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LANDSCAPE CLASSIFICATION METHODS BY GEOGRAPHIC INFORMATIVE SYSTEMS
Il lavoro ha riguardato lo studio di nuovi metodi di classificazione del paesaggio e la loro
visualizzazione cartografica per mezzo di software GIS, concentrando l’attenzione sul
comune di Muggia situato nella provincia di Trieste.
Lo studio ha visto l’applicazione di due diversi metodi di classificazione del paesaggio,
suggeriti da Barocchi (2005) e che richiamano i concetti di valutazione quantitativa e
qualitativa delle componenti paesaggistiche. Nei due metodi si prevede rispettivamente
l’assegnazione di valori di natura quantitativa (scala numerica) nel primo metodo e qualitativa
(scala di valori descrittivi), nel secondo caso, alle diverse porzioni di territorio selezionate
quali unitĂ di paesaggio.
Il Geographic Information System (GIS) è stato utile per impostare, elaborare e visualizzare
i dati e risultati tramite la creazione della relativa cartografia.The project considered the landscape of a city (Muggia) located in Triest’s province,
analysed through using cartographic systems.
It’s realized by means of the application of two classification methods contained in
the book “La pianificazione del paesaggio, Esperienze nel Friuli-Venezia Giulia”
(Barocchi, 2005): their feature consists of assigning quantitative values (numeric
scale) – first method – and qualitative values (descriptive scale) – second method – at
the landscape’s portions.
The Geographic Information System (GIS) is used for planning, processing and visualizing
datum and results by means of cartography creation
Epstein-Barr virus-specific T cell receptors for adoptive transfer of transduced T cells in allogeneic stem cell transplantation
More than one third of patients experience Epstein-Barr Virus (EBV) reactivation after allogeneic stem cell transplantation (alloSCT) and up to 3% of transplanted patients develop post-transplant lymphoproliferative disorders (PTLD). In healthy individuals, virus epitope-specific T cells are critical for EBV control; however, post-transplant cytopenia and immunosuppression leaves patients vulnerable to virus reactivation and associated malignancies. Antibody-mediated depletion of B cells, which are natural targets and reservoirs for EBV, delays the reconstitution of cellular immunity and comes with considerable short- and long-term side effects.
The goal of this work is to identify EBV-specific T cell receptors (TCR) and transduce them into T cells for adoptive transfer. Stimulation of stem cell grafts or peripheral blood cells with EBV plasmid-recombinant antigen-presenting cells (APC) or EBV-derived peptides leads to a substantial expansion of EBV-specific T cells; however, the degree of expansion is dependent on an antigen-experienced memory compartment non-existing in EBV seronegative donors. I present three articles that, combined, describe the identification and characterization of 16 different EBV-specific TCRs for TCR-based immunotherapy.
In the first article, we established efficient single cell immune phenotyping and TCR sequencing using rectal cancer infiltrating T cells as an example. In the second article, we applied this technology to identify EBV peptide-specific TCRs which can be transduced into peripheral blood T cells and recognize EBV-infected B cells. In the third article, we tracked adoptively transferred virus-specific T cells in an alloSCT patient during EBV reactivation.
We were able to establish a robust, GMP-compliant pipeline for the discovery of EBV-specific TCRs with prophylactic and therapeutic potential. The use of single EBV-peptides for stimulation facilitated targeting of different antigens, HLA-restrictions, and potentially other viruses. Identified TCRs for selected HLA restrictions can be stored as TCR libraries to prepare readily available off-the-shelf products.
Reconstitution of cellular immunity against EBV can offer protection against associated complications and potentially contributes to a better outcome post-transplant. We propose adoptive transfer of virus-specific T cells transduced with carefully selected TCRs as a prophylactic and therapeutic approach to prevent EBV-infection, reactivation, and associated complications.Bei mehr als einem Drittel der Patienten kommt es nach allogener Stammzelltransplantation (AlloSZT) zur Reaktivierung des Epstein-Barr-Virus (EBV) und bis zu 3% der Patienten entwickeln eine lymphoproliferative Erkrankung nach Transplantation (PTLD). EBV-spezifische T-Zellen spielen eine entscheidende Rolle bei der Virus-Kontrolle, jedoch erhöht die Zytopenie und immunsuppressive Therapie nach AlloSZT das Risiko für eine EBV-Reaktivierung. Die Depletion von B-Zellen, den primären Wirtszellen von EBV, durch monoklonale Antikörper verzögert die Wiederherstellung der zellulären Immunität und ist von schwerwiegenden Nebenwirkungen begleitet.
Ziel dieser Arbeit ist die Identifizierung EBV-spezifischer T-Zell-Rezeptoren (TCR) und ihre Transduktion in T-Zellen für den adoptiven Transfer. EBV-spezifische T-Zellen können ausgehend von unterschiedlichen Spenderzellen, mit rekombinanten antigen-präsentierenden Zellen oder EBV-Peptiden in vitro expandiert werden. Das Ausmaß der Expansion ist spenderabhängig und insbesondere bei seronegativen Spendern ohne EBV-spezifische Gedächtniszellen nicht erfolgreich. In drei Publikationen wird die Identifizierung und Charakterisierung von insgesamt 16 verschiedenen EBV-spezifischen TCR beschrieben, die sich für TCR-basierte Immuntherapien eignen.
In der ersten Veröffentlichung wird eine Einzelzell-Technik zur Immunphänotypisie-rung und TCR-Sequenzierung am Beispiel Tumor-infiltrierender T-Zellen beim Rektumkarzinom entwickelt. In der zweiten Veröffentlichung nutzen wir diese Technik zur Identifizierung EBV-peptid-spezifischer TCRs, die, transduziert in T-Zellen, EBV-infizierte Zellen erkennen. In der dritten Veröffentlichung verfolgen wir adoptiv-transferierte T-Zellen in einem Patienten mit EBV-Reaktivierung nach AlloSZT.
Wir haben eine effiziente Methodik zur Identifizierung EBV-spezifischer TCRs mit prophylaktischem und therapeutischem Potenzial etabliert. Die Verwendung einzelner Peptide zur Stimulation erlaubt die Auswahl definierter Zielantigene bei bekannter HLA-Restriktion und kann perspektivisch auch für die Identifizierung von TCRs gegen andere Viren genutzt werden. Die Arbeiten ermöglichen potentiell den Aufbau von TCR Bibliotheken mit exakt definierten Spezifitäten zur Herstellung gezielter Zelltherapeutika.
Die Wiederherstellung der zellulären Immunität gegen EBV schützt Patienten vor EBV-assoziierten Komplikationen. Wir schlagen den adoptiven Transfer TCR-rekombinanter Zellen mit sorgfältig ausgewählten Spezifitäten als prophylaktischen und therapeutischen Ansatz gegen EBV-Infektion, Reaktivierung und assoziierte Komplikationen vor
Compréhension historique des dynamiques spatiales d'un vignoble ligérien (XV e -XXI e s.) : premier pas vers le modèle VitiTerroir
International audienceLe programme VitiTerroir a pour ambition de poser les bases d'une analyse dynamique des territoires viticoles en région Centre. L'objectif est d'élaborer un outil prospectif fondé sur la modélisation des transformations spatiales des territoires viticoles dans la longue durée. Le programme envisage de mener des études historiques de l'activité viticole à plusieurs échelles spatiales (régions, départements, vignobles, parcelles) et temporelles (décennie, demi-siècle, siècle, pluriséculaire), afin de mesurer précisément le poids des facteurs environnementaux et sociétaux dans leur profondeur historique (résilience). Une première expérience a été menée sur le territoire d'Azay-le-Rideau en Touraine, pour lequel on dispose de données permettant d'analyser les dynamiques spatiales du vignoble du XV e siècle à aujourd'hui. La cartographie de l'évolution des surfaces encépagées sur 5 siècles met en évidence une dynamique spatiale complexe entrainant, selon les époques, de fortes variations de la place de la viticulture dans l'économie agricole du territoire. Du XVII e siècle à la crise phylloxérique, la viticulture connaît une véritable explosion de son activité, avec une relative concentration des surfaces encépagées autour d'une vallée sèche dans la moitié occidentale du territoire communal. A la suite de l'épisode phylloxérique, le vignoble ridellois se reconstitue difficilement, très concentré sur des terres qui jusqu'à présent n'avaient jamais été utilisées pour la viticulture. L'analyse historique des dynamiques spatiales du vignoble d'Azay-le-Rideau a pour ambition, dans le cadre d'une approche systémique d'isoler les facteurs en oeuvre dans l'évolution du territoire viticole et de formuler une série d'hypothèses quant à leur poids dans le jeu des interactions. Il s'agit d'élaborer un socle de référence indispensable pour aboutir à une généralisation des processus qui seront intégrés dans le modèle VitiTerroir
Some propositions to find optimal conditions to simulate a flexible transport using an Agent-Based Model
This paper presents a method to assess the sensitivity of a flexible transport model based on agents and simulated using NetLogo. We simulate and we analyse a set of 124 transportation scenarios on several virtual networks and we assess their performance. Our main objective is to detect thresholds in the system scalability and efficiency. The research leads to three main results: (i) using Agent-Based Model, it is possible to significantly improve the global transport efficiency without any general objective function, (ii) there exists an optimal balance between the demand frequency and the number of simulated agents to simulate and perform a good flexible transport, (ii) to some extent, the network topological structure plays a non-negligible role in transport efficiency
How to assess the robustness of a flexible transport using an Agent Based Model? : Some observations on optimal conditions of simulation.
This paper presents a method to evaluate the robustness of a cooperating flexible transport system based on agents (taxis and clients) and simulated using NetLogo. Analysing a set of 124 scenarios of simulations on a range of synthetic populations (clients) and on various space networks organizations, we assess the sensitivity of a transportation model we proposed. Our main objective is to detect robustness thresholds in flow configurations and system efficiency. The research leads to two main results: (i) there exists an optimal balance between the frequency of system iterations (number of clients generations) and the total number of clients involved in simulations, (ii) to some extend, the network topological structure plays a non negligible role in transport efficiency.Cet article présente une méthode pour évaluer la robustesse d'un service de transport flexible modélisé en multi-agent et simulé sur la plate-forme Netlogo. Nous analysons la sensibilité du modèle grâce à 124 scénarios de simulation, chacun d'eux intégrant différentes quantités de population synthétique (les clients), combinées à quatre formes d'organisation spatiale théoriques.Notre objectif est de révéler des seuils de robustesse au delà desquels le système peut être considéré comme efficace ou non. À l'aide de plusieurs indicateurs, nous montrons qu'il existe un ratio optimal entre la fréquence et la quantité de client à créer. Nous expliquons aussi dans quelle mesure la forme des réseaux routiers influence l'efficacité du modèle
Analysis of economic viability with the use of monte carlo simulation for microgeneration of photovoltaic energy
A series of public policies are being adopted worldwide to seek greater participation of renewable energy sources in the energy matrix. Brazil is a country that has a predominantly renewable energy source, with hydroelectric energy being responsible for the largest portion, but with enormous potential to be exploited for solar energy. The objective of this study was to carry out an analysis of the economic viability of a photovoltaic matrix in the distributed microgeneration model from the residential consumer perspective. Through the Monte Carlo simulation, 10.000 iterations were performed and the NPV was calculated in each of them, then counted to recover the corresponding output probability distribution and verified the NPV probability to be greater than zero. The developed method has proved to be a reliable tool to support decision making and can be applied to several scenarios. The scenario adopted for the design of the photovoltaic system presented a 95.2% probability of returning with an NPV above zero and this makes it economically feasible. The main contribution of this paper is the replicability of the methodology used for other economic analysis studies
Le modèle VitiTerroir pour simuler la dynamique spatiale des vignobles sur le temps long (1836-2014). Exemple d'application au département d'Indre-et-Loire
L'ambition du programme régional VitiTerroir est de développer un modèle pour simuler les dynamiques des territoires viticoles en région Centre-Val de Loire sur le temps long (pluriséculaire), moyen et court. Il s'agit, à terme, de mettre en oeuvre un outil de modélisation géoprospectif propre à aider aux orientations politiques de la filière. L'approche est résolument géohistorique puisque nous travaillons à partir de sources anciennes (enquêtes préfectorales, cadastre napoléonien, chartriers seigneuriaux…) et contemporaines (Cadastre viticole informatisé, Recensement général agricole…). Nous utilisons un outil de simulation spatialisé pour analyser les trajectoires diachroniques de ces espaces. Dans le cadre de cet article, nous étudions en particulier l'impact de quatre facteurs sur la dynamique des territoires viticoles en Indre-et-Loire (Touraine), et cela sur deux siècles (1800-2014) : la consommation de vin, la polarisation des centres de production, la croissance urbaine et la crise du phylloxera. Ces facteurs, de natures variées, opèrent à différentes échelles géographiques et sur différentes temporalités. Nous explorerons leur impact sur les surfaces viticoles communales à travers quatre sous-modèles. En explorant de manière exhaustive les différents sous-modèles, nous montrons que l'évolution des pratiques de consommation explique largement à elle seule l'évolution des superficies viticoles pour la majorité des communes (68 %). Mais il convient de prendre aussi en compte l'importance de certains vignobles dans l'histoire (facteur " temps ") pour expliquer la résilience de centres de production (Vouvray, Chinon, Bourgueil) au-delà de la crise du phylloxera qui touche la Touraine dans les années 1880. Enfin, nous montrons que la croissance urbaine, analysée par le biais de l'évolution démographique, explique, dans une certaine mesure, le déclin de quelques grands vignobles du 19e siècle. Cependant, ce dernier facteur ne concerne qu'une minorité de communes faisant partie de l'agglomération tourangelle. Enfin, si la crise du phylloxera ne constitue pas un facteur pertinent pour expliquer la dynamique spatiale du vignoble tourangeau sur le long terme, son implémentation améliore la précision du modèle
Simulation des dynamiques spatiales d'un territoire agro-viticole : premier pas vers le modèle VitiTerroir
International audienceLoin d'être figés, les territoires viticoles, espaces vivants, évoluent au rythme des pulsations de la société. Les communautés humaines créent, exploitent, entretiennent, adaptent à leurs besoins les vignobles sous l'influence des considérations culturelles (évolution des goûts, sentiment d'attachement identitaire à la vigne), sociales (exigences nouvelles des consommateurs en matière de santé publique et de bien-être), économiques (évolution de la demande, pression de la concurrence), juridiques (évolution de la législation sur les droits de plantation) et environnementales (appauvrissement et érosion des sols, évolutions climatiques, pression urbaine).Le programme VitiTerroir a pour ambition de poser les bases d'une analyse dynamique des territoires viticoles en région Centre. Nous considérons le territoire viticole comme le produit des interactions entre écosystème et anthroposystème, autrement dit, comme un système (très) complexe. Il n'est en aucun cas donné comme un invariant déterminé par des nécessités naturelles, mais bien au contraire comme un construit social (Dion 1959). Pour simuler les dynamiques spatiales des territoires viticoles à des échelles de temps et d’espace variables, nous avons opté pour la modélisation multi-agents (Ferber & Perrot 1995). Elle nous semble particulièrement adaptée pour appréhender la complexité des systèmes et étudier leurs répercutions spatiales (Amblard & Phan 2006).Notre contribution s’insère dans les volets « 4. Configurations paysagères, occupation du sol, écologie spatiale », « 5. Dynamiques spatiales et interactions sociales » et « 12. Simulations spatiales et systèmes complexes » de TheoQuant15. Nous présentons tout d’abord le modèle VICTOR (VIticulture Consommation TOuRaine) (Delay et al. 2013) qui a constitué le premier pas dans l’élaboration du programme VitiTerroir. Après une discussion des principaux résultats obtenus, nous proposons une transition vers la méthodologie générale adoptée pour VitiTerroir, en précisant son domaine d’application
Ação polĂtica e afirmação territorial: turismo de base comunitária entre os caiçaras de SĂŁo Gonçalo, Paraty, Rio de Janeiro
O presente texto sintetiza nossas primeiras reflexões (ainda em curso) sobre a criação de roteiros de turismo de base comunitária entre os caiçaras de SĂŁo Gonçalo, municĂpio de Paraty, Rio de Janeiro. Esta iniciativa Ă© entendida como ação polĂtica que evidencia o histĂłrico de luta da comunidade por afirmação territorial, ressaltando a importância do conhecimento local na produção dos roteiros e na contextualização do lugar onde a comunidade desenvolve sua existĂŞncia.This paper sums up our first thoughts (in progress) on the establishment of community-based tourism routes among caiçaras of SĂŁo Gonçalo, city of Paraty, Rio de Janeiro. This initiative is seen as political action that reflects the community’s historical struggle for territorial claim, highlighting the importance of local knowledge in producing guides and contexts of places where the community exists.Ce texte synthĂ©tise nos premières rĂ©flexions (encore en cours) sur le tourisme Ă base communautaire parmi les pĂŞcheurs « caiçaras » dans le village de SĂŁo Gonçalo, municipalitĂ© de Paraty, Rio de Janeiro. On comprend que ce genre de tourisme fait partir d’une action politique capable de mettre en Ă©vidence une histoire de conflits au nom de l’affirmation territoriale. Au mĂŞme temps, le tourisme Ă SĂŁo Gonçalo signale l’importance des connaissances locales dans la rĂ©alisation des voies touristiques et dans la contextualisation de l’endroit oĂą la vie de la communautĂ© se dĂ©roule.El actual texto sintetiza las primeras reflexiones (aĂşn en curso) acerca de la creaciĂłn de rutas de turismo de base comunitaria entre los caiçaras en la cercanĂa de SĂŁo Gonçalo, ciudad de Paraty, Rio de Janeiro. Esta iniciativa se entiende como acciĂłn polĂtica que evidencia la lucha de la comunidad por afirmaciĂłn territorial, destacando la importancia del conocimiento local en la producciĂłn de las rutas y la contextualizaciĂłn del lugar en donde la comunidad desarrolla su existencia
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