Elucidation of xenobiotic metabolism pathways in human skin and human skin models by proteomic profiling

Human skin has the capacity to metabolise foreign chemicals (xenobiotics), but knowledge of the various enzymes involved is incomplete. A broad-based unbiased proteomics approach was used to describe the profile of xenobiotic metabolising enzymes present in human skin and hence indicate principal routes of metabolism of xenobiotic compounds. Several in vitro models of human skin have been developed for the purpose of safety assessment of chemicals. The suitability of these epidermal models for studies involving biotransformation was assessed by comparing their profiles of xenobiotic metabolising enzymes with those of human skin

An analytic framework for exploring sampling and observation process biases in genome and phenome‐wide association studies using electronic health records

Peer Reviewedhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/155932/1/sim8524.pdfhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/155932/2/SIM8524-sup-0001-supinfo.pdfhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/155932/3/sim8524_am.pd

Antimicrobial susceptibility of Gram-positive bacteria isolated from European medical centres: results of the Daptomycin Surveillance Programme (2002-2004)

The antimicrobial susceptibility patterns of 9322 contemporary (2002-2004) Gram-positive bacterial isolates collected from 31 medical centres in 14 countries in Europe were evaluated by broth microdilution methods according to CLSI guidelines. the isolates collected comprised Staphylococcus aureus (4842 isolates), coagulase-negative staphylococci (CoNS; 1942 isolates), Enterococcus faecalis (1147 isolates), Enterococcus faecium (391 isolates), beta-haemolytic streptococci (660 isolates) and viridans group streptococci (340 isolates). the organisms were tested against daptomycin and more than 20 comparator agents in Mueller-Hinton broth, supplemented with calcium to 50 mg/L when testing daptomycin. Overall, methicillin (oxacillin) resistance rates were 26.7% and 77.0% for S. aureus (MRSA) and CoNS, respectively, and the vancomycin resistance rate among enterococci was 6.1%. MRSA rates varied from 0.6% in Sweden to 40.2-43.0% in Belgium, Greece, Ireland, the UK and Israel, and VRE rates varied from 0% in Switzerland to 21.2% in Ireland. More than 99.9% of isolates tested were considered susceptible to daptomycin according to breakpoints established by the United States Food and Drug Administration and the CLSI. Daptomycin was active against all Gram-positive species, with the highest MIC being 2, 8, 0.5 and 2 mg/L for staphylococci, enterococci, beta-haemolytic streptococci and viridans group streptococci, respectively. Daptomycin activity was not influenced adversely by resistance to other agents among staphylococci or enterococci. This novel lipopeptide (daptomycin) appears to be an excellent alternative therapeutic option for serious infections caused by multidrug-resistant Gram-positive organisms isolated in Europe.JMI Labs Inc, N Liberty, IA 52317 USAUniversidade Federal de São Paulo, São Paulo, BrazilTufts Univ, Sch Med, Boston, MA 02111 USAUniversidade Federal de São Paulo, São Paulo, BrazilWeb of Scienc

Mercury evasion from a boreal peatland determined with advanced REA and chamber methods

Gasförmiges, elementares Quecksilber (Hg^0) ist die dominierende Form von Hg in der Atmosphäre und steht in ständigem Austausch mit Böden und Wasseroberflächen. In borealen Mooren ist dieser Land-Atmosphären-Austausch von Hg^0 von besonderer Relevanz. - in solch anoxischen Ökosystem bildet sich das hochtoxische Methylquecksilber (MeHg) - , da sich verändernde Depositions- und Emissionsraten den Hg-Pool im Boden beeinflussen. Um natürliche influssfaktoren zu bestimmen, welche die Reduktion von Hg(II) zu Hg^0 und damit die Ausgasung fördern, haben wir dynamische Durchflusskammern (DFCs) verwendet. Der Effekt von erhöhter Schwefel- und Stickstoffdeposition sowie veränderten Temperatur- und Feuchtebedingungen auf den Hg^0-Fluss wurden untersucht und typische Flussraten für unser Untersuchungsgebiet quantifiziert. Das boreale Moor liegt etwa 10 Kilometer westlich von Vindeln, in der Provinz Västerbotten in Schweden. Um den ganzjährigen In- und Output von Hg^0 über die Atmosphäre zu quantifizieren, entwickelten wir ein neues Relaxed Eddy Accumulation (REA) System mit zwei Lufteinlässen, nur einem Detektor und einem ausgefeilten, automatischen Kalibrationsmodul. Während den Hg-Messungen wurden meteorologische Parameter, im Wasser gelöstes Hg^0(DGM) und die Gesamtdeposition von Hg gemessen. Letztere während der Vegetationsperiode 2014. Das Gesamt-Hg im Boden und im Abflussbereich des Moores wurde vorgängig bestimmt und trägt zum besseren Verständnis des Hg-Kreislaufs bei. Hohe Schwefeldepositionen, wie sie in den 80er-Jahren in Schweden üblich waren, führten zu einer Hemmung von Hg-Emissionen. Dies ist mit einer initialen Ausgasung von Hg zu Beginn des Versuches oder mit dem Binden von Hg an Schwefelgruppen und anschliessendem Abtransport im Oberflächenwasser zu erklären. DFC-Messungen im Juli 2014 wurden während Strahlungstagen durchgeführt und zeigten einen deutlichen Tagesgang und eine starke lineare Abhängigkeit von der Temperatur innerhalb und ausserhalb der Kammern. Erste Auswertungen der REA-Daten zeigten eine Spannweite der Monatsmittelwerte zwischen -6 ng m^-2 h^-1 im November 2013 und 15 ng m^-2 h^-1 im Juni 2014. Hg^0-Emissionen dominierten während des Sommers und Hg^0-Deposition von Spätherbst bis Frühling. Als erste Forschungsgruppe gelang es uns, den Hg^0-Fluss über einem borealen Moor während eines ganzen Jahres zu messen und dabei REA erfolgreich anzuwenden. Des Weiteren konnten wir mit DFC-Messungen Faktoren identifizieren, welche Hg^0-Emissionen hemmen oder begünstigen. Die Ausgasung von Hg^0 in die Atmosphäre scheint die Menge im Abfluss deutlich zu übersteigen und deutet darauf hin, dass das boreale Moor heute nicht nur eine Quelle für MeHg, sondern auch für Gesamt-Hg ist