Genome-wide DNA sampling by Ago nuclease from the cyanobacterium Synechococcus elongatus

Members of the conserved Argonaute (Ago) protein family provide defense against invading nucleic acids in eukaryotes in the process of RNA interference. Many prokaryotes also contain Ago proteins that are predicted to be active nucleases, however, their functional activities in host cells remain poorly understood. Here, we characterize the in vitro and in vivo properties of the SeAgo protein from the mesophilic cyanobacterium Synechococcus elongatus. We show that SeAgo is a DNA-guided nuclease preferentially acting on single-stranded DNA targets, with nonspecific guide-independent activity observed for double-stranded substrates. The SeAgo gene is steadily expressed in S. elongatus, however, its deletion or overexpression does not change the kinetics of cell growth. When purified from its host cells or from heterologous E. coli, SeAgo is loaded with small guide DNAs whose formation depends on the endonuclease activity of the argonaute protein. SeAgo co-purifies with SSB proteins suggesting that they may also be involved in DNA processing. The SeAgo-associated small DNAs are derived from diverse genomic locations, with certain enrichment for the proposed sites of chromosomal replication initiation and termination, but show no preference for an endogenous plasmid. Therefore, promiscuous genome sampling by SeAgo does not have great effects on cell physiology and plasmid maintenance

Genome-wide DNA sampling by Ago nuclease from the cyanobacterium Synechococcus elongatus

Members of the conserved Argonaute (Ago) protein family provide defense against invading nucleic acids in eukaryotes in the process of RNA interference. Many prokaryotes also contain Ago proteins that are predicted to be active nucleases, however, their functional activities in host cells remain poorly understood. Here, we characterize the in vitro and in vivo properties of the SeAgo protein from the mesophilic cyanobacterium Synechococcus elongatus. We show that SeAgo is a DNA-guided nuclease preferentially acting on single-stranded DNA targets, with nonspecific guide-independent activity observed for double-stranded substrates. The SeAgo gene is steadily expressed in S. elongatus, however, its deletion or overexpression does not change the kinetics of cell growth. When purified from its host cells or from heterologous E. coli, SeAgo is loaded with small guide DNAs whose formation depends on the endonuclease activity of the argonaute protein. SeAgo co-purifies with SSB proteins suggesting that they may also be involved in DNA processing. The SeAgo-associated small DNAs are derived from diverse genomic locations, with certain enrichment for the proposed sites of chromosomal replication initiation and termination, but show no preference for an endogenous plasmid. Therefore, promiscuous genome sampling by SeAgo does not have great effects on cell physiology and plasmid maintenance

Programmable DNA cleavage by Ago nucleases from mesophilic bacteria Clostridium butyricum and Limnothrix rosea

Argonaute (Ago) proteins are key players in RNA interference in eukaryotes, where they function as RNA-guided RNA endonucleases. Prokaryotic Argonautes (pAgos) are much more diverse than their eukaryotic counterparts but their cellular functions and mechanisms of action remain largely unknown. Some pAgos were shown to use small DNA guides for endonucleolytic cleavage of complementary DNA in vitro. However, previously studied pAgos from thermophilic prokaryotes function at elevated temperatures, which limits their potential use as a tool in genomic applications. Here, we describe two pAgos from mesophilic bacteria, Clostridium butyricum (CbAgo) and Limnothrix rosea (LrAgo), that act as DNA-guided DNA nucleases at physiological temperatures. In comparison with previously studied pAgos, CbAgo and LrAgo do not show strong preferences for the 5′-nucleotide in guide DNA and can use not only 5′-phosphorylated but also 5′-hydroxyl DNA guides. Both CbAgo and LrAgo can tolerate guide/target mismatches in the seed region, but are sensitive to mismatches in the 3′-guide region. Both pAgos can perform programmable endonucleolytic cleavage of double-stranded DNA substrates, showing enhanced activity at AT-rich regions and at elevated temperatures. The biochemical characterization of mesophilic pAgo proteins paves the way for their use for DNA manipulations both in vitro and in vivo

Оцінка та управління ризиком використання послуг комерційного банку для легалізації кримінальних доходів або фінансування тероризму

В роботі проаналізовано ризики використання послуг комерційних банків для легалізації кримінальних доходів або фінансування тероризму; досліджено методи і механізми боротьби з відмиванням коштів; розглянуті основні системи організації фінансового контролю та фінансового моніторингу в Україні; визначено роль та місце внутрішньобанківських ризиків надання банком послуг, пов'язаних з легалізацією коштів, отриманих злочинним шляхом, або фінансуванням тероризму; проаналізовано фінансові операції на предмет їх використання у схемах, які можуть бути пов’язані з легалізацією коштів.The work is stressed on the risks of using the services of commercial banks for money laundering or terrorist financing; Methods and mechanisms to combat money laundering; the main systems of financial control and financial monitoring in Ukraine; the role and place of the bank's internal risk provision of services related to money laundering crime or terrorist financing; analysis of financial transactions for their use in circuits that could be related to money laundering

Розроблення та дослідження методів графо-функціонального моделювання розподілених систем

During the research, the method of geometric modeling of distributed systems and related technological objects was developed. The method is based on the use of functional graphs. In the context of the research, the main differences between such graphs are: modeling of technological objects of distributed systems only by vertices without the use of edges to reproduce the mentioned objects; using the edges exclusively for the reproduction of the connections between the objects. Weighing of the vertices of the specified graphs is performed using the assigned functions or functionals with a complete absence of weights of the edges.In contrast to the closest analogues, the basis of the analytical interpretation of the formed graphic models in the proposed method is formed not by the incidence matrices, but by the parametric-topological adjacency matrices. In such conditions, the principles of assigning weight coefficients of graph elements change significantly: instead of the positional distribution of the weight sets elements between the matrix cells, the assignment of the specified elements as function arguments as a part of functional vertices is used. In the mentioned approach, a diagonal way of prescribing functions or functionals of vertices in the adjacency matrix is used. The assignment of the connections between the graph elements in the analytical interpretation is performed according to the introduced positional principle with the use of positive or negative logic. With this approach, the possibility of analytical formation of multiple connections between the vertices with an arbitrary number and direction, which was not used in the matrix of adjacency previously, is reached. Moreover, assigning functional dependencies to the graph elements allows the reproduction of not only static, but also the dynamic characteristics of the modeled objects in the geometric model.The practical value of the proposed method is increasing the universality and simplifying the automated configuration of software management systems. Achieving this result is possible by reducing the amount of input data and the possibility of introducing additional functions of control objects without the modification of the output code. In addition, the improvement of the formalized drawing up of technical tasks in the development of technical documentation and hardware distribution systems is provided. Furthermore, the integration of the method into existing CAE and CAD systems is possible, which provides opportunities for building up and creating fundamentally new similar systems.Further development of the proposed method consists in solving the problems related to the optimization of the distribution of arguments of vertex functions by cells of parametric-topological matrices.В процессе исследования разработан метод геометрического моделирования распределённых систем и связанных технологических объектов. В основу метода заложено использование функциональных графов. В контексте исследования основными отличительными особенностями данных графов являются: моделирование технологических объектов распределённых систем исключительно вершинами, без применения рёбер для воспроизведения; 2) использование рёбер исключительно для воспроизведения связей между объектами; 3) взвешивание вершин с помощью назначенных функций или функционалов с полным отсутствием взвешенности рёбер.В отличие от ближайших аналогов в основу аналитической интерпретации формируемых графических моделей в предлагаемом методе заложены не матрицы инцидентности, а параметрично-топологические матрицы смежности. При этом существенно изменяется принцип присвоения весовых коэффициентов элементам графа: вместо позиционного распределения элементов весовых множеств между ячейками матриц используется задание указанных элементов в качестве аргументов функций в составе функциональных вершин. При этом применён диагональный способ прописывания функций или функционалов вершин в матрице смежности. Задание связей между элементами графа при аналитической интерпретации выполняется по введённому позиционному принципу с применением положительной либо отрицательной логики. При таком подходе достигается возможность аналитического формирования множественных связей между вершинами с произвольными количеством и направленностью, что ранее не применялось в составе матриц смежности. Кроме этого, присвоение элементам графа функциональных зависимостей позволяет воспроизводить в составе геометрической модели не только статические, но и динамические характеристики моделируемых объектов.Практическая ценность предлагаемого метода состоит в: 1) повышении универсальности и упрощении процедур автоматизированного конфигурирования программного обеспечения систем управления за счёт сокращения объёма вводимых данных и возможности введения дополнительных функций объектов управления без правки исходного кода; 2) совершенствовании формализованного составления технических заданий при разработке технической документации и аппаратного обеспечения распределенных систем; 3) интеграции в существующие системы САЕ и САПР, возможности наращивания возможностей и создании принципиально новых таких систем.Последующее развитие предлагаемого метода состоит в разрешении вопросов, связанных с оптимизацией распределения аргументов функций вершин по ячейкам парамерично-топологических матрицУ процесі дослідження розроблено метод геометричного моделювання розподілених систем і пов'язаних з ними технологічних об'єктів. В основу методу закладено використання функціональних графів. В контексті дослідження основними відмінностями таких графів є: моделювання технологічних об’єктів розподілених систем виключно вершинами, без застосування ребер для відтворення зазначених об’єктів; використання ребер виключно для відтворення зв'язків між об'єктами. Зважування вершин зазначених графів виконується за допомогою призначених функцій або функціоналів з повною відсутністю виваженості ребер.На відміну від найближчих аналогів, в основу аналітичної інтерпретації сформованих графічних моделей в пропонованому методі закладені не матриці інцидентності, а параметрично-топологічні матриці суміжності. В таких умовах істотно змінюється принципи присвоєння вагових коефіцієнтів елементів графа: замість позиційного розподілу елементів вагових множин між комірками матриць використовується завдання зазначених елементів в якості аргументів функцій у складі функціональних вершин. При зазначеному підході застосований діагональний спосіб прописування функцій або функціоналів вершин в матриці суміжності. Завдання зв'язків між елементами графа при аналітичній інтерпретації виконується по введеному позиційному принципу із застосуванням додатної або від’ємної логіки. При такому підході досягається можливість аналітичного формування множинних зв'язків між вершинами з довільною кількістю і спрямованістю, що раніше не застосовувалося в складі матриць суміжності. Крім цього, присвоєння елементам графа функціональних залежностей дозволяє відтворювати в складі геометричної моделі не тільки статичних, але й динамічних характеристик об'єктів, що моделюються.Практична цінність пропонованого методу полягає в підвищенні універсальності і спрощенні процедур автоматизованої конфігурації програмного забезпечення систем керування. Досягнення такого результату можливе за рахунок скорочення обсягу даних, що вводяться, і можливості введення додаткових функцій об'єктів керування без правки вихідного коду. Додатково забезпечується вдосконалення формалізованого складання технічних завдань при розробленні технічної документації та апаратного забезпечення розподілених систем. Крім того, можлива інтеграція методу в існуючі системи САЕ і САПР, що забезпечує нарощування можливостей і створення принципово нових таких систем.Подальший розвиток запропонованого методу полягає у розв'язанні питань, пов'язаних з оптимізацією розподілу аргументів функцій вершин по комірках парамерично-топологічних матриц

Data mining and bifurcation analysis of the risk of money laundering with the involvement of financial institutions

Сучасні тенденції глобалізації, об’єднання банків та страхових компаній світу у єдину фінансовий конгломерат, а також поява нових електронних засобів розрахунку змушують уряди різних держав шукати нові підходи до аналізу ризиків участі фінансових установ в процесі легалізації кримінальних доходів. Дослідження пояснює, як за допомогою обмеженого обсягу інформації на основі загальних показників характеристики країни можливо на основі інтелектуального та біфуркаційного аналізу встановити рівень стійкості держави до залучення її фінансових установ в процес легалізації кримінальних доходів. Дана інформація може виступати основою прийняття національними та міжнародними контролюючими органами ефективних управлінських рішень щодо інтенсивності застосування інструментів випливу відносно учасників ринку фінансових послуг. Метою статті є розробка науково-методичного підходу до оцінювання ризику використання фінансових установ з метою легалізації кримінальних доходів, який ґрунтується на дослідженні динамічної стійкості даного ризику на основі теорії біфуркації. Об’єктом дослідження виступають105 країн світу з різним рівнем розвитку економіки та фінансової системи. Інструментом реалізації запропонованого науково-методичного підходу є інтелектуальний аналіз, а саме: кластеризація, метод головних компонент, кореляційний аналіз та біфуркаційний аналіз. Безпосередньо, науково-методичний підхід до оцінювання ризиків участі фінансових установ в money laundering включає чотири етапи реалізації. В рамках першого етапу використано інструментарій інтелектуального аналізу даних (проведено перевірку мультиколінеарності вхідних показників шляхом застосування кореляційного аналізу) для виявлення релевантних показників характеристики країни фінансові установи якої, можуть бути залучені до процесу легалізації кримінальних доходів. На другому етапі за допомогою кластеризації методом k-середніх проведено об’єднання країн світу на 10 груп, що дозволяє виділити характерні для них риси з метою розробки в подальшому індивідуальних заходів міжнародного та національного нагляду та контролю. Третій етап присвячено виявленню релевантних показників характеристики процесу оцінювання динамічної стійкості ризику використання фінансових установ з метою легалізації кримінальних доходів за допомогою методу головних компонент. Так, доведено, що для опису даного ризику необхідно не сім, а чотири фактори: bank secrece; internally displaced persons, new displacement associated with conflict and violence (number of cases); corruption perceptions index; global terrorism index. На четвертому етапі здійснюється біфукарційний аналіз різних груп країн, що дозволяє описати стан рівноваги системи їх характеристики в розрізі ймовірності використання фінансових установ з метою легалізації кримінальних доходів. На основі емпіричних розрахунків встановлено, що для групи країн, до яких належить Україна, динамічна система знаходиться в нерівноважному стані та описується у вигляді фазового портрету типу «сідло». Тобто, в Україні ризик використання фінансових установ з метою легалізації кримінальних доходів високий, хоча й знаходиться під певним контролем з боку держави. В той же час, отримані розрахунки свідчать, що за умови посилення та реформування системи протидії легалізації кримінальних доходів в Україні система втратить умовну стійкість та відповідний ризик, ще більше зросте.The current trends of globalization, the integration of banks and insurance companies worldwide into a single financial conglomerate, as well as the emergence of new electronic payment instruments, force governments of different countries to search for new approaches to analyse the risks of involvement of financial institutions in money laundering. The research explains how to use the data mining and bifurcation analysis based on the limited information on general indices of a country's characteristics to evaluate the state’s resilience to the involvement of its financial institutions in money laundering. The purpose of the article is to develop a scientific and methodological approach to assessing the risk of using financial institutions in money laundering. It is based on the study of the dynamic stability of this risk on the basis of bifurcation theory. Empirical calculations show that for a group of countries, to which Ukraine belongs, the dynamic system is in a non-equilibrium state and is described as a phase portrait “saddle”. Therefore, the risk of using financial institutions for money laundering is high in Ukraine, although it is under certain control by the state. However, the calculations show that under conditions of the partial reform of the anti-money laundering system in Ukraine, the system will lose its conditional stability and the corresponding risk will increase even mor

Подходы к оценке инновационной восприимчивости организации

Материалы XX Междунар. науч.-техн. конф. студентов, аспирантов и молодых ученых, Гомель, 23–24 апр. 2020 г

Система фінансового моніторингу як запорука досягнення високого рівня економічної безпеки національної економіки

Сучасна національна економіка функціонує в доволі несприятливих умовах, що здійснюють негативний вплив на її діяльність, а також пов’язані з постійними змінами зовнішнього та внутрішнього середовища, досить високим рівнем наявних загроз і певних фінансових ризиків. Саме тому, в теперішніх ринкових умовах господарювання гостро постає питання забезпеченням фінансово-економічної безпеки економіки країни. Для вирішення вищезазначеного питання у державі повинна діяти ефективна система забезпечення економічної безпеки, що містить певні взаємопов’язані складові частини, що охоплюють різні сфери економічного життя суспільства. Одним з найвагоміших елементів забезпечення економічної безпеки повинен виступати фінансовий моніторинг. Тому, що саме фінансова безпека є одним з найвагоміших компонентів економічної безпеки національної економіки, що забезпечує можливість успішного функціонування господарських процесів

Система фінансового моніторингу як запорука досягнення високого рівня економічної безпеки національної економіки

Сучасна національна економіка функціонує в доволі несприятливих умовах, що здійснюють негативний вплив на її діяльність, а також пов’язані з постійними змінами зовнішнього та внутрішнього середовища, досить високим рівнем наявних загроз і певних фінансових ризиків. Саме тому, в теперішніх ринкових умовах господарювання гостро постає питання забезпеченням фінансово-економічної безпеки економіки країни. Для вирішення вищезазначеного питання у державі повинна діяти ефективна система забезпечення економічної безпеки, що містить певні взаємопов’язані складові частини, що охоплюють різні сфери економічного життя суспільства. Одним з найвагоміших елементів забезпечення економічної безпеки повинен виступати фінансовий моніторинг. Тому, що саме фінансова безпека є одним з найвагоміших компонентів економічної безпеки національної економіки, що забезпечує можливість успішного функціонування господарських процесів