On bicluster aggregation and its benefits for enumerative solutions

Biclustering involves the simultaneous clustering of objects and their attributes, thus defining local two-way clustering models. Recently, efficient algorithms were conceived to enumerate all biclusters in real-valued datasets. In this case, the solution composes a complete set of maximal and non-redundant biclusters. However, the ability to enumerate biclusters revealed a challenging scenario: in noisy datasets, each true bicluster may become highly fragmented and with a high degree of overlapping. It prevents a direct analysis of the obtained results. To revert the fragmentation, we propose here two approaches for properly aggregating the whole set of enumerated biclusters: one based on single linkage and the other directly exploring the rate of overlapping. Both proposals were compared with each other and with the actual state-of-the-art in several experiments, and they not only significantly reduced the number of biclusters but also consistently increased the quality of the solution.Comment: 15 pages, will be published by Springer Verlag in the LNAI Series in the book Advances in Data Minin

Controlo de qualidade em tomografia computorizada: qualidade de imagem e dose no diagnóstico, verificação da possibilidade da utilização da TC Conebeam do acelerador linear Elekta (XVI) no cálculo da dose de terapia

Tese de mestrado, Biofísica (Física Médica e Engenharia Biomédica), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2009As directivas europeias de qualidade de imagem em radiodiagnóstico perseguem o objectivo do estabelecimento de uma adequada qualidade de imagem e níveis de dose administrada ao doente razoavelmente baixos. Para tal, e segundo a IEC (International Electrotechnical Commission) deverão ser estabelecidos testes de constância da Tomografia Computorizada (TC) após os testes de aceitação. Os testes de aceitação são definidos pela IEC como os “testes realizados após a aquisição e instalação de um equipamento novo, ou modificações efectuadas ao equipamento existente, por de forma a verificar a concordância com as especificações contratuais”. Os testes de constância são definidos pela IEC como o “conjunto de testes a realizar para assegurar que o desempenho funcional do equipamento cumpre os critérios estabelecidos; ou permitir o reconhecimento da alteração das propriedades dos componentes do equipamento”. Em geral, os testes de constância são um subgrupo dos parâmetros medidos durante os testes de aceitação do equipamento; os valores de referência para os testes de constância são estabelecidos durante os testes de aceitação. Neste enquadramento são objectivos do presente trabalho de mestrado: -A análise do desempenho da TC Siemens Emotion 6 utilizada no Serviço de Radioterapia do Hospital da Luz, segundo a norma IEC 61223-2-6; -Verificar a dose da TC (Siemens Emotion 6); -Verificar a possibilidade da utilização das imagens obtidas na TC ConeBeam, do acelerador linear Elekta, para o cálculo da dose administrada em tempo real, nos doentes submetidos a tratamentos com radioterapia por comparação com a TC Siemens Emotion 6 utilizada nos planeamentos dosimétricos.The European directives of image quality in radio-diagnostics pursue the purpose of establishing an adequate image quality and to keep the dose levels to patients as reasonably low as achievable. For this purpose, constancy tests of Computed Tomography (CT) must be done after acceptance tests in order to follow IEC (International Electrotechnical Commission) recommendations. Acceptance tests are defined by the IEC as a “test carried out after a new equipment has been installed, or major modifications have been made to an existing equipment, in order to verify compliance with contractual specifications”. Constancy tests are defined by the IEC as “a series of tests carried out to ensure that equipment functional performance meets established criteria; or to enable the recognition of changes in the properties of equipment components”. In general, constancy tests are limited to a subgroup of the parameters measured in acceptance testing; reference values for constancy tests are established by the acceptance tests. Within this context and using these guidelines the purposes of this work were: -To analyze the performance of Siemens CT - Siemens Emotion 6 –used in Radiotherapy Department of Hospital da Luz, according to the IEC 61223-2-6 standard; -To verify the CT dose delivered to patients (Siemens Emotion 6); -To verify the possibility of using images obtained on the CT ConeBeam of the linac accelerator (Elekta) in order to account the real time given dose submitted to patients in radiotherapy treatments by comparison with the CT Siemens Emotion 6 used for radiation therapy planning’s

IMAGEM E REPRESENTAÇÃO: MATRIZES DAS BINARIEDADES DA LINGUAGEM

Este artigo analisa a produção de sentido nos processos de mediação e representação, tomando por base o papel das experiências primárias na produção de imagens simbólicas e dicotomias da linguagem, que alimentam os processos de representação nas narrativas literárias e midiáticas das ordens culturais e simbólicas em geral

Quality assessment of systematic reviews regarding dental implant placement on diabetic patients : an overview of systematic reviews

Since implant placement on diabetic patients still is a controversial topic and systematic reviews are at the top of scientific evidence hierarchy, a thorough assessment of the methodological quality of these reviews must be performed to inform clinicians if their conclusions and recommendations can be followed on clinical practice. An overview of systematic reviews was performed with the purpose to assess the methodological quality of systematic reviews regarding dental implant placement on diabetic patients. In addition, we presented a synthesis of clinical outcomes about the focused theme. An online search was performed on MEDLINE via PubMed, EMBASE, DARE-Cochrane, Scopus, Web of Science, LILACS, and SIGLE via Open Grey. Searches were conducted from database inception to May 2018. Systematic review articles with or without meta-analysis about the placement of dental implants on diabetic patients were included. Exclusion criteria were: articles whose primary outcome was not the survival/success rate of dental implants on diabetic patients; studies that do not relate the survival/success rate of dental implants with diabetes; duplicated papers. Methodological quality assessment was performed with AMSTAR. A descriptive synthesis of clinical outcomes was performed. We identified 1.661 initial hits and eight articles were selected for overview (kappa=0.83; strong agreement). Six studies presented moderate methodological quality and two showed high methodological quality. Implant survival rate ranged from 31.8% to 100% and data from four meta-analysis showed that diabetes does not affect implant survival rate. On the other hand, data from two meta-analysis for marginal bone loss showed that diabetes statistically affects this outcome. Two of the eight included studies presented high methodological quality and their meta-analysis showed that implant placement on diabetic patients does not affect implant survival rate and statistically affects marginal bone loss. However, clinicians must be aware that marginal bone loss values were not clinically relevant and may not be safe to follow the conclusions and recommendations of these studies

REFLEXÕES SOBRE O JOGO E ESTRATÉGIAS CRIATIVAS NA EDUCAÇÃO A FUNÇÃO DO JOGO E DO ACASO NA AQUISIÇÃO DE CONHECIMENTO

Este artigo reflete sobre a natureza do jogo - e do acaso - a partir da percepção científica desses fenômenos e sua incorporação no desenvolvimento de estratégias criativas para a aquisição de conhecimento, bem como através do aprimoramento de jogos lúdicos educativos e sua função com a emergência do acaso, sobretudo com o objetivo de refletir sobre o desenvolvimento de novas estratégias criativas e modelos pedagógicos capazes de pensar em uma educação para lidar com a complexidade do ambiente informacional e o problema ontológico do devir

Videovigilância, compressão e criptografia

Mestrado em Engenharia Electrotécnica e de ComputadoresO estudo desta tese centra-se em torno de uma ideia que envolve condições aparentemente controversas, i.e. video vigilância segura, usando sistemas de baixo custo, através de redes baixo débito. Pretende-se com esta tese demonstrar que, recorrendo a determinados mecanismos de optimização e simplificação da compressão, se podem satisfazer simultaneamente as diversas condições, de forma a tornar a solução segura. Para esse efeito são estudados e implementados algoritmos de compressão (com e sem perdas) e de criptografia, num sistema de baixo custo, desenvolvido de raiz no projecto da Licenciatura, o sistema VideoVigi. Em relação à compressão implementou-se uma versão adaptada da recomendação H.263 do ITU-T que inclui compressão de redundância espacial, temporal e de símbolos. No que diz respeito à criptografia foi implementado um algoritmo de encriptação simétrica, o standard AES. Os desenvolvimentos efectuados tiveram em conta o formato de vídeo CIF na sua versão monocromática. Para se avaliar a nova solução VideoVigi realizaram-se diversos ensaios num ambiente semi-real. Para isso recorreu-se a um acesso ADSL de baixo débito (BW= 64 kbps) configurado num DSLAM ligado à rede IP. Nos testes realizados obteve-se uma taxa de 3 frames por segundo, com encriptação, e 6 frames por segundo, sem encriptação. A compressão atingiu valores superiores a 99%, assegurando um fluxo contínuo de imagens perfeito para a video vigilância. De outro modo, na rede usada para teste e sem recorrer à compressão, a taxa de frames por segundo não foi além de 0,06. Os mecanismos de optimização da compressão e encriptação implementados, alteraram os dados do vídeo o suficiente, para poderem ser enviados por uma rede de baixo débito (64 kbps), e encriptados para poderem ser transferidos, de um modo seguro, sobre uma rede partilhada como a Internet. A simplificação destes mecanismos tornaram o seu algoritmo suficientemente ―leve‖ para ser implementado em sistemas de baixo custo (30 MIPS). Desta forma, sistemas de baixo custo, como o VideoVigi, podem tornar a video vigilância de locais remotos viável através de redes de baixo débito (e.g. General Packet Radio Service – GPRS).The study of this thesis is focused around an idea that involves conditions apparently controversial, i.e. secure video surveillance, low-cost solution implementations, through low-bandwidth networks. This thesis aims to prove that, through specific optimization and compression mechanisms, it is possible to satisfy the several conditions and build a secure solution. In order to make it possible studies were conducted, encryption and compression algorithms (with and without losses) were implemented and integrated in the low-cost VideoVigi system, developed from scratch during the final project of the graduation course. Regarding the compression, an adapted version of the ITU-T H.263 recommendation is implemented that includes compression of space, time and symbol redundancies. In order to encrypt the video data, a symmetric encryption algorithm was also developted, the standard AES. The developments were carried out considering the CIF video format in its monochromatic version. In order to evaluate the VideoVigi solution, several trials were realized in a semi-real environment. For that, a low-bandwidth ADSL network access (BW = 64 kbps) was configured in a DSLAM connected to the IP network. Rates of 3 encrypted frames per second and 6 non-encrypted frames per second were measured during the tests. The compression reached values above 99%. Otherwise, on the network used for tests and without compression, the rate of frames per second was not more than 0.06. The mechanisms for optimizing the implemented compression and encryption algorithms, processed the video data the enough to enable its transmission via a low-bandwidth network (64 kbps), and encrypted to enable the transmission through a shared network, like the Internet, in a secure way. The simplification of these mechanisms made the algorithms sufficiently "light" enabling their implementation in low cost systems (30 MIPS). Thus, low-cost systems, such as VideoVigi, makes the video surveillance of remote sites possible through low-bandwidth networks (e.g. General Packet Radio Service - GPRS)

Effects of Dehydroepiandrosterone (DHEA) Supplementation to Improve Ovarian Response and IVF Outcomes on Women with Poor Ovarian Response

There is still no clear consensus on the poor responder (PR) definition, however, the European Society of Human Reproduction and Embryology (ESHRE) suggested, in 2011, the Bologna criteria, which includes, for a poor ovarian response definition, at least two of the following three characteristics: age > 40 years, the number of oocytes previously recovered equal to or less than three, and low ovarian reserve tests score. It is noticed that, despite the use of different effective ovulation stimulation protocols, clinical pregnancy rates remain low in PR. In recent years, however, many authors, including Casson et al., reported the beneficial of DHEA supplementation on ovarian response in this group. Dehydroepiandrosterone (DHEA), a precursor of estradiol (E2) and testosterone (T), originates from the reticularis adrenal zone and from ovarian theca cell. In this chapter, we intend to demonstrate the potential benefits of DHEA supplementation in women with poor response in IVF outcomes

Perfeccionismo, auto-apresentação e ansiedade na competição desportiva e na prática de exercício: estudo exploratório com atletas de competição e praticantes de exercício

Esta investigação exploratória procurou analisar o padrão de relações entre perfeccionismo, ansiedade física e social, percepção de ameaça e auto-apresentação em atletas de competição (taekwondo e kickboxing) e em praticantes regulares de exercício. Participaram no estudo 107 indivíduos de ambos os sexos, com idades compreendidas entre os 14 e os 38 anos, envolvidos em competições oficiais de “taekwondo” (N=42), “kickboxing” (N=20) e na prática de exercício em “health clubs” ou ginásios (N=47). Foram administradas versões traduzidas e/ou adaptadas dos seguintes instrumentos: a) Escala Multidimensional de Perfeccionismo no Desporto (Dunn e tal., 2002); b) Questionário de Auto-Apresentação (Gammage et al., 2003); c) Escala de Ansiedade no Desporto e Actividade Física (Norton et al., 2004); d) Escala de Percepção de Ameaça (Cruz, 1996). Os resultados sugerem moderadas a fortes relações entre todas dimensões do perfeccionismo, diferentes medidas da ansiedade (competitiva, física e social) e diferentes dimesões da auto-apresentação (construção da impressão e motivação para a impressão). Foram também evidentes diferenças significativas em função do grupo (competição vs exercício)

Reprodução de crustáceos peneídeos : Endocrinologia e ultrastrutura da ovogénese

Dissertação de Doutoramento em Ciências Biomédicas apresentada ao Instituto de Ciências Biomédicas de Abel Salazar da Universidade do PortoA importância da cultura do camarão peneídeo Penaeus japonicus, bem como a existência no sul de Portugal da espécie autóctone P. kerathurus justificam o aprofundamento dos conhecimentos sobre o seu ciclo reprodutivo. O presente trabalho resulta de uma abordagem morfológica e endocrinológica da reprodução nestas espécies, através do estudo das alterações morfológicas do ovário e da ultrastrutura do ovócito bem como da sua relação com os níveis de hormonas ecdisteróides e esteróides sexuais durante a ovogénese.O estudo histológico do ovário de P. japonicus e P. kerathurus permitiu definir cinco fases vitelogénicas: Fase I Previtelogénese. Fase II - Previtelogénese avançada ou vitelogénese primária. Fase III - Vitelogénese (vitelogénese secundária). Fase IV - Maturação (formação de vesículas corticais). Fase V Desova. O presente trabalho constitui o primeiro estudo ultrastrutural da vitelogénese na espécie P. kerathurus, demonstrando pela primeira vez nos peneídeos, a formação do retículo endoplásmico e a origem dos grânulos densos. A origem dos vacúolos autofágicos e a presença simultânea de dois tipos de células foliculares nos crustáceos, bem como a presença de pontes intercelulares ("nurse-cells") na sub-classe malacostraca, constituem igualmente observações inéditas deste trabalho. Em P. kerathurus o vitelo tem uma origem mista, i. e., intraovocítica e extraovocítica. No início da vitelogénese predominam os fenómenos de endocitose mediada por receptores. Numa fase posterior, o processo vitelogénico é fundamentalmente intraovocítico, exibindo apenas escassos fenómenos de endocitose. A síntese de vitelo endógeno, que nesta espécie apresenta características peculiares, é descrito detalhadamente. Finalizada a vitelogénese, observa-se a formação das especializações corticais (vesículas corticais com estruturas do tipo "proteoglicano") cuja origem e desenvolvimento são descritas pela primeira vez nos peneídeos.Tendo como objectivo a quantificação de hormonas este ..