Monitoring primary carbon metabolism in plants using heavy isotope labelling and mass spectrometry

This thesis covers the possibilities and limitations of studying primary metabolism in intact plants, with special focus on heavy isotope labelling and mass spectrometry methodology. In paper I, a series of Arabidopsis thaliana mutants lacking one or both genes of mitochondrial malate dehydrogenase (mMDH characterised) were characterised. We found that mMDH has a complex respiration-controlling role. In paper II, we continued to study one of the single mutants, mmdh1. We developed a method using ¹³CO₂ to label whole plants and analyse their metabolic profiles by gas and liquid chromatography coupled to mass spectrometry (GC- and LC-MS). The results show that mmdh1 had a metabolic phenotype that revealed an altered flux through photorespiration, especially under low CO₂ conditions. Combining incorporation data with metabolite pool size deepened our understanding regarding the role of mMDH in photorespiration, respiration, and cellular redox balance. The practical and theoretical aspects of ¹³C-labelling of plants learned from this study were used for designing the experimental setup of paper III, a labelling study of developing wood in hybrid aspen. The labelling strategy, time resolution, and sampling had to be adapted to suit woody plants. Two months old trees were labelled with ¹³CO₂ in a 4 h burst and then sampling of source leaves, stem phloem, and developing wood continued over 24 hours. Since sucrose is the main carbon transporter the analysis was concentrated around this metabolite. We found previously unrecognised temporal patterns in wood biosynthesis and an indication that the diurnal cycle serves as a cue in the regulation of carbon allocation in developing wood. To study systems with complex structures such as plants, it is informative to study specific cell types rather than whole plants or whole organs. In paper IV, a method was developed for analysis of metabolite profiles in cell type specific cells. Isolated protoplast from Arabidopsis roots were sorted by fluorescence-activated cell sorting (FACS) and their metabolite profiles were analysed by GC-MS. The method is fast, robust and reliable for analysis of cell type specific metabolic profiling and a beginning to meet the call for new metabolite analysis techniques with a high spatial resolution

IDOL regulates systemic energy balance through control of neuronal VLDLR expression.

Liver X receptors limit cellular lipid uptake by stimulating the transcription of Inducible Degrader of the LDL Receptor (IDOL), an E3 ubiquitin ligase that targets lipoprotein receptors for degradation. The function of IDOL in systemic metabolism is incompletely understood. Here we show that loss of IDOL in mice protects against the development of diet-induced obesity and metabolic dysfunction by altering food intake and thermogenesis. Unexpectedly, analysis of tissue-specific knockout mice revealed that IDOL affects energy balance, not through its actions in peripheral metabolic tissues (liver, adipose, endothelium, intestine, skeletal muscle), but by controlling lipoprotein receptor abundance in neurons. Single-cell RNA sequencing of the hypothalamus demonstrated that IDOL deletion altered gene expression linked to control of metabolism. Finally, we identify VLDLR rather than LDLR as the primary mediator of IDOL effects on energy balance. These studies identify a role for the neuronal IDOL-VLDLR pathway in metabolic homeostasis and diet-induced obesity

Development of a Model System to Identify Differences in Spring and Winter Oat

Our long-term goal is to develop a Swedish winter oat (Avena sativa). To identify molecular differences that correlate with winter hardiness, a winter oat model comprising of both non-hardy spring lines and winter hardy lines is needed. To achieve this, we selected 294 oat breeding lines, originating from various Russian, German, and American winter oat breeding programs and tested them in the field in south- and western Sweden. By assaying for winter survival and agricultural properties during four consecutive seasons, we identified 14 breeding lines of different origins that not only survived the winter but also were agronomically better than the rest. Laboratory tests including electrolytic leakage, controlled crown freezing assay, expression analysis of the AsVrn1 gene and monitoring of flowering time suggested that the American lines had the highest freezing tolerance, although the German lines performed better in the field. Finally, six lines constituting the two most freezing tolerant lines, two intermediate lines and two spring cultivars were chosen to build a winter oat model system. Metabolic profiling of non-acclimated and cold acclimated leaf tissue samples isolated from the six selected lines revealed differential expression patterns of 245 metabolites including several sugars, amino acids, organic acids and 181 hitherto unknown metabolites. The expression patterns of 107 metabolites showed significant interactions with either a cultivar or a time-point. Further identification, characterisation and validation of these metabolites will lead to an increased understanding of the cold acclimation process in oats. Furthermore, by using the winter oat model system, differential sequencing of crown mRNA populations would lead to identification of various biomarkers to facilitate winter oat breeding

Varje flicka bär med sig sin historia! Professionellas bemötande av självskadebeteende

Undersökningens syfte var att ta reda på vilket bemötande flickor med självskadebeteende får av professionella inom olika verksamheter, med inriktning på stöd och behandling. Följande frågeställningar användes för att besvara syftet; Hur får flickorna stöd? Vilken behandling får flickorna? Vilka andra viktiga aspekter bör uppmärksammas i det professionella arbetet med flickor med självskadebeteende? Utifrån en kombination av en kvantitativ och en kvalitativ ansats genomfördes undersökningen i fem kommuner i Västra Götaland. Enkäterna besvarades av professionella som arbetar inom skolhälsovård, ungdomsmottagningar samt BUP, barn- och ungdomspsykiatrin. Totalt besvarades enkäten av 60 personer, vid 20 verksamheter. En halvstrukturerad intervju genomfördes dessutom med en professionell, med erfarenhet av kognitiv beteendeterapeutisk behandling av flickor med självskadebeteende. Analysen av materialet skedde utifrån kognitiv beteendeterapi och utfördes med ad-hoc metod, som med sitt eklektiska perspektiv möjliggjorde tolkning av materialet med hjälp av tabeller, text och tematisering. Resultatet visar att flickor med självskadebeteende är en heterogen grupp med en egen problematik, som ofta är komplex, då den skiftar i svårighetsgrad. De professionella som möter dessa flickor är erfarna, men de önskar ändå mer kunskap, kring självskadebeteende. Flickorna får ett individuellt bemötande av de professionella inom de undersökta verksamheterna, vad gäller både stöd och behandling. Samtalsstöd, motivations- och familjearbete utgör en stor del av det stöd som professionella ger målgruppen. Det visar sig även att flickans familj är betydelsefull och utgör en resurs i ett förändringsarbete. Viktiga aspekter som visar sig är samverkan mellan verksamheter och tid, kunskap och handledning för professionella

Utvärdering av användandet av Smiley-systemet : Miljökontor och livsmedelsverksamheter i två kommuner i Skåne

A system for the publication of the control results on food businesses were introduced in Sweden but for various reasons it was never fully implemented. It was, however, a few municipalities in Sweden which became curious about this system and gradually began to use it. In this study, I have investigated what perceptions and views local authorities and associated food businesses that use the system have and if they think that it is a good system. 2 municipalities were interviewed with related food industries and a simple questionnaire about their views on the system was sent to a few more establishments. The results showed that local authorities were satisfied with the system and considered that so far there were no disadvantages to the system. The food businesses felt that the Smiley system was mainly a positive system, and in their view above all for the customer. The non-premier a Smiley considered it a positive system so long as it was done in the right way. The majority of the interviewed businesses felt that there was a marketing value in having the Smiley sticker.Ett system för offentliggörande av kontrollresultat på livsmedelsverksamheter i Sverige planerades för några år sedan men av olika skäl infördes aldrig systemet. Det var dock några kommuner i Sverige som på frivillig väg började använda sig av systemet. I denna studie ville jag undersöka vad inspektörerna och tillhörande livsmedelsverksamhetsutövare, som använder sig av systemet, hade för uppfattning och synpunkter på systemet benämnt Smiley. Undersökning genomfördes dels med intervjuer och dels med enkäter. Inspektörer och livsmedelsverksamhetsutövare intervjuades i två kommuner i Skåne. En enkel enkät skickades ut till några fler verksamhetsutövare i kommunen. Resultatet visade att inspektörerna var nöjda med systemet och de ansåg att det än så länge inte fanns några större nackdelar med systemet. Livsmedelsverksamhetsutövarna ansåg att i grunden är Smiley ett positivt system och framförallt ansåg de att Smiley är bra för kunden. Vid de verksamheter som inte premierats med en Smiley ansåg verksamhetsutövarna att det var ett positivt system så länge det gjordes på rätt sätt. Majoriteten av de intervjuade verksamhetsutövarna ansåg att det fanns ett marknadsföringsvärde att ha Smiley-dekalen

Management lingo today : a study of four management consulting companies’ parlance on their websites

Syftet med denna studie var att undersöka hur språkanvändningen på en särskild kommunikationskanal, nämligen webbsidor, ser ut hos olika företag inom branschen för managementkonsulting. Studien gjordes på uppdrag av Madicon Communication AB vilket är grunden till att ett vidare syfte även var att undersöka hur Madicon med hjälp av språket och de likheter samt skillnader som framkommit kan positionera sig annorlunda i förhållande till andra företag i samma bransch. I denna undersökning studerades komposition samt frekvens av engelska uttryck, facktermer, upprepningar, pronomen och tilltal, informella och formella ordval och användning av versaler samt språkhandlingar. Resultatet visade bland annat att alla fyra företagen till stor del använder samma delar i kompositionen, men att det finns skillnader beroende på företagens inriktningar. Vidare använder de två tekniskt inriktade företagen engelska mest. Facktermer visade sig tydligt ha en väsentlig roll inom managementspråket då stor mängd påträffats i texterna. När det kommer till upprepningar och hur företagen valde att synas i sina texter kunde vi återigen se skillnad utefter företagens inriktning. Utifrån studiens resultat är endast Madicon det företag som följer riktlinjerna om att företag vinner på att låta både ett ’vi’ och ett ’du’ synas i texter på webben. Resultatet visade även att företagen håller olika grad av formalitet vilket möjligt gör att företagen uppfattas olika. Madicon använder i jämförelse med de andra företagen versaler mer frekvent. Utifrån att alla fyra företagen använde språkhandlingarna ’erbjudande’ och ’löfte’ i båda sina texter kan dessa tolkas som centrala

The effect of fonts on mobile devices for people with dyslexia : A study on different fonts

Personer med dyslexi har svårt att läsa och stava. Typografi har signifikant visats påverka tillgängligheten för dyslektiska läsare. Syftet med denna kandidatuppsats var därför att utforska läsupplevelsen hos personer med dyslexi avseende olika typsnitt på mobila enheter. För detta genomfördes en kvalitativ studie där data samlades in genom individuella semistrukturerade intervjuer och ett läsupplevelsetest med sex forskningsdeltagare, som alla hade dyslexi. De insamlade uppgifterna analyserades tematiskt och diskuterades med hjälp av relaterad litteratur från forskningsområdet inom interaktionsdesign, läsupplevelse, läsbarhet, dyslexi och typografi inklusive självbestämmandeteori. Forskningsresultaten visade att samtliga typsnitt ansågs både vara enkla och svåra av informanterna som intervjuades. Verdana var det typsnitt som flest ansågs vara enkelt att läsa med. Flera informanter upplevde även svårigheter gällande ord och olika avstånd däribland rad – och teckenavstånd. Studien visar att olika typsnitt och typsnittens tecken- eller radavstånd samt teckenstorlek påverkar läsupplevelsen för dyslektiska läsare.People with dyslexia have difficulty reading and spelling. Typography has been shown to significantly affect accessibility for dyslexic readers. The purpose of this bachelor's thesis was therefore to explore the reading experience of people with dyslexia regarding different fonts on mobile devices. For this, a qualitative study was conducted in which data was collected through individual semi-structured interviews and a reading experience test with six research participants, all of whom had dyslexia. The collected data were analyzed thematically and discussed using related literature from the research area of interaction design, reading experience, readability, dyslexia, and typography including self-determination theory. The research results showed that all fonts were considered both simple and difficult by the informants interviewed. Verdana was the font that was considered easy to read with. Several informants also experienced difficulties regarding words and different distances including line and character spacing. The study shows that different fonts, font spacing and font size affect the reading experience for dyslexic readers

Barns användning av tecken i sin kommunikation och föräldrars syn på användning av TAKK i förskolan

TAKK (Tecken som Alternativ och Kompletterande Kommunikation) är en metod som används speciellt till hörande barn med behov av stöd i sin kommunikation men TAKK används även nu allt oftare på förskolor för att det kan gynna alla barn även de utan behov av stöd. Barn får både höra det talade språket samtidigt som de får möjligheten att känna orden med hjälp av sina händer. TAKK lär barn att kunna kommunicera på mer än ett sätt. Utbildning är viktigt för de personer som ska använda sig av TAKK för att på bästa sätt kunna hjälpa barnen i deras språkutveckling. Syftet med studien var att undersöka föräldrars syn på användningen av TAKK i förskolan samt ta reda på om barnen använde sig av tecken i sin kommunikation med andra. Metoden som användes i studien var den hermeneutiska ansatsen genom enkäter till föräldrar och den etnometodologiska ansatsen genom observationer av barnens teckenkommunikation. Resultatet av studien visar att föräldrarna överlag var positiva till användningen av tecken på förskolan och att jag i observationerna kunde se att barnen använde sig av tecken för att kommunicera både med pedagoger och kamrater. Det var pedagogerna som använde tecken mest och hade alltid ögonkontakt med barnen när TAKK användes