Adaptación de la técnica Personas para mejorar su integración en procesos de desarrollo ágil

Los procesos de desarrollo ágil están aumentando su consideración sobre la usabilidad, integrando diferentes técnicas de diseño centrado en el usuario a lo largo del desarrollo. Una de estas técnicas es Personas, que propone el diseño de usuarios ficticios que comparten las preferencias de los usuarios reales para realizar el diseño de aplicaciones. Como la aplicación de esta técnica entra en conflicto con las limitaciones de tiempo del desarrollo ágil, Personas se ha ido adaptando a lo largo de los años. Por ello, el primer objetivo de este trabajo es determinar el nivel de adopción y el tipo de integración que se ha llevado a cabo en los últimos años para poder proponer mejoras a la técnica. Durante la primera etapa del estudio se ha llevado a cabo un mapeo sistemático de la literatura, recuperando 28 artículos que fueron agrupados por tipo de metodología ágil. En ellos se identifican algunos puntos de integración comunes, independientemente del tipo de proceso ágil, como la etapa del ciclo de vida o el análisis del usuario objetivo, y también algunos problemas frecuentes, principalmente relacionados con los tiempos del proyecto y la representación del contexto de Personas. Con base en estas dificultades, el segundo objetivo del trabajo es proponer una posible mejora de la técnica, reduciendo las tareas de la investigación contextual y así evitando generar un impacto temporal tan grande al comienzo del desarrollo. Al terminar cada iteración, la persona preliminar se irá refinando mediante la validación de los subproductos con los usuarios, acercándose cada vez más a las preferencias reales de ellos. Para validar esta adaptación, se lleva a cabo un Estudio de Caso, donde se utiliza la adaptación propuesta de la técnica Personas para desarrollar la interfaz gráfica de un software de procesado de imágenes dentro de Scipion: una plataforma que integra distintos programas de procesamiento de imagen de microscopía electrónica. Dicho proyecto se ha llevado a cabo con la colaboración de la Unidad de Biocomputación del Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), desde la perspectiva del Product Owner. En conclusión, este estudio analiza las diferentes estrategias de integración de la técnica de Personas dentro de los procesos ágiles, evalúa las dificultades encontradas y propone una solución que se valida mediante un estudio de caso. Si bien los ajustes realizados a la técnica resultaron útiles en este caso, es necesario continuar con las investigaciones futuras para determinar su utilidad en otros proyectos, con el objetivo de desarrollar software ágil cada vez más usable

A systematic mapping study on integration proposals of the personas technique in agile methodologies

Agile development processes are increasing their consideration of usability by integrating various user‐centered design techniques throughout development. One such technique is Personas, which proposes the creation of fictitious users with real preferences to drive application design. Since applying this technique conflicts with the time constraints of agile development, Personas has been adapted over the years. Our objective is to determine the adoption level and type of integration, as well as to propose improvements to the Personas technique for agile development. A systematic mapping study was performed, retrieving 28 articles grouped by agile methodology type. We found some common integration strategies regardless of the specific agile approach, along with some frequent problems, mainly related to Persona modelling and context representation. Based on these limitations, we propose an adaptation to the technique in order to reduce the creation time for a preliminary persona. The number of publications dealing with Personas and agile development is increasing, which reveals a growing interest in the application of this technique to develop usable agile softwareThis research was funded by the Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities research grant PGC2018-097265-B-I00, MASSIVE project (RTI2018-095255-B-I00) and by EIT-Health, grant number 19091 (POSITIVE project). This research was also supported by the Madrid Region R&D programme (project FORTE, P2018/TCS-4314

Continuous flexibility analysis of SARS-CoV-2 spike prefusion structures

Using a new consensus-based image-processing approach together with principal component analysis, the flexibility and conformational dynamics of the SARS-CoV-2 spike in the prefusion state have been analysed. These studies revealed concerted motions involving the receptor-binding domain (RBD), N-terminal domain, and subdomains 1 and 2 around the previously characterized 1-RBD-up state, which have been modeled as elastic deformations. It is shown that in this data set there are not well defined, stable spike conformations, but virtually a continuum of states. An ensemble map was obtained with minimum bias, from which the extremes of the change along the direction of maximal variance were modeled by flexible fitting. The results provide a warning of the potential image-processing classification instability of these complicated data sets, which has a direct impact on the interpretability of the results.The authors would like to acknowledge financial support from CSIC (PIE/COVID-19 No. 202020E079), the Comunidad de Madrid through grant CAM (S2017/BMD-3817), the Spanish Ministry of Science and Innovation through projects SEV 2017-0712, FPU-2015/264 and PID2019-104757RB-I00/AEI/ FEDER, the Instituto de Salud Carlos III [PT17/0009/0010 (ISCIII-SGEFI/ERDF)], and the European Union and Horizon 2020 through grants INSTRUCT–ULTRA (INFRADEV-03-2016-2017, Proposal 731005), EOSC Life (INFRAEOSC-04-2018, Proposal 824087), HighResCells (ERC-2018-SyG, Proposal 810057), IMpaCT (WIDESPREAD- 03-2018, Proposal 857203), CORBEL (INFRADEV-1-2014-1, Proposal 654248) and EOSC–Synergy (EINFRA-EOSC-5, Proposal 857647). HDT and BF were supported by NIH grant GM125769 and JSM was supported by NIH grant R01-AI12752

Aplicación de la técnica Personas en un proyecto de desarrollo ágil con Scrum

Este Trabajo Fin de Grado lleva a cabo un estudio de caso que tiene como objetivo validar una transformación de la técnica de usabilidad Personas, para ser integrada en un proceso de desarrollo ágil real con Scrum. El proyecto consiste en diseñar una aplicación móvil con el equipo de desarrollo ágil de la empresa Camposanto Parque de la Paz de Guayaquil, Ecuador, para los empleados del departamento de ventas de la misma empresa. La técnica Personas se basa en crear modelos de usuarios ficticios denominados personas, que engloban las preferencias de diseño del conjunto de usuarios reales frente al producto que se desea desarrollar. Cada modelo de persona sintetiza la personalidad de un conjunto de usuarios reales, y como se presentan como historias individuales, sus prioridades son más concretas y, por tanto, más fáciles de satisfacer por el equipo durante el desarrollo. Los procesos de desarrollo ágil cada vez tienen en mayor consideración a los Diseños Centrados en Usuario (DCU), debido a que una metodología ágil no garantiza necesariamente que el resultado del desarrollo sea usable, y si no lo es, es más probable que dicha aplicación caiga en desuso. A lo largo de este trabajo se muestran las distintas técnicas de integración de DCU en procesos ágiles, y durante el estudio se aplica la estrategia de integración de equipo. Esta estrategia consiste en incorporar a un profesional en DCU dentro de un equipo de desarrollo ágil, y aplicar la técnica Personas en paralelo a las iteraciones del proyecto. La técnica original de Personas, que propone la creación del modelo de diseño al comienzo del proyecto, entra en conflicto con las restricciones temporales que caracterizan al desarrollo ágil. Por este motivo, algunos estudios han transformado la técnica pura en una versión agilizada de la misma, de manera que, en lugar de llevarse a cabo de manera exhaustiva al principio del proyecto, los modelos se van refinando paulatinamente a medida que se completan las iteraciones. En este trabajo se ha evaluado la eficacia de aplicar dicha técnica agilizada en el desarrollo de un proyecto ágil real, desde la perspectiva del experto en DCU. A lo largo del proyecto se ha realizado una evaluación tanto de los resultados de satisfacción de los usuarios con el producto diseñado, como del impacto de haber aplicado la técnica Personas adaptada en dicho proyecto. En ambos casos, las consecuencias de haber aplicado dicha técnica han resultado ser útiles y positivas, y se han obtenido resultados en general satisfactorios, tanto por parte de los usuarios como por parte del equipo de desarrollo

ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation

International audienceImage processing in cryogenic electron tomography (cryoET) is currently at a similar state as Single Particle Analysis (SPA) in cryogenic electron microscopy (cryoEM) was a few years ago. Its data processing workflows are far from being well defined and the user experience is still not smooth. Moreover, file formats of different software packages and their associated metadata are not standardized, mainly since different packages are developed by different groups, focusing on different steps of the data processing pipeline. The Scipion framework, originally developed for SPA (de la Rosa-Trevín et al., 2016), has a generic python workflow engine that gives it the versatility to be extended to other fields, as demonstrated for model building (Martínez et al., 2020). In this article, we provide an extension of Scipion based on a set of tomography plugins (referred to as ScipionTomo hereafter), with a similar purpose: to allow users to be focused on the data processing and analysis instead of having to deal with multiple software installation issues and the inconvenience of switching from one to another, converting metadata files, managing possible incompatibilities, scripting (writing a simple program in a language that the computer must convert to machine language each time the program is run), etcetera. Additionally, having all the software available in an integrated platform allows comparing the results of different algorithms trying to solve the same problem. In this way, the commonalities and differences between estimated parameters shed light on which results can be more trusted than others. ScipionTomo is developed by a collaborative multidisciplinary team composed of Scipion team engineers, structural biologists, and in some cases, the developers whose software packages have been integrated. It is open to anyone in the field willing to contribute to this project. The result is a framework extension that combines the acquired knowledge of Scipion developers in close collaboration with third-party developers, and the ondemand design of functionalities requested by beta testers applying this solution to actual biological problems

The small-molecule SMARt751 reverses Mycobacterium tuberculosis resistance to ethionamide in acute and chronic mouse models of tuberculosis.

The sensitivity of Mycobacterium tuberculosis, the pathogen that causes tuberculosis (TB), to antibiotic prodrugs is dependent on the efficacy of the activation process that transforms the prodrugs into their active antibacterial moieties. Various oxidases of M. tuberculosis have the potential to activate the prodrug ethionamide. Here, we used medicinal chemistry coupled with a phenotypic assay to select the N-acylated 4-phenylpiperidine compound series. The lead compound, SMARt751, interacted with the transcriptional regulator VirS of M. tuberculosis, which regulates the mymA operon encoding a monooxygenase that activates ethionamide. SMARt751 boosted the efficacy of ethionamide in vitro and in mouse models of acute and chronic TB. SMARt751 also restored full efficacy of ethionamide in mice infected with M. tuberculosis strains carrying mutations in the ethA gene, which cause ethionamide resistance in the clinic. SMARt751 was shown to be safe in tests conducted in vitro and in vivo. A model extrapolating animal pharmacokinetic and pharmacodynamic parameters to humans predicted that as little as 25 mg of SMARt751 daily would allow a fourfold reduction in the dose of ethionamide administered while retaining the same efficacy and reducing side effects.info:eu-repo/semantics/publishe