Análise da mutação R337H e TP53 em pacientes com carcinomas mamários

Orientador : Prof. Dr. Iglenir João CavalliCoorientadora : Profª. Drª. Enilze M. S. F. RibeiroDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 22/11/2016Inclui referências : f. 63-80Resumo: O câncer de mama é o tipo mais comum dos casos de câncer diagnosticados em adultos com mutações germinativas no gene TP53, representando 27% de todos os tipos de câncer que apresentam mutação nesse gene. O estudo do gene supressor de tumor TP53 possibilitou a identificação da mutação R337H TP53 que se caracteriza por codificar uma histidina no lugar de arginina (R337H), no exon 10 do gene TP53, no domínio de tetramerização da proteína p53. Esta mutação ocorre em 95% dos pacientes pediátricos do Sul do Brasil portadores de Tumor de Córtex Adrenal (TCA), sendo de 0,27% a sua frequência populacional. Em uma análise de 171.649 recém-nascidos do Estado do Paraná, as famílias de indivíduos com a mutação R337H TP53 foram analisadas, sendo observado que o câncer de mama foi o tipo mais frequente de neoplasia encontrada nos adultos, correspondendo a 14,55% dos casos. O objetivo principal deste trabalho foi verificar, através da técnica de discriminação alélica pelo sistema TaqMan e Sequenciamento de Sanger, a frequência da mutação R337H TP53 em uma amostra de DNA tumoral de 700 pacientes portadoras de carcinomas mamários atendidas nos Hospitais Nossa Senhora das Graças e de Clínicas de Curitiba, PR, e analisar a instabilidade genômica, por array-CGH, nas pacientes com (n=5) e sem (n=9) a mutação R337H TP53. Das 700 pacientes, onze eram heterozigotas para a mutação estudada, com frequência genotípica de 0,0157 e alélica de 0,0079. A frequência genotípica observada na amostra analisada foi demonstrada ser 5,93 vezes maior do que a descrita previamente (0,27%), em uma amostra de 171.649 recém-nascidos do Estado do Paraná, indicando a relevância desta mutação na carcinogênese mamária. Após a comparação dos dados clínicos histopatológicos das pacientes com e sem a mutação, foi observada diferença estatisticamente significativa entre as médias de idade dos dois grupos de pacientes (t=1,97; P<0,05), tendo as pacientes com a mutação uma média de idade ao diagnóstico inferior (46,54 ± 14,53 anos) quando comparado com o grupo sem a mutação (55,47 ± 14,96 anos). Os resultados de análise de a-CGH no DNA das pacientes estudadas demonstrou nenhuma diferença estatisticamente significativa entre as médias das alterações cromossômicas (ganhos, perdas e total) observadas nos dois grupos de pacientes, indicando que a mutação R337H TP53 não contribui significativamente para a instabilidade genômica nas pacientes com câncer de mama portadoras dessa mutação. Palavras-chave: Câncer de mama. TP53. R337H. Genotipagem. Instabilidade genômicaAbstract: Breast cancer is the most common cancer type diagnosed in adults with germline mutations in the TP53 gene, accounting for 27% of all of those cancers. The study of TP53 tumor supressor gene allowed the identification of R337H TP53 mutation in exon 10, resulting in an arginine-to-histidine amino acid substitution in the dimerization domain of the p53 protein. This mutation occurs in 95% of pediatric patients with adrenocortical tumors (ACT) in South of Brazil, reaching a frequency of 0.27% in this population. In a populational study involving 171.649 newborns of Paraná state, families of individuals carrying the R337H TP53 mutation were analyzed, and breast cancer was the most common type of malignancy found in this cohort (14.55%)The aim of this study was to verify, through genotyping techniques as TaqMan assay and Sanger Sequencing, the frequency of the R337H TP53 mutation in a cohort of 700 patients with breast carcinoma collected in two Institutions (Hospital Nossa Senhora das Graças and Hospital de Clínicas) from Curitiba, Paraná, and to analyze genomic instability, using array-CGH, in patients with (n=5) or without the R337H TP53 mutation (n=9). In this cohort, eleven patients were identified as heterozygous for the R337H TP53 mutation giving a genotypic frequency of 0.0157 and an allelic frequency of 0.0079. The genotypic frequency observed in this study was 5.93 times higher than the one described previously in a sample of 171.649 newborns of Paraná, implying the relevance of this mutation in breast carcinogenesis. After comparing the histopathological and clinical data of patients with and without the mutation, it was observed a statistically significant difference between the mean age of both groups (t = 1.97, P <0.05), where patients with the mutation exhibit a lower average age (46.54 ± 14.53 years) at diagnosis when compared with the group without the mutation (55.47 ± 14.96 years). CGH analysis reveal no statistically significant difference between the mean changes (chromosome gains, losses and total) observed in both groups of patients, indicating that the mutation R337H TP53 does not significantly contribute to chromosomal instability in patients with breast cancer. Keywords: Breast cancer; R337H, TP53, Genotyping, Genomic Instabilit

Análise da mutação R337H TP53 em pacientes com carcinomas mamários esporádicos

Orientador: Enilze Maria de Souza Fonseca RibeiroCo-orientador: Iglenir João CavalliMonografia (Bacharelado) - Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Curso de Graduação em Ciências Biológica

Synchronization on a limit cycle of multi-agent systems governed by discrete-time switched affine dynamics

This paper addresses the problem of synchronizing a group of interacting discrete-time switched affine systems with centralized control laws. A first time-dependent control law is obtained directly, and then, two other state-dependent control laws are proposed to improve performance. The different methods are based on recent literature on switched affine systems and are evaluated on an academical example with a multi-agent system

Tratamento Precoce Da Oligodontia Não-sindrômica: Relato De Caso Clínico

This report aims to describe the clinical case of a 10-year-old male patient (R.C.B.C.), presenting nonsyndromic oligodontia with maternal family trait and absence of 22 permanent teeth. Clinically, the patient had prolonged retention of some primary teeth and presence of permanent maxillary left central incisor, permanent mandibular right central incisor and four first permanent molars. Radiographically, only permanent maxillary second molars and mandibular third molars were developing, whereas all other germs of permanent teeth were missing. Treatment consisted of maxillary expansion followed by moving permanent maxillary left central incisor bucco-mesially, and rehabilitation of spaces with removable denture, where the main goal was to restore function and esthetic harmony. The case has been monitored for the past six years. Nonsyndromic oligodontia is a rare condition that poses significant functional and psychosocial difficulties. Treatment usually requires a multidisciplinary approach among which pediatric dentistry and orthodontics play a major role. In view of its complexity, treatment should be initiated as early as possible to minimize future functional and aesthetic issues. Dental implants are considered as definitive treatment of cases of oligodontia, however, until the patient reached the ideal age, other treatments to ensure aesthetics and function must be performed.33123223

Collaborative design in virtual environments

How can architects and engineers work together in the digital world? The article "Collaborative Design in Virtual Environments" provides an answer. The authors describe how the use of virtual reality (VR) and augmented reality (AR) is becoming increasingly important in the architecture industry and what opportunities this opens up. In particular, the article focuses on collaboration in virtual spaces and collaborative modeling of 3D objects. The authors also present a software tool that enables collaborative 3D modeling in virtual environments. The aim of the "Industry 4.0 in Teaching" project is to promote collaboration and joint learning and to prepare students for the requirements of the digital working world. (Editor)Wie können Architekten und Ingenieure in der digitalen Welt zusammenarbeiten? Eine Antwort darauf liefert der Artikel "Collaborative Design in Virtual Environments". Die Autoren beschreiben, wie die Anwendung von Virtual Reality (VR) und Augmented Reality (AR) in der Architekturbranche immer wichtiger wird und welche Möglichkeiten sich daraus ergeben. Insbesondere die Zusammenarbeit in virtuellen Räumen und die gemeinsame Modellierung von 3D-Objekten stehen im Fokus des Artikels. Die Autoren stellen außerdem ein Software-Tool vor, das die kollaborative 3D-Modellierung in virtuellen Umgebungen ermöglicht. Das Ziel des Projekts "Industry 4.0 in Teaching" ist es, die Zusammenarbeit und das gemeinsame Lernen zu fördern und die Studierenden auf die Anforderungen der digitalen Arbeitswelt vorzubereiten. (Herausgeber

Model Pengembangan UMKM Berbasis Triple Helix: Tendensi Peran Akademisi Perguruan Tinggi

The importance of the role of Triple Helix for the development of MSMEs is one of the bases for this research. By taking a location in Kairatu District, West Seram Regency (SBB), it is expected to be able to produce a Triple Helix Model in the development of MSMEs in Kairatu District. The type of research conducted is qualitative research using the questionnaire method with Triple helix actors, namely academics, business, and government, which play a role in the development of MSMEs in Kairatu District. As a result, a comprehensive study can be obtained in building an integrated Triple Helix Model in the development of MSMEs. The study results show that Kairatu Sub-district has the potential of MSMEs that can develop and be sustainable through the synergy of the Triple Helix elements of government, academia and business. The role of academics in higher education must continue to improve the quality and quantity of MSMEs to be competitive and survive in the present and future

Estruturas fractais em sistemas hamiltonianos caóticos com aplicações em física de plasmas

Orientador: Prof. Dr. Ricardo Luiz VianaTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Exatas, Curso de Pós-Graduação em Física. Defesa: Curitiba, 18/08/2017Inclui referências : f. 94-99Resumo: Neste trabalho investigamos algumas propriedades do transporte de partículas em sistemas dinâmicos caóticos descritos a partir de um modelo de ondas de deriva e pelo mapa de Martin-Taylor. Em ambos casos estudados, a não uniformidade das regiões caóticas que aparecem nos espaços de fase é uma consequência do aparecimento de estruturas complexas de órbitas caóticas em sistemas dinâmicos. Essas estruturas são governadas pelo emaranhado homoclínico formado pelas intersecções das variedades invariantes provenientes de órbitas periódicas instáveis embutidas nas órbitas caóticas. Devido ao movimento das variedades, as trajetórias caóticas se tornam sensíveis às condições iniciais, ou seja, uma pequena perturbação pode levar uma órbita a escapar através de uma diferente saída, prejudicando a capacidade de prever o futuro do sistema. Em sistemas abertos, as trajetórias das partículas escapam para regiões bem definidas dos espaços de fase, desse modo determinamos as bacias de escape. A bacia de escape é formada por uma região do espaço de fase definida pelo conjunto de condições iniciais que escapam, ou deixam, determinada região do espaço de fase. Em modelos para tokamaks, a parede da câmara de confinamento é uma saída do espaço de fase para órbitas da borda do plasma. Quantificamos a fractalidade das fronteiras das bacias de escape, através da dimensão da fronteira fractal da bacia de duas saídas. A entropia da bacia e a entropia da fronteira da bacia, foram calculadas para verificarmos o quanto as bacias estão entrelaçadas. No caso das bacias de escape com três saídas, averiguamos a existência da propriedade de Wada, onde qualquer ponto que está sobre a fronteira de uma bacia de escape estará também simultaneamente sobre a fronteira das outras bacias. Quantificamos as bacias de Wada, aplicando o método da grade para verificarmos o quanto a propriedade está satisfeita nos sistemas. Palavras chave: Física de Plasma, Sistemas Hamiltonianos, Ondas de Deriva, Mapa Martin- TaylorAbstract: In this work we investigated some properties of particle transport in chaotic systems described using a model of drift waves and by the Martin-Taylor maps. In both cases studied, the non-uniformity of the chaotic regions appearing in the phase space is a consequence of the appearance of complex structures of chaotic orbits in dynamic systems. These structures are governed by the homoclinic tangled formed by the intersections of the invariant manifolds stemming from unstable periodic orbits embedded in the chaotic orbits. Due to the motion of the manifolds, the chaotic trajectories become sensitive to the initial conditions, that is, a small perturbation can cause an orbit to escape through a different exit, impairing the ability to predict the future of the system. In open systems, the trajectories of the particles escape into well defined regions of the phase space, thus determining the basins of escape. They are formed by a region of the phase space defined by the set of initial conditions that escape, or exit, a certain region of the phase space. In models for tokamaks, the confinement chamber wall is an exit region of the phase space for orbits in the plasma edge. We quantify the fractality of the escape basin boundaries, through the fractal boundary dimension of the two basins of escape. The basin entropy and the boundary basin entropy were calculated to verify how much the basins are intertwined. In the case of the three basins of escape, we investigate the existence of the Wada property, where any point on the boundary of an basins of escape will also be simultaneously over the boundary of the other basins of escape. We quantify the Wada basins by applying the grid approach technique to verify how much property is satisfied in the systems. Keywords: Plasma Physics, Hamiltonian Systems, Drift Waves, Martin-Taylor Ma

lncRNAs in Hallmarks of Cancer and Clinical Applications

Long noncoding RNAs (lncRNAs) are transcripts longer than 200 nucleotides in length that, in general, do not appear to have protein-coding potential. lncRNAs act in gene regulation involved with several biological processes. Furthermore, lncRNAs have been associated with a significant number of cancers, suggesting a potential role in tumorigenesis and progression. For example, HOTAIR regulates proliferation processes and other lncRNAs like highly upregulated in liver cancer (HULC), H19, PTENP1, HEIH, and antisense noncoding RNA in the INK4 locus (ANRIL). Other lncRNAs as AFAP1-AS1 and lincRNA-p21 can interact with BCL-2 and TP53, acting in apoptosis. Moreover, NORAD plays a vital role in genomic stability. Additionally, due to deregulated expression and high tissue specificity level, lncRNAs exhibit great potential as prognostic markers. In this chapter, we review the most highlighted lncRNAs acting in hallmarks of cancer and clinical application

O uso das novas tecnologias para a busca de material didático no ensino de língua francesa

-O sistema virtual oferece inúmeras alternativas interessantes e relevantes para o professor de língua estrangeira, no caso a língua francesa, no quesito formação de material pedagógico. Todavia, também se constata grande dificuldade em se mapear sites dessa natureza – que apresentem exercícios específicos do conteúdo a ser ministrado, não somente na estrutura padrão de folhas impressas, mas também dentro da lógica interativa que o sistema virtual permite –, saber buscá-los e arquivá-los para futuras consultas, em função de suas constantes atualizações e transformações. Sites assim são criados, na rede, quase que mensalmente. Acompanhar de forma total essa produção é uma tarefa impossível para o professor-pesquisador. Assim como, saber selecionar o que tem e não tem relevância para ser utilizado em sala de aula, saber diferenciar os níveis de aprendizado para cada site, ou cada sub-setor do site, exige tempo e familiaridade com o tema e com o meio utilizado. O projeto pretendeu, assim, iniciar um trabalho de mapeamento do maior número possível – dentro do limite de tempo de sua realização – de sites de teor de construção-formação-criação de material pedagógico em língua francesa, analisá-los e estabelecer critérios para a sua utilização em sala de aula e/ou para estudo individualizado do aluno