Ongoing inventory on landrace potato onions in Finland

vo

Challenges of Utilizing Open Data in Global Organizations Big Data Analytics

Useat organisaatiot ovat viime vuosina ryhtyneet avaamaan dataansa kaikkien vapaasti saataville. Avoimelle datalle ei ole vielä olemassa vakiintunutta määritelmää, mutta usein avoimella datalla tarkoitetaan dataa, johon kuka tahansa voi avoimesti päästä käsiksi, käyttää, muokata ja jakaa sitä mihin tahansa käyttötarkoitukseen. Big data on avoimen datan tavoin hyvin uusi ilmiö, jolla tarkoitetaan erityisen suurten ja järjestämättömien tietomassojen keräämistä, säilyttämistä sekä analysointia tietoteknisten ratkaisujen avulla. Tutkimuksessa keskityttiin suurten ja sisällöltään vaihtelevien avoimien data-aineistojen tarkasteluun, jolloin puhutaan avoimesta big datasta. Tutkimusongelmana oli tietämättömyys siitä, mitä haasteita esiintyy avoimen datan hyödyntämisessä osana globaalin organisaation big data analytiikkaa. Tutkimus toteutettiin tarkastelemalla avoimien datalähteiden saatavuutta, kokonaisuutta ja laatua, dataformaattia, arkkitehtuurikuvausta ja rajapintoja, käyttöehtoja, kustannuksia sekä metadatan kuvaamista. Lisäksi tarkasteltiin data-aineiston maantieteellistä kattavuutta, havaintotarkkuutta sekä ajanjaksoa. Tutkimus toteutettiin laadullisena dokumenttisanalyysinä, joka hyödyntää eksploratiivisen tutkimuksen strategiaa. Tutkimuksen havaintoina määriteltiin seitsemän haastetta: tiedostomuotojen eroavaisuudet, puutteet metadatassa, erot havaintotarkkuuksissa, maantieteelliset rajoitteet, heikko arkkitehtuurikuvaus ja rajapinnat, eroavaisuudet datan laadussa sekä heikko saatavuus ja löydettävyys. Avoimien datalähteiden yhdisteleminen on haastavaa ja työlästä eikä aineistojen sisältämää dataa kuvata usein tarpeeksi tarkalla tasolla. Ratkaisuvaihtoehtona avoimen datan yhtenäistämiselle tutkimus esittää erillisen avoimen datan standardin määrittämistä. Standardin tulisi pitää sisällään yksiselitteinen määritelmä avoimelle datalle sekä ehdot sille, miten avointa dataa tulisi tarjota ja avata uudelleenhyödynnettäväksi

An improved RT-qPCR method for direct quantification of enveloped RNA viruses

Reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) has emerged as the gold standard for virus detection and quantification, being utilized in numerous diagnostic and research applications. However, the direct detection of viruses has so far posed a challenge as the viral genome is often encapsidated by a proteinaceous layer surrounded by a lipid envelope. This necessitates an additional and undesired RNA extraction step prior to RT-qPCR amplification. To circumvent this limitation, we have developed a direct RT-qPCR method for the detection of RNA viruses. In our method, we provide a proof-of-concept using phage phi6, a safe-to-use proxy for pathogenic enveloped RNA viruses that is commonly utilized in e.g. aerosolization studies. First, the phage phi6 envelope is removed by 1% chloroform treatment and the virus is then directly quantified by RT-qPCR. To identify false negative results, firefly luciferase is included as a synthetic external control. Thanks to the duplex format, our direct RT-qPCR method reduces the reagents needed and provides an easy to implement and broadly applicable, fast, and cost-effective tool for the quantitative analysis of enveloped RNA viruses.center dot One-step direct RT-qPCR quantification of phage phi6 virus without prior RNA isolation.center dot Reduced reaction volume for sustainable and cost-effective analysis.(c) 2022 The Author(s). Published by Elsevier B.V.This is an open access article under the CC BY license ( http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ )Peer reviewe

On the factors affecting product distribution in laccase-catalyzed oxidation of a lignin model compound vanillyl alcohol : experimental and computational evaluation

Peer reviewe

Lehmän hyvinvointiin vaikuttavat seikat pihatossa - kirjallisuuskatsaus : Osa 2. Lehmien tärkeimpien sairauksien ennaltaehkäisy

Summary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 2. Prevention of the most important diseases of cowsSummary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 2. Prevention of the most important diseases of cowsSummary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 2. Prevention of the most important diseases of cowsNon peer reviewe

Lehmän hyvinvointiin vaikuttavat seikat pihatossa - kirjallisuuskatsaus : Osa 1. Naudan lajinomainen käyttäytyminen

Summary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 1. Natural behavior of cattleSummary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 1. Natural behavior of cattleSummary: Factors affecting cow welfare in loose housing systems - a review. Part 1. Natural behavior of cattleNon peer reviewe