Pairwise and incremental multi-stage alignment of metagenomes: A new proposal

Traditional comparisons between metagenomes are often performed using reference databases as intermediary templates from which to obtain distance metrics. However, in order to fully exploit the potential of the information contained within metagenomes, it becomes of interest to remove any intermediate agent that is prone to introduce errors or biased results. In this work, we perform an analysis over the state of the art methods and deduce that it is necessary to employ fine-grained methods in order to assess similarity between metagenomes. In addition, we propose our developed method for accurate and fast matching of reads.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Potencial exportador de Medellín en tercerización de servicios: retos y fortalezas del sector

The concepts of outsourcing and outsourcing have been equivocally assimilated. Both notions correspond to different phenomena. Outsourcing commits the delegation of processes from the production chain to third parties. On the other hand, outsourcing is a transition process through which a localized economy redirects the centralization of its efforts and productive factors, previously aimed at strengthening the primary and secondary sector, towards the promotion and development of the tertiary sector, better known as service sector. Colombia is not a foreign country to that reality. Although it is considered a Latin American economy based on efficiency1, the government, through the Productive Transformation Program, has dedicated resources aimed at involving private companies. The objective is to improve the benefits for exporting services, as well as boost the sector through training and investments that, when operating within the territory, strengthen research and bring with it the necessary and appropriate technology to provide greater and better value added to the scheme. OutsourcingLos conceptos de tercerización y terciarización han sido equívocamente asimilados. Ambas nociones corresponden a fenómenos diferentes. La tercerización compromete la delegación de procesos de la cadena productiva a terceros. Por otro lado, la terciarización es un proceso de transición mediante el cual una economía localizada redirecciona la centralización de sus esfuerzos y factores productivos, antes orientados a fortalecer el sector primario y secundario, hacia la promoción y el desarrollo del sector terciario, mejor conocido como sector servicios. Colombia no es un país ajeno a dicha realidad. Aunque es considerada una economía latinoamericana basada en eficiencia1, el gobierno, por medio del Programa de Transformación Productiva, ha dedicado recursos orientados a involucrar a la empresa privada. El objetivo es mejorar los beneficios para exportación de servicios, así como impulsar el sector por medio de capacitaciones e inversiones que, al operar dentro del territorio, fortalezcan la investigación y traigan consigo la tecnología necesaria y apropiada para brindar mayor y mejor valor agregado al esquema de tercerización

Diving inside a hairy black hole

We investigate the interior of the Einstein-Gauss-Bonnet charged black-hole with scalar hair. We find a variety of dynamical epochs, with the particular important feature that the Cauchy horizon is not present. This makes the violation of the no-hair theorem a possible tool to understand how might the strong cosmic censorship conjecture work.Fil: Grandi, Nicolás Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Salazar, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; Argentin

Fases de aprendizaje en el contexto de van Hiele para el concepto de continuidad local

El presente reporte articula el modelo educativo de van Hiele en su aspecto prescriptivo con la enseñanza de uno de los conceptos fundamentales del Análisis Matemático, continuidad local, a través de la implementación y el desarrollo de un Módulo de Aprendizaje que permite procesos de razonamiento en los estudiantes con el fin de promoverlos de un Nivel II a un Nivel III, el módulo es construido en correspondencia con los descriptores de fases para de dar cuenta de las estructuras mentales elaboradas. Posteriormente, en el análisis de cada uno de los tres casos, se describe en categorías en correspondencia los descriptores y donde se hace explícito como razonan los estudiantes en su paso del Nivel II al Nivel III respecto al concepto de continuidad local

Revisión sobre diferentes métodos de optimización basados en rough set theory

En los años recientes se han publicado diversos artículos relacionados con la técnica de optimización llamada: Conjuntos aproximativos o Rough Set Theory (RST) en sus diversos usos y aplicaciones. En este trabajo se realizó una revisión de diferentes artículos publicados entre los años del 2010 al 2016, sobre los diferentes métodos de optimización que utilizan RST, teoría de conjuntos difusos Fuzzy Sets (FS) y teoría de conjuntos suaves Soft Sets (SS). La revisión consideró las técnicas utilizadas, además, en cuáles han sido implementadas y las tendencias donde la metodología será utilizada en futuras investigaciones y publicaciones; haciendo énfasis en la optimización de búsquedas en sus diferentes tipos, mejoras en la obtención de resultados y reducción de atributos o tiempos de respuesta. La consulta se realizó en bases de datos científicas relacionados con RST, FS y SS, obteniendo 58 artículos base, donde se clasificaron y agruparon según la técnica utilizada. Se establece que el RST es una metodología bastante utilizada en diferentes áreas y procesos, validando que es una técnica útil para diferentes aplicaciones como la toma de decisiones, la minería de datos y predicciones, entre otros. Además, se encontró que es un tópico que está atrayendo la atención en diversas investigaciones como también que el RST asociado con algoritmos basados en el comportamiento de la naturaleza (BioMetainspirados), está tornándose en una gran tendencia, abriendo el campo de acción en alternativas de investigación con respecto a la optimización. De la información recolectada, se estableció un análisis comparativo de uso entre las diferentes técnicas encontradas y que interactúan con RST. A su vez, se resalta la capacidad de la teoría y su versatilidad para combinarse con diferentes técnicas y así aplicarse e implementarse en diversos procesos de optimización como se observará en el presente documento.Ingeniero de Sistemaspregrad

Diseño de un extensómetro para la medición del esfuerzo en las nanofibras de polímeros para uso biológico

El campo de la medicina se ha vuelto muy complejo ya que cada vez se hacen más necesarias nuevas tecnologías que garanticen la calidad de vida de las personas, el acceso de muchos laboratorios para obtener herramientas óptimas, se hace cada vez más exigente debido a los cambios tecnológicos, esto hace que las prácticas investigativas se desarrollaren eficazmente para bajar los costos de herramientas ya existentes y facilitar el acceso a ellas, de este modo los costos de la medicina bajan y el tratamiento de enfermedades se vuelve más seguro y así los beneficios pueden ser experimentados por muchas personas en el mundo. Teniendo en cuenta lo anterior, se hace referencia a las máquinas para la medición de la elongación de materiales aplicables a tejidos biológicos, ya que se consiguen en el extranjero a un costo elevado. Por esta razón, un desarrollo nacional baja notablemente los costos de adquisición, además de la disminución en los costos de mantenimiento, debido a que el conocimiento es desarrollado por los autores de este trabajo de grado. El desarrollo de este sistema es un valioso aporte al proyecto del instituto de investigación de materiales de la UNAM, sobre el prototipo de la válvula de “trileaflet” Poli (e-caprolactona) (PCL ya que se implementarían técnicas para el mejoramiento de tratamientos médicos

Workflows and service discovery: a mobile device approach

Bioinformatics has moved from command-line standalone programs to web-service based environments. Such trend has resulted in an enormous amount of online resources which can be hard to find and identify, let alone execute and exploit. Furthermore, these resources are aimed -in general- to solve specific tasks. Usually, this tasks need to be combined in order to achieve the desired results. In this line, finding the appropriate set of tools to build up a workflow to solve a problem with the services available in a repository is itself a complex exercise. Issues such as services discovering, composition and representation appear. On the technological side, mobile devices have experienced an incredible growth in the number of users and technical capabilities. Starting from this reality, in the present paper, we propose a solution for service discovering and workflow generation while distinct approaches of representing workflows in a mobile environment are reviewed and discussed. As a proof of concept, a specific use case has been developed: we have embedded an expanded version of our Magallanes search engine into mORCA, our mobile client for bioinformatics. Such composition delivers a powerful and ubiquitous solution that provides the user with a handy tool for not only generate and represent workflows, but also services, data types, operations and service types discoveryUniversidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Analyzing the differences between reads and contigs when performing a taxonomic assignment comparison in metagenomics

Metagenomics is an inherently complex field in which one of the primary goals is to determine the compositional organisms present in an environmental sample. Thereby, diverse tools have been developed that are based on the similarity search results obtained from comparing a set of sequences against a database. However, to achieve this goal there still are affairs to solve such as dealing with genomic variants and detecting repeated sequences that could belong to different species in a mixture of uneven and unknown representation of organisms in a sample. Hence, the question of whether analyzing a sample with reads provides further understanding of the metagenome than with contigs arises. The assembly yields larger genomic fragments but bears the risk of producing chimeric contigs. On the other hand, reads are shorter and therefore their statistical significance is harder to asses, but there is a larger number of them. Consequently, we have developed a workflow to assess and compare the quality of each of these alternatives. Synthetic read datasets beloging to previously identified organisms are generated in order to validate the results. Afterwards, we assemble these into a set of contigs and perform a taxonomic analysis on both datasets. The tools we have developed demonstrate that analyzing with reads provide a more trustworthy representation of the species in a sample than contigs especially in cases that present a high genomic variability.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Diseño de una metodología para la dirección de proyectos de inversión basados en el Project Management Institute (PMI) para las áreas del conocimiento del alcance, tiempo y costo

El presente trabajo reúne la documentación técnica y funcional necesaria para establecer un marco metodológico en la dirección de proyectos de inversión a través de la adaptación de los lineamientos señalados por la Guía Metodológica del Project Management Institute (PMI), en relación a las áreas del conocimiento, alcance mediante la elaboración de estudios técnicos y la identificación de datos de salida de los procesos que constituyen datos de entrada relacionados a los grupos de procesos de la gestión de proyectos, el presente documento exhibe las necesidades, alcance, herramientas y técnicas, funcionalidades y aspectos administrativos, técnicos y financieros requeridos para la dirección de los proyectos de inversió

Seriously, less taxes? Tax reform's effects over labor supply

Using a matching and a difference in differences approach we analyzed the impact of a payroll costs reduction implemented through a tax reform in Colombia on worked hours and hourly income -- Existing studies have found mixed results, while increases in wages are commonly found, the results for employment and worked hours effects are a source of debate with no consensus on sight -- However, in line with earlier revisions of literature, we concluded that the effect of payroll costs reductions is positive and significant on both, worked hours and income -- In this paper, using socioeconomic data from Colombia we found that those individuals a effected by a payroll cost reduction between 2012-2014 exhibited significant increases in both hours and income compared to similar individuals una effected by this framewor