Pulmonary Nontuberculous Mycobacterial Infections in the State of Para, an Endemic Region for Tuberculosis in North of Brazil

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / Federal University of Para. Tropical Medicine Nucleus. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Federal University of Para. Tropical Medicine Nucleus. Belém, PA, Brazil.Oswaldo Cruz Institute. Oswaldo Cruz Foundation. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Federal University of Para. Department of Integrative Medicine. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil

Molecular characterization of pre-extensive drug resistant Mycobacterium tuberculosis in Northeast Brazil

In Fortaleza, the capital of Ceara State, Brazil, the detection rate of tuberculosis (TB) in 2018 was 65.5/100,000 inhabitants with a cure rate of 59.1%, which is higher than the country average. This study investigated the risk factors associated with drug-resistant tuberculosis (DR-TB) and identified the drug-resistance phenotype and resistance-conferring mutations. The geographic distribution of DR-TB in Fortaleza, Brazil, was also determined. From March 2017 to February 2018, 41 DR-TB isolates and 69 drug-susceptible pulmonary TB isolates were obtained from patients seen at a referral hospital in Fortaleza, Brazil. Samples were subjected to phenotypic and genetic analysis of resistance; the spatial distribution of the participants was also analyzed. Primary resistance was high (50.9%) among participants. The following risk factors for DR were identified: being female (p = 0.03), having diabetes (p < 0.01), history of previous TB disease (p < 0.01), and the number of intra-domiciliary contacts (p < 0.01). Analysis by multiplex allele-specific polymerase chain reaction detected mutations in the genes katG (65.8%), rpoB (43.9%), inhA promoter (14.6%), and gyrA (9.8%). Sequencing identified mutations in the the genes katG (75.6%), inhA promoter (19.5%), rpoB (85.4%), and gyrA (100%). There was no mutation in the rrs gene. Spatial analysis showed DR-TB isolates distributed in areas of low socioeconomic status in the city of Fortaleza. Our results emphasized the importance of detecting resistance to TB drugs. The resistance found in the gene gyrA is of concern due to the high number of pre-extensive DR-TB cases in Fortaleza

MANIFESTAÇÕES CUTÂNEAS E CLÍNICAS EM PACIENTES DIAGNOSTICADOS COM COVID-19 NA AMAZÔNIA: SÉRIE DE CASOS

In 2019, a new obscured pneumonia was reported by Wuhan Chinese scientists. Posteriorly, SARS-Cov-2 structure was identified, furthermore the pathology caused by this virus was named as COVID-19. The period of incubation of this disease is something about 4 or 5 days before the onset of symptoms, with 97,5% of patients having 11,5 days of symptoms nearly. Furthermore, affected patients are having cutaneous manifestations, in addition to the classic pulmonary, laboratorial, and systemic affection. Thus, the goal of the present article was the description of the clinical, cutaneous and laboratorial manifestations in adults of 18 to 59 years old affected by COVID19 and supported by São Rafael hospital, localized in Altamira- Pará, a region of AmazonEn 2019, científicos chinos de Wuhan informaron de una nueva neumonía oscurecida. Posteriormente, se identificó la estructura del SARS-Cov-2, además la patología causada por este virus fue denominada como COVID-19. El período de incubación de esta enfermedad es algo así como 4 o 5 días antes de la aparición de los síntomas, con un 97,5% de los pacientes que tienen casi 11,5 días de síntomas. Además, los pacientes afectados están teniendo manifestaciones cutáneas, además de la clásica afección pulmonar, de laboratorio y sistémica. Por lo tanto, el objetivo del presente artículo fue la descripción de las manifestaciones clínicas, cutáneas y de laboratorio en adultos de 18 a 59 años afectados por COVID19 y apoyados por el hospital São Rafael, localizado en Altamira-Pará, una región de la Amazonía.Em 2019, uma nova pneumonia obscurecida foi relatada por cientistas chineses de Wuhan. Posteriormente, foi identificada a estrutura SARS-Cov-2, além disso, a patologia causada por esse vírus foi nomeada como COVID-19. O período de incubação desta doença é algo cerca de 4 ou 5 dias antes do início dos sintomas, com 97,5% dos pacientes tendo 11,5 dias de sintomas próximos. Além disso, os pacientes afetados estão tendo manifestações cutâneas, além do afeto pulmonar, laboratorial e sistêmico clássico. Assim, o objetivo do presente artigo foi a descrição das manifestações clínicas, cutâneas e laboratoriais em adultos de 18 a 59 anos afetados pelo COVID19 e apoiados pelo Hospital São Rafael, localizado em Altamira-Pará, região do Amazona

Tuberculosis Caused by Mycobacterium tuberculosis Complex in a Captive Tapir (Tapirus terrestris)

Background: Tuberculosis is an infectious disease caused by the Mycobacterium tuberculosis complex has already been identified in a great number of wild species. Captive animals may have a potential source for zoonoses, because is related to factors such as cohabitation, direct contact with the public, presence of biological vectors, nutritional deficiencies, absence of sanitary barriers, precautionary hygienic measures and sanitary vigilance. In Brazil, there is little information on tuberculosis in captivity animals, and little attention is given to the risks of disease transmission from humans. The aim of this study was to report the first diagnosed case of tuberculosis Tapirus terrestris in Brazilian Amazon region.Case: One Tapirus terrestris was kept by local zoobotanic foundation in city of Marabá, Southeast of Pará state, Brazilian Amazon, and became ill. Physical examination revealed cough, sneezing, nasal outflow, dyspnea, hyperthermia and lethargy, leading to death. Necropsy demonstrated severe pulmonary alterations: thickening of the inter-alveolar septa, alveolar emphysema, and miliary nodules with dimensions up to 5 mm, which were yellowish-white, caseous, and sometimes calcified. Additionally, large areas of caseous compaction of the parenchyma, characteristic of caseous tuberculosis. Histopathological analysis revealed a process characteristic of mycobacterial infection, with alveoli filled with caseous exudate and thickened septa and fibrocytes, in addition to recently formed tubercles, some with caseous necrosis, calcifications and Langhans cells. In the Ziehl-Neelsen staining, alcohol-acid resistant bacilli were observed in the mesenteric lymph nodes. No mycobacterial growth was observed in Lowenstein-Jensen culture medium. A nested PCR followed by a sequencing assay targeting the hsp65 gene and M. tuberculosis complex member was detected. Water and M. tuberculosis H37Rv were used as negative and positive controls, respectively.Discussion: This article reports the first case of tuberculosis in T. terrestris in Amazonia. The case of infection was caused by a complex of Mycobacterium tuberculosis, as well as reports of other studies described in wild animals. This record presented clinical and pathological similarity with the cases of a tapir and coati at the zoo of Curitiba, and non-human primates in bioteries in Belém. The disease was reported, also, in a T. indicus female in Bangkok, Thailand. In another study with two tapirs there was positivity of tuberculin test result in a Swedish zoo. In necropsy findings of tuberculosis in a Malayan tapir showed multiple white, caseous nodules spread throughout the lungs. Studies have shown that lesions can be in various organs, among them the mediastinal and mesenteric lymph nodes, liver, spleen, kidneys, ovaries, serosa, diaphragm, intestines and uterus. For exemple in a case of disseminated tuberculosis caused by M. tuberculosis in a Malayan tapir were described multiple granulomes, some coalescent, characterized by necrotic caseous centers, with some Langhans giant cells and a discrete fibrotic zone. In the present work, the results of the anatomopathological and molecular assays confirmed the clinical suspicion of respiratory infection and established the conclusive diagnosis of pulmonary tuberculosis caused by M. tuberculosis complex member. It is worth noting that tuberculosis is an important zoonotic disease affecting survival of the species, posing an extinction threat and also a public health concern

Phylogenomic Perspective on a Unique Mycobacterium bovis Clade Dominating Bovine Tuberculosis Infections among Cattle and Buffalos in Northern Brazil.

Lack of routine surveillance in countries endemic for bovine tuberculosis (TB) and limited laboratory support contributes to the inability to differentiate the Mycobacterium tuberculosis Complex species, leading to an underestimated burden of the disease. Here, Whole-Genome Sequencing of Mycobacterium bovis isolated from tissues with TB-like lesions obtained from cattle and buffalos at Marajó Island, Brazil, demonstrates that recent transmission of M. bovis is ongoing at distinct sites. Moreover, the M. bovis epidemiology in this setting is herein found to be dominated by an endemic and unique clade composed of strains evolved from a common ancestor that are now genetically differentiated from other M. bovis clades. Additionally, envisioning a rapid strain differentiation and tracing across multiple settings, 28 globally validated strain-specific SNPs were identified, three of which considered as robust markers for the M. bovis Marajó strain. In conclusion, this study contributes with data regarding the identification of a novel M. bovis phylogenetic clade responsible for ongoing transmission events in both cattle and buffalo species in Brazil, provides a framework to investigate the dissemination of this highly prevalent strain and, holds the potential to inform TB control strategies that may help to prevent the spread of bovine and zoonotic TB

INCIDÊNCIA DE INFECÇÕES DE SÍTIO CIRÚRGICO EM CIRURGIAS LIMPAS EM CLÍNICAS CIRÚRGICAS DE UM HOSPITAL ONCOLÓGICO DA REGIÃO NORTE

ABSTRACT Surgical Site Infection (SSI) is characterized as a post-surgical complication that occurs at the incision site, resulting from clinical aspects of the patient and/or incorrect handling of techniques that ensure the safety of procedures, increasing the probability of complications in surgeries classified as clean. This study aimed to determine the incidence of surgical site infection in breast, cardiac and thoracic surgeries in an oncology hospital in the North Region, highlighting the predisposing conditions and the etiological agents involved in the emergence of infections. This is an exploratory research with a quantitative, retrospective approach, carried out with 2,811 patients, in the period 2013-2020. The study found that 17 (0.6%) patients had infections, 13 (76.47%) were female and 4 (23.52%) were male. Escherichia coli and Staphylococcus Coagulase Negative (17.65%) were the most reported etiologic agents in SSI. The surgical wound was the main risk factor for SSI (33.33%).  Therefore, the article seeks to provide up-to-date knowledge about SSI-related risk factors to help with control interventions in hospitals. KEYWORDS: Cross Infection. Epidemiology. Surgery.RESUMEN La Infección del Sitio Quirúrgico (ISQ) se caracteriza como una complicación posquirúrgica que se presenta en el sitio de la incisión, resultante de aspectos clínicos del paciente y / o manejo incorrecto de técnicas que garantizan la seguridad de los procedimientos, aumentando la probabilidad de complicaciones en cirugías clasificadas tan limpio. Este estudio tuvo como objetivo determinar la incidencia de infección del sitio quirúrgico en cirugías de mama, cardíaca y torácica en un hospital de oncología de la Región Norte, destacando las condiciones predisponentes y los agentes etiológicos involucrados en la aparición de infecciones. Se trata de una investigación exploratoria con abordaje cuantitativo, retrospectivo, realizada con 2.811 pacientes, en el período 2013-2020. El estudio encontró que 17 (0,6%) pacientes tenían infecciones, 13 (76,47%) eran mujeres y 4 (23,52%) eran hombres. Escherichia coli y Staphylococcus Coagulase Negative (17,65%) fueron los agentes etiológicos más notificados en la ISQ. La herida quirúrgica fue el principal factor de riesgo de ISQ (33,33%). Por lo tanto, el artículo busca proporcionar conocimientos actualizados sobre los factores de riesgo relacionados con la ISQ para ayudar con las intervenciones de control en los hospitales. Palabras-clave: Infección nosocomial. Epidemiología. Cirugías.A Infecção de Sítio Cirúrgico (ISC) é caracterizada como uma complicação pós-cirúrgica que ocorre no local da incisão, decorrente de aspectos clínicos do paciente e/ou do manejo incorreto das técnicas que garantem a segurança dos procedimentos, elevando a probabilidade de intercorrências em cirurgias classificadas como limpas. Este trabalho teve como objetivo determinar a incidência de infecção de sítio cirúrgico em cirurgias de mastologia, cardíaca e torácica de um hospital oncológico da Região Norte, destacando as condições predisponentes e os agentes etiológicos envolvidos no surgimento das infecções. Trata-se de uma pesquisa exploratória com abordagem quantitativa, retrospectiva, realizada com 2.811 pacientes, no período de 2013-2020. O estudo constatou que 17 (0,6%) pacientes apresentaram infecções, sendo 13 (76,47%) do sexo feminino e 4 (23,52%) do sexo masculino. Escherichia coli e Staphylococcus Coagulase Negativo (17,65%) foram os agentes etiológicos mais notificados nas ISC. A ferida operatória foi o principal fator de risco para a ISC (33,33%). Portanto, o artigo procura prover conhecimento atualizado sobre os fatores de risco relacionados à ISC para ajudar nas intervenções de controle nos hospitais. Palavras-chave: Infecção Hospitalar. Epidemiologia. Cirurgias

Educar para empoderar: o uso de tecnologias educativas para o controle e prevenção de infecção hospitalar / Educating to empower: the use of educational technologies for hospital infection control and prevention

Objetivo: Avaliar a utilização de tecnologias educativas na prevenção e controle de infecções hospitalares em um centro de terapia intensiva (CTI) de um Hospital Público de Ensino de Belém do Pará. Método: estudo de intervenção, realizado com profissionais da saúde do CTI, por meio de atividades de educação em serviço com auxílio de tecnologias educativas, tais como cartilhas e cartazes. Resultados: o uso das tecnologias educativas possibilitou a aprendizagem de novas regras e melhoria no conhecimento pré-existente dos participantes, também garantiu empoderamento nas ações e tomadas de decisões, quanto a prevenção e controle das infecções. Portanto, pode-se sugerir a eficácia da tecnologia educativa ao processo de aprendizagem, visto que, houve um maior segmento de regras previstas nas cartilhas e cartazes educativos e, consequentemente, redução das taxas de infecção no setor investigado. Além disso, os participantes consideraram positivo o uso desse tipo de tecnologia, principalmente, aquelas relacionadas à higienização das mãos. Conclusão: As tecnologias educativas utilizadas apresentaram um resultado eficaz no processo de aprendizagem dos profissionais de saúde, relacionando-se com a futura redução das taxas de controle de infecções do hospital estudado. Contudo, futuras investigações podem verificar o efeito temporal dessas medidas, além de testarem novas tecnologias educacionais

Perfil epidemiológico e espacial da síndrome gripal confirmada para COVID-19 no início da pandemia no estado do Pará-Brasil

Introduction: COVID-19 broke out in Wuhan in China in December 2019, soon reached pandemic level causing thousands of deaths worldwide. It presents mostly mild flu cases; however, it can evolve into a severe respiratory syndrome that is responsible for hospitalizations and deaths. Objective: To describe the epidemiological and spatial profile of confirmed cases of influenza-like syndrome (GB) by COVID-19 in the state of Pará. Method: Descriptive and ecological study, referring to cases of COVID-19 reported in the E-SUS VE. From the variables of the epidemiological profile, spatial distribution and temporal trend of the disease. Results: The spatial distribution showed that the concentration of cases is located in the southern municipalities of the state. In the profile variables: female gender (53.16%), age group (61.14%) 30 and 59 years, chronic heart disease represented (41.99%), diabetes (31.22%) and (16.30%) chronic respiratory diseases Health professionals infected (8%). Clinical features: fever (71.99%), cough (64.57%), and sore throat (46.78%). Confirmation criteria: rapid antibody test (84.39%), rapid antigen test (7.61%), and RT-PCR (7.48%). The temporal trend of the disease showed the peak of cases in the 20th epidemiological week. Conclusion: Mostly women, most frequent heart diseases and diabetes, confirmed by rapid test and classical symptoms of GS. A flattening of the curve was observed after the 21st week, possibly due to the lockdown intervention. However, it was shown the high number of cases on 07/07/2020 in several regions, specifically in municipalities of the southern region of the state.Introdução: A COVID-19 surgiu em Wuhan na China em dezembro de 2019, logo alcançou o nível de pandemia causando milhares de mortes no mundo. Se apresenta em sua maioria casos gripais leves, entretanto pode evoluir para uma síndrome respiratória grave que é responsável pelas hospitalizações e óbitos. Objetivo: Descrever o perfil epidemiológico e espacial dos casos confirmados de Síndrome Gripal (SG) por COVID-19 no estado do Pará. Método: Estudo descritivo e ecológico, referente aos casos de COVID-19 notificados no E-SUS VE. A partir das variáveis do perfil epidemiológico, distribuição espacial e tendência temporal da doença. Resultados: A distribuição espacial mostrou que a concentração dos casos localiza-se nos municípios do Sul do estado. Nas viariáveis do perfil: sexo feminino (53,16%), faixa etária (61,14%) 30 e 59 anos, doenças cardíacas crônicas representou (41,99%), diabetes (31,22%) e (16,30%) doenças respiratórias crônicas Profissionais da saúde infectados (8%). Características clínicas: febre (71,99%),tosse (64,57%) e dor de garganta (46,78%). Critério de confirmação: teste rápido- anticorpo (84.39%), teste rápido antígeno (7.61%) e RT-PCR (7.48%). Na tendência temporal da doença evidenciou-se o pico de casos na 20º semana epidemiológica. Conclusão: A maioria mulheres, doenças cardíacas e diabetes mais evidentes, confirmados a maioria por teste rápido e sintomatologia clássica da SG. Observou-se o achatamento da curva após a 21º semana, possivelmente, por conta da intervenção lockdown. Entretanto mostrou-se a alta de casos na data de 07/07/2020 em diversas regiões, especificamente em municípios da região sul do estado

Estrutura física e insumos destinados à higienização das mãos no CTI de um hospital público

Background and Objectives: healthcare-associated infections (HAIs) are a serious public health problem worldwide. They occur mainly in Critical Care Units (CCUs), where physical structure and supplies do not favor hand hygiene (HH) compliance among health professionals. Thus, the present study aimed to describe and assess the physical structure and supplies for HH practice in a CCU of a public cancer hospital in the North region, Pará, Brazil. Methods: this is a descriptive, observational and cross-sectional study with a quantitative approach. Data were collected through a questionnaire based on the Guide to the Implementation of the World Health Organization (WHO) Multimodal Hand Hygiene Improvement Strategy. Results: the study identified that there were 17 functioning beds and 6 interdicted, in addition to 11 sinks on site, but only 5 had liquid soap and paper towels, all with water. Ten alcohol dispensers were identified, but only 7 were functioning and replenished. None of the professionals found had a pocket alcoholic bottle. Conclusion: the study concluded that the physical structure and supplies found in the investigated CCU are partially adequate for carrying out hand disinfection. However, improvements in these structures must be implemented as well as periodic audits and permanent health education activities, aiming to remind professionals about HH practice correctly.Justificación y objetivos: las infecciones asociadas a la atención de la salud (IAAS) son un grave problema de salud pública a nivel mundial. Ocurren principalmente en Unidades de Cuidados Intensivos (UCI), donde la estructura física y los suministros no favorecen la adherencia a la higiene de manos (HM) entre los profesionales de la salud. Así, el presente estudio tuvo como objetivo describir y evaluar la estructura física y los insumos para la práctica de la HM en una UCI de un hospital oncológico público de la región Norte de Pará, Brasil. Métodos: se trata de un estudio descriptivo, observacional, transversal con enfoque cuantitativo. Los datos fueron recolectados a través de un cuestionario basado en la Guía para la Implementación de la Estrategia Multimodal para la Mejora de la Higiene de Manos de la Organización Mundial de la Salud (OMS). Resultados: el estudio identificó que había 17 camas en funcionamiento y 6 intervenidas, además de 11 lavabos en el lugar, pero solo 5 tenían jabón líquido y toallas de papel, todas con agua. Se identificaron 10 dispensadores de alcohol, pero solo 7 funcionaban y se reponían. Ninguno de los profesionales encontrados tenía una botella de alcohol de bolsillo. Conclusión: el estudio concluyó que la estructura física y los insumos encontrados en la UCI investigada son parcialmente adecuados para la realización de la práctica de desinfección de manos. Sin embargo, se deben implementar mejoras en estas estructuras, así como auditorías periódicas y actividades de educación continua en salud, con el objetivo de recordar a los profesionales sobre la práctica correcta de HM.Justificativas e objetivos: as infecções relacionadas à assistência a saúde (IRAS) são um grave problema de saúde pública mundial. Ocorrem principalmente nos Centros de Terapia Intensiva (CTI), onde a estrutura física e insumos não favorecem a adesão da higienização das mãos (HM) entre os profissionais de saúde. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo descrever e avaliar a estrutura física e de insumos destinados à prática de HM em um CTI de um hospital público oncológico da região Norte, Pará, Brasil. Métodos: trata-se de um estudo descritivo, observacional e transversal com abordagem quantitativa. Os dados foram coletados através de um questionário baseado no Guia para a Implementação da Estratégia Multimodal da Organização Mundial da Saúde (OMS) para a Melhoria da Higiene das Mãos. Resultados: o estudo identificou que existiam 17 leitos funcionantes e 6 interditados, além de 11 pias no local, porém apenas 5 possuíam sabão líquido e papel toalha, todas com água. Foram identificados 10 dispensadores de álcool, porém apenas 7 estavam funcionantes e reabastecidos. Nenhum dos profissionais encontrados possuíam frasco alcoólico de bolso. Conclusão: o estudo concluiu que a estrutura física e os insumos encontrados no CTI investigado estão parcialmente adequados para a realização da prática de desinfecção das mãos. Contudo, devem ser implementadas melhorias nessas estruturas, bem como auditorias periódicas e atividades de educação permanente em saúde, visando relembrar os profissionais sobre a prática de HM de forma correta