USI: a fast and accurate approach for conceptual document annotation

International audienceBackground : Semantic approaches such as concept-based information retrieval rely on a corpus in which resources are indexed by concepts belonging to a domain ontology. In order to keep such applications up-to-date, new entities need to be frequently annotated to enrich the corpus. However, this task is time-consuming and requires a high-level of expertise in both the domain and the related ontology. Different strategies have thus been proposed to ease this indexing process, each one taking advantage from the features of the document.Results : In this paper we present USI (User-oriented Semantic Indexer), a fast and intuitive method for indexing tasks. We introduce a solution to suggest a conceptual annotation for new entities based on related already indexed documents. Our results, compared to those obtained by previous authors using the MeSH thesaurus and a dataset of biomedical papers, show that the method surpasses text-specific methods in terms of both quality and speed. Evaluations are done via usual metrics and semantic similarity.Conclusions : By only relying on neighbor documents, the User-oriented Semantic Indexer does not need a representative learning set. Yet, it provides better results than the other approaches by giving a consistent annotation scored with a global criterion instead of one score per concept

Weakly Supervised Temporal Convolutional Networks for Fine-grained Surgical Activity Recognition

Automatic recognition of fine-grained surgical activities, called steps, is a challenging but crucial task for intelligent intra-operative computer assistance. The development of current vision-based activity recognition methods relies heavily on a high volume of manually annotated data. This data is difficult and time-consuming to generate and requires domain-specific knowledge. In this work, we propose to use coarser and easier-to-annotate activity labels, namely phases, as weak supervision to learn step recognition with fewer step annotated videos. We introduce a step-phase dependency loss to exploit the weak supervision signal. We then employ a Single-Stage Temporal Convolutional Network (SS-TCN) with a ResNet-50 backbone, trained in an end-to-end fashion from weakly annotated videos, for temporal activity segmentation and recognition. We extensively evaluate and show the effectiveness of the proposed method on a large video dataset consisting of 40 laparoscopic gastric bypass procedures and the public benchmark CATARACTS containing 50 cataract surgeries

Desarrollo de un prototipo electrónico inalámbrico para medir el nivel de agua en cuencas del sistema agroalimentario argentino

El balance hidrológico se ve alterado producto de la deforestación, los cambios del uso del suelo y la cobertura vegetal, la sobreexplotación de los acuíferos y el drenaje de cuerpos de aguas naturales (FAO, 2011). Los cambios del ambiente, en los que se desenvuelven los procesos naturales, producen desequilibrios en los sistemas y generan fenómenos que pueden afectar la dinámica hídrica significativamente. Así, el conocimiento hidrológico en el tiempo y el espacio es indispensable para entender el funcionamiento del sistema a diferentes escalas: cuencas, subcuencas, microcuencas y lotes de productores (OMM, 2011). El nivel o altura del agua es la altura de la superficie del agua en relación a una determinada referencia la cual puede ser registrada de manera sistemática y operativa con un instrumento denominado limnígrafo. En contextos vinculados a proyectos de investigación relacionados con el sistema agroalimentario argentino, este tipo de dispositivo permite adquirir mediciones y crear bases de datos continuas en el tiempo, que ayudan a generar información hidrológica básica. Así, por ejemplo, se pueden predecir tanto la disponibilidad de agua para cultivos como los niveles que alcanzaran crecidas o sequías extraordinarias (Havrylenko et al., 2016), disponer de una serie temporal de la variación de los niveles de agua de los acuíferos, predecir su dinámica de comportamiento ante distintos escenarios climáticos, entre otros. No se debe interpretar este registro como una simple cuantificación de una variable, sino como un dato determinante para los procesos de toma de decisión, tareas de investigación, gestión eficaz de los recursos hídricos, producción alimentaria sostenible y desarrollo rural. Los limnígrafos pueden diferenciarse según la tecnología disponible en los tres componentes principales del equipo de registro: el tipo de sensor, el tipo de almacenamiento de datos y el tipo de transmisión remota (OMM, 1994). En particular, el limnígrafo con sensor de presión hidrostática, es un dispositivo electrónico que mide y registra valores de columna de agua a intervalos de tiempo seleccionables por el usuario. Producir un limnígrafo desde el Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) a partir de un desarrollo tecnológico propio, permite independizarse del instrumental ofrecido por el mercado. Esto presenta beneficios económicos y técnicos. En relación a los económicos, se reduce el costo de adquisición del equipamiento. Además, favorece la posibilidad de instalar una mayor cantidad de dispositivos, mejorando la resolución espacial y por lo tanto el conocimiento del nivel del agua en el área de estudio. Otro de los beneficios está relacionado con el mantenimiento a largo plazo del instrumental, la accesibilidad de los repuestos y el reemplazo de los componentes en caso de desabastecimiento u obsolescencia.Fil: Havrylenko, Sofí­a Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Clima y Agua; ArgentinaFil: Moltoni, Andrés Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Clemares, Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Espíndola, Aimé. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Clima y Agua; ArgentinaFil: Fiorini Correa, Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; Argentin

Desarrollo de un hardware para una estación de monitoreo hidrológico multiparamétrica

Conocer el valor del nivel del agua y algunos parámetros de calidad como temperatura, pH, conductividad eléctrica y oxígeno disuelto, tanto en forma superficial en arroyos y ríos, como en profundidad en las napas freáticas es esencial para interpretar y predecir la dinámica de su comportamiento ante distintos escenarios climáticos o sistemas de producción. Las estaciones de monitoreo hidrológico son equipos de medición constituidos por tres componentes principales: sensor, hardware y transmisión remota, los que se ubican en un recinto resistente a la intemperie ya que las estaciones se suelen instalar de manera permanente en un punto de interés (Figura 1). Este tipo de instrumental está diseñado para adquirir mediciones del agua de manera continua, permitiendo conformar bases de datos hidrológicas, cuya información es determinante para los procesos de toma de decisión y tareas de investigación, relacionadas a la producción agrícola, manejo del riego, inundaciones o sequías, entre otros. El objetivo general de este trabajo fue desarrollar el hardware para un prototipo de estación de monitoreo hidrológico que permita la medición y el registro de algunos parámetros hidrológicos en un único equipo. Este desarrollo tecnológico fue pensado para ser utilizado por investigadores del sector público o privado dedicados a estudiar la hidrología superficial o subterránea, productores agropecuarios, entre otros. Al ser un diseño propio, permite independizarse del instrumental ofrecido por el mercado, presentando beneficios económicos y técnicos.Fil: Clemares, Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Moltoni, Andrés Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Havrylenko, Sofí­a Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Clima y Agua; ArgentinaFil: Espíndola, Aimé. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Clima y Agua; ArgentinaFil: Fiorini Correa, Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; Argentin

Highly cohesive dual nanoassemblies for complementary multiscale bioimaging

International audienceInnovative nanostructures made of a high payload of fluorophores and superparamagnetic nanoparticles (NPs) have simply been fabricated upon self-assembling in a two-step process. The resulting hybrid supraparticles displayed a dense shell of iron oxide nanoparticles tightly attached through an appropriate polyelectrolyte to a highly emissive non-doped nanocore made of more than 10 5 small organic molecules. Cooperative magnetic dipole interactions arose due to the closely packed magnetic NPs at the nanoarchitecture surface, causing enhanced NMR transverse relaxivity. Large in vivo MRI T 2 contrast was thus obtained with unusually diluted solutions after intravenous injection in small rodents. Two-photon excited fluorescence imaging could be performed, achieving unprecedented location resolution for agents combining both magnetic nanoparticles and fluorescence properties. Finally, TEM imaging of the sectioned mouse tissue succeeded in isolating the core–shell structures, which represents the first image of intact complex magnetic and fluorescent nanoassemblies upon in vivo injection. Such highly cohesive dual nanoarchitectures should open great horizons toward the assessment with high spatial resolution of the drug or labeled stem cell biodistribution

Los costos de la mecanización agrícola en soja y maíz: un análisis comparado

Dentro de la producción agrícola, los gastos incurridos en el proceso de mecanización son de gran relevancia dado que ocupan una importante fracción en el costo de producción agrícola. Sin embargo, suelen ser frecuentemente minimizados (Garbers y Chen, 2013). Si bien la mecanización no es la única tecnología aplicable al desarrollo de la agricultura, frecuentemente es la forma de cambio más visible y fácil de reconocer en las zonas rurales (Cortes et al., 2009). Los costos derivados de su utilización siempre representan una parte importante de los gastos involucrados en el proceso productivo (Fernandes de Souza et. al., 2013). Sumado a esto, en los últimos años el creciente nivel tecnológico asociado a estos equipos generó mayor incidencia en los costos de producción y un consecuente incremento de productividad y rentabilidad (Carrasco et al., 2018). Por este motivo, resulta relevante conocer cuál es su incidencia dentro de los costos de producción y cómo evolucionaron en los últimos años. El objetivo de este trabajo consiste en analizar comparativamente la composición de los costos directos de la producción agrícola considerando los cultivos de soja y maíz. Específicamente se estudiará la incidencia de aquellos asociados a la mecanización y su evolución en los últimos 5 años.Instituto de Ingeniería RuralFil: Moltoni, Luciana A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Duro, Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Masiá, Gerardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Moltoni, Andrés Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Clemares, Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Fiorini, Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; Argentin

Evaluación de sistema de guiado para la toma de muestras de compactación edáfica a campo

La adopción del uso de la agricultura de precisión, al igual que el manejo por ambientes de los lotes, se ha visto incrementada en los últimos años y en particular en la última década, debido al desarrollo masivo de dispositivos electrónicos confiables y también a una baja relativa en los costos de los mismos. En el marco de los proyectos de investigación dependientes de la Secretaria de Investigación y Vinculación Tecnológica de la Universidad Nacional de Moreno (UNM) se llevó a cabo, en conjunto con el INTA, el desarrollo de un sistema de medición de compactación edáfica “Penetrómetro Digital” (Figura 1). Dicho dispositivo desarrollado enteramente entre la UNM y el Laboratorio de Agroelectrónica del Instituto de Ingeniería Rural del INTA permite registrar el índice de cono a intervalos de profundidad de 1cm. Para poder adaptar este dispositivo de diagnóstico básico de compactación a la agricultura moderna, se lo dotó de un GPS de forma nativa y se le agregaron varias funcionalidades que facilitan la toma de muestras en los lotes. El equipo permite la carga de una lista georeferenciada de los puntos en donde se deben realizar las mediciones y mediante esta información asiste al usuario, guiándolo dentro del lote para que pueda encontrar estos puntos y realizar las mediciones.Instituto de Ingeniería RuralFil: Moltoni, Andrés Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Masiá, Gerardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Fiorini, Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Knaupp, Lucas. Universidad Nacional de Moreno; ArgentinaFil: Clemares, Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Duró, Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Moltoni, Luciana A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; Argentin

Multi-level-assistance robotic platform for navigation in the urinary system: design and preliminary tests

This work was supported by the ATLAS project. This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie grant agreement No 813782. This work was also partially supported by French State Funds managed by the “Agence Nationale de la Recherche (ANR)” through the “Investissements d’Avenir” (Investments for the Future) Program under Grant ANR-10-IAHU-02 (IHU-Strasbourg).Peer ReviewedPostprint (published version