A database of naturally occurring human urinary peptides and proteins for use in clinical applications

Owing to its availability, ease of collection and correlation with (patho-) physiology, urine is an attractive source for clinical proteomics. However, the lack of comparable datasets from large cohorts has greatly hindered development in this field. Here we report the establishment of a high resolution proteome database of naturally occurring human urinary peptides and proteins - ranging from 800-17,000 Da - from over 3,600 individual samples using capillary electrophoresis coupled to mass spectrometry, yielding an average of 1,500 peptides per sample. All processed data were deposited in an SQL database, currently containing 5,010 relevant unique urinary peptides that serve as classifiers for diagnosis and monitoring of diseases, including kidney and vascular diseases. Of these, 352 have been sequenced to date. To demonstrate the applicability of this database, two examples of disease diagnosis were provided: For renal damage diagnosis, patients with a specific renal disease were identified with high specificity and sensitivity in a blinded cohort of 131 individuals. We further show definition of biomarkers specific for immunosuppression and complications after transplantation (Kaposi's sarcoma). Due to its high information content, this database will be a powerful tool for the validation of biomarkers for both renal and non-renal diseases

Ramucirumab plus docetaxel versus placebo plus docetaxel in patients with locally advanced or metastatic urothelial carcinoma after platinum-based therapy (RANGE): a randomised, double-blind, phase 3 trial

Few treatments with a distinct mechanism of action are available for patients with platinum-refractory advanced or metastatic urothelial carcinoma. We assessed the efficacy and safety of treatment with docetaxel plus either ramucirumab-a human IgG1 VEGFR-2 antagonist-or placebo in this patient population

Вивчення кінетики окиснення нітрит йонів калій фератом(VI)

The oxidation kinetics of nitrite to nitrate ions by potassium ferrate(VI) in a wide range of pH, from neutral to alkaline medium has been studied. Two series of kinetic experiments based on the different technologies for obtaining potassium ferrate(VI) were conducted. In the first series of experiments, crystalline potassium ferrate(VI) was prepared by the chemical synthesis. In the pH range 6.5–11, solid K2FeO4 was added to solutions of nitrite ions at known concentration and pH. Kinetic studies were performed under pH and ionic strength controlled conditions. Half times for these experiments ranged from milliseconds to a few minutes. In the second series of experiments, solutions of K2FeO4 were generated by the electrochemical synthesis. Alkaline solutions of potassium ferrate(VI) in 8.0 M KOH were obtained at t=20 oC by electrochemical dissolution of steel plates (S=10 cm2) containing: C – 0.16 %; Mn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; P – 0.04 %; the rest is Fe. The experiments were performed with fresh solutions of potassium ferrate(VI) and solutions, aged after the synthesis for several days. Kinetic studies were performed under nitrite concentrations controlled conditions. Half times in this case were in the range of several minutes to hours. It is found out that the maximum reaction rate is achieved by aging solution K2FeO4 after the synthesis for 8 days. Both methods show that the oxidation rate is controlled by the concentration of protonated ferrate, . The dependence of the observed rate constants on pH, nitrite concentrations and ionic strength has been investigated. The true rate constants of reaction are found. Particular orders of the reaction by nitrite and ferrate ions and the overall order of the reaction are calculated. The oxidation rate constant of water by Fe(VI) is found. The studies presented in this paper are important because the oxidation kinetics of harmful inorganic and organic substances by ferrates(VI) of alkali metals is widely used to determine the optimal parameters of technological processes for the purification of surface water, industrial wastewater and air.Изучена кинетика окисления нитрит до нитрат ионов ферратом(VI) калия в широком диапазоне pH, от нейтральной до щелочной среды. Проведены две серии кинетических экспериментов, основанных на разных технологиях получения феррата(VI) калия. В первой серии экспериментов кристаллический феррат(VI) калия получали химическим синтезом. В диапазоне рН 6.5–11  твердый K2FeO4 добавляли к растворам нитрит ионов при известной концентрации и рН. Эксперименты проводили под контролем рН и ионной силы. Кинетические исследования колебались от миллисекунд до нескольких минут. Во второй серии экспериментов растворы K2FeO4 было получено электрохимическим синтезом. Щелочные растворы феррата(VI) калия в 8.0 М КОН готовили электрохимическим растворения стальных пластин (S=10 см2), которые содержали: C – 0.16 %; Мn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; Р – 0.04 %; остальное Fe. Эксперименты проводили с использованием свежих растворов феррата(VI) калия и растворов, которые выдерживались после синтеза несколько дней, под контролем концентрации нитрит ионов. Кинетические исследования колебались от нескольких минут до часов. Установлено, что максимальная скорость реакции окисления достигается при использовании раствора K2FeO4, выдержанного после синтеза 8 дней. Две серии опытов показали, что скорость окисления нитрит ионов зависит от концентрации протонированного феррата, . Исследована зависимость наблюдаемых констант скорости от рН, концентраций нитрита и ионной силы. Рассчитаны истинные константы скорости, порядки реакции по нитрит и феррат ионам, общий порядок реакции. Найдена константа скорости реакции окисления воды ферратом(VI). Исследования, приведенные в данной статье, важны, так как кинетику окисления вредных неорганических и органических веществ ферратами(VI) щелочных металлов широко используют для установления оптимальных параметров технологических процессов очистки поверхностных вод, промышленных сточных вод и воздухаВивчено кінетику окиснення нітрит до нітрат йонів калій фератом(VI) в широкому діапазоні рН, від нейтрального до лужного середовища. Проведено дві серії кінетичних експериментів, заснованих на різних технологіях одержання калій ферату(VI). В першій серії експериментів кристалічний калій ферат(VI) отримували хімічним синтезом. В діапазоні рН 6.5–11 твердий K2FeO4 додавали до розчинів нітрит йонів при відомій концентрації та рН. Експерименти проводили під контролем рН та йонної сили. Кінетичні дослідження коливалися від мілісекунд до декількох хвилин. В другій серії експериментів розчини K2FeO4 було отримано електрохімічним синтезом. Лужні розчини калій ферату(VI) в 8.0 М КОН готували електрохімічним розчинення сталевих пластин (S=10 см2), що містили: C – 0.16 %; Мn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; Р – 0.04 %; решта Fe. Експерименти проводили з використанням свіжих розчинів калій ферату(VI) та розчинів, що витримувалися після синтезу декілька днів, під контролем концентрації нітрит йонів. Кінетичні дослідження коливалися від декількох хвилин до годин. Встановлено, що максимальна швидкість реакції окиснення досягається при використанні розчину K2FeO4, витриманого після синтезу 8 днів. Дві серії дослідів показали, що швидкість окиснення нітрит йонів залежить від концентрації протонованого ферату, . Досліджено залежність спостережуваних констант швидкості від рН, концентрацій нітриту та йонної сили. Розраховані істинні константи швидкості, порядки реакції за нітрит та ферат йонами, загальний порядок реакції. Знайдена константа швидкості реакції окиснення води фератом(VI). Дослідження, наведені в даній статті, важливі, тому що кінетику окиснення шкідливих неорганічних та органічних речовин фератами(VI) лужних металів широко застосовують для встановлення оптимальних параметрів технологічних процесів очищення поверхневих вод, промислових стічних вод та повітр

Застосування рециклінгу маткового розчину для одержання сполук Fe(VI)

In order to improve the indexes of ferrates(VI) synthesis and reduce production costs of the target product, we studied the recycling features of spent mother liquor. It is shown that the composition of mother liquors depends on the method of obtaining Fe(VI) compounds. Low-temperature salting-out is offered as the main technological decision for recycling. The solubility of K2FeO4 and some ballast salts (KCl, KNO3, K2SO4), which accumulate during the synthesis of ferrate in the mother liquor and when OH− ions are in large excess has been studied. It is shown that the solubility of the target product decreases with increasing concentration of potassium hydroxide and is ~0.7 g/l in 14.3 M KOH at 20 ºС. The influence of temperature and concentration of potassium hydroxide on the solubility of ballast salts has been studied and it is found out that for the effective removal of impurities it is necessary to maintain temperature within the range 0–10 ºС at C (KOH)=14 M.It has been established that the electrochemical synthesis of crystalline K2FeO4 based on the transpassive dissolution of Fe in the concentrated NaOH solution is impractical, as profitable recycling of the spent mother liquor is practically impossible.It has been determined that with the hypochlorite method of obtaining ferrates(VI), the least amount of impurities enters the system when FeO(OH) is used as the initial Fe-containing precursor. At the same time, the least amount of ОН− anions is also used for the formation of 1 mole of the target product. Therefore, the recycling of the mother liquor for synthesis based on FeO(OH) is the simplest and the most profitable.Изучены особенности рециклинга маточного раствора в технологии получения ферратов(VI). Установлено, что основное влияние на степень очистки от балластных анионов оказывают температура и концентрация щелочи.Изучена растворимость K2FeO4, KCl, K2SO4, KNO3 в присутствии большого избытка OH− ионов. Предложены технологические решения по рециклингу концентрированных щелочных растворов для различных способов синтеза ферратов(VI)Вивчено особливості рециклінгу маткового розчину в технології одержання фератів(VI). Встановлено, що головним чином на ступінь очистки від баластних аніонів впливають температура та концентрація лугу. Вивчено розчинність K2FeO4, KCl, K2SO4, KNO3 в присутності великого надлишку ОН− йонів. Запропоновано технологічні рішення щодо рециклінгу концентрованих лужних розчинів для різних способів синтезу фератів(VI

Вивчення кінетики окиснення нітрит йонів калій фератом(VI)

The oxidation kinetics of nitrite to nitrate ions by potassium ferrate(VI) in a wide range of pH, from neutral to alkaline medium has been studied. Two series of kinetic experiments based on the different technologies for obtaining potassium ferrate(VI) were conducted. In the first series of experiments, crystalline potassium ferrate(VI) was prepared by the chemical synthesis. In the pH range 6.5–11, solid K2FeO4 was added to solutions of nitrite ions at known concentration and pH. Kinetic studies were performed under pH and ionic strength controlled conditions. Half times for these experiments ranged from milliseconds to a few minutes. In the second series of experiments, solutions of K2FeO4 were generated by the electrochemical synthesis. Alkaline solutions of potassium ferrate(VI) in 8.0 M KOH were obtained at t=20 oC by electrochemical dissolution of steel plates (S=10 cm2) containing: C – 0.16 %; Mn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; P – 0.04 %; the rest is Fe. The experiments were performed with fresh solutions of potassium ferrate(VI) and solutions, aged after the synthesis for several days. Kinetic studies were performed under nitrite concentrations controlled conditions. Half times in this case were in the range of several minutes to hours. It is found out that the maximum reaction rate is achieved by aging solution K2FeO4 after the synthesis for 8 days. Both methods show that the oxidation rate is controlled by the concentration of protonated ferrate, . The dependence of the observed rate constants on pH, nitrite concentrations and ionic strength has been investigated. The true rate constants of reaction are found. Particular orders of the reaction by nitrite and ferrate ions and the overall order of the reaction are calculated. The oxidation rate constant of water by Fe(VI) is found. The studies presented in this paper are important because the oxidation kinetics of harmful inorganic and organic substances by ferrates(VI) of alkali metals is widely used to determine the optimal parameters of technological processes for the purification of surface water, industrial wastewater and air.Изучена кинетика окисления нитрит до нитрат ионов ферратом(VI) калия в широком диапазоне pH, от нейтральной до щелочной среды. Проведены две серии кинетических экспериментов, основанных на разных технологиях получения феррата(VI) калия. В первой серии экспериментов кристаллический феррат(VI) калия получали химическим синтезом. В диапазоне рН 6.5–11  твердый K2FeO4 добавляли к растворам нитрит ионов при известной концентрации и рН. Эксперименты проводили под контролем рН и ионной силы. Кинетические исследования колебались от миллисекунд до нескольких минут. Во второй серии экспериментов растворы K2FeO4 было получено электрохимическим синтезом. Щелочные растворы феррата(VI) калия в 8.0 М КОН готовили электрохимическим растворения стальных пластин (S=10 см2), которые содержали: C – 0.16 %; Мn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; Р – 0.04 %; остальное Fe. Эксперименты проводили с использованием свежих растворов феррата(VI) калия и растворов, которые выдерживались после синтеза несколько дней, под контролем концентрации нитрит ионов. Кинетические исследования колебались от нескольких минут до часов. Установлено, что максимальная скорость реакции окисления достигается при использовании раствора K2FeO4, выдержанного после синтеза 8 дней. Две серии опытов показали, что скорость окисления нитрит ионов зависит от концентрации протонированного феррата, . Исследована зависимость наблюдаемых констант скорости от рН, концентраций нитрита и ионной силы. Рассчитаны истинные константы скорости, порядки реакции по нитрит и феррат ионам, общий порядок реакции. Найдена константа скорости реакции окисления воды ферратом(VI). Исследования, приведенные в данной статье, важны, так как кинетику окисления вредных неорганических и органических веществ ферратами(VI) щелочных металлов широко используют для установления оптимальных параметров технологических процессов очистки поверхностных вод, промышленных сточных вод и воздухаВивчено кінетику окиснення нітрит до нітрат йонів калій фератом(VI) в широкому діапазоні рН, від нейтрального до лужного середовища. Проведено дві серії кінетичних експериментів, заснованих на різних технологіях одержання калій ферату(VI). В першій серії експериментів кристалічний калій ферат(VI) отримували хімічним синтезом. В діапазоні рН 6.5–11 твердий K2FeO4 додавали до розчинів нітрит йонів при відомій концентрації та рН. Експерименти проводили під контролем рН та йонної сили. Кінетичні дослідження коливалися від мілісекунд до декількох хвилин. В другій серії експериментів розчини K2FeO4 було отримано електрохімічним синтезом. Лужні розчини калій ферату(VI) в 8.0 М КОН готували електрохімічним розчинення сталевих пластин (S=10 см2), що містили: C – 0.16 %; Мn – 0.43 %; Si – 0.04 %; S – 0.03 %; Р – 0.04 %; решта Fe. Експерименти проводили з використанням свіжих розчинів калій ферату(VI) та розчинів, що витримувалися після синтезу декілька днів, під контролем концентрації нітрит йонів. Кінетичні дослідження коливалися від декількох хвилин до годин. Встановлено, що максимальна швидкість реакції окиснення досягається при використанні розчину K2FeO4, витриманого після синтезу 8 днів. Дві серії дослідів показали, що швидкість окиснення нітрит йонів залежить від концентрації протонованого ферату, . Досліджено залежність спостережуваних констант швидкості від рН, концентрацій нітриту та йонної сили. Розраховані істинні константи швидкості, порядки реакції за нітрит та ферат йонами, загальний порядок реакції. Знайдена константа швидкості реакції окиснення води фератом(VI). Дослідження, наведені в даній статті, важливі, тому що кінетику окиснення шкідливих неорганічних та органічних речовин фератами(VI) лужних металів широко застосовують для встановлення оптимальних параметрів технологічних процесів очищення поверхневих вод, промислових стічних вод та повітр

Usage of Mother Liquor Recycling for the Obtaining of Fe(VI) Compounds

In order to improve the indexes of ferrates(VI) synthesis and reduce production costs of the target product, we studied the recycling features of spent mother liquor. It is shown that the composition of mother liquors depends on the method of obtaining Fe(VI) compounds. Low-temperature salting-out is offered as the main technological decision for recycling. The solubility of K2FeO4 and some ballast salts (KCl, KNO3, K2SO4), which accumulate during the synthesis of ferrate in the mother liquor and when OH− ions are in large excess has been studied. It is shown that the solubility of the target product decreases with increasing concentration of potassium hydroxide and is ~0.7 g/l in 14.3 M KOH at 20 ºС. The influence of temperature and concentration of potassium hydroxide on the solubility of ballast salts has been studied and it is found out that for the effective removal of impurities it is necessary to maintain temperature within the range 0–10 ºС at C (KOH)=14 M.It has been established that the electrochemical synthesis of crystalline K2FeO4 based on the transpassive dissolution of Fe in the concentrated NaOH solution is impractical, as profitable recycling of the spent mother liquor is practically impossible.It has been determined that with the hypochlorite method of obtaining ferrates(VI), the least amount of impurities enters the system when FeO(OH) is used as the initial Fe-containing precursor. At the same time, the least amount of ОН− anions is also used for the formation of 1 mole of the target product. Therefore, the recycling of the mother liquor for synthesis based on FeO(OH) is the simplest and the most profitable

The Estimation of the Stability of Plants Constituting the Photosynthesizing Unit of Bioregenerative Life Support Systems for Including Them into the Plant Waste Mass Exchange

One of the ways of increasing the closure of mass exchange processes in the bioregenerative life support systems (BLSS) may be the technology of plant cultivation on the so-called soil-like substrate (SLS) which is expected to utilize inedible plant biomass with the help of the SLS heterotrophic link. Earlier, based on the example of the radish inedible biomass, there was shown the principal possibility of its successful biological combustion (without decreasing the productivity of the plants cultivated) during their direct introduction into the SLS. The possibility of a direct plant waste introduction into the SLS could considerably simplify the technological processes of their biological combustion and increase their efficiency. However, there were no experiments carried out with respect to the other vegetables included into the BLSS photosynthesizing link. The aim of the given work is estimating the possible influence of the inedible biomass of different plant species introduced into the SLS, on the plant productivity. Several series of the test experiments were carried out. In the first experiment series, dried radish leafy tops making up 0.8 kg/m2 of the sown area, dried carrot leafy tops – 3.1 kg/m2 and dried beet leafy tops – 2.5 kg/m2 were introduced into the SLS makeup. As a test culture, there was taken the radish Raphanus sativus L of the Virovsky Beliy species. In the second experiment series, before the sowing of radish and wheat, there were introduced 1.2 kg/m2 and 3.1 kg/m2 of dry wheat straw into the SLS respectively. In the third series of the experiments, the wheat straw, before being introduced into the SLS, was subjected to the preliminary processing. In the fourth experiment series, there was studied the supposition about the possibility of decreasing the negative influence of introducing the vegetable tops into the SLS on the plant growth of the succeeding generation under the conditions of growing plants on a various-ages multi-species vegetable conveyor. According to the results of the research, the direct introduction of carrot and beet tops, as well as dry wheat straw, resulted in the considerable drop of the plant productivity. The vegetable cultivation in a conveyor mode done for three generations, also resulted in their productivity decrease. It was shown that the straw mineralization by using the method of “wet incineration” developed by Yu. A. Kudenko had completely removed the negative effect of the plant waste on the plant growth and could be the alternative way of the wheat waste utilization

Photoprotection by carotenoids of plantago media photosynthetic apparatus in natural conditions

The study of daily changes in photosynthetic rate, of energy used in photochemical and non-photochemical processes, and of carotenoid composition aimed at evaluating the role of xanthophyll cycle (XC) in protection of hoary plantain plants (Plantago media) in nature. The leaves of sun plants differed from shade plants in terms of CO2 exchange rate and photosynthetic pigments content. The total pool XC pigments and the conversion state increased from morning to midday in sun plants. An increase in zeaxanthin content occurred concomitantly with the violaxanthin decrease. About 80% violaxanthin was involved in conversion. The maximum of zeaxanthin in XC pigments pool was 60%. The conversion state of XC was twice as lower in shade plants than that in sun plants. The photosynthesis of sun leaves was depressed strongly at midday, but changes of maximum quantum yield of PS2 (Fv/Fm) were not apparent at that time. The coefficient qN (non-photochemical quenching) in the sun leaves changed strongly, from 0.3 to 0.9 as irradiance increased. The direct relation between heat dissipation and the conversion state of XC in plantain leaves was revealed. Thus, plantain leaves were found to be resistant to excess solar radiation due to activation of qN mechanisms associated with the XC de-epoxidation

Penetrating gunshot wounds to the penis: a case report of combat patient injured in the war in Ukraine

Abstract Background The current war in Ukraine is associated with frequent applications of multiple-launch rocket systems and cruise missiles as well as other various high-energy weapons to cause severe injuries in military personnel including abdomen wounds, vascular injury, and limb amputations as well as genitourinary trauma. The aim of this report is to demonstrate a case of successful penile salvage by restoring its function in a combat patient with gunshot genitourinary trauma in conditions of an interrupted supply of medical equipment. Case presentation We describe a case of a 48-year-old male patient with a combined shrapnel gunshot wound to the penis with damage to the urethra and combined injury to the soft tissues of the left thigh. Several hours after the injury, the patient underwent primary surgical debridement of the left thigh, ligation of the great saphenous vein of the thigh, primary sutures on the penile urethra and navicular fossa, suturing of the rupture of the head and penis, drainage of the wound, catheterization of the bladder, and epicystostomy. An artificial erection was performed intraoperatively. The urethral catheter was removed 3 weeks after urethral suturing (May 4, 2022). The epicystostomy was removed 5 months after the injury (August 4, 2022) and 2 days after the restoration of spontaneous urination. At the follow-up of 7 months after the injury, the patient has normal urination with minor urinary dribbling, sufficient erection, and ejaculation. Conclusions We have shown that in a case of gunshot wounds to the penis and hanging part of the urethra, even in the presence of combined severe purulent lesions of non-urological localizations, it is possible to perform a primary reconstruction of urogenital injuries using a primary urethral suture and applying a negative pressure device. Findings from this case report shed new light on the management of penile gunshot injury in ongoing warfare as well as provide evidence of the possibility to perform adequate management for penile injury in conditions of limited medical resources, violation of international humanitarian law, and under frequent strikes of high-energy weapons