“Stewards of the future: accompanying the rising tide of young voices by setting youth-inclusive research agendas in sustainability research”

Background From the worldwide youth-led climate strikes of 2018–2019 to the student-initiated austerity protests in Chile in 2019, it is undeniable that young people have been protagonists in pressuring for social change towards greater sustainability in recent years. This piece reflects on youth as agents of social-ecological change, and what researchers can learn from the rise in youth-led social movements demanding action in the face of global sustainability challenges. The study of sustainability problems like climate change and biodiversity loss, intrinsically requires consideration of inter-generational equity. However, despite 50% of the global population being under 30 years old, youth are often not included explicitly as actors in environmental social sciences and sustainability-related research. Here we discuss why explicitly considering young people as distinct actors during the research process is important, as it allows researchers to engage in just and inclusive work whilst at the same time accounting for important agents of change in complex social-ecological systems. Results As a framework for our inquiry we present the themes which emerged during a series of international meetings and forums on sustainability challenges and youth in 2019, a year characterized by world-wide youth mobilization. Our briefing spans the United Nations Youth 2019 Climate Action Summit, the post-2020 meetings organized by the youth branch of the Convention of Biological Diversity (CBD), the UNESCO Man and Biosphere Youth forums and the results from the Global Shapers Survey of the World Economic Forum. Conclusions We argue that if researchers wish to facilitate youth-inclusive evidence-based decision making, research agendas must address knowledge gaps highlighted by institutional efforts to incorporate youth concerns within global sustainability policy, a recommendation that is even more relevant in the light of the COVID-19 crisis. We draw on the themes which emerged in our analysis of international youth meetings to provide recommendations for research agendas which account both for young actors as both passive and active components of social-ecological change and we propose a more inclusive and holistic study of coupled natural-human systems.publishedVersio

Categorização funcional de sequências expressas envolvidas na defesa do cafeeiro a doenças.

O entendimento dos mecanismos de defesa e da interação do cafeeiro com patógenos pode ser útil no desenvolvimento de novas alternativas para um controle eficiente das doenças. Tem sido demonstrado, em diferentes espécies de plantas, que genes R, responsáveis pelo reconhecimento dos patógenos, apresentam domínios conservados, como NBS (Nucleotide Binding Site) e LRR (Leucine Rich Repeat). Dessa forma, nesse trabalho, seqüências do Projeto Brasileiro do Genoma Café, previamente identificadas como contendo domínios NBS e LRR, foram funcionalmente categorizadas. A categorização foi realizada em 140 EST-contigs, sendo que 99 foram classificados em pelo menos uma das categorias funcionais do Gene Ontology. Essa categorização permitiu associar os produtos preditos das EST-Contigs com os processos biológicos que incluíram resposta de defesa e apoptose e com funções moleculares como ligação a nucleotídeo e atividade de transdutor de sinais. Esses e outros termos encontrados são comprovadamente relacionados com a atuação de genes de resistência no mecanismo de defesa da planta

FREE VIBRATION ANALYSIS OF RECTANGULAR PLATES WITH VARIABLE THICKNESS

An approximate method for analyzing the free vibration of rectangular plates with variable thickness is proposed. The approximate method is based on the Green function of a rectangular plate. The Green function of a rectangular plate with arbitrary variable thickness is obtained as a discrete form solution for deflection of the plate with a concentrated load. The discrete form solution is obtained at each discrete point equally distributed on the plate. It is shown that the numerical solution for the Green function has the good convergency and accuracy. By applying the Green function, the free vibration problem of plate is translated into the eigen-value problem of matrix. The convergency and accuracy of the numerical solutions for the natural frequency parameter calculated by the proposed method are investigated, and the freqency parameters and their modes of free vibration are shown for some rectangular plates

Plant breeding with marker-assisted selection in Brazil.

Over the past three decades, molecular marker studies reachedextraordinary advances, especially for sequencing and bioinformatics techniques.Marker-assisted selectionbecamepart of the breeding program routines of important seed companies, in order to accelerate and optimize the cultivar developing processes. Private seed companies increasingly use marker-assisted selection, especially for the species of great importance to the seed market, e.g. corn, soybean, cotton, and sunflower. In the Brazilian public institutions few breeding programs use it efficiently.The possible reasons are: lack of know-how, lack of appropriate laboratories, few validated markers, high cost, and lack of urgency in obtaining cultivars. In this article we analyze the use and the constraints of marker-assisted selection in plant breeding programs of Brazilian public institute

Obtenção de marcador molecular potencialmente envolvido com a resistência do cafeeiro à ferrugem.

O Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) gerou um banco de dados contendo mais de 200.000 ESTs (Expressed Sequence Tags). Em trabalho preliminar, o banco foi minerado por meio de análise in silico e identificaram-se várias seqüências potencialmente associadas à resistência do cafeeiro a patógenos. Visando verificar o envolvimento destas seqüências com a resistência do cafeeiro à ferrugem foram desenhados oligonucleotídeos iniciadores (primers) que amplificaram as seqüências mineradas. Noventa pares de oligonucleotídeos iniciadores específicos foram desenhados utilizando o programa computacional Primer3. A estabilidade dos oligonucleotídeos foi verificada por meio do programa PrimerSelect®. Diferentes concentrações dos componentes da reação de PCR foram analisadas. Para a amplificação no termociclador, foram avaliadas diferentes combinações de tempo e temperatura, incluindo touchdown PCR. Utilizando as condições de reação e amplificação otimizadas, 40 iniciadores foram testados em 12 genótipos resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Destes, 29 resultaram em bandas únicas e bem definidas, sendo um polimórfico. Os demais 50 estão sendo testados por PCR. Este trabalho permitiu obter, até o momento, um marcador molecular polimórfico entre os dois grupos de indivíduos resistentes e susceptíveis. Para confirmar a possível ligação e seu potencial, o marcador está sendo testado em diferentes populações do Programa de Melhoramento da UFV/EPAMIG

Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico.

A partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência a Hemileia vastatrix Berk. et Br. presentes nos cafeeiros. Foram usadas diferentes estratégias para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como ?iscas? para mineração dos dados. Com o auxílio de ferramentas disponíveis na plataforma de bioinformática do PBGC, criaram-se projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. Utilizou-se, também, o ?Electronic Northern?, uma ferramenta desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). A mineração, usando as três estratégias, identificou 8.968 seqüências do PBGC. O envolvimento ou ligação destas seqüências com genes de resistência à ferrugem do cafeeiro será confirmado, em trabalhos futuros, utilizando marcadores moleculares e técnicas de genômica funcional

Effects of curcumin in an orthotopic murine bladder tumor model

Cigarette smoking (CS) is the main risk factor for bladder cancer development. There are more than 100 carcinogens present in cigarette smoke. Among the potential mediators of CS-induced alterations is nuclear factor-kappa (NF-κB), which is responsible for the transcription of genes related to cell transformation, tumor promotion, angiogenesis, invasion and metastasis. Curcumin is a polyphenol compound derived from Curcuma longa that suppress cellular transformation, proliferation, invasion, angiogenesis, and metastasis by down regulating NF-κB and its regulated genes. The aim of our study was to assess the effects of curcumin in bladder urothelial carcinoma. We studied the effects of curcumin in vitro and in vivo using the orthotropic syngeneic bladder tumor animal model MB49. Curcumin promotes apoptosis of bladder tumor cells in vitro. In vivo tumors of animals treated with curcumin were significantly smaller as compared to controls. Using immunohistochemistry, we demonstrated a decrease in the expression of Cox-2 by 8% and Cyclin D1 by 13% in the animals treated with curcumin; both genes regulated by NF-κB and related to cell proliferation. In this study, we showed that curcumin acts in bladder urothelial cancer, possibly dowregulating NF-κB-related genes, and could be an option in the treatment of urothelial neoplasms. The results of our study suggest that further research is warranted to confirm our findings

Identificação de cromossomo artificial de bactéria contendo gene de resistência a doenças em cafeeiro.

O estudo e a caracterização de fatores genéticos de resistência são importantes para ampliar os conhecimentos da interação planta-patógeno. O marcador molecular CARF 005, identificado em trabalho anterior, é capaz de identificar um fragmento de gene de resistência a doenças presente em genótipos de cafeeiro resistentes a ferrugem, principal doença da cultura. Neste trabalho, o CARF 005 foi utilizado para fazer o screening de uma biblioteca BAC de Coffea arabica com 56.832 clones. Foram identificados dois clones contendo o fragmento do gene de resistência. Após o sequenciamento, esses poderão ser usados para estudo da estrutura do gene e, eventualmente, em obtenção de plantas transgênicas para auxiliar programas de melhoramento

Identificação e caracterização de microssatélites provenientes de sequências expressas do projeto brasileiro de genoma café.

Dentre os marcadores genéticos disponíveis, os microssatélites ou SSRs (Simple Sequence Repeats) têm sido os escolhidos para diferentes estudos genéticos por apresentarem características que agregam simplicidade técnica, grande poder de resolução e alto nível de polimorfismo. Com a disponibilidade das seqüências ESTs (Expressed Sequence Tags), geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café, surgiu a oportunidade de desenvolver esses marcadores, de forma direta e eficiente, por meio de análise eletrônica. Visando o desenvolvimento futuro de marcadores SSRs para café, nesse trabalho foram identificados e caracterizados microssatélites nas seqüências expressas do genoma do cafeeiro. A mineração dos dados foi realizada utilizando-se todas as combinações de di-, tri- e tetranucleotídeos formadores dos microssatélites, perfazendo um total de 46 combinações (quatro de dinucleotídeos, 10 de trinucleotídeos e 32 de tetranucleotídeos). Foram considerados os microssatélites perfeitos e com tamanho mínimo de 12 pares de bases. Do total de 130.792 ESTs proveniente de C. arabica foram identificadas 37.826 contendo microssatélites, que após a clusterização resultou em 24.031 EST-SSR. Dentre estas, 45,11% apresentaram tetranucleotídeos, 36,67% trinucleotídeos e 18,23% dinucleotídeos. As unidades repetitivas mais abundantes dentro de cada categoria de EST-SSR foram (AG)n encontrada em 57,08% das sequências contendo dinucleotídeos, (AGG)n com 30,79% dos trinucleotídeos e (AGGG)n com 33,24% dos tetranucleotídeos. A grande quantidade de SSRs identificada nas seqüências transcritas do genoma do cafeeiro demonstra que essas são fontes valiosas para o desenvolvimento dos marcadores moleculares EST-SSRs