Morphological, genetical and ecological discrimination of sympatric Coastal Guinea Mastomys (Mammalia : Rodentia) species (West Africa) : implications for health and agriculture

Cytogenetic and molecular tools have shown the existence of two sibling species of the multimammate rat in Coastal Guinea : M. erythroleucus and M. huberti from Mankoutan locality. Here we present the study of the unique population of M. huberti ever recorded in Guinea, distant from 350 km from the closest locality in Senegal and representing the southernmost point of the species’ disjunct distribution. In order to clarify its ecological preferences and define its degree of sympatry with M. erythroleucus, we have searched for morphological and morphometric criteria allowing reliable identification of the species in Coastal Guinea. Discriminant Factorial Analyses (DFA) were performed on external and skull measurements for respectively 108 and 106 previously genetically typed individuals. All discriminant analyses showed that the 100 % rate of good classification is never attained. Misclassifications of 55.6 % of the specimens were obtained in the field by using external fur colour and aspect whereas the error score ranged from 4.5 to 8 % by using DFA on external measurements. Furthermore, DFA on skull measurements gave 100 % of correct classification for M. huberti - which is characterized by a smaller size - against 96.97 % for M. erythroleucus. In the same time, we were able to define the local specific habitat of each species. In Mankountan, M. huberti is never found into houses but prefers wet rice fields, while M. erythroleucus is found both in houses and cultures as well as in wet rice fields where it is found in syntopy with M. huberti at the end of the dry season. In Yerende, a hundred kilometres from Mankoutan, we only caught M. erythroleucus both in houses and fields. This study once again highlights the importance of a deep taxonomic knowledge of small mammals’ diversity for sanitary and agricultural risks evaluation but also confirms the problems of identification encountered with rodent sibling species living in sympatryLes analyses cytogénétiques et moléculaires ont mis en évidence la présence de deux espèces jumelles de Mastomys en Guinée Maritime: M. ervthroleucus et M. huberti dans la localité de Mankoutan. Il s'agit de la première étude de la seule population de M. huberti rencontrée en Guinée située à 350 km de la population la plus proche du Sénégal, à l'extrémité Sud de l'aire de distribution disjointe de l'espèce. Afin de définir ses préférences écologiques, nous avons recherché des critères morphologiques et morphométriques pour identifier les deux espèces de Mastomys afin de mieux définir leur degré de sympa-trie. Des Analyses Factorielles Discriminantes (AFD) effectuées sur les caractères externes et crâniens de 108 et 106 individus ayant fait l'objet d'analyses moléculaires (cyt.b) et /ou cytogénétiques, provenant de deux localités proches, montrent que l'on ne peut jamais discriminer avec 100 % de certitude les spécimens en 'peau' et 'crâne'. Le taux d'erreur de détermination des deux espèces atteint 55,6 % pour la coloration et l'aspect du pelage sur le terrain, il oscille entre 4,5 et 8 % en AFD sur les mesures externes. Cependant avec les mesures crâniennes traitées par AFD, les M. huberti se distinguent à 100 % par une taille légèrement plus faible, contre 96,97 % chez M. erythroleucus. Parallèlement, nous avons pu préciser l'habitat spécifique aux deux espèces dans la même localité. Ainsi, à Mankountan, M. huberti n'est jamais rencontré dans les maisons et préfère les champs de riz inondés. M. erythroleucus est présent à la fois dans les maisons et dans les champs, quelquefois dans les rizières inondés où, à la fin de la saison sèche, il se retrouve en syntopie avec M. huberti. La localité de Yerendé située à 100 km de Mankountan n'a livré que des M. erythroleucus, présents à la fois dans les maisons et les champs. Cette étude montre l'importance d'une connaissance approfondie de la systématique et de la diversité des petits mammifères nuisibles pour l'évaluation des risques sanitaires et agricoles et confirme les difficultés d'identification morphologique des espèces jumelles chez les rongeurs

Mastomys natalensis and Lassa Fever, West Africa

PCR screening of 1,482 murid rodents from 13 genera caught in 18 different localities of Guinea, West Africa, showed Lassa virus infection only in molecularly typed Mastomys natalensis. Distribution of this rodent and relative abundance compared with M. erythroleucus correlates geographically with Lassa virus seroprevalence in humans

Resurgence of Ebola virus in 2021 in Guinea suggests a new paradigm for outbreaks

These authors contributed equally: Alpha K. Keita, Fara R. Koundouno, Martin Faye, Ariane Düx, Julia Hinzmann.International audienc

Les forêts sacrées du Bassin du Haut Niger en Guinée : quelle évolution depuis trois décennies ?

International audienceLa présente étude porte sur l'analyse diachronique de la dynamique spatiale de 20 forêts sacrées dans le Bassin du Haut Niger en Guinée entre 1990 et 2017. L'interprétation des images satellites anciennes et récentes SPOT 6 & 7, des observations humaines ainsi que des enquêtes auprès des populations sur la gestion des forêts sacrées ont été utilisés. L'étude a révélé que malgré le caractère sacré des forêts étudiées, leur gestion pose des problèmes dans le Bassin du Haut Niger en Guinée. L'analyse diachronique de l'évolution spatiale de 20 forêts du Bassin montre une tendance régressive de la superficie des différentes forêts. Pour tous les sites confondus, la superficie totale est passée de 2896,56 ha en 1990 à 1381,42 ha en 2017. En 27 ans, la superficie totale initiale de ces sites s'est réduite de 52 %, à un taux annuel moyen d'environ 2 %. Ce recul considérable s'explique principalement par l'extension des zones agricoles et d'habitations avec la pression démographique, la proximité des forêts avec des agglomérations et l'affaiblissement du système local de gestion. Des stratégies de gestion durable sont donc nécessaires, au risque de perdre totalement ce patrimoine écologique et culturel du Bassin dans les trois prochaines décennies

Rodent control to fight Lassa fever: Evaluation and lessons learned from a 4-year study in Upper Guinea

Lassa fever is a viral haemorrhagic fever caused by an arenavirus. The disease is endemic in West African countries, including Guinea. The rodents Mastomys natalensis and Mastomys erythroleucus have been identified as Lassa virus reservoirs in Guinea. In the absence of a vaccine, rodent control and human behavioural changes are the only options to prevent Lassa fever in highly endemic areas. We performed a 4 year intervention based on chemical rodent control, utilizing anticoagulant rodenticides in 3 villages and evaluating the rodent abundance before and after treatment. Three additional villages were investigated as controls. Analyses to assess the effectiveness of the intervention, bait consumption and rodent dynamics were performed. Anthropological investigations accompanied the intervention to integrate local understandings of human–rodent cohabitation and rodent control intervention. Patterns of bait consumption showed a peak at days 5–7 and no consumption at days 28–30. There was no difference between Bromadiolone and Difenacoum bait consumption. The main rodent species found in the houses was M. natalensis. The abundance of M. natalensis, as measured by the trapping success, varied between 3.6 and 16.7% before treatment and decreased significantly to 1–2% after treatment. Individuals in treated villages welcomed the intervention and trapping because mice are generally regarded as a nuisance. Immediate benefits from controlling rodents included protection of food and belongings. Before the intervention, local awareness of Lassa fever was non-existent. Despite their appreciation for the intervention, local individuals noted its limits and the need for complementary actions. Our results demonstrate that chemical treatment provides an effective tool to control local rodent populations and can serve as part of an effective, holistic approach combining rodent trapping, use of local rodenticides, environmental hygiene, house repairs and rodent-proof storage. These actions should be developed in collaboration with local stakeholders and communities.Peer Reviewe

Discrimination morphologique, génétique et écologique de deux espèces sympatriques de Mastomys (Mammalia : Rodentia) en Guinée Maritime (Conakry) : implications pour la santé et l’agriculture

Morphological, genetical and ecological discrimination of sympatric Coastal Guinea Mastomys (Mammalia : Rodentia) species (West Africa) : implications for health and agriculture. Cytogenetic and molecular tools have shown the existence of two sibling species of the multimammate rat in Coastal Guinea : M. erythroleucus and M. huberti from Mankoutan locality. Here we present the study of the unique population of M. huberti ever recorded in Guinea, distant from 350 km from the closest locality in Senegal and representing the southernmost point of the species’ disjunct distribution. In order to clarify its ecological preferences and define its degree of sympatry with M. erythroleucus, we have searched for morphological and morphometric criteria allowing reliable identification of the species in Coastal Guinea. Discriminant Factorial Analyses (DFA) were performed on external and skull measurements for respectively 108 and 106 previously genetically typed individuals. All discriminant analyses showed that the 100 % rate of good classification is never attained. Misclassifications of 55.6 % of the specimens were obtained in the field by using external fur colour and aspect whereas the error score ranged from 4.5 to 8 % by using DFA on external measurements. Furthermore, DFA on skull measurements gave 100 % of correct classification for M. huberti - which is characterized by a smaller size - against 96.97 % for M. erythroleucus. In the same time, we were able to define the local specific habitat of each species. In Mankountan, M. huberti is never found into houses but prefers wet rice fields, while M. erythroleucus is found both in houses and cultures as well as in wet rice fields where it is found in syntopy with M. huberti at the end of the dry season. In Yerende, a hundred kilometres from Mankoutan, we only caught M. erythroleucus both in houses and fields. This study once again highlights the importance of a deep taxonomic knowledge of small mammals’ diversity for sanitary and agricultural risks evaluation but also confirms the problems of identification encountered with rodent sibling species living in sympatry.Les analyses cytogénétiques et moléculaires ont mis en évidence la présence de deux espèces jumelles de Mastomys en Guinée Maritime : M. erythroleucus et M. huberti dans la localité de Mankoutan. Il s’agit de la première étude de la seule population de M. huberti rencontrée en Guinée située à 350 km de la population la plus proche du Sénégal, à l’extrémité Sud de l’aire de distribution disjointe de l’espèce. Afin de définir ses préférences écologiques, nous avons recherché des critères morphologiques et morphométriques pour identifier les deux espèces de Mastomys afin de mieux définir leur degré de sympatrie. Des Analyses Factorielles Discriminantes (AFD) effectuées sur les caractères externes et crâniens de 108 et 106 individus ayant fait l’objet d’analyses moléculaires (cyt.b) et / ou cytogénétiques, provenant de deux localités proches, montrent que l’on ne peut jamais discriminer avec 100 % de certitude les spécimens en ‘peau’ et ‘crâne’. Le taux d’erreur de détermination des deux espèces atteint 55,6 % pour la coloration et l’aspect du pelage sur le terrain, il oscille entre 4,5 et 8 % en AFD sur les mesures externes. Cependant avec les mesures crâniennes traitées par AFD, les M. huberti se distinguent à 100 % par une taille légèrement plus faible, contre 96,97 % chez M. erythroleucus. Parallèlement, nous avons pu préciser l’habitat spécifique aux deux espèces dans la même localité. Ainsi, à Mankountan, M. huberti n’est jamais rencontré dans les maisons et préfère les champs de riz inondés. M. erythroleucus est présent à la fois dans les maisons et dans les champs, quelquefois dans les rizières inondés où, à la fin de la saison sèche, il se retrouve en syntopie avec M. huberti. La localité de Yerendé située à 100 km de Mankountan n’a livré que des M. erythroleucus, présents à la fois dans les maisons et les champs. Cette étude montre l’importance d’une connaissance approfondie de la systématique et de la diversité des petits mammifères nuisibles pour l’évaluation des risques sanitaires et agricoles et confirme les difficultés d’identification morphologique des espèces jumelles chez les rongeurs.Denys Christiane, Lalis Aude, Kourouma Fodé, Kan Kouassi Stéphane, Nicolas Violaine, Aniskine Vladimir, Koivogui Lamine. Discrimination morphologique, génétique et écologique de deux espèces sympatriques de Mastomys (Mammalia : Rodentia) en Guinée Maritime (Conakry) : implications pour la santé et l’agriculture. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 67, n°2, 2012. pp. 193-211

GENERAL PARALYSIS IN A TROPICAL COUNTRY. STUDY OF 43 OBSERVATIONS

PARALYSIE GÉNÉRALE EN MILIEU TROPICAL. ÉTUDE DE 43 OBSERVATIONS RESUME Description :Les auteurs rapportent une étude de 43 cas de paralysie générale, révélés par un syndrome démentiel et des formes atypiques notamment les troubles confusionnels répétitifs et des crises épileptiformes. Objectif : L'objectif de cette étude est de réévaluer cette pathologie du point de vue clinique et paraclinique en milieu tropical. Méthode : Il s'agit d'une étude prospective. Le diagnostic a reposé sur la positivité des réactions sérologiques ( VDRL-TPHA) dans le sang et le liquide céphalo-rachidien, la présence d'une hypercellularité à prédominance lymphocytaire et d'une hyperprotéinorachie. Resultats : Les troubles cognitifs et moteurs, les états confusionnels répétitifs et les crises épileptiques constituent les formes cliniques dominantes de début. Chez tous les patients, le scanner a mis en évidence une discrète dilatation ventriculaire diffuse et un élargissement des sillons de la convexité. Le tracé électroencéphalographique était anormal dans près de 67% des cas. SUMMARY Description : The authors report a study of 43 cases of general paralysis revealed by some mental disorders and atypical forms notably repeater confessional disorders and some seizure-like attacks. Objective : The goal of this study is to revalue this pathology from the clinical and paraclinic point of view in tropical medium. Method : In this prospective study, the diagnosis was based on the serologic tests (VDRL-TPHA) in the blood and the cerebrospinal fluid (CSF); CSF cell count with lymphocyte predominance ; protein level in the fluid. Result : The diagnosis was based on the serologic tests (VDRL-TPHA) in the blood and the cerebrospinal fluid(CSF); high CSF cell count with lymphocyte predominance; high protein level in the fluid. The cogniture and motor troubles, the repeated confusion status and the epileptic seizures constitute the dominant clinical forms of the onset. In all the patients, the CT-scan revealed discrete diffuse ventricular dilation and widening of the grooves of the convexity. The electroencephalographic traces were abnormal in 67% of the cases. Key Words: Afrique, Guinée, paralysie générale, syphilis nerveuse, Africa, Guinea, general paralysis, neurosyphilis African Journal of Neurological Sciences Vol.23(2) 200

supplement information-tables.xlsx

Table 1 presents the raw data on rodent captured during 4 years. Their abundance is evaluated through the trapping success, which is based on the numbers by trapping night.<br><br>Table 2 presents the bait consumption in grammes per day (J1 to J31) during year 3. <br><br>Table 3 presents the bait consumption in grammes per day (J1 to J31) during year 4