Incidence du type d'extraction sur la caractérisation des matières organiques naturelles transférables. Application sur des sols de montagne des Alpes du Nord

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La plateforme Géomateriaux et Monitoring (GéMo). Monitoring, échantillonnage et caractérisation des Géomatériaux

Fanget Bernard, Malet Emmanuel, Pignol Cécile, Soufi Fayçal, Blanc Vincent, Develle Anne-Lise. La plateforme Géomateriaux et Monitoring (GéMo). Monitoring, échantillonnage et caractérisation des Géomatériaux. In: Collection EDYTEM. Cahiers de géographie, numéro 16, 2014. Environnements, dynamiques et territoires de la montagne : Dix ans de recherches au laboratoire EDYTEM. pp. 153-162

Structure-from-motion, multi-view stereo photogrammetry applied to line-scan sediment core images

International audienceImages of sediment cores are often acquired to preserve primary color information, before such profiles are altered by subsequent sampling and destructive analyses. In many cases, however, no post-processing of these images is undertaken to extract information, despite the fact that image processing can be used to describe and measure structures within the sample. Improvements of RGB (Red/Green/Blue) cameras and image processing algorithms now enable the acquisition of high-resolution, metrically calibrated pictures called ortho-images, which have great potential. The way to obtain such ortho-images is by processing several raw images. We propose a semi-automated method that uses metrically calibrated targets to create the ortho-image, using Agisoft Photoscan software and a Python script. The method was tested on sediment cores up to 1.5 m long. It was compared to an approach without markers, one that uses only image matching. The proposed method showed better resolution and less distortion (GSD: 59 lm, RMSE: 7–18 lm). Images acquired without calibrated targets can still be used, by manually positioning points that can then be metrically calibrated. This approach is very useful for smartphone images taken in the field. There are many potential applications for such images of sediment cores, for instance as metric stratigraphic logs to facilitate description of the profile by unit, to study and measure structures (e.g. laminae, instantaneous deposits), or use of image registration or data fusion to create spatial landmarks for non-destructive sensors or destructive laboratory analyses. High-resolution metrically calibrated RGB images of sediment cores are simple to acquire and can play an important role in paleoclimate and paleoenvironmental studies

Evaluation du volume placentaire en échographie 3D à 12, 16, 22 SA : relation avec les facteurs de croissance placentaires (étude d'une Cohorte prospective monocentrique )

Objectifs : L'identification de facteurs prédictifs du risque de survenue ou de récidives de pathologies vasculaires placentaires, responsables en grande partie de la morbi-mortalité périnatale, est un des objectifs principaux en obstétrique et en diagnostic anténatal. Le but de cette étude est de comparer les volumes placentaires en échographie 3D à 12, 16 et 22 SA aux taux des D-Dimères et des récepteurs de la protéine C chez des patientes avec antécédent(s) de pathologies vasculaires placentaires.Méthodes : II s'agit d'une étude pilote monocentrique prospective de cohorte menée d'octobre 2008 à juillet 2009. Quarante patientes consécutives, à risque ou avec antécédents de pathologie vasculaire placentaire et venant consulter à 12 SA dans le cadre d'une surveillance spécialisée, ont été sélectionnées. Trois calculs du volume et du quotient placentaire ont été réalisés par deux échographistes différents à 11-14, 16-18, 20-22 SA. Dans le même temps, le dosage des D Dimères et des récepteurs de la protéine C a été effectué. Nous avons étudié la survenue de pathologies vasculaires placentaires dans cette population. Résultats : 11 patientes ont présenté une pathologie vasculaire placentaire : 8 retards de croissance intra utérins et 3 prééclampsies. Il n'y a pas de différence statistiquement significative entre les deux observateurs pour les mesures des volumes placentaires. Il existe une corrélation significative entre le volume placentaire, qui est plus petit, et la survenue d'une pathologie vasculaire placentaire dès la première échographie. On peut définir un seuil du quotient placentaire à l'inclusion qui est à 0,48 pour prédire une pathologie vasculaire placentaire, avec une sensibilité de 54,5% [23,4 - 83,3], 1,15 à la deuxième visite, avec une sensibilité de 90,9% [58,7 - 99,8] et 1,24 à la troisième visite avec une sensibilité de 87,5% [47,3 - 99,7]. Il n'existe aucune corrélation significative entre le volume placentaire ou la survenue d'une pathologie vasculaire placentaire, et le taux des D-Dimères et de récepteurs à la protéine C à 12SA, 16SA et20SA. Conclusion : Notre travail montre une relation entre le volume placentaire et le risque la survenue d'une pathologie vasculaire placentaire. Les marqueurs de croissance placentaire évalués dans cette étude ne semblent pas améliorer ce volume placentaire mais laissent entrevoir une voie de recherche intéressante dans le dépistage des pathologies vasculaires placentaires.ST ETIENNE-BU Médecine (422182102) / SudocSudocFranceF

La gestion et valorisation des données issues de carottes sédimentaires terrestres en France: vers la professionnalisation et la mutualisation de moyens

Les carottes sédimentaires lacustres font l'objet d'un intérêt grandissant de la part des paléoenvironnementalistes mais également d'écologues s'intéressant à la trajectoire des écosystèmes. Les carottes marines ou continentales prélevées dans le cadre de consortium internationaux (IODP, ICDP) font l'objet de toutes les attentions - de la mission de prélèvement jusqu'à leurs stockage, en passant par la mise à disposition, suivi et valorisation d'échantillons. Peut-on envisager la transposition de tels dispositifs à l'échelle nationale ? C'est l'un des défis que se propose de relever CLIMOR (Equipex ANR-11-EQPX-0009). Le besoin de gestion de carottes sédimentaires lacustres est illustré par le Projet ANR Iper-retro , qui a constitué sans doute le plus important effort de recherche paléolimnologique jamais réalisé sur les grands lacs français (Bourget, Annecy, Léman). Ce projet, tout à la fois multi-sites, multi-thématiques, multi-proxies, multi-partenaires (la plupart biologistes, ignorant tout de l'étude des sédiments) et international, concentrait la plupart des défis de gestion associés à un grand projet d'étude de carottes sédimentaires. Au total, ce sont 132 carottes prélevées dans 3 lacs différents qui ont du être datées, inter-corrélées et plus de 6000 échantillons qui ont été prélevés, inter-datés, distribués et suivis dans une banque de données mutualisée. La gestion de ces 132 carottes a reposé sur le recrutement d'un " curator " qui a mis en place dès le début du programme des procédures permettant le suivi des besoins et du partage d'échantillons de chaque membre. En parallèle, il a fallu identifier et mettre en place rapidement un outil de gestion des metadonnées et des données associées à chaque 1/2 carotte du projet tout en prévoyant au mieux les questionnements, à la fois de mutualisation d'échantillons ou de données, mais aussi de répondre à la problématique d'archivage, de traçabilité, de la qualité des carottes et des données. Nous proposons de nous appuyer sur cette expérience pour poser les fondements d'une future banque de données associée au Centre de Carottage et de Forage National (C2FN)2. Les perspectives aujourd'hui sont grandes. La carothèque du laboratoire EDYTEM compte une quarantaine de lacs et on remarque depuis maintenant plus de deux ans, un accroissement des demandes d'échantillons disponibles et datés et de données validées de la part de laboratoires étrangers à l'étude sédimentaire. Ce mouvement vers la réutilisation de carottes prélevées dans un but autre est un excellent moyen pour favoriser l'interdisciplinarité et valoriser les investissements publics de recherche. Cette demande croissante met en relief la pertinence, voire la nécessité, de développer une base de données s'inspirant de celle de IODP-ICDP "Drilling Information System DIS "3. L'Equipex CLIMCOR va permettre, en complément de l'émergence de nouvelles capacités de carottage (SediDrill, etc.), le développement d'un outil adapté pour la gestion et la traçabilité des objets " carottes " tout au long de leur archivage. Il s'agit d'une condition préalable pour évoluer à terme vers le partage de données

Caractérisation par fluorescence en trois dimensions de matières organiques transférables de sols de montagne des Alpes du nord

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Theoretical Principles and Perspectives of Hyperspectral Imaging Applied to Sediment Core Analysis

International audienceHyperspectral imaging is a recent technology that has been gaining popularity in the geosciences since the 1990s, both in remote sensing and in the field or laboratory. Indeed, it allows the rapid acquisition of a large amount of data that are spatialized on the studied object with a low-cost, compact, and automatable sensor. This practical article aims to present the current state of knowledge on the use of hyperspectral imaging for sediment core analysis (core logging). To use the full potential of this type of sensor, many points must be considered and will be discussed to obtain reliable and quality data to extract many environmental properties of sediment cores. Hyperspectral imaging is used in many fields (e.g., remote sensing, geosciences and artificial intelligence) and offers many possibilities. The applications of the literature will be reviewed under five themes: lake and water body trophic status, source-to-sink approaches, organic matter and mineralogy studies, and sedimentary deposit characterization. Afterward, discussions will be focused on a multisensor core logger, data management, integrated use of these data for the selection of sample areas, and other opportunities. Through this practical article, we emphasize that hyperspectral imaging applied to sediment cores is still an emerging tool and shows many possibilities for refining the understanding of environmental processe

Relationship between Plasma D-Dimer Concentration and Three-Dimensional Ultrasound Placental Volume in Women at Risk for Placental Vascular Diseases: A Monocentric Prospective Study

International audienceINTRODUCTION:The aim of this study was to correlate placental volumes deduced from three-dimensional ultrasound and virtual organ computer-aided analysis (VOCAL) software with systemic concentrations of D-dimer and soluble endothelial protein C receptor (sEPCR).METHODS:This was a monocentric experimental prospective study conducted from October 2008 to July 2009. Forty consecutive patients at risk of placental vascular pathology (PVP) recurrence or occurrence were included. Placental volumes were systematically measured three times (11-14, 16-18 and 20-22 weeks of gestation (WG)) by two independent sonographers. D-dimers and sEPCR plasma concentrations were measured using ELISA kits (Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay).RESULTS:Eleven patients had a PVP. The plasma D-dimer level was positively correlated with placental volume (r = 0.45, p < 0.001). A smaller placental volume and placental quotient was evidenced in women who developed a PVP at the three gestational ages, and the difference was more pronounced during the third exam (20 WG). No obvious correlation could be demonstrated between the development of a PVP and the levels of D-dimer and sEPCR. There was no significant difference in the values of placental volumes measured by the two sonographers.CONCLUSION:The placenta growth could be a major determinant of the elevation of D-dimer during pregnancy. Consideration of placental volume could allow for modulation of the D-dimer concentrations for restoring their clinical interest