The fecal resistome of dairy cattle is associated with diet during nursing.

Antimicrobial resistance is a global public health concern, and livestock play a significant role in selecting for resistance and maintaining such reservoirs. Here we study the succession of dairy cattle resistome during early life using metagenomic sequencing, as well as the relationship between resistome, gut microbiota, and diet. In our dataset, the gut of dairy calves serves as a reservoir of 329 antimicrobial resistance genes (ARGs) presumably conferring resistance to 17 classes of antibiotics, and the abundance of ARGs declines gradually during nursing. ARGs appear to co-occur with antibacterial biocide or metal resistance genes. Colostrum is a potential source of ARGs observed in calves at day 2. The dynamic changes in the resistome are likely a result of gut microbiota assembly, which is closely associated with diet transition in dairy calves. Modifications in the resistome may be possible via early-life dietary interventions to reduce overall antimicrobial resistance

COVID-19 stressors and health behaviors:A multilevel longitudinal study across 86 countries

Anxiety associated with the COVID-19 pandemic and home confinement has been associated with adverse health behaviors, such as unhealthy eating, smoking, and drinking. However, most studies have been limited by regional sampling, which precludes the examination of behavioral consequences associated with the pandemic at a global level. Further, few studies operationalized pandemic-related stressors to enable the investigation of the impact of different types of stressors on health outcomes. This study examined the association between perceived risk of COVID-19 infection and economic burden of COVID-19 with health-promoting and health-damaging behaviors using data from the PsyCorona Study: an international, longitudinal online study of psychological and behavioral correlates of COVID-19. Analyses utilized data from 7,402 participants from 86 countries across three waves of assessment between May 16 and June 13, 2020. Participants completed self-report measures of COVID-19 infection risk, COVID-19-related economic burden, physical exercise, diet quality, cigarette smoking, sleep quality, and binge drinking. Multilevel structural equation modeling analyses showed that across three time points, perceived economic burden was associated with reduced diet quality and sleep quality, as well as increased smoking. Diet quality and sleep quality were lowest among respondents who perceived high COVID-19 infection risk combined with high economic burden. Neither binge drinking nor exercise were associated with perceived COVID-19 infection risk, economic burden, or their interaction. Findings point to the value of developing interventions to address COVID-related stressors, which have an impact on health behaviors that, in turn, may influence vulnerability to COVID-19 and other health outcomes

COVID-19 stressors and health behaviors. A multilevel longitudinal study across 86 countries

Anxiety associated with the COVID-19 pandemic and home confinement has been associated with adverse health behaviors, such as unhealthy eating, smoking, and drinking. However, most studies have been limited by regional sampling, which precludes the examination of behavioral consequences associated with the pandemic at a global level. Further, few studies operationalized pandemic-related stressors to enable the investigation of the impact of different types of stressors on health outcomes. This study examined the association between perceived risk of COVID-19 infection and economic burden of COVID-19 with health-promoting and health-damaging behaviors using data from the PsyCorona Study: an international, longitudinal online study of psychological and behavioral correlates of COVID-19. Analyses utilized data from 7,402 participants from 86 countries across three waves of assessment between May 16 and June 13, 2020. Participants completed self-report measures of COVID-19 infection risk, COVID-19-related economic burden, physical exercise, diet quality, cigarette smoking, sleep quality, and binge drinking. Multilevel structural equation modeling analyses showed that across three time points, perceived economic burden was associated with reduced diet quality and sleep quality, as well as increased smoking. Diet quality and sleep quality were lowest among respondents who perceived high COVID-19 infection risk combined with high economic burden. Neither binge drinking nor exercise were associated with perceived COVID-19 infection risk, economic burden, or their interaction. Findings point to the value of developing interventions to address COVID-related stressors, which have an impact on health behaviors that, in turn, may 111 influence vulnerability to COVID-19 and other health outcomes

Analyse morphologique automatique du slovaque (étude approfondie du système linguistique slovaque et sa reconnaissance d'après la forme dans les textes scientifiques et techniques. Application au machinisme agricole)

L'analyse morphologique automatique du slovaque constitue la première étape d'un système d'analyse automatique du contenu des textes scientifiques et techniques slovaques. Un tel système pourrait ête utilisé par des applications, telles que l'indexation automatique des textes, la recherche automatique de la terminologie ou par un système de traduction. Une description des régularités de la langue par un ensemble de règles ainsi que l'utilisation de tousles éléments au niveau de la forme du mot qui rendent possible son interprétation permettent de réduire d'une manière considérable le volume des dictionnaires. Notamment s'il s'agit d'une langue à très riche flexion, comme le slovaque. Les résultats que nous obtenons lors de l'analyse morphologique confirment la faisabilité et la grande fiabilité d'une analyse morphologique basée sur la reconnaissance des formes et ceci pour toutes les catégories lexicales concernées par la flexion.Automatic morphological analysis of Slovak language is the first level of an automotical analyser for Slovak's scientifical and technical texts. Such a system could be used for different applications : automatic text indexation, automatic research of terminology or transmlation systems. A rule-based description of language's regularities as well as the use of all the formal level elements of words allow to reduce considerably the volume of dictionnaries. Notably in case of inflectionally rich languages such as Slovak. The results obtained by our morphological analyser jusstify such an approach and confrirm the high reliability of morphological analysis based on form-recognition for all lexical categoriesPARIS-Bibl.Langues Orientales (751072101) / SudocSudocFranceF

LE PROCHE ET LE LOINTAIN : ENSEIGNER, APPRENDRE ET PARTAGER DES CULTURES ÉTRANGÈRES / Séance 7 : QUELLE PLACE POUR LES OUTILS INNOVANTS DANS L’APPRENTISSAGE DES LANGUES ET CULTURES ? : Colloque International organisé par PLIDAM (Pluralité des Langues et des Identités : Didactique, Acquisition, Médiation - EA4514, Inalco, Sorbonne Paris Cité)

The various resources made available by information and communications technologies push the boundaries of the classroom, gain in popularity among stakeholders of the teaching and learning of languages and cultures, and call for the establishment of new practices that focus on creativity and autonomy within the confines of the real and the virtual.Les diverses ressources offertes par les technologies de l'information et de la communication repoussent les murs de la classe, séduisent les acteurs de l’enseignement et de l’apprentissage des langues et des cultures et invitent à mettre en place de nouvelles pratiques axées sur la créativité et l’autonomie aux confins du réel et du virtuel

L’enseignement des langues dans le contexte de l’après-Covid aux États-Unis: Regards sur la recherche : outils, concepts, démarches (Séminaire doctoral PLIDAM)

Fonds audiovisuel de l’Inalco, France, © 2021Après des études d’économie et de statistiques en Grèce et aux États-Unis, Stéphane Charitos a obtenu un doctorat en littérature française de l’Université de la Caroline du Nord à Chapel Hill. Depuis 1998, il est Directeur du Language Resource Center à la Columbia University dans la ville de New York où il est chargé de fournir un appui pédagogique et un encadrement technologique aux enseignants de langues ainsi que de la mise en place de solutions innovantes pour l’enseignement des langues rares et minoritaires. Il est un des principaux investigateurs du Shared Course Initiative, un programme collaboratif d’enseignement des langues minoritaires par visioconférence qui a été conçu avec l’aide de la Mellon Foundation

Pre- and post-sequencing recommendations for functional annotation of human fecal metagenomes.

BackgroundShotgun metagenomes are often assembled prior to annotation of genes which biases the functional capacity of a community towards its most abundant members. For an unbiased assessment of community function, short reads need to be mapped directly to a gene or protein database. The ability to detect genes in short read sequences is dependent on pre- and post-sequencing decisions. The objective of the current study was to determine how library size selection, read length and format, protein database, e-value threshold, and sequencing depth impact gene-centric analysis of human fecal microbiomes when using DIAMOND, an alignment tool that is up to 20,000 times faster than BLASTX.ResultsUsing metagenomes simulated from a database of experimentally verified protein sequences, we find that read length, e-value threshold, and the choice of protein database dramatically impact detection of a known target, with best performance achieved with longer reads, stricter e-value thresholds, and a custom database. Using publicly available metagenomes, we evaluated library size selection, paired end read strategy, and sequencing depth. Longer read lengths were acheivable by merging paired ends when the sequencing library was size-selected to enable overlaps. When paired ends could not be merged, a congruent strategy in which both ends are independently mapped was acceptable. Sequencing depths of 5 million merged reads minimized the error of abundance estimates of specific target genes, including an antimicrobial resistance gene.ConclusionsShotgun metagenomes of DNA extracted from human fecal samples sequenced using the Illumina platform should be size-selected to enable merging of paired end reads and should be sequenced in the PE150 format with a minimum sequencing depth of 5 million merge-able reads to enable detection of specific target genes. Expecting the merged reads to be 180-250 bp in length, the appropriate e-value threshold for DIAMOND would then need to be more strict than the default. Accurate and interpretable results for specific hypotheses will be best obtained using small databases customized for the research question

L'apprentissage confiné : passage de l’enseignement en semi autonomie à tout distanciel - un paradoxe ? <br>: Distances apprivoisées.L’enseignement confiné des langues étrangères

Fonds audiovisuel de l'INALCO, France, © 20201. Le cadre éducatif L’enseignement des langues peut se faire dans des contextes divers et au cours de trajectoires variées. Il signifie aujourd’hui :inter(agir), de plus en plus en dehors du cadre institutionnel, de plus en plus à distance, de plus en plus à l’échelle mondiale. Pour être appris, les savoirs linguistiques ont-ils besoin d’être véhiculés dans un cadre éducatif ? L’espace pédagogique du confinement octroie à l’enseignant une large gamme d’options pour organiser son dispositif d’enseignement : canaux (son, texte, vidéo, etc.), modes (synchrone, asynchrone), séances (individuelles ou collectives). L’enseignement ne se déroule plus dans un lieu spécifique (l’établissement), selon un cadrage horaire immuable (l’emploi du temps), autour de fonctions et de rôles codifiés.2. L’outil Les dispositifs de partage de ressources multimodales et de coconstruction des connaissances en ligne constituent des évolutions qui apparaissent comme en partie irréversibles. Enseigner à des publics lointains est une réalité depuis plusieurs dizaines d’années. De nombreux dispositifs en ligne cherchent la flexibilité, le suivi personnalisé et tendent à être compatibles avec un maximum de supports. Toute innovation nécessite une période de maturation et l’adhésion d’une communauté d’acteurs à un socle de convictions. Quel est le rôle joué par les plateformes d’apprentissage en ligne, les MOODLE (Modular Object-Oriented Dynamic Learning Environment) et les MOOC (Massive Open Online Course) ?3. La structuration des connaissances Enseigner une langue signifie : décrire un système et affronter sa complexité, planifier et réguler l’automatisation des réflexes, proposer une alternance entre des séquences de maniement tantôt plus souples, tantôt plus directifs. Comment trouver le bon dosage entre guidage et liberté dans un contexte où l’espace de travail se dématérialise du jour au lendemain ? La distance crée le besoin d’autonomisation. Des millions d’apprenants potentiels sont aujourd’hui en contact informel avec des langues étrangères (avec une prédominance de l'anglais sur la Toile) grâce à des ressources authentiques variées. À l’heure des échanges planétaires que suscitent les réseaux sociaux est-il encore nécessaire de structurer préalablement le champ des connaissances ?4. Dédramatiser la crise À un moment où la palette des moyens techniques s’élargit, entre réalités physique et virtuelle, hors ligne et en ligne, comment être à la fois stimulant, innovant et scientifiquement valide afin que l’apprenant réussisse à avoir les connaissances, la solution des tâches qu’on lui impose et le comportement qu’on attend de lui ? Le jeu apparaît comme une réelle stratégie pédagogique quifavorise l’expression, tout en ‘estompant’ la situation d’apprentissage en particulier lorsqu’elle est traumatisante. Comment concilier les ressorts ludiques et les objectifs d’acquisition ? La situation d'apprentissage reste-t-elle essentiellement formelle (besoin de correction, nécessité d’évaluation et rappel du contrat pédagogique) ou devient-elle plus informelle à même de dédramatiser la crise ? 5. L’enseignant et sa formation Savoir enseigner à distance devient-il un élément constitutif de l’expertise des professeurs de langues étrangères ? Concevoir un parcours d’apprentissage accessible à distance et assurer le suivi des tâches à travers des outils de communication nécessite l’adoption d’un discours pédagogique mêlant le cognitif et l’affectif, la clarté des consignes et des rétroactions. Les attraits du numérique ne doivent pas occulter le rôle central du scénario pédagogique. Quels que soient les supports de transmission (de plus en plus sophistiqués dans leur multimodalité) et les besoins de communication (encore inconnus) qui émergent, la modernité ne semble pas mettre en péril la relation humaine professeur / apprenant. Une classe de langue étrangère, individualisée ou collective, traditionnelle ou confinée, est portée par la richesse et la cohérence des pratiques pédagogiques mises en oeuvre.6. Le présent et l’avenir La communication électronique devient-elle une nouvelle modalité d’apprentissage des langues à l'échelle mondiale ? Les cours confinés seront-ils à même de renouveler la pédagogie des langues ? À l’échelle mondiale, permettront-ils de sortir les cyber-apprenants de l’anonymat, de diversifier la palette des langues enseignées et d’apporter aux pays les plus défavorisés des formations à distance en langues étrangères ? Quelles seront les modalités d'apprentissage de demain ? Par quels canaux et par quels dispositifs apprendra-t-on des langues étrangères ? Que devient la classe de langue ? Que deviennent les centres de ressources, les espaces multimédias dédiés au perfectionnement en langues ? Quelle articulation entre apprentissage formel et informel, entre distanciel et présentiel

L'apprentissage confiné : passage de l’enseignement en semi autonomie à tout distanciel - un paradoxe ? <br>: Distances apprivoisées.L’enseignement confiné des langues étrangères

Fonds audiovisuel de l'INALCO, France, © 20201. Le cadre éducatif L’enseignement des langues peut se faire dans des contextes divers et au cours de trajectoires variées. Il signifie aujourd’hui :inter(agir), de plus en plus en dehors du cadre institutionnel, de plus en plus à distance, de plus en plus à l’échelle mondiale. Pour être appris, les savoirs linguistiques ont-ils besoin d’être véhiculés dans un cadre éducatif ? L’espace pédagogique du confinement octroie à l’enseignant une large gamme d’options pour organiser son dispositif d’enseignement : canaux (son, texte, vidéo, etc.), modes (synchrone, asynchrone), séances (individuelles ou collectives). L’enseignement ne se déroule plus dans un lieu spécifique (l’établissement), selon un cadrage horaire immuable (l’emploi du temps), autour de fonctions et de rôles codifiés.2. L’outil Les dispositifs de partage de ressources multimodales et de coconstruction des connaissances en ligne constituent des évolutions qui apparaissent comme en partie irréversibles. Enseigner à des publics lointains est une réalité depuis plusieurs dizaines d’années. De nombreux dispositifs en ligne cherchent la flexibilité, le suivi personnalisé et tendent à être compatibles avec un maximum de supports. Toute innovation nécessite une période de maturation et l’adhésion d’une communauté d’acteurs à un socle de convictions. Quel est le rôle joué par les plateformes d’apprentissage en ligne, les MOODLE (Modular Object-Oriented Dynamic Learning Environment) et les MOOC (Massive Open Online Course) ?3. La structuration des connaissances Enseigner une langue signifie : décrire un système et affronter sa complexité, planifier et réguler l’automatisation des réflexes, proposer une alternance entre des séquences de maniement tantôt plus souples, tantôt plus directifs. Comment trouver le bon dosage entre guidage et liberté dans un contexte où l’espace de travail se dématérialise du jour au lendemain ? La distance crée le besoin d’autonomisation. Des millions d’apprenants potentiels sont aujourd’hui en contact informel avec des langues étrangères (avec une prédominance de l'anglais sur la Toile) grâce à des ressources authentiques variées. À l’heure des échanges planétaires que suscitent les réseaux sociaux est-il encore nécessaire de structurer préalablement le champ des connaissances ?4. Dédramatiser la crise À un moment où la palette des moyens techniques s’élargit, entre réalités physique et virtuelle, hors ligne et en ligne, comment être à la fois stimulant, innovant et scientifiquement valide afin que l’apprenant réussisse à avoir les connaissances, la solution des tâches qu’on lui impose et le comportement qu’on attend de lui ? Le jeu apparaît comme une réelle stratégie pédagogique quifavorise l’expression, tout en ‘estompant’ la situation d’apprentissage en particulier lorsqu’elle est traumatisante. Comment concilier les ressorts ludiques et les objectifs d’acquisition ? La situation d'apprentissage reste-t-elle essentiellement formelle (besoin de correction, nécessité d’évaluation et rappel du contrat pédagogique) ou devient-elle plus informelle à même de dédramatiser la crise ? 5. L’enseignant et sa formation Savoir enseigner à distance devient-il un élément constitutif de l’expertise des professeurs de langues étrangères ? Concevoir un parcours d’apprentissage accessible à distance et assurer le suivi des tâches à travers des outils de communication nécessite l’adoption d’un discours pédagogique mêlant le cognitif et l’affectif, la clarté des consignes et des rétroactions. Les attraits du numérique ne doivent pas occulter le rôle central du scénario pédagogique. Quels que soient les supports de transmission (de plus en plus sophistiqués dans leur multimodalité) et les besoins de communication (encore inconnus) qui émergent, la modernité ne semble pas mettre en péril la relation humaine professeur / apprenant. Une classe de langue étrangère, individualisée ou collective, traditionnelle ou confinée, est portée par la richesse et la cohérence des pratiques pédagogiques mises en oeuvre.6. Le présent et l’avenir La communication électronique devient-elle une nouvelle modalité d’apprentissage des langues à l'échelle mondiale ? Les cours confinés seront-ils à même de renouveler la pédagogie des langues ? À l’échelle mondiale, permettront-ils de sortir les cyber-apprenants de l’anonymat, de diversifier la palette des langues enseignées et d’apporter aux pays les plus défavorisés des formations à distance en langues étrangères ? Quelles seront les modalités d'apprentissage de demain ? Par quels canaux et par quels dispositifs apprendra-t-on des langues étrangères ? Que devient la classe de langue ? Que deviennent les centres de ressources, les espaces multimédias dédiés au perfectionnement en langues ? Quelle articulation entre apprentissage formel et informel, entre distanciel et présentiel

De l'importance du contact physique dans le rapport éducatif, et le leurre des nouvelles technologies. <br>: Distances apprivoisées.L’enseignement confiné des langues étrangères

Fonds audiovisuel de l'INALCO, France, © 20201. Le cadre éducatif L’enseignement des langues peut se faire dans des contextes divers et au cours de trajectoires variées. Il signifie aujourd’hui :inter(agir), de plus en plus en dehors du cadre institutionnel, de plus en plus à distance, de plus en plus à l’échelle mondiale. Pour être appris, les savoirs linguistiques ont-ils besoin d’être véhiculés dans un cadre éducatif ? L’espace pédagogique du confinement octroie à l’enseignant une large gamme d’options pour organiser son dispositif d’enseignement : canaux (son, texte, vidéo, etc.), modes (synchrone, asynchrone), séances (individuelles ou collectives). L’enseignement ne se déroule plus dans un lieu spécifique (l’établissement), selon un cadrage horaire immuable (l’emploi du temps), autour de fonctions et de rôles codifiés.2. L’outil Les dispositifs de partage de ressources multimodales et de coconstruction des connaissances en ligne constituent des évolutions qui apparaissent comme en partie irréversibles. Enseigner à des publics lointains est une réalité depuis plusieurs dizaines d’années. De nombreux dispositifs en ligne cherchent la flexibilité, le suivi personnalisé et tendent à être compatibles avec un maximum de supports. Toute innovation nécessite une période de maturation et l’adhésion d’une communauté d’acteurs à un socle de convictions. Quel est le rôle joué par les plateformes d’apprentissage en ligne, les MOODLE (Modular Object-Oriented Dynamic Learning Environment) et les MOOC (Massive Open Online Course) ?3. La structuration des connaissances Enseigner une langue signifie : décrire un système et affronter sa complexité, planifier et réguler l’automatisation des réflexes, proposer une alternance entre des séquences de maniement tantôt plus souples, tantôt plus directifs. Comment trouver le bon dosage entre guidage et liberté dans un contexte où l’espace de travail se dématérialise du jour au lendemain ? La distance crée le besoin d’autonomisation. Des millions d’apprenants potentiels sont aujourd’hui en contact informel avec des langues étrangères (avec une prédominance de l'anglais sur la Toile) grâce à des ressources authentiques variées. À l’heure des échanges planétaires que suscitent les réseaux sociaux est-il encore nécessaire de structurer préalablement le champ des connaissances ?4. Dédramatiser la crise À un moment où la palette des moyens techniques s’élargit, entre réalités physique et virtuelle, hors ligne et en ligne, comment être à la fois stimulant, innovant et scientifiquement valide afin que l’apprenant réussisse à avoir les connaissances, la solution des tâches qu’on lui impose et le comportement qu’on attend de lui ? Le jeu apparaît comme une réelle stratégie pédagogique quifavorise l’expression, tout en ‘estompant’ la situation d’apprentissage en particulier lorsqu’elle est traumatisante. Comment concilier les ressorts ludiques et les objectifs d’acquisition ? La situation d'apprentissage reste-t-elle essentiellement formelle (besoin de correction, nécessité d’évaluation et rappel du contrat pédagogique) ou devient-elle plus informelle à même de dédramatiser la crise ? 5. L’enseignant et sa formation Savoir enseigner à distance devient-il un élément constitutif de l’expertise des professeurs de langues étrangères ? Concevoir un parcours d’apprentissage accessible à distance et assurer le suivi des tâches à travers des outils de communication nécessite l’adoption d’un discours pédagogique mêlant le cognitif et l’affectif, la clarté des consignes et des rétroactions. Les attraits du numérique ne doivent pas occulter le rôle central du scénario pédagogique. Quels que soient les supports de transmission (de plus en plus sophistiqués dans leur multimodalité) et les besoins de communication (encore inconnus) qui émergent, la modernité ne semble pas mettre en péril la relation humaine professeur / apprenant. Une classe de langue étrangère, individualisée ou collective, traditionnelle ou confinée, est portée par la richesse et la cohérence des pratiques pédagogiques mises en oeuvre.6. Le présent et l’avenir La communication électronique devient-elle une nouvelle modalité d’apprentissage des langues à l'échelle mondiale ? Les cours confinés seront-ils à même de renouveler la pédagogie des langues ? À l’échelle mondiale, permettront-ils de sortir les cyber-apprenants de l’anonymat, de diversifier la palette des langues enseignées et d’apporter aux pays les plus défavorisés des formations à distance en langues étrangères ? Quelles seront les modalités d'apprentissage de demain ? Par quels canaux et par quels dispositifs apprendra-t-on des langues étrangères ? Que devient la classe de langue ? Que deviennent les centres de ressources, les espaces multimédias dédiés au perfectionnement en langues ? Quelle articulation entre apprentissage formel et informel, entre distanciel et présentiel