmatramo bioetiku mosta Rensselaera Pottera kao vrlo sličnu Jahrovim mislima. Metodom „analize sadržaja“ napravljena je tablica koja uspoređuje teorijske sheme Pottera i Jahra, korelirajući kvalitativnom metaanalizom svaki odlomak Jahrova temeljnog teksta (1927.) s Potterovim analognim tekstom (1970.). Sličnost tekstova otkriva da je Potter, u teoriji, imao koristi od Jahrove utopije, namećući joj redukcionističko podrijetlo. Potter, prema tome, izražava etnološki vid jahrizma

Prognostic Biomarkers and EBV Infection Research in Diffuse Large B-Cell Lymphoma of the Palatine Tonsils

Diffuse large B-cell lymphoma represents approximately 30%–40% of all diagnoses of non-Hodgkin's Lymphoma and may represent up to 80% of all lymphomas that arise in the palatine tonsils. Several studies have attempted to correlate clinical, laboratorial, and tissue factors with the prognosis of the lymphomas, such as the International Prognostic Index, the tissue expression of some proteins, and the lymphocyte count at the time of diagnosis, as well as to correlate Epstein-Barr virus (EBV) infection with worse prognoses. Patients with palatine tonsil DLBCL, from Salvador, Bahia, Brazil, were studied in order to identify prognostic factors. Twenty-four patients with DLBCL were studied. The factors that negatively influenced the patients' survival rates were the lymphocyte count at the time of diagnosis <1.000/mm3 and the Bcl-2 protein expression. There was no CD5 expression in these lymphomas, and neither was there an association with EBV infection

Desempenho e qualidade de carcaça de animais terminados em confinamento provenientes do cruzamento de raças bovinas de corte e de leite e análise econômica do sistema / Performance and carcass quality of animals finished in feedlots results of the crossbreeding of beef and milk breeds and economic analysis of the system

Sabe-se que o estado de Santa Catarina não produz a totalidade de carne bovina necessária para manutenção e exportação da mesma, sendo assim, através do cruzamento de raças bovinas de leite com raças bovinas de corte pretende-se produzir carne de qualidade para auxiliar a suprir essa demanda. Com isso, o objetivo do projeto foi avaliar o desempenho e a qualidade de carcaça de animais provenientes do cruzamento de raças bovinas leiteiras com raças de corte, além da análise econômica do sistema. O experimento foi realizado em uma propriedade localizada no município de Capinzal/SC. Foram avaliados 19 animais em fase de terminação, provenientes de dois tipos de cruzamentos: 9 fêmeas e 10 machos castrados Red Angus com Holandesa e Red Angus com Jersey. Estes animais foram terminados em confinamento com dieta a base de ração composta por milho moído, farelo de soja, casquinha de soja, núcleo mineral e silagem de milho, sendo fornecida 12 kg de ração por animal duas vezes ao dia. Avaliou-se o ganho médio diário de peso vivo, rendimento de carcaça, medida da gordura subcutânea, tipificação da carcaça e análise econômica. O peso inicial foi de 320,5 kg para as fêmeas e 337,5 kg para os machos. O peso final foi de 509,5kg nas fêmeas e 494,5 kg nos machos, o ganho médio diário observado foi de 1,15 kg para as fêmeas e 1,05 kg para os machos. O rendimento de carcaça das fêmeas foi de 46,6% e dos machos 46,8%. De acordo com a avaliação do frigorífico, as carcaças foram tipificadas como boas. Os resultados demonstram a viabilidade de uso de animais provenientes do cruzamento de raças bovinas de corte e de leite para produção de carcaça de qualidade, além de demonstrarem ganho econômico quando o produtor opta por utilizar desse tipo de cruzamento como uma segunda fonte de ganho para sua propriedade

Rapid decline of Zika virus NS1 antigen-specific antibody responses, northeastern Brazil

Zika virus (ZIKV) is a positive-stranded RNA virus within the Flaviviridae family. After decades of circulation in Asia, ZIKV was introduced to Brazil in 2014–2015, associated with a rise in congenital malformations. Unlike the genetically related dengue virus (DENV), ZIKV constitutes only one serotype. Although assumed that ZIKV infection may engender lifelong immunity, the long-term kinetics of ZIKV antibody responses are unclear. We assessed long-term kinetics of ZIKV NS1-IgG response in 144 individuals from 3 different subpopulations: HIV patients, tuberculosis patients and healthy individuals first tested in 2016 and retested 1.5–2 years after the 2015–2016 ZIKV epidemic in Salvador de Bahia, Brazil, using a widely distributed NS1-based commercial ELISA. The seropositivity in 2016 reached 59.0% (85/144, 95% confidence interval (CI) 50.7–66.7%), and decreased to 38.6% (56/144, CI 31.3–47.0%) 1.5–2 years later. In addition, the median ZIKV NS1-ELISA reactivity for individuals that remained positive in both timepoints significantly decreased from a ratio of 4.4 (95% CI 3.8–5.0) to 1.6 (95% CI 1.6–1.9) over the 2-year interval (Z: − 6.1; p < 0.001) irrespective of the subpopulation analyzed. Initial 2016 DENV antibody response was non-significant between groups, suggesting comparable DENV background. The high 20.6% seroreversion suggest that widely used serologic tests may fail to account a considerable proportion of past ZIKV infections in flavivirus endemic countries. In addition, ZIKV immunity might be shorter-lived than previously thought, which may contribute to local ZIKV resurgence once individual immune responses wane sufficiently to reduce community protective immunity in addition to birth and migration

Aspectos psicossociais e estigmatizantes da leishmaniose cutâneo-mucosa

Os autores selecionaram 15 pacientes portadores de leishmaniose cutâneo- mucosa (LCM) forma grave, onde buscaram, através de entrevista psicológica, conhecer aspectos da vida de cada um, antes de contrair a doença, no decorrer e após o tratamento. Concomitantemente, realizaram 25 entrevistas com a comunidade onde residem os pacientes, com a intenção de avaliar as reações da mesma ao doente com leishmaniose. Constataram que entre os pacientes entrevistados: 14(93,3%) referiram algum tipo de modificação no decorrer da doença; 11(73,3%) perceberam-se marginalizados; 9(60%) sentiram-se afastados do convívio da sociedade; 10(66,6%) tiveram dificuldade de retomar ao trabalho. Na comunidade, 11(44%) associam o portador da LCM a indivíduos que apresentam deformações no corpo, 8(32%) têm receio de contrair a doença pelo caráter destrutivo das lesões, 24(96%) referiram que os pacientes têm problemas de relacionamento social.The authors selected 15 patients with severe mucocutaneous leishmaniasis. By means of an interview concentrating on sociopsychological aspects they sought to understand aspects of the life of each patient before, during and after treatment of the disease. At the same time similar interviews were recorded on 25 healthy members of the same community to gauge their reaction to subjects with leishmaniasis. Among the patients interviewed, in 14(93.3%) their lives were affected by the disease and (73.3%) were suffering from discrimination. Nine (60%) felt di vorced from society and 10(66.6%) had difficulty in returning to work. Of the healthy community members interviewed 11(44%) associated the disease with bodily deformities and 8(32%) were afraid of catching the disease due its destructive nature. Twenty-four (96%) thought patients had social problems