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Caracterización mineralógica y estratigráfica de las formaciones neógenas del borde sur de la cuenca del Tajo (Comarca de la Sagra).
El estudio mineralógico y químico de los materiales neógenos del borde sur de la cuenca del Tajo ha permitido establecer cinco unidades litoestratigráficas, a las que se ha atribuido el rango de formación. Estas unidades se han formado bajo la acción de diferentes procesos genéticos. Las formaciones con carácter más terrígeno ("Formación de Arenas Gruesas Rojas", "Formación de Arenas Gruesas Pardas" y "Formación de Arenas Finas con Sepiolita, Sílex y Carbonatos") presentan una composición mineralógica resultado de los procesos de herencia de los productos de alteración del área fuente, a excepción de los niveles de sepiolita y ópalo que aparecen en la "Formación de Arenas Finas con Sepiolita, Sílex y Carbonatos", los cuales han de ser considerados como depósitos autigénicos. Las formaciones detríticas más finas ("Formación de Arcillas Rojas de la Sagra" y "Formación de Arcillas Verdes") presentan una composición debida a fenómenos de transformación y neoformación
Estructura de fibras de bacteriófagos
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 25-10-2013Los bacteriófagos son virus que infectan bacterias. Para ello, después de
reconocer a la célula hospedadora y transferir el material genético a su interior y
redirigen toda la maquinaria celular para producir más partículas virales. El primer
paso fundamental para que este proceso se pueda llevar a cabo es la correcta
interacción entre el fago y la membrana de la célula, por lo que los virus han
desarrollado mecanismos para realizar eficientemente este proceso.
La mayor parte de los bacteriófagos descritos pertenecen al orden Caudovirales,
que se caracterizan por tener una cápside icosaédrica o prolada y una cola. En
muchos casos, en la base de la cola hay fibras o espinas, que actúan como receptores
de la célula hospedadora. Las fibras son proteínas triméricas que en su extremo distal
presentan el dominio de unión al hospedador. Son proteínas muy estables, pero su
forma de L también les confiere también cierta flexibilidad, necesaria para su unión
al receptor, generalmente reversible.
Los Caudovirales agrupan tres familias diferenciadas en función de la morfología
de su cola: Myoviridae, Podoviridae y Siphoviridae. La familia Myoviridae incluye
fagos con una cola larga y contráctil; siendo T4 el myovirus mejor estudiado, que
tiene seis fibras largas y seis fibras cortas. La familia Podoviridae abarca los fagos
con una cola corta y no contráctil. A esta familia pertenece el fago T7, que tiene seis
fibras formadas por trímeros de la proteína gp17. Estas fibras han sido caracterizadas
únicamente por microscopía electrónica y análisis bioquímicos. La familia
Siphoviridae, está formada por fagos con una cola larga y flexible. El siphovirus T5
tiene tres fibras largas con forma de L formadas por trímeros de la proteína pb1, que
han sido poco estudiadas hasta el momento.
En esta tesis doctoral se planteó el estudio de la estructura del extremo carboxilo
terminal de las fibras de los fagos T7 y T5, formadas por las proteínas gp17 y pb1
respectivamente. La determinación de la estructura atómica de los extremos de las
fibras de los fagos abre nuevas posibilidades para el desarrollo de aplicaciones
biotecnológicas, como la modificación de los aminoácidos que interaccionan con el
receptor y, por lo tanto, redireccionando los fagos hacia otras bacterias de interés.
Debido a la aparición, cada vez más frecuente, de bacterias con resistencia a
múltiples antibióticos, los fagos se presentan como una posible alternativa contra
cepas bacterianas que causan patologías importantes en humanos.Bacteriophages are viruses that infect bacteria. For this infection they recognise
the host cell, transfer the genetic material inside the cell and redirect the cell
machinery in order to produce many viral particles. The first step for a successful
infection is the correct interaction between the phage and the cell membrane. For this
reason, viruses have developed mechanisms to bind efficiently to a specific receptor.
Most bacteriophages belong to the order Caudovirales. These phages have
icosahedral or prolate capsids with a tail. In most cases, fibres or spikes are attached
to the base of the tail, and function as receptors for the host cell. Fibres are trimeric
proteins with a carboxy-terminal host-binding domain. Because of their folding, they
are very stable proteins, resistant to denaturing agents and high temperature, but their
L shape confers them flexibility, facilitating receptor binding. This receptor binding
is generally reversible and is followed by the irreversible interaction with a
secondary receptor. After the receptor binding, the tail penetrates through the cell
membrane and the phage DNA is ejected into the cell cytoplasm.
The Caudovirales are divided into three families according to their tail
morphology. The Myoviridae family consists of phages with a long contractile tail.
T4, perhaps the best-known member of the Myoviridae family, has six long tail
fibres and six short tail fibres. The Podoviridae family consists of phages with a
short non-contractile tail. Bacteriophage T7, which has six fibres made by gp17
trimers, belongs to this family. These fibres have been previously analysed by
electron microscopy and biochemical studies, but the atomic structure was still
unknown. The last family, the Siphoviridae family, consists of phages with a long
flexible tail. The siphovirus T5 has three L-shaped long fibres made by trimers of
protein pb1 and they have been poorly studied.
In this PhD thesis, a study of the carboxy-terminal parts of T7 and T5 fibres, made
by the proteins gp17 and pb1 respectively, has been done. The knowledge of the
atomic structure of the distal part of the fibres opens new approaches to future
biotechnological applications: amino acids interacting with the receptor can be
modified to redirect the phage to other bacteria of interest. At a time when the
antibiotics are losing their effectiveness to resistant bacteria, phages represent a
possible alternative
Estudio del efecto del campo magnético sobre las curvas corriente-voltaje en películas delgadas de YBa2Cu3O-7a: análisis de la inestabilidad térmica
Este trabajo se centra en el estudio de las curvas corriente-voltaje, y en particular, de la ruptura de la superconductividad provocada por la aplicación de altas densidades de corriente en superconductores de alta temperatura crítica bajo campos magnéticos externos de hasta 1 T. Las muestras utilizadas son micropuentes patroneados a partir de capas delgadas de YBa2Cu3O-7 crecidas sobre sustratos de SrTiO3. Los campos magnéticos externos se aplican perpendicularmente a los planos cristalográficos ab. Las medidas se realizaron a diferentes temperaturas mediante la aplicación de pulsos de corriente de 1 ms de duración y de amplitud creciente, capaces de producir la transición de la muestra hasta un estado de alta disipación. La transición superconductora (quenching) se analizó según un modelo basado en la inestabilidad del sistema de vórtices (modelo de Larkin-Ovchinnikov) así como también bajo un modelo (denominado modelo térmico) desarrollado en nuestro grupo de investigación, basado en el inevitable calentamiento producido por el paso de corriente y el comportamiento no lineal de la resistividad en un superconductor. El modelo térmico reproduce la evolución de las curvas E-J medidas tanto en ausencia de campo magnético externo como en presencia de campo para todas las temperaturas y proporciona valores para J* que se desvían de los experimentales en menos de un 10% en los casos más desfavorables. La temperatura que alcanza la muestra en el punto de salto, según las predicciones del modelo, oscila entre 0.5 K y 1.5 K para las medidas en ausencia de campo, y entre 1 K y 2.5 K para las medidas bajo campos magnéticos externos. Este aumento de temperatura se mantiene siempre por debajo de la temperatura de transición superconductora, Tc, de forma que la ruptura del estado superconductor no está asociada a un calentamiento de la muestra por encima de ese valor sino a una solución “explosiva” del campo de temperaturas
Aportaciones didácticas de un tablero digital para personas con dificultades de competencia comunicativa
La presente tesis aborda la investigación, desarrollo e innovación en la propuesta de soluciones de comunicación accesibles para personas con diversidad funcional basadas en PC/dispositivos móviles desde la Pedagogía/Lingüística Aplicada y la Tecnología de las Comunicaciones, explorando sus potencialidades didácticas
Análisis de los minerales de la arcilla y sus procesos genéticos en las formaciones arcillosas de la Cuenca del Tajo.
Se han estudiado seis sondeos, realizados en la cuenca neógena del Tajo, con el fin de conocer los procesos genéticos de los materiales arcillosos de la cuenca. Estos sondeos cortan facies correspondientes a distintos ambientes deposicionales. La evolución observada puede relacionarse con dos etapas distintas de sedimentación. La primera corresponde a la sedimentación de la Unidad de Yesos; la asociación de minerales de arcilla en esta unidad está constituida principalmente por illita, menores contenidos de esmectita, interestratificados I/Sm, Cl/Sm, Glauconita/Sm, palygorskita y clorita. El origen de esta asociación es en parte detrítica y en parte neoformada; los aportes detríticos corresponden a illita y esmectita, mientras que los minerales neoformados son principalmente illita e interestratificados, clorita y palygorskita. Esta etapa se caracteriza por la existencia de procesos de illitización. En la segunda etapa de sedimentación (Unidad de Arcillas Verdes), se observa un incremento de los aportes detríticos y una evolución hacia condiciones de menor salinidad. El ambiente de formación de esta unidad se encuentra enriquecido en magnesio y los minerales de la arcilla más característicos de las facies que componen dicha unidad son las esmectitas magnésicas (saponita y estevensita) y, en menor proporción, los interestratificados Cl/Sm. Esta asociación mineralógica se origina por la reacción entre las partículas detríticas arcillosas y los cationes del medio
Multilevel Multiphase Feedforward Space-Vector Modulation Technique
Multiphase converters have been applied to an increasing number of industrial applications in recent years. On the other hand, multilevel converters have become a mature technology mainly in medium- and high-power applications. One of the problems of multilevel converters is the dc voltage unbalance of the dc bus. Depending on the loading conditions and the number of levels of the converter, oscillations appear in the dc voltages of the dc link. This paper presents a feedforward modulation technique for multilevel multiphase converters that reduces the distortion under balanced or unbalanced dc conditions. The proposed modulation method can be applied to any multilevel-converter topology with any number of levels and phases. Experimental results are shown in order to validate the proposed feedforward modulation technique.Ministerio de Ciencia e Innovación DPI2009-07004Ministerio de Eduación y Ciencia TEC2007-6187
Genomic Edition of Ashbya gossypii Using One-vector CRISPR/Cas9
The CRISPR/Cas9 system is a novel genetic tool which allows the precise manipulation of virtually any genomic sequence. In this protocol, we use a specific CRISPR/Cas9 system for the manipulation of Ashbya gossypii. The filamentous fungus A. gossypii is currently used for the industrial production of riboflavin (vitamina B2). In addition, A. gossypii produces other high-value compounds such as folic acid, nucleosides and biolipids. A large molecular toolbox is available for the genomic manipulation of this fungus including gene targeting methods, rapid assembly of heterologous expression modules and, recently, a one-vector CRISPR/Cas9 editing system adapted for A. gossypii that allows marker-free engineering strategies to be implemented. The CRISPR/Cas9 system comprises an RNA guided DNA endonuclease (Cas9) and a guide RNA (gRNA), which is complementary to the genomic target region. The Cas9 nuclease requires a 5′-NGG-3′ trinucleotide, called protospacer adjacent motif (PAM), to generate a double-strand break (DSB) in the genomic target, which can be repaired with a synthetic mutagenic donor DNA (dDNA) by homologous recombination (HR), thus introducing a specific designed mutation. The CRISPR/Cas9 system adapted for A. gossypii largely facilitates the genomic edition of this industrial fungus
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