Arthropod distribution in a tropical rainforest: tackling a four dimensional puzzle

Quantifying the spatio-temporal distribution of arthropods in tropical rainforests represents a first step towards scrutinizing the global distribution of biodiversity on Earth. To date most studies have focused on narrow taxonomic groups or lack a design that allows partitioning of the components of diversity. Here, we consider an exceptionally large dataset (113,952 individuals representing 5,858 species), obtained from the San Lorenzo forest in Panama, where the phylogenetic breadth of arthropod taxa was surveyed using 14 protocols targeting the soil, litter, understory, lower and upper canopy habitats, replicated across seasons in 2003 and 2004. This dataset is used to explore the relative influence of horizontal, vertical and seasonal drivers of arthropod distribution in this forest. We considered arthropod abundance, observed and estimated species richness, additive decomposition of species richness, multiplicative partitioning of species diversity, variation in species composition, species turnover and guild structure as components of diversity. At the scale of our study (2km of distance, 40m in height and 400 days), the effects related to the vertical and seasonal dimensions were most important. Most adult arthropods were collected from the soil/litter or the upper canopy and species richness was highest in the canopy. We compared the distribution of arthropods and trees within our study system. Effects related to the seasonal dimension were stronger for arthropods than for trees. We conclude that: (1) models of beta diversity developed for tropical trees are unlikely to be applicable to tropical arthropods; (2) it is imperative that estimates of global biodiversity derived from mass collecting of arthropods in tropical rainforests embrace the strong vertical and seasonal partitioning observed here; and (3) given the high species turnover observed between seasons, global climate change may have severe consequences for rainforest arthropods1012CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQSolVin-Solvay SA; Smithsonian Institution; Smithsonian Tropical Research Institute; United Nations Environment Programme; Smithsonian Institution; Smithsonian National Museum of Natural History; European Science Foundation (ESF); Global Canopy Programme; Czech Science foundation GACR grant; European Social Fund (ESF); Ministry of Education, Youth & Sports - Czech Republic; French National Research Agency (ANR); Research Council of Norway; Grant Agency of the Czech Republi

La théorie neutraliste de S. Hubbell (UNTB) appliquée à l'étude de plusieurs communautés de végétaux et d'insectes d'une forêt du Panamá

En 2001, Stephen Hubbell a formulé la théorie connue sous la nom de "Unified Neutral Theory of Biodiversity" (UNTB). Cette théorie cherche à prédire, selon un modèle neutraliste, les abondances spécifiques attendues dans une communauté écologique dépendant de certains paramètres. Dans ce travail, les principaux développements mathématiques de la théorie sont examinés et commentés. De plus, des essais d'estimations de paramètres sont effectués sur des données originales obtenues pour des végétaux et insectes d'une forêt proche de la côte caraïbe du Panamá

Investigation of Robust Keypoint Detection for Image Identification

Computer Vision can be traced back to 1960. Its aims are multiple, but are mostly organized around the automation of the cognitive abilities of the human brain and eye to process visual information. In particular, one goal of computer vision is the identification of objects in images, of images from the same scene, as well as the tracking of objects in videos (see Fig. 1.2). To this effect, keypoint detectors and keypoint descriptors are used

Structuration d’un écosystème pour la gestion d’un commun : le cas du parc bas carbone Atlantech

International audienceÀ travers une étude de cas unique, l’objectif de cet article est de comprendre comment les acteurs d’un écosystème se structurent autour d’un « paysage de pratiques » afin de gérer un commun d’innovation. S’inscrivant dans le projet de quartier bas carbone de l’agglomération rochelaise, ce cas analyse la gestion d’une démarche inter-organisationnelle autour de la transition énergétique et durable. La structuration de l’écosystème étudié est abordée par la littérature sur les « communautés de pratique » et les « proximités ». La démarche d’investigation empirique nous permet de révéler le fonctionnement de communautés de pratique pour la gestion d’un « commun intangible ». L’utilisation des proximités constitue un apport méthodologique pour la qualification des communautés de pratique et la restitution des capitaux de proximités des écosystèmes d’innovation

The use of herbarium specimens in DNA phylogenetics: Evaluation and improvement

During the last few years we have been confronted with the need to use herbarium specimens in the molecular phylogeny studies, since it is generally difficult to obtain living material of some rare species. Ancient DNA has been sequenced, and there are also reports on successful DNA amplification from herbarium specimens. However, it is not easy to obtain amplified DNA from the first herbarium sample tested. In this paper, experiments are described about trials of DNA amplification from two to 151-year-old herbarium specimens of plant species we needed for our projects. Of the 17 herbarium samples tested only two allowed DNA amplification under standard DNA isolation conditions. Different types of PCR inhibiting activities were demonstrated in DNA extracts. In some of the extracts there was extremely low concentration of template with satisfactory quality. In some instances, PCR inhibiting activities were successfully removed by treating them either with insoluble polyvinylpyrrolidone or by adding bovine serum albumin (BSA) to the amplification mixture. However, some PCR-inhibiting activities were resistant to the treatments described above. When the concentration of template was very low, a second PCR amplification with internal primers was necessary to increase the amount of DNA for sequencing. Nevertheless, contamination of either DNA extract or amplification mixture were sometimes observed, and consequently precautions were taken to minimize them. Finally, successful amplification was obtained in eight samples out of the 17 examined

RSE et numérique : une vision francophone

Ouvrage réalisé par la communauté académique réunie au sein de l’association pour le développement de l’enseignement et de la recherche en responsabilité sociale (ADERSE).International audienceChacun observe désormais une double mutation du management :• l’engagement opérationnel dans la responsabilité sociale des entreprises (RSE) ;• une maîtrise progressive des innovations numériques.Ces phénomènes s’imposent dans le quotidien des managers avec le visage du plus ancien des dieux romains: Janus le maître de la transformation. C’est pourquoi au cœur des crises, l’ADERSE a mobilisé une forte équipe de 33 chercheurs pluridisciplinaires pour dessiner les voies qui nous conduisent des conflits et contradictions à la conception et mise en œuvre de stratégies socialement responsables, pour une maîtrise du numérique selon une vision francophone qui est une constante historique de Lamartine à F. Perroux : « le dialogue au-delà de l’échange des objets ». Un parcours en trois étapes :• Que nous dit le terrain ?• Les impacts de la technique sur le social.• La RSE, une régulation pour le numérique.Avec la préface de V. Zardet (Past-Présidente de l’ADERSE) s’ouvre un inventaire structuré des réponses à cette somme de défis dont J.-M. Peretti brosse très concrètement les enjeux, les péripéties et les impacts sociétaux. L’articulation des approches successivement empiriques, analytiques et théoriques conduit le lecteur au diagnostic proposé par V. Fernandez et L. Draetta (co-directrices de la chaire Identité Numérique Responsable de l’Institut Polytechnique de Télécom Paris) : avec la RSE pour une éthique du numérique.Cet ouvrage est destiné à une large communauté : étudiants des universités et des grandes écoles, aux enseignants-chercheurs, aux techniciens experts, consultants, aux dirigeants et cadres des entreprises et plus globalement au citoyen curieux de mieux comprendre son époque