Detecção de vírus entéricos como medida de qualidade em água potável: situação atual e limitações

A água potável deve ser livre de poluição fecal. Os métodos clássicos de determinação de contaminação fecal da água baseiam-se na detecção de coliformes fecais. Todavia, vírus de excreção fecal (vírus entéricos) podem estar presentes mesmo na ausência de coliformes detectáveis e constituir risco como agentes causadores de epidemias na população humana. A presente revisão traz conceitos introdutórios sobre vírus entéricos, as técnicas atualmente disponíveis para análise virológica da água e os entraves técnicos e conceituais para a implementação de tais procedimentos na rotina do monitoramento de qualidade da água.Palavras-chave: Análise Virológica da Água. Vírus Entéricos. Água Potável.AbstractDrinking water should be free of fecal pollution. Classical methods for determination of fecal contamination of water are based on the detection of fecal coliforms. However, viruses of fecal excretion (enteric viruses) may be present even on the absence of detectable coliforms being a risk as causative agents of epidemics on the human population. The present review contains introductory concepts about enteric viruses, techniques which are presently available for viral analysis of water and the possible technical and conceptual barriers regarding the implementation of such procedures on the routine monitoring of water quality.Keywords: Viral Analysis of Water. Enteric Viruses. Drinking Water

MULTIPLEX SYBR® GREEN-REAL TIME PCR (qPCR) ASSAY FOR THE DETECTION AND DIFFERENTIATION OF Bartonella henselae AND Bartonella clarridgeiae IN CATS

A novel SYBR® green-real time polymerase chain reaction (qPCR) was developed to detect two Bartonella species, B. henselae and B. clarridgeiae, directly from blood samples. The test was used in blood samples obtained from cats living in animal shelters in Southern Brazil. Results were compared with those obtained by conventional PCR targeting Bartonella spp. Among the 47 samples analyzed, eight were positive using the conventional PCR and 12 were positive using qPCR. Importantly, the new qPCR detected the presence of both B. henselae and B. clarridgeiae in two samples. The results show that the qPCR described here may be a reliable tool for the screening and differentiation of two important Bartonella species.Um novo teste baseado na reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) com SYBR ® Green foi desenvolvido para detectar duas espécies de Bartonella, B. henselae e B. clarridgeiae, diretamente em amostras de sangue. Este teste foi utilizado em amostras de sangue obtidas de gatos que vivem em abrigos de animais do sul do Brasil. Os resultados foram comparados aos obtidos pelo PCR convencional utilizado para a detecção de Bartonella spp. Das 47 amostras analisadas, oito foram positivas no PCR convencional e 12 foram positivas para qPCR. A reação de qPCR, permitiu a detecção da presença simultânea de B. henselae e B. clarridgeiae em duas destas amostras. Os resultados mostram que a qPCR aqui descrita pode ser uma ferramenta confiável para a detecção e diferenciação de duas espécies importantes de Bartonella spp

Vírus respiratório sincicial bovino

O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é uma causa importante de doença respiratória, principalmente em bovinos jovens, caracterizada por pneumonia intersticial. A distribuição das infecções pelo BRSV é mundial e o vírus foi identificado em diferentes episódios no Brasil. O vírus pertence ao gênero Pneumovirus da família Paramyxoviridae e o seu genoma RNA não-segmentado de sentido negativo codifica para 10 proteínas. As proteínas de fusão (F) e de adesão (G) constituem os principais alvos para o sistema imune do hospedeiro. Esse fato deve estar relacionado com a grande variabilidade destas proteínas e de seus genes correspondentes, conforme determinado tanto por anticorpos monoclonais quanto por análise filogenética com base em seqüências de nucleotídeos. A transmissão, resposta imune e patogenia das infecções pelo BRSV, foram estudadas no hospedeiro natural sob condições naturais e experimentais; todavia, alguns aspectos da imunobiologia da infecção são ainda pouco conhecidos. O uso de modelos experimentais, especialmente roedores, pode fornecer novas informações sobre esse assunto. O estado atual do diagnóstico laboratorial das infecções e as medidas de controle para prevenir surtos de BRSV também são apresentados e discutidos

Low occurrence of Hepatitis A virus in water samples from an urban area of Southern Brazil

Hepatitis A virus (HAV), a member of Picornaviridae family, is the main causative agent of acute viral hepatitis in the world, mainly in developing countries. HAV may be present in contaminated water and food and its presence is often associated to a lesser extent with socioeconomic factors and environmental quality. The main goals in the present study were to standardize a cell culture combined to a polymerase chain reaction protocol for the detection and quantification of viral viability and analyze whether the virus could be found in water samples collected in four urban streams of Sinos River watershed. Virus recovery was assayed from known virus concentrations measured in experimentally contaminated raw and ultrapure water (MilliQ®). Recovery rates ranged from 270% in raw water to 15,000% in ultrapure water. In a second step, a qPCR coupled to a previous passage in cells, demonstrated more analytical sensitivity when compared to samples assayed without a previous passage in cell cultures. HAV genome was detected in only 1 of 84 samples analyzed, pointing to a very low occurrence of HAV in water samples in the studied region. These findings are remarkable, since no more than 5% of the domestic sewage in this area is treated pointing to a low occurrence of HAV in the population living nearby during the study period

Molecular detection and phylogenetic analysis of bovine respiratory syncytial virus (BRSV) in swabs and lung tissues of adult cattle

Bovine respiratory syncytial viruses virus (BRSV) is one of the etiologic agents of pneumonia in young cattle. Few studies have been made aiming detection of the virus in samples collected from adult animals, especially those asymptomatic bovines. However, it is assumed that infections in these groups may occur mostly asymptomatic and this would be an important mechanism for maintaining of BRSV in herds. In this study, the goal was to conduct an analysis of the occurrence of asymptomatic infections by BRSV in lung samples (n=68) and nasal swabs (209) taken from adult animals collected in abattoirs from Southern and Southeastern Brazil respectively, to detect via polymerase chain reaction the occurrence of infected animals in populations of adult cattle. The samples that resulted positive (6) on RT-PCR were subsequently subjected to cutting with restriction enzymes and sequencing for genetic characterization (2 samples). All samples belongs to subgroup B of BRSV, which is reported as the one circulating in Brazil. The results obtained demonstrate that BRSV may be present in samples taken from adult animals, which is in agreement the hypothesis that infections in adults run in a sub-clinical way that may be of importance as a maintenance mechanism of the virus in bovine herds.O vírus respiratório sincicial bovino (BRSV) é um dos agentes etiológicos de pneumonias em bovinos jovens. Poucos estudos foram realizados visando à detecção do agente em amostras coletadas de animais adultos, e em especial de bovinos assintomáticos. No entanto, presume-se que as infecções ocorridas nestes grupos possam ocorrer em sua maioria de forma assintomática e este seria um mecanismo importante para manutenção do BRSV nos rebanhos. No presente estudo, o objetivo foi realizar uma análise da prevalência de infecções assintomáticas pelo BRSV em pulmões (n=68) e swabs nasais (209) coletados de bovinos adultos coletadas em frigoríficos da região Sul e Sudeste respectivamente, no sentido de detectar por intermédio de reação da polimerase em cadeia qual a taxa de animais infectados em populações de animais adultos onde não ocorram sinais clínicos da infecção. As amostras positivas à RT-PCR (6) foram posteriormente submetidas ao corte com enzimas de restrição (REA) e sequenciamento para caracterização genética do gene F (2 das amostras). Todas as amostras se enquadram no subgrupo B de BRSV, o grupo circulante no Brasil conforme estudos anteriores. Os resultados obtidos demonstram que o BRSV pode estar presente em amostras obtidas de animais sadios, reforçando a hipótese de que infecções subclínicas fazem parte do mecanismo de manutenção do vírus nos rebanhos.961966Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq

Enterovírus como indicadores de qualidade da água

Enteroviruses belong to enteric virus group, which is composed by pathogens often isolated from water contaminated with fecal pollution. They receive this classification mainly due to their ability to replicate in the host’s gut and be transmitted through the fecal-oral route. This group of virus resist to high concentrations of chlorine, showing resistance to the usual protocols for treatment of water. Monitoring of fecal pollution in water is usually performed through the detection and quantification of fecal coliforms. When coliforms are present, it is recommendable to avoid the human consumption of water. However, several authors reported the presence of enteric viruses in water samples that are free of coliforms, this fact might indicate that this bacterial parameter is a non reliable indicator of fecal pollution. Besides, among the pathogens transmitted by water, the presence of enteroviruses is considered by WHO a reliable indicator of fecal contamination and related with epidemic diseases transmitted by water. This fact is exacerbated due the frequency of enterovírus causing habitual diseases, such as diarrhea and conjunctivitis, as well as more severe diseases, including meningitis and encephalitis.Os enterovírus fazem parte do grupo dos vírus entéricos, constituído de importantes patógenos, isolados com frequência de águas contaminadas por poluição fecal. Recebem essa classificação principalmente por suas características de replicação no trato intestinal do hospedeiro e transmissão pela via fecal-oral. Esse grupo de vírus resiste a altas concentrações de diferentes compostos clorados, apresentando, assim, resistência aos tratamentos habituais da água. Atualmente, o principal parâmetro utilizado para controle microbiológico da água são os coliformes fecais. Caso esses coliformes estejam presentes, deve-se evitar o consumo humano da água analisada. Porém, diversos autores têm discutido a presença de enterovírus em amostra de águas mesmo na ausência de coliformes, o que parece desmerecer essas bactérias como confiáveis marcadores de poluição fecal. Além disso, dentre os patógenos veiculados pela água, a presença de enterovírus é considerada pela OMS como sendo um indício de contaminação fecal e relacionada a epidemias de doenças de veiculação hídrica. Este fato é exacerbado por serem os enterovírus frequentes causadores de doenças habituais, tais como diarreias e conjuntivites, assim como doenças mais graves, incluindo meningoencefalites

Intervening variables in the existence of watershed committees in Brazil

A gestão de bacias hidrográficas por meio de comitês é essencial na mediação entre a oferta e a demanda de água para consumo doméstico, industrial, agrícola, lazer, entre outros usos da água. Uma gestão exitosa pode ocorrer por meio da identificação e compreensão das características socioeconômicas, demográficas, entre outras, e assim formatar as práticas adotadas pelos comitês. Neste contexto, o escopo central deste estudo consistiu em analisar as variáveis intervenientes relacionadas aos aspectos geográficos, demográficos, socioeconômicos e a existência de comitê de bacias. A metodologia consiste na abordagem quantitativa, empregando-se uma pesquisa documental secundária e sua análise ocorreu por meio da aplicação da estatística descritiva e do teste de correlação de Pearson. Os principais resultados evidenciam que a explicação da existência de comitês de bacias hidrográficas relaciona-se com o tamanho da população que promove maior pressão à medida que aumenta. Além disso, evidenciou-se que a existência de comitês de bacias correlaciona-se com: crescimento econômico, quantidade de conflitos pelos múltiplos usos, coleta de esgotos e nível de degradação da qualidade ambiental. Conclui-se, portanto, que de fato existem variáveis intervenientes para a existência de comitês de bacias e que eles são necessários para a gestão eficiente destas variáveis.Watershed management through committees is essential in mediating between water supply and demand for domestic consumption, as well as industrial, agricultural, leisure, and other uses of water. Successful management can occur through the identification and comprehension of socioeconomic and demographic characteristics, among others, and therefore, these help shape the practices adopted by the committees. In this context, the central objective of this study was to analyse the intervening variables related to the geographic, demographic, socioeconomic aspects and the existence of a basin committee. The methodology consisted of a quantitative approach, using previously published documents and analysis applying descriptive statistics and the Pearson correlation test. The main results showed that the existence of a watershed committee is correlated with the size of the population, which promotes greater pressure as it increases. In addition, it was observed that the creation of committees is related to economic growth, number of conflicts for multiple uses, sewage collection and level of environmental quality degradation. We conclude, therefore, that in fact there are intervening variables for the existence of river basin committees and that the committees are necessary for the efficient management of those variables