КРОС-ПЛАТФОРМНЕ ОБ’ЄДНАННЯ ДАНИХ МІКРОМАСИВ-ЕКСПЕРИМЕНТІВ ТА ЙОГО ВПЛИВ НА ЗНАЧЕННЯ ГЕННОЇ ЕКСПРЕСІЇ ПРИ АНАЛІЗІ ЗРАЗКІВ РАКОВИХ ПУХЛИН МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ ЛЮДИНИ

Introduction. Currently advances in different fields of biology and medicine accumulated large amount of high-throughput microarray datasets. It allows comparing, merging and analyzing such data in order to get more informative and statistically significant results. However, the process of cross-platform microarray data integration is complicated by different platform designs, that is the kind of probes used, the hybridization paradigm, the labeling and production methods. Such characteristics of microarray platforms should be considered when analyzing datasets from one study and even more when merging datasets.В различных областях биологии и медицины накопилось значительное количество данных широкомасштабных исследований генной экспрессии с использованием микромасив-технологий. Поэтому возникает насущная необходимость в сравнении, объединении и анализе этих данных с целью повышения информативности и статистической достоверности результатов анализа.У різних галузях біології та медицини накопичилася значна кількість даних широкомасштабних досліджень генної експресії за використання мікромасив-технологій. Тому виникає нагальна потреба в порівнянні, об'єднанні й аналізі цих даних з метою підвищення інформативності та статистичної достовірності результатів аналізу. Однак, процес об'єднання результатів мікромасив-експериментів на базі крос-платформного аналізу ускладнений існуванням багатьох мікроарей-платформ, різних за технологією виготовлення, методикою нанесення проб на чип і різновидністю дизайну проб. Ці особливості кожного з досліджень повинні бути враховані при обробленні та аналізі результатів мікромасив-експериментів, отриманих як на однакових, так і на різних платформах

Hepatoprotective activity of 1,2,4-triazole-3-thione derivatives, which contains on c5-atomic carbon hydroxy(phenyl)methyl dependent

Relevance of pharmaceuticals with high efficiency and low cost for the prevention and treatment of diseases of the digestive system is unquestionable. It would be appropriate to mention that we carried out an analysis of a number of studies in which hepatoprotective effects of 1,2,4-triazole derivatives were carried out, and showed high hepatoprotective effects. Therefore, the search for hepatoprotectors in the series of 1,2,4-triazole derivatives has not only theoretical but also practical significance. The aim of our work was to study the first synthesized derivatives of 1,2,4-triazole-3-thione, which was containing substituents on C5 by carbon atom in conditions of tetrachormethane hepatitis. To model toxic hepatitis, a hepatotoxic xenobiotic, carbon tetrachloride, was used. The study of biochemical indicators of liver status was carried out 24 hours after the last injection of carbon tetrachloride. The ability of the test compounds to restore the integrity of hepatocyte membranes was determined by the anti-cytolytic effect (decrease in the activity of Alanine Aminotransferase (ALT), Aspartate Aminotransferase (AST)). According to the results of the study, it was found that among 43 test compounds, 5 are able to prevent survival at 85.71%. Thus, among the substances studied, compound 2c, which contributed 85.71% of the survival of the experimental animals and decrease 33.43% in ALT and 34.33% in AST. In this case, a very weak inverse dependence of the above indices was observed (r = -0.31). Some regularities of the chemical structure of the hepatoprotective action of 1,2,4-triazole derivatives have been established, so the survival of the experimental animals decreased with the introduction of a phenyl substituent of the starting thiones with N4

Гепатопротекторна активність похідних 1,2,4-тріазол-3-тіону, які містять за с5 атомом вуглецю гідрокси(феніл)метильний замісник

Topicality. Actually it is very important to create highly effective but relatively inexpensive medications for the prevention and treatment the digestive system diseases. It would be appropriate to mention that we carried out an analysis of studies and examined hepatoprotective effects of 1,2,4-triazole derivatives, high rates of hepatoprotective effects were detected. Therefore, the search for hepatoprotectors in the series of 1,2,4-triazole derivatives has not only theoretical but also practical significance.Aim. To study the first synthesized derivatives of 1,2,4-triazole-3-thione, containing substituents on C5 by carbon atom in conditions of tetrachormethane hepatitis.Materials and methods. To model toxic hepatitis, a hepatotoxic xenobiotic, carbon tetrachloride, was used. The study of liver biochemical indicators was carried out in 24 hours later after the last injection of carbon tetrachloride. The ability of test compounds to restore the integrity of hepatocyte membranes was determined by anti-cytolytic effect (Alanine Aminotransferase (ALT), Aspartate Aminotransferase (AST) activity decrease). According to the results of the study, it was found that among 43 test compounds, 5 are able to prevent survival at 85.71 %.Results and discussion. Thus, among the substances studied, compound 2c, which contributed 85.71 % of the survival of the experimental animals and decrease 33.43 % in ALT and 34.33 % in AST. In this case a very weak inverse dependence of the above was observed (r = -0.31).Conclusions. As a result, some chemical structure patterns of the hepatoprotective action of 1,2,4-triazole derivatives were established, so the survival of the experimental animals decreased with the introduction of a phenyl substituent of the starting thiones with N4.Актуальность. Актуальность создания лекарственных средств с высокой эффективностью и низкой стоимостью для профилактики и лечения заболеваний пищеварительной системы является бесспорной. Нами проведен анализ ряда работ, в которых проводились исследования гепатопротекторного действия производных 1,2,4-триазола, и поэтому поиск гепатопротекторов в ряду производных 1,2,4-триазола имеет не только теоретическую, но и практическую значимость.Цель работы. Целью нашей работы было исследование впервые синтезированных производных 1,2,4-триазол-3-тиона, содержащих по С5 атому углерода заместители в условиях тетрахлорметанового гепатита.Материалы и методы. Для моделирования токсического гепатита был использован гепатотоксический ксенобиотик – тетрахлорметан. Изучение биохимических показателей состояния печени проводили через 24 ч после последнего введения тетрахлорметана. Способность исследуемых соединений к восстановлению целостности мембран гепатоцитов определяли по антицитолитическому действию (снижение активности аланинаминотрансферазы (АлАТ), аспартатаминотрансферазы (АсАТ)).Результаты и их обсуждение. По результатам исследования было установлено, что среди 43 исследуемых соединений 5 способны содействовать выживанию на уровне 85,71 %. Таким образом, среди исследуемых веществ эффективным следует считать соединение 2c, которое способствовало 85,71 % выживаемости подопытных животных и снижению уровня АлАТ на 33,33 % и АсАТ на 34,33 % соответственно. При этом наблюдалась очень слабая обратная зависимость вышеуказанных показателей (r = -0,31).Выводы. В ходе исследования установлены некоторые закономерности химического строения, зависящие от гепатопротекторного действия производных 1,2,4-триазола; так выживаемость подопытных животных снижалась при введении с N4 атомом азота фенильного заместителя исходных тионов.Актуальність створення лікарських засобів з високою ефективністю і низькою вартістю для профілактики і лікування захворювань травневої системи є безперечною. Нами проведено аналіз ряду робіт, в яких проводилися дослідження гепатопротекторної дії похідних 1,2,4-тріазолу, і проявляли високі показники гепатозахисної дії. Тому пошук гепатопротекторів в ряду похідних 1,2,4-тріазолу має не тільки теоретичну, а й практичну значимість.Метою нашої роботи було дослідження вперше синтезованих похідних 1,2,4-тріазол-3-тіонів, що містять по С5 атому вуглецю замісники в умовах тетрахорметанового гепатиту.Для моделювання токсичного гепатиту був використаний гепатотоксичний ксенобіотик – Тетрахлорметан. Вивчення біохімічних показників стану печінки проводили через 24 години після останнього введення тетрахлорметана. Здатність досліджуваних сполук до відновлення цілісності мембран гепатоцитів визначали по антіцітолітічному дії (зниження активності аланінамінотрансферази (АлАТ), аспартатмінотрансферази (АСТ)).За результатами дослідження було встановлено, що серед 43 досліджуваних сполуки 5 здатні попереджати виживання на рівні 85,71%.Таким чином серед досліджуваних речовин ефективною слід вважати сполуку 2c, яка сприяло 85,71% виживання піддослідних тварин і зниження рівня АлАТ на 33,33% і АсАТ на 34,33% відповідно. При цьому спостерігалася дуже слабка зворотня залежність вищевказаних показників (r = – 0.31).В ході дослідження встановлено деякі закономірності хімічної будови від гепатопротекторної дії похідних 1,2,4-тріазолу, так виживаність піддослідних тварин знижувалася при введенні з N4 атомому азоту фенильного замісника вихідних тіонів

Establishment of diuretic activity indicators for (3-thio-4-R-4-H-1,2,4-triazole-5-yl)(phenyl)methanols and their derivatives

Diuretic drugs are drugs that, by blocking the transport systems of the renal tubules, promote the removal of excess electrolytes and water from the body, normalization of the internal environment. They eliminate edema, reduce the fluid content in the body cavity. Diuretic drugs differ in their chemical structure, the mechanism of action on the urinary tract function of the kidneys and on the mechanisms of regulation of this function. It should be noted that the use of the above mentioned agents can lead to undesirable side effects, such as nausea, vomiting, unpleasant sensations in the stomach, headache, facial hyperemia. To date, there is evidence that 5-R-1,2,4-triazole derivatives have diuretic activity. The advantage of synthetic triazole derivatives is that, along with the expressed pharmacological action of the compound, there are relatively low rates of acute and chronic toxicity, but almost no side effects. Therefore, it is important to create new low-toxic substances of derivatives (3-thio-4-R-4-H-1,2,4-triazole-3-yl)(phenyl)methanols and study their diuretic properties. The purpose of the work is the purposeful search for new low-toxic and highly effective diuretic compounds among the derivatives of (3-thio-4-R-4-H-1,2,4-triazole-5-yl)(phenyl)methanols. Materials and methods. To establish the influence of compounds, which have been synthesized at the Physical and Chemical Chemistry Department of ZSMU, the method of E. B. Berchin was used on the excretory function of kidneys. Experiments on diuretic activity were conducted at the Department of Clinical Pharmacy, Pharmacotherapy and MFE of FPE, Zaporizhzhia State Medical University. Results. The diuretic activity of derivatives (3-thio-4-R-4H-1,2,4-triazole-5-yl)(phenyl)methanols was investigated. The study and analysis of the obtained experimental data were compared with the reference diuretic hypothiazide. Regularities "structure – activity" were established. The studies indicate that (3-thio-4-R-4H-1,2,4-triazoles-3-yl)(phenyl)methanol are not able to exceed hypothiazide diuretic effect, but 4-(5-hydroxy(phenyl)methyl-4-phenyl-4H-1,2,4-triazolе-3-ylthiomethyl)benzonitrile showed the results closer to the reference drug. Conclusion. By the method of E.B. Berchin the diuretic activity of derivatives (3-thio-4-R-4H-1,2,4-triazol-5-yl)(phenyl)methanols was investigated. Derivatives (3-thio-4-R-4H-1,2,4-triazole-3-yl)(phenyl)methanols do not excee the diuretic action of hypothiazide. Patterns "structure – action" were established. The most active compound was 4-(5-hydroxy(phenyl)methyl-4-phenyl-4H-1,2,4-triazolе-3-ylthiomethyl)benzonitrile

Predictive and prognostic significance of mRNA expression and DNA copies aberrations of ERCC1, RRM1, TOP1, TOP2A, TUBB3, TYMS, and GSTP1 genes in patients with breast cancer

Increasingly, many researchers are focusing on the sensitivity in breast tumors (BC) to certain chemotherapy drugs and have personalized their research based on the assessment of this sensitivity. One such personalized approach is to assess the chemotherapy’s gene expression, as well as aberrations in the number of DNA copies—deletions and amplifications with the ability to have a significant effect on the gene’s activity. Thus, the aim of this work was to study the predictive and prognostic significance of the expression and chromosomal aberrations of eight chemosensitivity genes in breast cancer patients. Material and methods. The study involved 97 patients with luminal B breast cancer IIB–IIIB stages. DNA and RNA were isolated from samples of tumor tissue before and after treatment. Microarray analysis was performed for all samples on high-density microarrays (DNA chips) of Affymetrix (USA) CytoScanTM HD Array and Clariom™ S Assay, human. Detection of expression level of seven chemosensitivity genes—RRM1, ERCC1, TOP1, TOP2a, TUBB3, TYMS, and GSTP1—was performed using PCR real-time (RT-qPCR). Results. The expression of the RRM1 (AC scheme), TOP2a, TYMS, and TUBB3 genes in patients with an objective response to treatment (complete and partial regression) is higher than in patients with stabilization and progression (p < 0.05). According to our results, the presence of a high level of GSTP1 in a tumor biopsy is associated with the low efficiency of the NAC CP scheme (p = 0.05). The presence of RRM1 deletion is associated with complete and partial regression, as for the TOP1 and TUBB3 genes (p < 0.05). Higher rates of metastatic survival are associated with a high level of expression and amplification of the GSTP1 gene (log-rank test p = 0.02 and p = 0.05). Conclusion. Thus, a complex assessment of the chemotherapy’s gene expression is important not only for understanding the heterogeneity and molecular biology of breast cancer but also to obtain a more accurate disease prognosis

Study of the physicochemical properties of dispersed aqueous toothpaste systems with sodium chloride and calcium glycerophosphate

To study the physicochemical properties of Dentaswiss Enamel Repair & Protect toothpaste, its aqueous extracts of various concentrations have been prepared. Their high electrical conductivity was established, which is due to the presence of a strong electrolyte - sodium chloride, as well as a significant amount of calcium 0.98-2.18 ± 0.01 mmol / l contained in the ionized state. It is this ionized calcium that is involved in the processes of mineralization of enamel when using this toothpaste. The high concentration of salts in the aqueous extract of the Dentaswiss Enamel Repair & Protect paste is confirmed by an increase in the surface tension of the solution with an increase in the paste content in the aqueous suspension. This indicates the anti-inflammatory effect of the studied therapeutic and prophylactic toothpasteДля изучения физико-химических свойств зубной пасты «Dentaswiss» Enamel Repair&Protect приготовлены её водные вытяжки различной концентрации. Установлена их высокая электропродность, котораяобусловлена присутствием сильного электролита – хлорида натрия, а также значительным количеством кальция 0,98-2,18±0,01ммоль/л, содержащегося в ионизированном состоянии. Именно этот ионизированный кальций участвует в процессах минерализации эмали при использовании данной зубной пасты.Высокая концентрация солей в водной вытяжке пасты «Dentaswiss» Enamel Repair&Protect, подтверждается увеличением поверхностного натяжения раствора с увеличением содержания пасты в водной суспензии. Это свидетельствует о противовоспалительном эффекте исследуемой лечебно- профилактической зубной паст

Comparative assessment of posture among 1st and 3rd year students of the medical and preventive faculty of the Ural state medical university

The purpose of the study is to identify and compare the features and patterns of posture disorders in students of the 1st and 3rd courses of the medical and preventive faculty of USMU.Цель исследования - выявить и сравнить особенности и закономерности нарушений осанки у студентов 1 и 3 курсов медико-профилактического факультета УГМУ

Extracts of Feijoa Inhibit Toll-Like Receptor 2 Signaling and Activate Autophagy Implicating a Role in Dietary Control of IBD

Inflammatory bowel disease (IBD) is a heterogeneous chronic inflammatory disease affecting the gut with limited treatment success for its sufferers. This suggests the need for better understanding of the different subtypes of the disease as well as nutritional interventions to compliment current treatments. In this study we assess the ability of a hydrophilic feijoa fraction (F3) to modulate autophagy a process known to regulate inflammation, via TLR2 using IBD cell lines

Молекулярный фенотип клеток крови, ассоциированный с прогрессированием трижды негативного рака молочной железы

Introduction. triple negative breast cancer is an aggressive clinical phenotype characterized by poor prognosis. immune system plays an important role in the development, treatment response, and progression of solid tumor. The search for immune-related markers associated with the prediction of treatment efficacy and disease prognosis, and based on the use of high-resolution molecular techniques, is a promising area of research, the results of which can be translated into clinical practice. Case description. The molecular profile of blood mononuclear cells in a 48-year-old female patient with histologically proven triple negative breast cancer (estrogen Receptor – 0; progesteron Receptor – 0; Her2/neu – 0; gata-3 – 0, androgen Receptor – 0 and Ki67 – 70 %) was described. The patient did not response to neoadjuvant chemotherapy with 4 cycles of paclitaxel + carboplatin followed by 2 cycles of adriamycin + cyclophosphamide. The patient underwent surgery. disease progression (pelvic bone metastases) occurred 2 months after surgery. The features of blood lymphocytes and monocytes associated with a lack of response to neoadjuvant chemotherapy and disease progression were described.Conclusion. This clinical case demonstrates that sequencing of peripheral blood mononuclear cells can be used as a method for identifying predictive markers of therapy efficacy and developing personalized treatments for patients with triple negative breast cancer.Актуальность. Трижды негативный подтип рака молочной железы характеризуется агрессивным течением и неблагоприятным прогнозом. Компоненты иммунной системы как непосредственные участники патогенеза играют роль в развитии, ответе на терапию и прогрессировании этой нозологии. Поиск маркеров иммунных клеток, ассоциированных с предсказанием эффективности лечения и прогнозом заболевания, основанный на применении молекулярных методов высокого разрешения, является перспективным направлением поискового исследования, результаты которого можно транслировать в клиническую практику. Описание клинического случая. Представлен первый опыт описания молекулярного профиля мононуклеарных клеток крови пациентки с трижды негативным раком молочной железы. Опухоль: инвазивная карцинома неспецифического типа с экспрессией: estrogen Receptor – 0; progesteron Receptor – 0; Her2/neu – 0; gata-3 – 0, androgen Receptor – 0, Ki67 – 70 % опухолевых клеток. Отмечено отсутствие ответа на неоадъювантную химиотерапию по схеме: 4 цикла «паклитаксел + + карбоплатин», с последующими 2 курсами АС (адриамицин + циклофосфан). Пациентке проведено оперативное лечение, через 2 мес после которого выявлены метастазы в кости таза. У пациентки описаны особенности лимфоцитов и моноцитов крови, которые могут быть ассоциированы с отсутствием ответа на неоадъювантную химиотерапию и прогрессированием заболевания.Заключение. Представленное клиническое наблюдение показывает, что метод секвенирования мононуклеарных клеток периферической крови можно использовать в качестве поискового для обнаружения предиктивных маркеров эффективности терапии и создания персонифицированной системы лечения пациенток с трижды негативным раком молочной железы