Estudo clínico, citogenético e molecular da síndrome do X frágil.

Trabalho de Conclusão de Curso - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Departamento de Clínica Médica, Curso de Medicina, Florianópolis, 199

Detección de Toxoplasma gondii en carnes de consumo humano por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa en tres ciudades del eje cafetero

Antecedentes. Es necesario conocer el grado de exposición a Toxoplasma gondii en la carne de diferentes especies para consumo humano en Colombia. Objetivo. Detectar material genómico de T gondii por la técnica de PCR en muestras de carne de res, cerdo y pollo obtenidas en Armenia, Manizales y Pereira, con el fin de establecer el tipo de carne y la ciudad en donde es más frecuente el hallazgo del parásito. Materiales y métodos. En cada ciudad se obtuvieron 20 muestras por tipo de carne de establecimientos comerciales clasificados en estratos. Se extrajeron 180 muestras de ADN, las cuales se utilizaron para realizar una PCR anidada (nested PCR) con el fin de obtener una región de 160 pares de bases específica de T gondii. Resultados. El 52,7% de las muestras de car¬ne tomadas fueron positivas para la presencia de T gondii. La carne de cerdo fue la más contaminada (70%), con mayor prevalencia en Manizales (80%), seguida por la carne de res en Armenia con 80% de resultados positivos y, por último, la carne de pollo en Pereira presentó la prevalencia más alta (70%). No hubo muestras positivas en pollos en Manizales. Conclusión. Se concluye que existe un alto grado de exposición en los tres tipos de carne analizados, los cuales se pueden considerar como alimentos de riesgo potencial para la transmisión de la infección. Estos resultados indican que se debenGanado de carne-Ganadería carn

Caracterización de la actividad serina proteasa en taquizoitos de Toxoplasma gondii

Se realizó la caracterización enzimática de la actividad serina proteasa y la purificación de proteínas con esta actividad en antígeno total soluble y en antígeno secretorio excretorio de Toxoplasma gondii. Se encontró actividad serina proteasa del tipo tripsina en antígeno total soluble de Toxoplasma pero no en el antígeno secretorio excretorio. Luego de probar tres tipos de columnas de afinidad para serina proteasa solo la cromatografía con arginina permitió determinar la presencia de cuatro formas proteicas en la electroforesis nativa, siendo predominantes una de 45 KDa. En antígeno total o en fracción purificada se encuentra que una proteína de 45 KDa, de acuerdo con los resultados de la prueba de zimograma de caseína es la responsable de la mayor actividad serina proteasa del tipo tripsina en Toxoplasma gondii.1. Resumen 2. Introducción 2.1. Generalidades de proteasas 2.2. Proteasas y parásitos 2.3. Toxoplasma y toxoplasmosis 2.4. Invasión del Toxoplasma gondii 2.5. Proteínas de Toxoplasma 2.5.1. Proteínas de las roptrías 2.5.2 Proteínas de micronemas 2.5.3 Proteínas de los gránulos densos 2.5.4 Proteínas mayores de superficie 2.5.5 Antígenos excretorios/secretorios (ESA) 2.6. Proteasas y Toxoplasma 3. MATERIALES Y METODOS 3.1. OBTENCIÓN DE TAQUIZOITOS VIVOS DE Toxoplasma gondii 3.2. FRACCIONAMIENTO CELULAR 3.2.1. Obtención de antigeno total soluble 3.2.2. Fraccionamiento de los productos liberados de los parasitos extracelulares (Antigeno secretorio excretorio-ESA-) 3.3. Determinación de proteínas totales 3.4. Purificación proteasica 3.4.1. Cromatografía en bacitracina 3.4.2. Cromatografia con arginina 3.4.3. Cromatografía con benzamidina 3.6. Ensayo de azocaseina 3.7. Determinación del peso molecular por electroforesis en poliacrilamida no denaturante y denaturante 4. Resultados 4.1. Obtención y ensayos de actividad proteasica en antigeno total soluble y ESA 4.2. Purificación por cromatografía de afinida

Giardiasis in children living in post-earthquake camps from Armenia (Colombia)

BACKGROUND: An earthquake in the coffee growing region of Colombia on January 25, 1999 destroyed 70% of the houses in Armenia city. Transitory housing camps still remained until two years after the disaster. Parasitological studies found that, in this population, giardiasis was the most frequent parasitic infection. This study was carried out in order to determine the epidemiological risk factors associated with this high prevalence. METHODS: Fecal samples were obtained from 217 children aged between 3 and 13 years. Stool samples were studied by direct wet examination and stained with ferric hematoxilin for microscopical examination. Epidemiological data were collected by questionnaire and analyzed by using the Epi-info software (CDC, Atlanta 2001). RESULTS: Giardia cysts were observed in 60.4% of the samples presented and trophozoites in 4.6%. The following epidemiological and laboratory factors were significantly associated with Giardia infection: 1. Use of communal toilet (vs. individual toilet) OR: 3.9, CI95%: 1.2–16; 2. water provision by municipal ducts (vs. water provision by individual tanks) OR: 3.5, CI95% 1.1–14, and 3. presence of mucus in stool OR: 2.3, IC95%: 0.9–6.7. CONCLUSIONS: A high prevalence of giardiasis was found in children living in temporary houses after the 1999 earthquake in Armenia (Colombia). Giardiasis is an emerging disease in post-disaster situations and adequate prevention measures should be implemented during these circumstances

Frecuencia y fuentes de Blastocystis sp. en niños de 0 a 5 años de edad atendidos en hogares infantiles públicos de la zona urbana de Calarcá, Colombia

Introduction: There are no reports of the potential sources of Blastocystis sp. in Colombia.Objectives: To estimate the frequency of Blastocystis sp. and explore possible associations among infection, clinical manifestations and environmental sources.Materials and methods: A descriptive study was conducted; a representative sample was calculated from a population of 1,993 children less than 5 years old of the lowest socioeconomic levels (1 and 2) attending day care centers in Calarcá, Colombia. The calculated sample size was 275 children, who were selected randomly in 10 % of the centers. Stool testing, questionnaires and sampling to identify the parasite in feces, nails, pets and environmental sources, were performed. Fresh preparations were made with 1% iodine solution, and a concentration technique with formalin-ether was used. Prevalence and odd ratios were estimated; the chi-square test was utilized for qualitative variables, and Student´s t for the quantitative ones.Results: The prevalence of infection in children was of 57.5%. A statistically significant association was found between the Blastocystis sp. positive stool tests and the presence of the parasite in containers of sugar cane beverage (OR=1.70; 95% CI: 1.05-2.79), wood or ground floors (OR=3.43; 95% CI: 1.12-10.48) and in foods other than bottled milk (OR=3.23; 95% CI: 1.41-4.41). A non-significant high prevalence was found in nails (OR=1.62; 95% CI: 0.99-2.67), as well as a significantly higher prevalence of diarrhea (OR=1.95; 95% CI: 0.99-2.77) in children with Blastocystis sp. (45%) as compared with those without the parasite (33%; p<0.05).Conclusions: Blastocystis sp. showed a significant association with diarrhea symptoms in children 0 to 5 years old and was widely distributed in the environment and in water. It is necessary to determine if there are specific hosts with pathogenic potential through molecular techniques.Introducción. No se han descrito las fuentes potenciales de infección por Blastocystis sp. en Colombia.Objetivos. Estimar la frecuencia de Blastocystis sp. y explorar posibles asociaciones entre la infección, las manifestaciones clínicas y algunas fuentes ambientales.Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio descriptivo con una población de 1.993 menores de 5 años (lactantes y preescolares) de estratos socioeconómicos 1 y 2, atendidos en hogares infantiles de Calarcá, Colombia. Se calculó una muestra de 275 y se seleccionó aleatoriamente a los participantes en 10 % de los hogares infantiles. Se practicaron exámenes coprológicos y encuestas y se tomaron muestras para la identificación del parásito en heces, uñas, animales domésticos y algunas fuentes ambientales. Se hicieron preparaciones en fresco con lugol al 1 % y se utilizó una técnica de concentración con formol-éter. Se estimaron prevalencias y razones de momios; para las variables cualitativas se utilizó el test de ji al cuadrado y, para las cuantitativas, la prueba t de Student.Resultados. La prevalencia de infección en los niños fue de 57,5 %. Hubo asociación estadísticamente significativa entre la presencia del parásito en heces y su hallazgo en recipientes de agua de panela (OR=1,70; IC95% 1,05-2,79), en los pisos de madera o de tierra en la vivienda (OR=3,43; IC95% 1,12-10,48), y en alimentos diferentes a la leche en el tetero (OR=3,23; IC95% 1,41-4,41); y se encontró una prevalencia alta sin asociación en muestras de uñas (OR=1,62; IC95% 0,99-2,67). La diarrea fue más frecuente en niños con Blastocystis sp. (45 %) que en aquellos sin el parásito (33 %) (OR: 1,95; IC95% 0,99-2,77) (p<0,05).Conclusiones. Blastocystis sp. se asoció significativamente con síntomas de diarrea en los niños menores de 5 años y se encontró distribuido ampliamente en el ambiente y en el agua. Se requeriría determinar si hay huéspedes específicos para genotipos patógenos por medio de técnicas moleculares

Technology overview of biogas production in anaerobic digestion plants : a European evaluation of research and development

Anaerobic digestion (AD) technology is used commercially around the world, especially in Europe, which has set some challenging targets to diversify its energy mix with more renewable energy. This study intends to demonstrate, through technology prospecting, the relation between academic research (published articles) and technology development (patent applications) evolved from 1990 to 2015. Published articles were classified under the topics and wastes they cover, which include manure, agricultural and food waste, wastewater, sewage sludge and the organic fraction of municipal solid waste, with the last of these often being associated with co-digestion processes. Meanwhile, the patents in the area are mostly for equipment of the AD process and new methods or means of purifying the biogas obtained. It was found that the patents filed in Europe tend to protect their innovations only occasionally in countries outside the EU. Germany is the clear leader in all the areas of research and the commercial applications of the technologies, followed by Italy, Spain and Sweden. This study also demonstrates the immense potential of biogas throughout Europe, not just for energy generation, but also as a fuel and a by-product of the treatment of different kinds of waste

Prevalence of Intestinal Coccidia: First Description of Cyclosporidiosis Associated with Diarrhea in Children in Colombia

Background: In Colombia, the studies about the etiology of acute diarrhea disease (ADD) in children by using standard stool culture techniques methods and DNA detection tools for intestinal virus show that viral origin was the most frequent, however still between 16 to 45% of the cases of unknown etiology. Specific staining techniques or high sensitivity molecular methods for the intestinal coccidia Cryptosporidium sp and Cyclospora sp have been not applied in the Colombian studies, for this reason, the current situation of these intestinal coccidia in Colombia as cause of diarrhea is unknown.  Objective: To estimate the frequency of Cryptosporidium sp. and Cyclospora sp. and to analyze the association between infection and clinical manifestations on children with acute diarrhea consulting the pediatrics emergency service of a third level Hospital. Methods:  An observational descriptive study was performed in 150 children that consulted the emergency service at the Hospital San Juan de Dios in Armenia, Colombia, in the period between April 1st and May 31st of 2022. We applied questionnaires and collected primary data from clinical records of children, as well as stool samples of each child after receiving informed consent from the parents and/or legal guardian of the minors. To identify the pathogenic intestinal coccidia (Cryptosporidium sp. and Cyclospora sp.), we used stool fresh preparations with 1% iodine and stained by a modified Ziehl Nielsen coloration protocol (Kinyoun stain). Samples were examined by expert microbiologists on a light microscope with a 40x objective. Prevalence and odds ratios were estimated. For statistical analysis differences in proportions among groups were compared via the X2 test and Fisher exact test. For non-parametric data, differences of means between two groups were analyzed through a Kruskall-Wallis test. Differences of medians were analyzed via Kruskal-Wallis test for non-parametric variables and analysis of variance (ANOVA) for parametric variables; statistical significance was considered when p ≤ 0.05. Statistical calculations were made by using software factors in Epi Info 7.2 Epi-Info version 3.5.1 (CDC, Atlanta).  Results: The prevalence of infection in the children that went to the urgency service was of 19,7% by Cryptosporidium sp. and 10,9% by Cyclospora sp. The 59,2% of children with cryptosporidiosis and 66,6% of children with cyclosporidiosis were hospitalized. There was a statistically significant association between the presence of parasite in stools and fever in cyclosporidiosis (93,3% of children with cyclosporidiosis vs. 56% by other causes, OR 10,7 IC95% 1,3-84; p= 0,004).  Conclusions: The study results indicate the need to use specific diagnostic techniques to identify Cryptosporidium sp and Cyclospora sp in children with diarrhea, because they are frequent and are treatable with specific antiparasitic medication. We recommend that its search should be done systematically

Determinación del estado sanitario e identificación de los riesgos potenciales en salud pública de la paloma doméstica, Columba livia domestica, en Bogotá, Colombia: Resultados preliminares

Introducción: La Paloma doméstica Columba livia es considerada como símbolo de la paz y atractivo en diversos espacios públicos. No obstante, su posible papel como reservorio y transmisor de enfermedades zoonóticas las puede convertir en un factor de riesgo y posterior problema de salud pública. Igualmente, cuando la densidad de las poblaciones es alta, se convierten en una plaga que produce daños en infraestructuras, edificaciones y puede contaminar los alimentos, entre otros. Objetivo general. El objetivo general de este estudio fue realizar un diagnóstico del estado sanitario de esta especie y determinar su posible impacto en salud pública en un sector de Bogotá. Materiales y Métodos: Se realizó la toma de muestras al azar de heces de unos especímenes de Columba livia procedentes de la Corporación de Abastos de Bogotá S.A.S.-Corabastos, se procesaron en el laboratorio de parasitología de la Universidad del Quindío mediante la técnica de Ritchie y Lugol al 1%. Otra parte de las muestras, se procesaron para la identificación de bacterias en medio agar sangre y agar MacConkey por 24 horas a 37°, posteriormente tinción de gram e identificación por API 20E. Para el aislamiento de hongos se realizó cultivo por 10 días en medio Sabouraud-Dextrosa a 37°C. Por otro lado, a las muestras de heces se les realizó el método de Ritchie para concentrar los parásitos; se lavó con PBS al 1X, se centrifugo a 3500rpm por 5 minutos. Extracción de ADN: se tomó 1ml del producto obtenido, y se le realizo el método basado en una lisis mecánica utilizando perlas de circonio de 1mm combinada con una lisis química con el fin de romper la membrana celular de los ooquistes de Toxoplasma spp. Se purificó el ADN siguiendo el protocolo del kit wizard genomics (Promega®). Para la detección del parásito se amplificó el gen B1 por nested PCR. Posteriormente se realizó la desnaturalización, alineamiento y extensión. En el producto de la PCR anterior se amplifico el Gen B1 con los cebadores 5’TGC ATA GGT TGC CAG TCA CYG 3’ Y 5’ GGC GAC CAA TCT GCG AAT ACA 3’. Se utilizó TNE a 1X, en el cual se agregó un búfer de carga al marcador de peso molecular, las muestras ya tenían búfer de carga para la visualización (Sybr green ADN), el cual contiene el kit GOTAQ. Se contó con aval del comité de bioética y de investigación de la Fundación Universitaria Agraria de Colombia (Uniagraria). Resultados: Se identificaron formas parasitarias compatibles con Entamoeba spp. En cuanto a bacterias se identificó Escherichia coli, Pseudomona spp. y Salmonella cholerasuis. En cuanto a hongos se identificaron Candida tropicalis, Rhizopus stolonifer, Cladosporium sphaerospermum, Trichophyton rubrum, Penicillium spp., Cladosporum spp. y Phytophthora spp. De las 10 muestras procesadas se obtuvo la amplificación de dos muestras para Toxoplasma gondii, lo cual nos arroja un 20% de muestras positivas para este parásito. Conclusión: Los resultados preliminares de este estudio, demuestran el potencial zoonótico de la paloma doméstica

Epidemiology and patterns of tracheostomy practice in patients with acute respiratory distress syndrome in ICUs across 50 countries

Background: To better understand the epidemiology and patterns of tracheostomy practice for patients with acute respiratory distress syndrome (ARDS), we investigated the current usage of tracheostomy in patients with ARDS recruited into the Large Observational Study to Understand the Global Impact of Severe Acute Respiratory Failure (LUNG-SAFE) study. Methods: This is a secondary analysis of LUNG-SAFE, an international, multicenter, prospective cohort study of patients receiving invasive or noninvasive ventilation in 50 countries spanning 5 continents. The study was carried out over 4 weeks consecutively in the winter of 2014, and 459 ICUs participated. We evaluated the clinical characteristics, management and outcomes of patients that received tracheostomy, in the cohort of patients that developed ARDS on day 1-2 of acute hypoxemic respiratory failure, and in a subsequent propensity-matched cohort. Results: Of the 2377 patients with ARDS that fulfilled the inclusion criteria, 309 (13.0%) underwent tracheostomy during their ICU stay. Patients from high-income European countries (n = 198/1263) more frequently underwent tracheostomy compared to patients from non-European high-income countries (n = 63/649) or patients from middle-income countries (n = 48/465). Only 86/309 (27.8%) underwent tracheostomy on or before day 7, while the median timing of tracheostomy was 14 (Q1-Q3, 7-21) days after onset of ARDS. In the subsample matched by propensity score, ICU and hospital stay were longer in patients with tracheostomy. While patients with tracheostomy had the highest survival probability, there was no difference in 60-day or 90-day mortality in either the patient subgroup that survived for at least 5 days in ICU, or in the propensity-matched subsample. Conclusions: Most patients that receive tracheostomy do so after the first week of critical illness. Tracheostomy may prolong patient survival but does not reduce 60-day or 90-day mortality