93 research outputs found
HerStory: Women\u27s History Month 2023
HerStory is a digital presentation created for Women\u27s History Month 2023 using collection materials from UTRGV University Library Special Collections & Archives and resources from other regional and digital archives.https://scholarworks.utrgv.edu/librarydisplayposters/1029/thumbnail.jp
Presidents Day 2023 Digital Exhibit
Presidents Day is celebrated on the third Monday of February every year. It is a celebration of the nation\u27s first President George Washington whose birthday is February 11. Washingtonâs birthday was officially recognized as a federal holiday in 1879.
This digital exhibit documents the visits of U.S. Presidents to the lower Rio Grande Valley since 1846.https://scholarworks.utrgv.edu/librarydisplayposters/1028/thumbnail.jp
MMTV Env encodes an ITAM responsible for transformation of mammary epithelial cells in three-dimensional culture
Expression of immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM)-containing signaling proteins is normally restricted to hematopoietic tissues. The basal activity of ITAM-containing proteins is mediated through negative regulation by coreceptors restricted to hematopoietic tissues. We have identified an ITAM signaling domain encoded within the env gene of murine mammary tumor virus (MMTV). Three-dimensional structures derived in vitro from murine cells stably transfected with MMTV env display a depolarized morphology in comparison with control mammary epithelial cells. This effect is abolished by Y>F substitution within the Env ITAM, as well as inhibitors of Syk and Src protein tyrosine kinases. Env-expressing cells bear hallmarks of cell transformation such as sensitivity to apoptosis induced by tumor necrosis factor (TNF)ârelated apoptosis-inducing ligand (TRAIL) or TNFÎą, as well as down-regulation of E-cadherin and Keratin-18. Human normal mammary epithelial cells expressing MMTV Env also develop transformed phenotype, as typified by growth in soft agar and Matrigel invasion. These disruptions are abrogated by Y>F substitutions. We conclude that ITAM-dependent signals are generated through MMTV Env and trigger early hallmarks of transformation of mouse and human mammary epithelial cells. Therefore, these data suggest a heretofore unappreciated potential mechanism for the initiation of breast cancer and identify MMTV Env and ITAM-containing proteins in human breast tumors as probable oncoproteins
CAR T manufacturing: process modifications for a transformational autologous product on a rapid path to licensure
The transformational impact of CAR T cell therapies on serious diseases demands a rapid path to licensure in order to establish widespread availability to desperate patients. In addition, the complex, labor intensive, and costly patient-specific manufacturing processes for CAR T cell therapies demand process modifications that enable scalability and affordability to maximize availability to patients. There are many options to improve CAR T processes ranging from automation to improved medium composition to simplified closed-system tubing sets. However, the dramatic dose-dependent safety and efficacy activities of these therapies amplifies the need for maintaining product comparability across process changes. This assessment of comparability is challenged by limited knowledge of product Critical Quality Attributes as well as limited availability of patient cells for process development studies. We have developed a comprehensive analytical toolbox that enables the assessment of product impact of process changes along with a risk-based approach to applying a matrix of appropriate tools for each change. This risk-based approach involves the most extensive product analysis for high-risk changes and a relatively restricted product analysis for low-risk changes. In all cases, the product analysis includes assessments of product characteristics that can hypothetically be impacted by the process change. We describe our approach to identifying, prioritizing, and assessing feasibility of process changes along with generating a suitable product comparability dataset to implement the most impactful process changes on an expedited timeline to licensure. We share examples of comparability data and its application to decision making
Frequent traces of EBV infection in Hodgkin and non-Hodgkin lymphomas classiďŹed as EBV-negative by routine methods: expanding the landscape of EBV-related lymphoma
peer-reviewedThe EpsteinâBarr virus (EBV) is linked to various B-cell lymphomas, including Burkitt lymphoma (BL), classical Hodgkin lymphoma (cHL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) at frequencies ranging, by routine techniques, from 5 to 10% of cases in DLBCL to >95% in endemic BL. Using higher-sensitivity methods, we recently detected EBV traces in a few EBV-negative BL cases, possibly suggesting a âhit-and-runâ mechanism. Here, we used routine and higher-sensitivity methods (qPCR and ddPCR for conserved EBV genomic regions and miRNAs on microdissected tumor cells; EBNA1 mRNA In situ detection by RNAscope) to assess EBV infection in a larger lymphoma cohort [19 BL, 34 DLBCL, 44 cHL, 50 follicular lymphomas (FL), 10 T-lymphoblastic lymphomas (T-LL), 20 hairy cell leukemias (HCL), 10 mantle cell lymphomas (MCL)], as well as in several lymphoma cell lines (9 cHL and 6 BL). qPCR, ddPCR, and RNAscope consistently documented the presence of multiple EBV nucleic acids in rare tumor cells of several cases EBV-negative by conventional methods that all belonged to lymphoma entities clearly related to EBV (BL, 6/9 cases; cHL, 16/32 cases; DLBCL, 11/30 cases), in contrast to fewer cases (3/47 cases) of FL (where the role of EBV is more elusive) and no cases (0/40) of control lymphomas unrelated to EBV (HCL, T-LL, MCL). Similarly, we revealed traces of EBV infection in 4/5 BL and 6/7 HL cell lines otherwise conventionally classified as EBV negative. Interestingly, additional EBV-positive cases (1 DLBCL, 2 cHL) relapsed as EBV-negative by routine methods while showing EBNA1 expression in rare tumor cells by RNAscope. The relapse specimens were clonally identical to their onset biopsies, indicating that the lymphoma clone can largely loose the EBV genome over time but traces of EBV infection are still detectable by high-sensitivity methods. We suggest EBV may contribute to lymphoma pathogenesis more widely than currently acknowledged
Osteochondral defects : present situation and tissue engineering approaches
Articular cartilage is often damaged due to trauma or degenerative diseases, resulting in severe
pain and disability. Most clinical approaches have been shown to have limited capacity to treat
cartilage lesions. Tissue engineering (TE) has been proposed as an alternative strategy to repair
cartilage. Cartilage defects often penetrate to the subchondral bone, or full-thickness defects are
also produced in some therapeutic procedures. Therefore, in TE strategies one should also consider
the need for a simultaneous regeneration of both cartilage and subchondral bone in situations
where osteochondral defects are present, or to provide an enhanced support for the cartilage
hybrid construct. In this review, different concepts related to TE in osteochondral regeneration
will be discussed. The focus is on the need to produce new biphasic scaffolds that will provide
differentiated and adequate conditions for guiding the growth of the two tissues, satisfying their
different biological and functional requirements
Infected pancreatic necrosis: outcomes and clinical predictors of mortality. A post hoc analysis of the MANCTRA-1 international study
: The identification of high-risk patients in the early stages of infected pancreatic necrosis (IPN) is critical, because it could help the clinicians to adopt more effective management strategies. We conducted a post hoc analysis of the MANCTRA-1 international study to assess the association between clinical risk factors and mortality among adult patients with IPN. Univariable and multivariable logistic regression models were used to identify prognostic factors of mortality. We identified 247 consecutive patients with IPN hospitalised between January 2019 and December 2020. History of uncontrolled arterial hypertension (pâ=â0.032; 95% CI 1.135-15.882; aOR 4.245), qSOFA (pâ=â0.005; 95% CI 1.359-5.879; aOR 2.828), renal failure (pâ=â0.022; 95% CI 1.138-5.442; aOR 2.489), and haemodynamic failure (pâ=â0.018; 95% CI 1.184-5.978; aOR 2.661), were identified as independent predictors of mortality in IPN patients. Cholangitis (pâ=â0.003; 95% CI 1.598-9.930; aOR 3.983), abdominal compartment syndrome (pâ=â0.032; 95% CI 1.090-6.967; aOR 2.735), and gastrointestinal/intra-abdominal bleeding (pâ=â0.009; 95% CI 1.286-5.712; aOR 2.710) were independently associated with the risk of mortality. Upfront open surgical necrosectomy was strongly associated with the risk of mortality (pâ<â0.001; 95% CI 1.912-7.442; aOR 3.772), whereas endoscopic drainage of pancreatic necrosis (pâ=â0.018; 95% CI 0.138-0.834; aOR 0.339) and enteral nutrition (pâ=â0.003; 95% CI 0.143-0.716; aOR 0.320) were found as protective factors. Organ failure, acute cholangitis, and upfront open surgical necrosectomy were the most significant predictors of mortality. Our study confirmed that, even in a subgroup of particularly ill patients such as those with IPN, upfront open surgery should be avoided as much as possible. Study protocol registered in ClinicalTrials.Gov (I.D. Number NCT04747990)
The Changing Landscape for Stroke\ua0Prevention in AF: Findings From the GLORIA-AF Registry Phase 2
Background GLORIA-AF (Global Registry on Long-Term Oral Antithrombotic Treatment in Patients with Atrial Fibrillation) is a prospective, global registry program describing antithrombotic treatment patterns in patients with newly diagnosed nonvalvular atrial fibrillation at risk of stroke. Phase 2 began when dabigatran, the first non\u2013vitamin K antagonist oral anticoagulant (NOAC), became available. Objectives This study sought to describe phase 2 baseline data and compare these with the pre-NOAC era collected during phase 1. Methods During phase 2, 15,641 consenting patients were enrolled (November 2011 to December 2014); 15,092 were eligible. This pre-specified cross-sectional analysis describes eligible patients\u2019 baseline characteristics. Atrial fibrillation disease characteristics, medical outcomes, and concomitant diseases and medications were collected. Data were analyzed using descriptive statistics. Results Of the total patients, 45.5% were female; median age was 71 (interquartile range: 64, 78) years. Patients were from Europe (47.1%), North America (22.5%), Asia (20.3%), Latin America (6.0%), and the Middle East/Africa (4.0%). Most had high stroke risk (CHA2DS2-VASc [Congestive heart failure, Hypertension, Age 6575 years, Diabetes mellitus, previous Stroke, Vascular disease, Age 65 to 74 years, Sex category] score 652; 86.1%); 13.9% had moderate risk (CHA2DS2-VASc = 1). Overall, 79.9% received oral anticoagulants, of whom 47.6% received NOAC and 32.3% vitamin K antagonists (VKA); 12.1% received antiplatelet agents; 7.8% received no antithrombotic treatment. For comparison, the proportion of phase 1 patients (of N = 1,063 all eligible) prescribed VKA was 32.8%, acetylsalicylic acid 41.7%, and no therapy 20.2%. In Europe in phase 2, treatment with NOAC was more common than VKA (52.3% and 37.8%, respectively); 6.0% of patients received antiplatelet treatment; and 3.8% received no antithrombotic treatment. In North America, 52.1%, 26.2%, and 14.0% of patients received NOAC, VKA, and antiplatelet drugs, respectively; 7.5% received no antithrombotic treatment. NOAC use was less common in Asia (27.7%), where 27.5% of patients received VKA, 25.0% antiplatelet drugs, and 19.8% no antithrombotic treatment. Conclusions The baseline data from GLORIA-AF phase 2 demonstrate that in newly diagnosed nonvalvular atrial fibrillation patients, NOAC have been highly adopted into practice, becoming more frequently prescribed than VKA in Europe and North America. Worldwide, however, a large proportion of patients remain undertreated, particularly in Asia and North America. (Global Registry on Long-Term Oral Antithrombotic Treatment in Patients With Atrial Fibrillation [GLORIA-AF]; NCT01468701
Dalla progettazione allâutilizzo di un sistema informativo geologico al servizio del rilevamento geologico: la banca dati della Regione Lombardia e la cartografia geologica derivata
In questa Tesi è descritto il processo di creazione di un Sistema Informativo Geologico e degli strumenti informatici per la gestione dellâinformazione su base geografica, o piĂš semplicemente GIS (Geographic Information System), al servizio delle attivitĂ di rilevamento geologico, finalizzato alla raccolta dei dati ed alla loro rappresentazione cartografica nell'ambito di un Sistema Informativo Territoriale (SIT).
Un SIT è definibile come l'insieme di uomini, strumenti e procedure che, nellâambito di una organizzazione, permettono lâacquisizione e la distribuzione dei dati relativi alla conoscenza dei fenomeni e degli attori presenti su territorio; tutto questo è facilitato in gran parte dalle capacitĂ e funzionalitĂ dei GIS.
Il Sistema Informativo Territoriale orientato alla Geologia (SIG â Sistema Informativo Geologico) della Regione Lombardia è costituito da un gruppo di lavoro composto da geologi, informatici e geologi-informatici dellâEnte regionale e della societĂ Lombardia Servizi (Gruppo Lombardia Informatica). Ho fatto parte del team di consulenza tecnico-scientifica incaricato da Lombardia Servizi per la realizzazione del SIG regionale.
I compiti del gruppo di lavoro sono:
- definizione di ruoli e metodi per la costituzione del SIG;
- definizione delle logiche per la creazione di strumenti finalizzati allâarchiviazione del dato geologico in una banca dati geologica e loro manutenzione;
Il progetto è inserito nel piÚ ampio processo di aggiornamento della Cartografia Geologica nazionale (progetto CARG).
Il SIG ha come principali obiettivi:
- la pianificazione ed esecuzione del rilevamento geologico di dettaglio (scala 1:10.000) del territorio lombardo;
- la costruzione di un database della geologia di superficie (ma anche del sottosuolo per le aree di pianura) interrogabile e aggiornabile ;
- il supporto ai processi di analisi finalizzati alla descrizione della geologia superficiale e ricostruzione degli eventi che hanno creato il paesaggio attuale;
- la rappresentazione cartografica dellâambiente geologico a partire dal database creato.
- la distribuzione dellâinformazione geologica archiviata in vari formati (cartaceo e digitale);
Sono qui descritte ed analizzate criticamente la filosofia di costruzione delle procedure e le soluzioni tecniche e metodologiche adottate per realizzare gli obiettivi prefissi.
LâAPAT (Agenzia per la Protezione dell'Ambiente e per i servizi Tecnici nazionali) ha ereditato dal Servizio Geologico il compito di rilevare, aggiornare e pubblicare la Carta Geologica d'Italia (progetto nazionale CARG) quale organo cartografico dello Stato in base alla legge 68/60. Nel 1976 era stato completato il rilevamento della Carta geologica d'Italia alla scala 1:100.000 costituita da 278 fogli a copertura del territorio nazionale; per il suo aggiornamento sono stati definiti strumenti normativi idonei a garantire l'omogeneitĂ dei contenuti e della rappresentazione cartografica; la definizione delle norme discende dall'applicazione di linee guida, frutto dell'attivitĂ di Commissioni e Gruppi di lavoro, pubblicate nei Quaderni della serie III (ed. APAT).
LâEnte Regione Lombardia, per rispondere allâimpegno istituzionale di aggiornamento della Carta Geologica, allâinterno del piĂš ampio e strutturato Sistema Informativo Territoriale regionale, ha dunque creato il Sistema Informativo Geologico (SIG) regionale. Il rapido evolversi delle ricerche nel campo delle Scienze della Terra e l'importanza che riveste la cartografia geologica nella gestione del territorio, hanno spinto la Regione Lombardia a progettare un rilevamento geologico di dettaglio per dotarsi di una banca dati geologica dalla quale derivare la propria cartografia geologica (alla scala 1:10.000). Sono stati quindi definiti standard specifici rispondenti a questa esigenza di maggior dettaglio (rispetto a quanto indicato dal progetto nazionale CARG) ed è stato pianificato e in gran parte realizzato un rilevamento ex-novo finalizzato alla pubblicazione del dato alla scala del rilevamento e per la sua generalizzazione alle scale 1:25.000 e 50.000.
Alla fine del processo saranno stati realizzati 14 fogli del territorio lombardo relativamente alle aree alpine e di passaggio alla pianura (Bergamo, Bormio, Breno, Clusone, Lecco, Iseo, Malonno, Ponte di Legno, Sondrio, Vimercate, Milano, Bagolino, Seregno, Voghera). In tale progetto sono anche coinvolti le UniversitĂ di Milano, di Pavia e di Bolona, il Politecnico di Milano e il CNR - Centro di Studio per la Geodinamica Alpina e Quaternaria di Milano.
LâattivitĂ di rilevamento geologico è di competenza dei funzionari regionali della Struttura Sistema Informativo Territoriale della Direzione Generale Territorio e Urbanistica che, coadiuvati da geologi rilevatori, realizzano tutte le fasi del lavoro, dalla raccolta del dato fino alla sua pubblicazione.
Lâambiente informatico GIS sviluppato, denominato CARGeo (Cartografia Geologica), permette di inserire i dati raccolti da geologi rilevatori in un database appositamente predisposto, mediante interfacce grafiche semplificate e procedure standard di archiviazione e controllo di correttezza formale.
La banca dati è costruita in modo da facilitare lâarchiviazione della maggior parte dei dati che normalmente il geologo registra nella carta e nei taccuini di terreno e, allo stesso tempo, guidarlo nella raccolta organica dellâinformazione geologica. Nella strutturazione del database è stata privilegiata la possibilitĂ di inserire attributi direttamente associabili agli elementi geometrici anzichĂŠ attraverso schede associate a punti di osservazione.
Il geologo rilevatore interviene per correggere errori di digitalizzazione o di attribuzione con un processo ciclico, fino ad ottenere una banca dati corretta secondo gli standard predefiniti.
Gli strumenti di creazione della banca dati permettono anche di:
- disegnare gli schemi accessori (sezioni geologiche, schemi stratigrafici e strutturali etc.);
- eseguire lo âsfoltimentoâ e posizionamento delle annotazioni sulla mappa (sigle di unitĂ litologiche e parametri di inclinazione delle giaciture) secondo criteri di leggibilitĂ della carta
- creare le legende;
- creare banche dati a scala inferiore (1:25.000 e 50.000);
- stampare e pubblicare carte geologiche complete di schemi e legende.
Il sistema contiene gli strumenti necessari alla migrazione della banca dati dalla struttura proprietaria CARG-Regione Lombardia a quella CARG-APAT secondo la struttura definita nei Quaderni della serie III
Il Sistema nel corso del biennio 2006-2007 ha raggiunto la fase di consegna dei dati (derivazione e generalizzazione della banca dati CARG-APAT 1.50.000 da quella 1:10.000 CARG-Regione Lombardia) dei primi fogli completati (ISEO, MALONNO, LECCO e SONDRIO) con ritardo rispetto alla programmazione. Sono state analizzate le cause che hanno portato a questo rallentamento del flusso di lavoro, quindi apportate le necessarie modifiche al Sistema. Sono qui descritti i problemi e le soluzioni trovate per migliorare l'efficienza del sistema.
Attualmente il Sistema Informativo Geologico è in una fase di ristrutturazione, che vede la migrazione verso unâarchitettura informatica basata sulla piattaforma ARCGisÂŽ 9.x.
Attraverso il Sistema Informativo Geologico viene tentata una sintesi fra le logiche metodologiche dei due ambiti tecnico-scientifici coinvolti (Geologia e Informatica), in un ambiente dove ricercatori e tecnici lavorano sperimentando lâinterazione tra le conoscenze e le metodologie conoscitive tipiche delle Scienze Geologiche e le tecnologie e processi logici delle Scienze Informatiche. Con questa Tesi è documentato tutto il percorso di costruzione della banca dati geologica attraverso e allâinterno del sistema realizzato assieme gruppo di lavoro composto da geologi e tecnici informatici, cui ho partecipato, riassumendo gli oltre 9 anni di lavoro dallâideazione del progetto CARGeo, anche in funzione del suo miglioramento
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