Oomycetes in rhizosphere soil of ornamental plants from retail nurseries in Southern Sweden

Trade of herbaceous and woody ornamental plants is recognized as a principal pathway for the introduction of alien plant pathogens, such as soil-borne Phytophthora and Pythium species (oomycetes). The rhizosphere soil of container-grown plants obtained from 13 nurseries and garden centres in southern Sweden were sampled and the presence of Phytophthora and Pythium species determined using traditional baiting and isolation. DNA sequencing of isolates revealed five Phytophthora taxa including P. cinnamomi, P. citricola s.l., P. plurivora, P. undulata and a non-identified Phytophthora sp., as well as Phytopythium cf. citrinum and several species of Pythium. Phytophthora cinnamomi was detected on two different ornamental plants at the same nursery and is a first record of P. cinnamomi in Sweden. The survey revealed that a diversity of potentially pathogenic oomycetes is associated with ornamental plants available for sale in Sweden and emphasizes the need to recognize potential risks if these organisms get introduced in nature

How environmental managers perceive and approach the issue of invasive species: the case of Japanese knotweed s.l. (Rhône River, France)

We would like to thank Springer for publishing our article. The final publication is available at http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10530-015-0969-1International audienceStudying the perceptions of stakeholders or interested parties is a good way to better understand behaviours and decisions. This is especially true for the management of invasive species such as Japanese knotweed s.l. This plant has spread widely in the Rhône basin, where significant financial resources have been devoted to its management. However, no control technique is recognized as being particularly effective. Many uncertainties remain and many documents have been produced by environmental managers to disseminate current knowledge about the plant and its management. This article aims at characterizing the perceptions that environmental managers have of Japanese knotweed s.l. A discourse analysis was conducted on the printed documentation produced about Japanese knotweed s.l. by environmental managers working along the Rhône River (France). The corpus was both qualitatively and quantitatively analysed. The results indicated a diversity of perceptions depending on the type of environmental managers involved, as well as the geographicalareas and scales on which they acted. Whereas some focused on general knowledge relating to the origins and strategies of colonization, others emphasized the diversity and efficacy of the prospective eradication techniques. There is a real interest in implementing targeted actions to meet local issues. To do so, however, these issues must be better defined. This is a challenging task, as it must involve all types of stakeholders

Ecological barrier to the dissemination of the causal agents of the ink disease in French chestnut groves

Les maladies émergentes des plantes constituent des menaces pour les services écosystémiques et à la santé publique dans le monde entier. Depuis quelques années, le châtaignier fait l’objet d’une recrudescence des signalements de dégâts d’origine pathologique, et en particulier de la maladie de l’encre. Cette maladie est causée par Phytophthora cinnamomi et/ou P. x cambivora, deux agents pathogènes exotiques qui ont été introduits en Europe au cours du XIXème siècle. L’objectif de ce travail était d’une part de préciser l’aire de distribution de l’encre du châtaignier en France, et de confirmer le statut d’espèce invasive naturalisée de P. cinnamomi. D’autre part, le second objectif était d’identifier les barrières écologiques qui pourraient limiter sa dissémination, des barrières liées aux hôtes, au microbiote du sol et/ou à l’environnement abiotique. Pour répondre à ces problématiques, la mise au point de méthodes de détection et de quantification de P. cinnamomi dans le sol (droplet digital PCR ciblée, adaptation d’un pipeline de métabarcoding) a été nécessaire. L’étude d’un dispositif de suivi du dépérissement du châtaignier en France, implémenté par le Département de la Santé des Forêts, a permis de confirmer que P. cinnamomi était largement répandu en France. Grâce à un dispositif expérimental dans une forêt de châtaigniers en mélange avec d’autres essences forestières, et où l’encre a été diagnostiquée, nous avons caractérisé les communautés fongiques du sol et quantifié l’inoculum de P. cinnamomi dans le sol. Ces communautés se sont avérées modifiées en présence de P. cinnamomi. De plus, nous avons mis en évidence que la quantité de P. cinnamomi était plus faible dans les parcelles mixtes que pures, suggérant l’existence d’un effet de dilution liée à la diversité des hôtes. La compétence des hôtes, i.e. capacité à transmettre l’inoculum, est un trait de l’hôte rarement évalué en phytopathologie, mais qui résulte parfois en des effets de dilution. Dans un premier temps, nous avons cherché à élaborer un cadre conceptuel pour l’étude de ce trait au travers d’une revue bibliographique. Dans un second temps, nous avons obtenu les premières évaluations de compétence pour P. cinnamomi de différentes essences forestières, au travers d’un dispositif expérimental en conditions contrôlées. Le chêne sessile (Quercus petraea) et le chêne pédonculé (Q. robur) se sont avérés très peu compétents pour P. cinnamomi. Ces résultats pourraient avoir d’importantes implications pour la gestion des écosystèmes de châtaigniers et de chênes menacés par la maladie de l’encre.Emerging plant diseases pose threats to ecosystem services and public health worldwide. In recent years, chestnut has been subject to an upsurge in reports of pathogen damage, particularly ink disease. This disease is caused by Phytophthora cinnamomi and/or P. x cambivora, two exotic pathogens that were introduced in Europe during the 19th century. The objective of this work was on the one hand to specify the distribution area of chestnut ink disease in France, and to confirm the status of naturalized invasive species for P. cinnamomi. On the other hand, the second objective was to identify the ecological barriers that could limit its dissemination, barriers related to the hosts, the soil microbiota and/or the abiotic environment. To address these issues, the development of methods for the detection and the quantification of P. cinnamomi in the soil (targeted droplet digital PCR, adaptation of a metabarcoding pipeline) was necessary. The investigation of a monitoring network of chestnut decline in France, implemented by the Department of Forest Health, confirmed that P. cinnamomi was widespread in France. Using an experimental set-up in a chestnut forest mixed with other forest species, and where the ink disease was diagnosed, we characterized the soil fungal communities and quantified the soil inoculum of P. cinnamomi. These communities were found to be modified in the presence of P. cinnamomi. In addition, we found that the abundance of P. cinnamomi was lower in mixed than in pure plots, suggesting the existence of a dilution effect related to host diversity. Host competence, i.e. the ability to transmit inoculum, is a host trait that is rarely assessed in plant pathology, but which sometimes results in dilution effects. First, we sought to develop a conceptual framework for the study of this trait through a literature review. Secondly, we obtained the first evaluations of the competence for P. cinnamomi of different forest species, through an experiment under controlled conditions. The sessile oak (Quercus petraea) and the pedunculate oak (Q. robur) were found to have very low competence for P. cinnamomi. These results could have important implications for the management of chestnut and oak ecosystems threatened by the ink disease

Ecological barrier to the dissemination of the causal agents of the ink disease in French chestnut groves

Les maladies émergentes des plantes constituent des menaces pour les services écosystémiques et à la santé publique dans le monde entier. Depuis quelques années, le châtaignier fait l’objet d’une recrudescence des signalements de dégâts d’origine pathologique, et en particulier de la maladie de l’encre. Cette maladie est causée par Phytophthora cinnamomi et/ou P. x cambivora, deux agents pathogènes exotiques qui ont été introduits en Europe au cours du XIXème siècle. L’objectif de ce travail était d’une part de préciser l’aire de distribution de l’encre du châtaignier en France, et de confirmer le statut d’espèce invasive naturalisée de P. cinnamomi. D’autre part, le second objectif était d’identifier les barrières écologiques qui pourraient limiter sa dissémination, des barrières liées aux hôtes, au microbiote du sol et/ou à l’environnement abiotique. Pour répondre à ces problématiques, la mise au point de méthodes de détection et de quantification de P. cinnamomi dans le sol (droplet digital PCR ciblée, adaptation d’un pipeline de métabarcoding) a été nécessaire. L’étude d’un dispositif de suivi du dépérissement du châtaignier en France, implémenté par le Département de la Santé des Forêts, a permis de confirmer que P. cinnamomi était largement répandu en France. Grâce à un dispositif expérimental dans une forêt de châtaigniers en mélange avec d’autres essences forestières, et où l’encre a été diagnostiquée, nous avons caractérisé les communautés fongiques du sol et quantifié l’inoculum de P. cinnamomi dans le sol. Ces communautés se sont avérées modifiées en présence de P. cinnamomi. De plus, nous avons mis en évidence que la quantité de P. cinnamomi était plus faible dans les parcelles mixtes que pures, suggérant l’existence d’un effet de dilution liée à la diversité des hôtes. La compétence des hôtes, i.e. capacité à transmettre l’inoculum, est un trait de l’hôte rarement évalué en phytopathologie, mais qui résulte parfois en des effets de dilution. Dans un premier temps, nous avons cherché à élaborer un cadre conceptuel pour l’étude de ce trait au travers d’une revue bibliographique. Dans un second temps, nous avons obtenu les premières évaluations de compétence pour P. cinnamomi de différentes essences forestières, au travers d’un dispositif expérimental en conditions contrôlées. Le chêne sessile (Quercus petraea) et le chêne pédonculé (Q. robur) se sont avérés très peu compétents pour P. cinnamomi. Ces résultats pourraient avoir d’importantes implications pour la gestion des écosystèmes de châtaigniers et de chênes menacés par la maladie de l’encre.Emerging plant diseases pose threats to ecosystem services and public health worldwide. In recent years, chestnut has been subject to an upsurge in reports of pathogen damage, particularly ink disease. This disease is caused by Phytophthora cinnamomi and/or P. x cambivora, two exotic pathogens that were introduced in Europe during the 19th century. The objective of this work was on the one hand to specify the distribution area of chestnut ink disease in France, and to confirm the status of naturalized invasive species for P. cinnamomi. On the other hand, the second objective was to identify the ecological barriers that could limit its dissemination, barriers related to the hosts, the soil microbiota and/or the abiotic environment. To address these issues, the development of methods for the detection and the quantification of P. cinnamomi in the soil (targeted droplet digital PCR, adaptation of a metabarcoding pipeline) was necessary. The investigation of a monitoring network of chestnut decline in France, implemented by the Department of Forest Health, confirmed that P. cinnamomi was widespread in France. Using an experimental set-up in a chestnut forest mixed with other forest species, and where the ink disease was diagnosed, we characterized the soil fungal communities and quantified the soil inoculum of P. cinnamomi. These communities were found to be modified in the presence of P. cinnamomi. In addition, we found that the abundance of P. cinnamomi was lower in mixed than in pure plots, suggesting the existence of a dilution effect related to host diversity. Host competence, i.e. the ability to transmit inoculum, is a host trait that is rarely assessed in plant pathology, but which sometimes results in dilution effects. First, we sought to develop a conceptual framework for the study of this trait through a literature review. Secondly, we obtained the first evaluations of the competence for P. cinnamomi of different forest species, through an experiment under controlled conditions. The sessile oak (Quercus petraea) and the pedunculate oak (Q. robur) were found to have very low competence for P. cinnamomi. These results could have important implications for the management of chestnut and oak ecosystems threatened by the ink disease

Barrières écologiques à la dissémination des agents causals de l’encre dans les châtaigneraies françaises

Emerging plant diseases pose threats to ecosystem services and public health worldwide. In recent years, chestnut has been subject to an upsurge in reports of pathogen damage, particularly ink disease. This disease is caused by Phytophthora cinnamomi and/or P. x cambivora, two exotic pathogens that were introduced in Europe during the 19th century. The objective of this work was on the one hand to specify the distribution area of chestnut ink disease in France, and to confirm the status of naturalized invasive species for P. cinnamomi. On the other hand, the second objective was to identify the ecological barriers that could limit its dissemination, barriers related to the hosts, the soil microbiota and/or the abiotic environment. To address these issues, the development of methods for the detection and the quantification of P. cinnamomi in the soil (targeted droplet digital PCR, adaptation of a metabarcoding pipeline) was necessary. The investigation of a monitoring network of chestnut decline in France, implemented by the Department of Forest Health, confirmed that P. cinnamomi was widespread in France. Using an experimental set-up in a chestnut forest mixed with other forest species, and where the ink disease was diagnosed, we characterized the soil fungal communities and quantified the soil inoculum of P. cinnamomi. These communities were found to be modified in the presence of P. cinnamomi. In addition, we found that the abundance of P. cinnamomi was lower in mixed than in pure plots, suggesting the existence of a dilution effect related to host diversity. Host competence, i.e. the ability to transmit inoculum, is a host trait that is rarely assessed in plant pathology, but which sometimes results in dilution effects. First, we sought to develop a conceptual framework for the study of this trait through a literature review. Secondly, we obtained the first evaluations of the competence for P. cinnamomi of different forest species, through an experiment under controlled conditions. The sessile oak (Quercus petraea) and the pedunculate oak (Q. robur) were found to have very low competence for P. cinnamomi. These results could have important implications for the management of chestnut and oak ecosystems threatened by the ink disease.Les maladies émergentes des plantes constituent des menaces pour les services écosystémiques et à la santé publique dans le monde entier. Depuis quelques années, le châtaignier fait l’objet d’une recrudescence des signalements de dégâts d’origine pathologique, et en particulier de la maladie de l’encre. Cette maladie est causée par Phytophthora cinnamomi et/ou P. x cambivora, deux agents pathogènes exotiques qui ont été introduits en Europe au cours du XIXème siècle. L’objectif de ce travail était d’une part de préciser l’aire de distribution de l’encre du châtaignier en France, et de confirmer le statut d’espèce invasive naturalisée de P. cinnamomi. D’autre part, le second objectif était d’identifier les barrières écologiques qui pourraient limiter sa dissémination, des barrières liées aux hôtes, au microbiote du sol et/ou à l’environnement abiotique. Pour répondre à ces problématiques, la mise au point de méthodes de détection et de quantification de P. cinnamomi dans le sol (droplet digital PCR ciblée, adaptation d’un pipeline de métabarcoding) a été nécessaire. L’étude d’un dispositif de suivi du dépérissement du châtaignier en France, implémenté par le Département de la Santé des Forêts, a permis de confirmer que P. cinnamomi était largement répandu en France. Grâce à un dispositif expérimental dans une forêt de châtaigniers en mélange avec d’autres essences forestières, et où l’encre a été diagnostiquée, nous avons caractérisé les communautés fongiques du sol et quantifié l’inoculum de P. cinnamomi dans le sol. Ces communautés se sont avérées modifiées en présence de P. cinnamomi. De plus, nous avons mis en évidence que la quantité de P. cinnamomi était plus faible dans les parcelles mixtes que pures, suggérant l’existence d’un effet de dilution liée à la diversité des hôtes. La compétence des hôtes, i.e. capacité à transmettre l’inoculum, est un trait de l’hôte rarement évalué en phytopathologie, mais qui résulte parfois en des effets de dilution. Dans un premier temps, nous avons cherché à élaborer un cadre conceptuel pour l’étude de ce trait au travers d’une revue bibliographique. Dans un second temps, nous avons obtenu les premières évaluations de compétence pour P. cinnamomi de différentes essences forestières, au travers d’un dispositif expérimental en conditions contrôlées. Le chêne sessile (Quercus petraea) et le chêne pédonculé (Q. robur) se sont avérés très peu compétents pour P. cinnamomi. Ces résultats pourraient avoir d’importantes implications pour la gestion des écosystèmes de châtaigniers et de chênes menacés par la maladie de l’encre

Ecological barrier to the dissemination of the causal agents of the ink disease in French chestnut groves

Les maladies émergentes des plantes constituent des menaces pour les services écosystémiques et à la santé publique dans le monde entier. Depuis quelques années, le châtaignier fait l’objet d’une recrudescence des signalements de dégâts d’origine pathologique, et en particulier de la maladie de l’encre. Cette maladie est causée par Phytophthora cinnamomi et/ou P. x cambivora, deux agents pathogènes exotiques qui ont été introduits en Europe au cours du XIXème siècle. L’objectif de ce travail était d’une part de préciser l’aire de distribution de l’encre du châtaignier en France, et de confirmer le statut d’espèce invasive naturalisée de P. cinnamomi. D’autre part, le second objectif était d’identifier les barrières écologiques qui pourraient limiter sa dissémination, des barrières liées aux hôtes, au microbiote du sol et/ou à l’environnement abiotique. Pour répondre à ces problématiques, la mise au point de méthodes de détection et de quantification de P. cinnamomi dans le sol (droplet digital PCR ciblée, adaptation d’un pipeline de métabarcoding) a été nécessaire. L’étude d’un dispositif de suivi du dépérissement du châtaignier en France, implémenté par le Département de la Santé des Forêts, a permis de confirmer que P. cinnamomi était largement répandu en France. Grâce à un dispositif expérimental dans une forêt de châtaigniers en mélange avec d’autres essences forestières, et où l’encre a été diagnostiquée, nous avons caractérisé les communautés fongiques du sol et quantifié l’inoculum de P. cinnamomi dans le sol. Ces communautés se sont avérées modifiées en présence de P. cinnamomi. De plus, nous avons mis en évidence que la quantité de P. cinnamomi était plus faible dans les parcelles mixtes que pures, suggérant l’existence d’un effet de dilution liée à la diversité des hôtes. La compétence des hôtes, i.e. capacité à transmettre l’inoculum, est un trait de l’hôte rarement évalué en phytopathologie, mais qui résulte parfois en des effets de dilution. Dans un premier temps, nous avons cherché à élaborer un cadre conceptuel pour l’étude de ce trait au travers d’une revue bibliographique. Dans un second temps, nous avons obtenu les premières évaluations de compétence pour P. cinnamomi de différentes essences forestières, au travers d’un dispositif expérimental en conditions contrôlées. Le chêne sessile (Quercus petraea) et le chêne pédonculé (Q. robur) se sont avérés très peu compétents pour P. cinnamomi. Ces résultats pourraient avoir d’importantes implications pour la gestion des écosystèmes de châtaigniers et de chênes menacés par la maladie de l’encre.Emerging plant diseases pose threats to ecosystem services and public health worldwide. In recent years, chestnut has been subject to an upsurge in reports of pathogen damage, particularly ink disease. This disease is caused by Phytophthora cinnamomi and/or P. x cambivora, two exotic pathogens that were introduced in Europe during the 19th century. The objective of this work was on the one hand to specify the distribution area of chestnut ink disease in France, and to confirm the status of naturalized invasive species for P. cinnamomi. On the other hand, the second objective was to identify the ecological barriers that could limit its dissemination, barriers related to the hosts, the soil microbiota and/or the abiotic environment. To address these issues, the development of methods for the detection and the quantification of P. cinnamomi in the soil (targeted droplet digital PCR, adaptation of a metabarcoding pipeline) was necessary. The investigation of a monitoring network of chestnut decline in France, implemented by the Department of Forest Health, confirmed that P. cinnamomi was widespread in France. Using an experimental set-up in a chestnut forest mixed with other forest species, and where the ink disease was diagnosed, we characterized the soil fungal communities and quantified the soil inoculum of P. cinnamomi. These communities were found to be modified in the presence of P. cinnamomi. In addition, we found that the abundance of P. cinnamomi was lower in mixed than in pure plots, suggesting the existence of a dilution effect related to host diversity. Host competence, i.e. the ability to transmit inoculum, is a host trait that is rarely assessed in plant pathology, but which sometimes results in dilution effects. First, we sought to develop a conceptual framework for the study of this trait through a literature review. Secondly, we obtained the first evaluations of the competence for P. cinnamomi of different forest species, through an experiment under controlled conditions. The sessile oak (Quercus petraea) and the pedunculate oak (Q. robur) were found to have very low competence for P. cinnamomi. These results could have important implications for the management of chestnut and oak ecosystems threatened by the ink disease

Rythme des mobilités humaines et cycles environnementaux dans le Mésolithique atlantique.

International audienceCollective mobility over a cyclical period of time and according to closed paths—referred to here as circulars—is presumed to be characteristic of hunter-gatherers around the world, whether ancient or current. In this article, we aim to identify rhythms of movement, a theme that has received little attention in recent work on the Mesolithic. Based on the excavation of the Mesolithic coastal habitat site of Beg-er-Vil (Quiberon, Morbihan), carried out between 2013 and 2018, we discuss all the chronological elements at our disposal to establish the rhythms of these collective mobilities. The 12 radiocarbon dates currently selected were obtained from animal bone or twigs. They range from 6250 to 6100 BC, a very short duration for a Mesolithic habitat. The near total domination of symmetrical trapezes in the toolkit and the very legible organization of the dwelling could be linked to a very short occupation. But other indicators are changing our time perspective. For example, the stratigraphic sequences sampled in the heart of the shell midden area do not revealany abandonment phases. While geoarchaeology provides more evidence for a long period of residence, it does not exclude successive short-term mobility (a few weeks?). Theextraction of temporality information related to plants and animals shows that, theoretically, these Mesolithic maritime populations had year-round access to food. Unfortunately, this potentiality confronted with the two possible centuries of occupation does not allow us to know if this regular presence over an annual cycle was continuous or the result of an accumulation of occupations. Drawing on all the “pieces of time” available at the Beg-er-Vil site, we can compare the typologist’s short time, the radiocarbon’s short time (one century), the community’s long time in a domestic space according to the geoarchaeologist, and the extended time of seasonal predation according to the zooarchaeologist.La mobilité collective durant un temps cyclique et selon des cheminements fermés sur eux-mêmes qualifiés ici de circulaires - est présumée caractéristique des chasseurs-cueilleurs de la planète, qu’ils soient anciens ou actuels. On tentera dans cet article de cerner les rythmes de ces déplacements, thème peu traité dans les travaux récents sur le Mésolithique. À partir de la fouille de l’habitat littoral mésolithique de Beg-er-Vil (Quiberon, Morbihan) réalisée entre 2012 et 2018, nous souhaitons discuter de tous les éléments chronologiques dont nous disposons pour établir les rythmes de ces mobilités collectives. Les douze dates retenues actuellement ont été réalisées sur ossement animal ou sur brindilles. Elles s’étagent entre 6250 et 6100 av. n.-è., soit une durée très courte pour un habitat mésolithique. La domination presque totale des trapèzes symétriques dans l’outillage et le plan très lisible de l’habitat conduiraient à écrire que l’habitat de Beg-er- Vil a été occupé de manière très ponctuelle. Mais d’autres indicateurs viennent changer notre perspective temporelle. Ainsi, les séquences stratigraphiques échantillonnées au coeur de la zone de l’amas coquillier ne révèlent pas de phases d’abandon. La géoarchéologie porte davantagetémoignage d’un temps de résidence long, mais elle n’exclut pas des mobilités successives de courte durée (quelques semaines). L’extraction des informations sur la temporalitéliée aux végétaux et animaux montre que théoriquement ces populations maritimes du Mésolithique avaient accès à de la nourriture toute l’année. Malheureusement, cette potentialité confrontée aux deux siècles possibles d’occupation ne nous permet pas de savoir si cette présence sur un cycle annuel est continue ou si elle est un effet fallacieux d’un cumul de séjours. En additionnant tous les « morceaux de temps » disponibles sur le site de Beg-er-Vil, on peut opposer le temps court du typologue, le temps court du radiocarbone(un siècle), le temps long d’une communauté dans un espace domestique selon la géoarchéologue et le temps prolongé des exploitations saisonnières selon l’archéozoologue

Oomycetes in rhizosphere soil of ornamental plants from retail nurseries in Southern Sweden

Trade of herbaceous and woody ornamental plants is recognized as a principal pathway for the introduction of alien plant pathogens, such as soil-borne Phytophthora and Pythium species (oomycetes). The rhizosphere soil of container-grown plants obtained from 13 nurseries and garden centres in southern Sweden were sampled and the presence of Phytophthora and Pythium species determined using traditional baiting and isolation. DNA sequencing of isolates revealed five Phytophthora taxa including P. cinnamomi, P. citricola s.l., P. plurivora, P. undulata and a non-identified Phytophthora sp., as well as Phytopythium cf. citrinum and several species of Pythium. Phytophthora cinnamomi was detected on two different ornamental plants at the same nursery and is a first record of P. cinnamomi in Sweden. The survey revealed that a diversity of potentially pathogenic oomycetes is associated with ornamental plants available for sale in Sweden and emphasizes the need to recognize potential risks if these organisms get introduced in nature

Resistance, tolerance and competence for a root pathogen in six woody species

The outcome of host-pathogen interactions depends on host defence and pathogen infection strategies. On the host side, two strategies, resistance and tolerance, have long been identified. They differ in their underlying mechanisms and their effects on pathogens. However, the dynamics of disease transmission also rely on host competence. This trait, defined as the ability of the host to allow pathogen transmission, is rarely studied for pathogen-supporting plants. We assessed the competence for Phytophthora cinnamomi of seedlings of five Quercus and one Castanea species and studied how this trait is correlated with resistance and tolerance. P. cinnamomi is responsible for the chestnut ink disease, alongside with Phytophthora x cambivora, which has a much less generalist behaviour. Each seedling was inoculated in minirhizotrons by root-mycelium contact and phenotyped for its resistance, tolerance and competence. The amount of necrosis (lesion length), the effect of infection on plant performance (root growth) and the sporangia number were measured. Moreover, we developed a droplet digital (dd) PCR assay to quantify the pathogen within host tissues near the inoculation point. This measure was used as a proxy of pathogen load. We were thus able to relate individual host competence to the pathogen content measured in the same root fragment. No significant correlation between the phenotyped traits was found at the individual level. However, at the species level, the least competent species (Q. robur, Q. petraea) proved to be the most resistant. These results may have important implications for management of chestnut and oak ecosystems threatened by ink disease

Partir, caboter, revenir : comprendre la mobilité maritime dans la France atlantique durant le Mésolithique

National audienceLa notion de nomadisme recouvre des déplacements individuels et collectifs qui sont au coeur du fonctionnement des premières communautés humaines et permettent de faire le lien entre celles-ci et des ressources dispersées dont la disponibilité est fonction du cycle des saisons ou des marées. Les motifs de ces itinérances vont cependant bien au-delà de processus adaptatifs et d’une supposée rationalité économique déconnectée des autres contingences. Le déplacement régulier des habitats répond aussià des exigences familiales, sociales ou religieuses, tout comme à un ethos valorisant cette mobilité, que ce soit celui des chasseurs-cueilleurs (Kelly 1992) ou celui des actuelles communautés nomades sur le territoire français (Bergeon 2014). D’autres mobilités parfois sans retour, les migrations, répondent à des crises écologiques, démographiques ou politiques. Elles peuvent également être liées à l’exploration de nouveaux territoires continentaux (Kelly & Todd 1988) ou insulaires (Warren 2017 ; Tune 2020). Dans un contexte maritime ou fluvial, d’autres paramètres s’ajoutent à ces considérations. L’usage d’embarcations, d’outils et de matériaux dédiés conditionne la totalité du système technique, avec la mobilisation d’un vaste ensemble de savoirs (courants, marées, météorologie, géographie). La navigation transforme aussi la configuration des réseaux de mobilité, en autorisant des projections plus lointaines de tout ou partie du groupe, en donnant accès à des espaces insulaires aux contraintes écologiques particulières (Marchand 2013) et en permettant le transport de ressources volumineuses que l’on peut transformer loin de leurs zones d’acquisition (Ames 2002). Seule une démarche pluridisciplinaire permet de réfléchir aux conditions techniques, aux rythmes et à l’extension spatiale de ces mouvements. Elle se fonde sur des preuves indirectes, comme la dispersion sur le territoire de vestiges lithiques et de parures en matériaux divers, sur des analyses géo-archéologiques menées au coeur des habitats ou encore sur la gestion de la faune et de la flore. Les amas coquilliers sont un premier point d’accroche pour le développement d’une telle démarche, car ils regroupent un nombre incomparable d’informations sur les activités domestiques, la gestion des ressources alimentaires et minérales ou les normes funéraires (tableau 1