The University of Texas MD Anderson Cancer Center - Biology Summer Internship

Program Overview: 10 week program MD Anderson Cancer Center in Houston, Texas Students will be matched with a faculty mentor in any number of areas of biomedical research where a project will be assigned. Participants work alongside the mentor in a lab or clinic on projects designed by faculty to reflect current research. Workshops and lectures provide opportunities to connect with faculty, residents, postdoctoral and clinical fellows, and other participants. Through the program, students assess goals related to careers in oncology research and patient care. Symposium in which participants present talks and posters on their research projects to peers and faculty

Los grupos de investigación: un acercamiento desde una mirada ética

La investigación es una práctica socio-histórica multifactorial en la cual los sujetos que la realizan, dejan su huella. Aceptando la presencia de aspectos éticos en la ciencia, el artículo se centra en las relaciones entre investigadores y entre éstos y alumnos de posgrado en los grupos de investigación. A través de información de orden documental y empírica, se reconoce que en una producción colectiva de conocimiento puede darse tanto el respeto a cada uno de los miembros que lo componen como el atropello a alguno(s) en un momento dado. Categorías analíticas como equilibrio entre cohesión y precisión, conformación de un ethos profesional, tensión entre igualdad y sometimiento y formación para el oficio nos permiten describir las dinámicas grupales. Al final, el artícul

Coarse-Grained and Analytical Models for Vesicle-to-Membrane Adhesion Mechanisms

Molecular adhesion is the basis for many complicated biological processes. In particular the role of regulated adhesion of the vesicle to the plasma membrane in exocytosis as part of synaptic transmission is crucial. This adhesion must overcome the long-range electrostatic and hydration repulsion in a mediated fashion. Complications within this neurological process can lead to serious diseases and disorders such as schizophrenia and botulism. Little is understood about the mechanistic details of this process. Therefore, developing fundamental knowledge is invaluable to the design of treatments and therapies. Many molecular players have been identified to take part in this process, but we focus on SNARE (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor) because that is the central conserved player. SNARE proteins are the workhorses of this adhesion and therefore developing an understanding of their role in the process is important. This is a very complex system, so in addition to experiments, modeling of the system is also required, and there are several options available. Because of the combination of long length scale (10s of nm) and time scales (1-10s of µs, to seconds), it is difficult to study this system using all-atom simulations. Therefore residue based coarse-grained (CG) Brownian dynamics simulations are used that are validated by both experimental data and detailed all-atom simulation results. The CG model of SNARE included an elastic spring-network model for intrahelical interactions and chemically specific Miyazawa and Jernigan potentials for helix-helix interactions.Using this CG model this thesis investigates two underlying questions dealing with synaptic vesicle to membrane docking/fusion that have yet to be definitively answered: (1) how many SNAREs are required in this process? and (2) how do SNAREs assemble? The force-displacement relationship for the unzippering of SNARE was determined using CG displacement control simulations. These results were combined with a continuum model of the vesicle/membrane including electrostatic and hydration repulsion to predict that 1 SNARE can bring the vesicle to within 3 nm of the membrane. This docking distance can be reduced as additional SNAREs are added. However, adding more than 4-6 SNAREs increases the minimum distance between the vesicle and plasma membrane. The vesicle was never brought closer than 2nm to the membrane, suggesting that SNAREs alone are not sufficient for vesicle to membrane fusion, that their principal role is docking.Next, the SNARE assembly process was studied using the CG model. Two models for SNARE assembly are proposed in the literature: (1) Munc18 acts as a template for SNARE assembly by holding SNARE in a semi-zippered conformation and promoting helicity, and (2) SNARE serves as a self-template for zippering and assembly. Force control unzippering simulations were performed to set up initial states for assembly simulations. Several simulations were performed mimicking the two hypotheses. We find that assembly time grows exponentially with how far the SNARE has been unzippered, and this assembly time is increased even more with the degree of unfolding. We find that helical SNAREs assemble rapidly, however it is known (from experiments) that unstructured, completely disassembled SNAREs assemble in ms to s timescales. Therefore, Munc18 or another chaperone would most likely be required to promote a half-zippered SNARE state prior to assembly. We tackled another system of importance due to its deadly and contagious characteristics: the Ebola virus (EBOV) internalization by the host cell which is an adhesion problem of comparable length and time scales. A better understanding of this system will lead to the development of possible vaccines/therapies. Again this system included two negatively charged surfaces, EBOV and the host cell membrane. We developed an analytical model to investigate the parameters required for EBOV ingestion into the host cell. We studied this system at two limits: (1) membrane bending dominates in resisting deformation and (2) membrane tension dominates in resisting deformation. From the membrane bending limit study, a dimensionless parameter representing the ratio of membrane bending stiffness to adhesion was found that determines whether EBOV will be engulfed into the host cell. From the membrane tension limit study we also extract a dimensionless parameter representing the ratio of membrane tension to adhesion that determines whether engulfment will occur. In particular, these dimensionless parameters can be used to relate single-molecule force spectroscopy measurements to the behavior at the length scale of the full virus

Modulation of the physico-chemical and functional properties of bread by applying surface treatments

El pan es un alimento de gran consumo desde la antigüedad, obtenido de un proceso de panificación dinámico. Una de las innovaciones de mayor éxito en panificación ha sido el pan parcialmente cocido obtenido por la tecnología de panificación interrumpida que proporciona pan crujiente en cualquier momento del día. La crujibilidad es el atributo más demandado por los consumidores en el pan crujiente fresco. Desafortunadamente, la crujibilidad es percibida por corto tiempo después del horneado y la pérdida de ésta es uno de los atributos que causa rechazo en los consumidores. El objetivo de esta investigación fue la modulación de las propiedades físico-químicas y funcionales del pan mediante la aplicación de tratamientos de superficie con el fin de comprender las características de la corteza y el desarrollo de productos de pan con un valor agregado. Para abordar dicho objetivo se han realizado estudios para determinar el impacto de la adición de vapor, durante el horneado, sobre las propiedades mecánicas de la corteza y para evaluar la influencia de estas propiedades en los parámetros de calidad utilizando diferentes panes comerciales. Además se han realizado estudios para modular las propiedades de la corteza dirigidos a entender su microestructura y modificarla mediante tratamientos enzimáticos con amiloglucosidasa o con un recubrimiento funcional, con la finalidad de modificar la permeabilidad de la corteza u obtener panes probióticos. Los resultados mostraron que la cantidad de vapor utilizada durante la cocción (100, 200 y 400 ml) modificaron las propiedades físico-químicas y mecánicas así como la estructura de la corteza del pan. Los parámetros de calidad permitieron la diferenciación de variedades de pan parcialmente cocido, específicamente las propiedades mecánicas de la corteza junto con el volumen específico, dureza y estructura de la miga. Sin embargo, la textura de la corteza de pan fue significativamente dependiente de las condiciones de ensayo (velocidad y sección de la sonda). Los resultados mostraron que la velocidad más baja (0,5 mm / s) dio información acerca de la estructura celular de la corteza relacionada con la textura crujiente. Por otra parte, la estructura celular fue modificada por la amiloglucosidasa pulverizada sobre la superficie del pan antes de la cocción, lo que condujo a una disminución en el contenido de agua y actividad del agua de la corteza, lo cual se requiere para extender crujibilidad. La aplicación de recubrimientos comestibles con L. acidophilus microencapsulado sobre la superficie pan (disperso o en multicapa) garantizó la supervivencia del microorganismo después del tiempo de cocción y almacenamiento, a pesar de que estos disminuyeron la fuerza de fractura y actividad de agua de la corteza. El análisis de microestructura demostró la presencia de microcapsulas dispersas en la corteza de pan. Por lo tanto, L. acidophilus incluido en microcápsulas pueden ser incorporado en la superficie de pan a través de recubrimientos comestibles, abriendo la posibilidad de obtener panes funcionales.Altamirano Fortoul, RDC. (2013). Modulation of the physico-chemical and functional properties of bread by applying surface treatments [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/33398TESI

Sugars and its related compounds in space and on the early Earth

第8回極域科学シンポジウム/個別セッション：[OA] 南極隕石 / はやぶさ12月4日（月）国語研究所 2階講堂The Eighth Symposium on Polar Science/Ordinary sessions: [OA] Antarctic meteorites / HayabusaMon. 4 Dec./2F Auditorium, National Institute for Japanese Language and Linguistic

Revisiting U.S. Stock Market Returns: Individual Retirement Accounts

Numerous studies have estimated U.S. stock market returns measured by various indexes such as the S&P 500 Index over certain periods. The purpose of this paper is twofold: first we calculate, under certain scenarios, the final total accumulation of a representative individual who invests a certain amount of funds per month during a long investment horizon of say 30 or 40 years. Second, we evaluate the performance of such an investment plan of defined monthly contributions. This evaluation is based on a benefit target and working backwards we compute the necessary monthly contributions. In our calculations we use actual monthly returns of the S&P 500 Index instead of averages obtained from a large sample. We calculate that accumulations of gradual investments over 30 or 40 years are skewed to the right and we also compute the probability that a given percentage of contributions will be sufficient to finance certain retirement benefits

Effect of high pressure processing on wheat dough and bread characteristics

8 pages, 3 figures, 4 tables.-- Available online 30 June 2009.Microbial, physical and structural changes in high pressured wheat dough were studied as a function of pressure level (50–250 MPa) and holding time (1–4 min). Thereafter, selected conditions of high hydrostatic processing (HPP) were applied to bread dough and the technological quality of the obtained breads was studied. The effect of HPP on wheat dough was investigated by determining microbial population (total aerobic mesophilic bacteria, moulds and yeasts), color and mechanical and texture surface related dough parameters (cohesiveness, adhesiveness, hardness and stickiness). HPP reduced the endogenous microbial population of wheat dough from 10^4 colony forming units/g (CFU) to levels of 10^2 CFU. HPP treatment significantly (P < 0.05) increased dough hardness and adhesiveness, whereas treatment time reduced its stickiness. Scanning electron micrographs suggested that proteins were affected when subjected to pressure levels higher than 50 MPa, but starch modification required higher pressure levels. HPP treated yeasted doughs led to wheat breads with different appearance and technological characteristics; crumb acquired brownish color and heterogeneous cell gas distribution with increased hardness due to new crumb structure. This study suggests that high hydrostatic processing in the range 50–200 MPa could be an alternative technique for obtaining novel textured cereal based products.This work was financially supported by Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación Project (AGL2005-05192-C04-01), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) and Mexican Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT).Peer reviewe

Historia constitucional de Venezuela. Tomo primero, La colonia, la independencia, La gran Colombia

2a ed. rev

La Institucionalidad electoral en México y la construcción de la confianza: una reflexión desde la gobernanza

La “Institucionalidad electoral en México y la construcción de la confianza: una reflexión desde la gobernanza” es un profundo trabajo de investigación que tiene el propósito de conformar un marco que permita un análisis de la realidad electoral que se ha dado en México durante las últimas décadas, a partir de consideraciones que han permitido construir la confianza en la ciudadanía más allá del marco jurídico, legal e institucional, para llegar a una democracia electoral que tiene un amplio componente ciudadano, que trasciende lo partidista y que ineludiblemente se puede abordar desde la gobernanza. La presente tesis doctoral en un primer momento describe las dimensiones de los factores clave que se despliegan en un sistema de gobernanza electoral en un marco de institucionalidad democrática que permite la interrelación y gestión efectiva de los valores que favorecen la confianza de la sociedad y la ciudadanía en los procesos electorales de corte federal. Aquí se establecen los alcances de la investigación, se hace notar que se realizó una investigación bibliográfica acorde y puntual que permite comenzar con los documentos bases para el estudio de los sistemas de gobernanza a fin de poder establecer un metatexto, así como a los autores y referencias bibliográficas que permiten, con posterioridad la formulación de un diseño de modelo de sistema de gobernanza institucional electoral que pueda identificar las dimensiones manifiestas que mejor representan la realidad de los procesos electorales en México a nivel federal; con lo que se desprende la pregunta específica de la investigación ¿Cuáles son las dimensiones de los factores críticos que definen la gobernanza de una institucionalidad electoral? También se presentan tanto el problema de la investigación, como su hipótesis: analizar en términos de gobernanza, elementos institucionales y administrativos del organismo electoral en México, en el proceso electoral 2000, 2006 y 2012, que hagan posible que la consideren como una entidad altamente confiable, en lo relativo a los procesos electorales; que en el marco de una institucionalidad precaria en el ámbito electoral, previo a la creación del Instituto Federal Electoral, se hizo necesario construir un diseño normativo que le diera confianza a los dirigentes partidistas y a los ciudadanos en lo relativo a la organización de elecciones nacionales, respectivamente..

Historia constitucional de Venezuela. Tomo primero, La colonia, la independencia, La gran Colombia

2a ed. rev