Estudo da variação ontogenética do veneno de Bothrops atrox por análise proteômica e peptidômica: Identificação de peptídeos potencializadores de bradicinina

Tese apresentada à Universidade Federal de Rondônia - UNIR, para a obtenção do título de Doutor em Biologia Experimental pelo Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental.Os acidentes com serpentes na Amazônia são causados na sua maioria, cerca de 90%, por Bothrops atrox, com rápida evolução hemorrágica e morte tecidual. A caracterização ontogenética dos espécimes estudados mostram a relevância do acidente ofídico negligenciado, que produz indivíduos com sequelas ou danos físicos irreparáveis pela ineficácias das terapias utilizadas atualmente. Deste modo, a compreensão das diferenças moleculares entre os venenos de serpentes de uma determinada região geográfica, no caso Porto Velho-RO, são de extrema importância na prepação de bioativos antiofídicos para diminuir os danos e sintomas fisiológicos que a peçonha de serpente causa. Por outro lado, as diferenças protéicas podem contribuir para a descoberta de protótipos de interesse biológico e/ou da medicina. Neste trabalho investigamos a possível variação ontogenética dos venenos de Bothrops atrox (adultas, jovens e de filhotes na localidade de Porto Velho-RO) por cromatografia de fase reversa em coluna C-18, cromatografia de exclusão molecular, eletroforese mono e bidimensional, espectrometria de massa (MALDI) e atividades biológicas: miotóxica, hemolítica, hemorrágica, pró-coagulante e coagulante; evidenciando-se a variação ontogenética dos espécimes desta região da Amazônia brasileira. Os venenos de jovens e filhotes analisados apresentaram maior atividade fosfolipásica (hemolítica), hemorrágica, miotóxica, coagulante e atividade pró-coagulante sobre substrato cromogênico, em relação aos indivíduos adultos. As proteínas do veneno desta espécie, apareceram em géis bidimensionais, em condições não redutoras, com bandas protéicas nas faixas moleculares de 92, 52, 37 e 21 kDa. Os perfis cromatográficos destes venenos, monstraram variações quanto aos tempos de retenção e proteínas expressas nas amostras, diferenciando-se dos demais perfis de Bothrops atrox já estudados, avalizando a variação geográfica e ontogenética que ocorre com o gênero Bothrops distribuído por toda Amazônia legal. Identificou-se por homologia quatro novos peptídeos potencializadores de bradicinina (BPPs), nos venenos de B. atrox Adulta e Jovem, os quais apresentaram massas de 691,21; 1074,99; 1116,54; 1146,55 e 1384,7386 m/z, sendo o BPP de maior massa sequenciado por sequenciamento de novo, para o qual obteve-se os seguintes resíduos de aminoácidos: ZKWPRPGPEIPP, denominado de BAX12

Modelling the test, trace and quarantine strategy to control the COVID-19 epidemic in the state of São Paulo, Brazil.

Testing for detecting the infection by SARS-CoV-2 is the bridge between the lockdown and the opening of society. In this paper we modelled and simulated a test-trace-and-quarantine strategy to control the COVID-19 outbreak in the State of São Paulo, Brasil. The State of São Paulo failed to adopt an effective social distancing strategy, reaching at most 59% in late March and started to relax the measures in late June, dropping to 41% in 08 August. Therefore, São Paulo relies heavily on a massive testing strategy in the attempt to control the epidemic. Two alternative strategies combined with economic evaluations were simulated. One strategy included indiscriminately testing the entire population of the State, reaching more than 40 million people at a maximum cost of 2.25 billion USD, that would reduce the total number of cases by the end of 2020 by 90%. The second strategy investigated testing only symptomatic cases and their immediate contacts - this strategy reached a maximum cost of 150 million USD but also reduced the number of cases by 90%. The conclusion is that if the State of São Paulo had decided to adopt the simulated strategy on April the 1st, it would have been possible to reduce the total number of cases by 90% at a cost of 2.25 billion US dollars for the indiscriminate strategy but at a much smaller cost of 125 million US dollars for the selective testing of symptomatic cases and their contacts

Análise de tendência para dados pluviométricos no município de Toritama-PE

As mudanças atmosféricas ocasionadas pelo processo de desenvolvimento e industrialização afetam diretamente o ciclo hidrológico. A detecção de tendências em séries temporais de dados hidrológicos é de grande importância científica e prática para a gestão dos recursos hídricos. O objetivo deste estudo é averiguar as tendências e as flutuações ao longo do tempo das variáveis climatológicas (precipitação diária máxima anual; precipitação total anual; dias sem chuva; e precipitação das estações do ano) no município de Toritama-PE. Foi utilizado o teste Mann-Kendall e o estimador Sen’s Slope (?) para determinar a existência de tendência e sua magnitude. Para identificar flutuações nas tendências ao longo do tempo e para detectar os possíveis pontos de mudança na série de chuvas se utilizou o teste sequencial de Mann-Kendall. O teste não paramétrico de Mann-Kendall demonstrou não haver mudança significativa ao nível de 5% nas chuvas em estudo, havendo apenas uma tendência negativa no número de dias sem chuva (decrescimento de 0,75 dia/ano) causada, possivelmente, por influência da La Niña. Segundo o teste sequencial Mann-Kendall, o início do decaimento da atividade pluviométrica coincidiu com o ano do aumento das atividades antrópicas na região

Modelo de arquitetura para sistema de divulgação dos pontos turísticos da região Sul do Maranhão / Software architecture model to promote natural tourist places in the Southern Maranhão Region

A região sul do Maranhão possui uma rica biodiversidade e recursos naturais abundantes os quais possuem um elevado potencial bioeconômico. Contudo, a região não possui muitas tecnologias que ajudem na divulgação de tais riquezas naturais e sua utilização sustentável. Visando promover a difusão do conhecimento a respeito desses recursos naturais, o presente trabalho propõe um modelo de arquitetura para a criação de sistemas de software voltados à divulgação de recursos naturais e promoção do ecoturismo na região. O sistema oferece funcionalidades tais como: localização, infraestrutura e acesso aos pontos turísticos e trilhas que dão acesso a diversos ecossistemas; localização dos pontos de produção e venda de especiarias obtidas a partir de recursos naturais da região; mapas dos principais pontos turísticos e dos locais ainda não tão explorados para o ecoturismo, entre outras funcionalidades. Outrossim, este trabalho visa promover o uso sustentável desses recursos e a difusão da cultura sul-maranhense através do desenvolvimento do turismo regional, a preservação dos recursos naturais, a promoção da bioeconomia e do desenvolvimento sustentável

Management of traumatic superficial palmar arch pseudoaneurysm: a therapeutic challenge

Abstract Pseudoaneurysm of the palmar arch is a rare entity. Diagnosis is dependent on high clinical suspicion. We present a case referred to the emergency department, with a history of glass penetrating trauma to the palmar surface with a pulsatile mass and jet bleeding. Doppler ultrasound evidenced a partially thrombosed pseudoaneurysm. A CT angiography examination showed a saccular formation arising from the superficial palmar arch. A conventional surgical approach was indicated. A clinical suspicion must be ventured to arrive at the correct diagnosis. Imaging modalities are needed to identify the pseudoaneurysm and plan the treatment course. Nonetheless, the sequence of diagnosis is individual, because further evaluation with different imaging methods may not change the rationale for the intervention. In our experience, conventional surgical removal is preferable, due to its safety and well-established outcomes

Avaliação de modelos probabilísticos para chuvas intensas nas mesorregiões do estado de Pernambuco

O presente trabalho tem como objetivo avaliar como as distribuições de variáveis aleatórias de Gumbel, Log-Normal de dois parâmetros, Generalizada de Valores Extremos, Fréchet máximos, Weibull com dois e três parâmetros, Gama, Pearson tipo III e Log-Pearson tipo III se ajustam aos eventos de precipitação máxima diária anual (PMDA), em cada mesorregião do estado de Pernambuco. Foi utilizada uma série de PMDA para cada mesorregião pernambucana, a partir de dados obtidos na APAC e na ANA. Para avaliar a qualidade de aderência das distribuições, foram utilizados os testes de aderência de Anderson Darling (AD), Kolmogorov-Smirnov (KS), o teste Qui-Quadrado de Pearson (?2) e o coeficiente de determinação (R2). O Método da Verossimilhança apresentou uma melhor qualidade de ajuste que o Método dos Momentos. A distribuição de Log-Pearson tipo III obteve o melhor ajuste para as mesorregiões da Zona da Mata e do Agreste, enquanto que a distribuição de Pearson tipo III obteve melhor aderência ao Sertão e ao São Francisco, e a Região Metropolitana do Recife a distribuição Generalizada de Valores Extremos foi a que obteve a melhor aderência. Dentre os testes de aderência utilizados o teste do Qui-Quadrado de Pearson foi considerado o mais restritivo

PLUVIOMETRIA ESPAÇO-TEMPORAL DA BACIA HIDROGRÁFICA DO UNA: Spatial-temporal pluviometry of the Una Basin

The Una River Basin holds a diversified rainfall regime. Due to the extension of this Basin, it is inserted in two mesoregions of the Pernambuco state (Zona da Mata and Agreste), which present different climatic patterns. In this context, this research aims to analyze the space-time rainfall behavior in the Una River Basin. This evaluation was carried out through the analysis of homogeneity by the K-Mean algorithm, filling of lacks with the regional vector and spatialization of the average monthly and annual data with the IDW algorithm. According to the monthly rainfall regimen the Cluster K-Mean algorithm coherently determined four clusters in the Una River basin. Regarding the pluviometric lacks, the regional vector method showed good results in the filling of monthly lacks. The double mass curve allowed the perception of consistency of the annual rainfall data. A great variability was observed in the spatialization of the annual total precipitations and of the months considered humid, from which the rainfall decreases in the East-West direction (inversely to the altitude).A Bacia Hidrográfica do Rio Una detém de um regime pluviométrico diversificado. Graças a sua extensão ela está inserida em duas mesorregiões Pernambucanas (Zona da Mata e Agreste) que apresentam padrões climáticos distintos. Nesse contexto, essa pesquisa visa analisar o comportamento pluviométrico espaço-temporal na Bacia Hidrográfica do Rio Una, por meio de uma análise de homogeneidade pelo algoritmo K-Mean, preenchimento de falhas com o vetor regional e espacialização dos dados médios mensais e anuais com o algoritmo do IDW. De acordo com o regime pluviométrico mensal o algoritmo Cluster K-Mean determinou coerentemente quatro clusters na Bacia hidrográfica do Rio Una. Quanto ao preenchimento de falhas pluviométricas, o método do vetor regional demonstrou bons resultados no preenchimento de falhas mensais. Com a curva de dupla massa, foi possível perceber consistência dos dados pluviométricos anuais. Na espacialização foi constatada uma grande variabilidade nas precipitações totais anuais e nos meses considerados úmidos, dos quais detêm a magnitude pluviométrica decrescente na direção Leste-Oeste (inversamente a altitude)

In vivo antimalarial activity and mechanisms of action of 4-nerolidylcatechol derivatives

4-Nerolidylcatechol (1) is an abundant antiplasmodial metabolite that is isolated from Piper peltatum roots. O-Acylation or O-alkylation of compound 1 provides derivatives exhibiting improved stability and significant in vitro antiplasmodial activity. The aim of this work was to study the in vitro inhibition of hemozoin formation, inhibition of isoprenoid biosynthesis in Plasmodium falciparum cultures, and in vivo antimalarial activity of several 4-nerolidylcatechol derivatives. 1,2-O,O-Diacetyl-4-nerolidylcatechol (2) inhibited in vitro hemozoin formation by up to 50%. In metabolic labeling studies using [1-(n)-3H]geranylgeranyl pyrophosphate, diester 2 significantly inhibited the biosynthesis of isoprenoid metabolites ubiquinone 8, menaquinone 4, and dolichol 12 in cultures of P. falciparum 3D7. Similarly, 2-O-benzyl-4-nerolidylcatechol (3) significantly inhibited the biosynthesis of dolichol 12. P. falciparum in vitro protein synthesis was not affected by compounds 2 or 3. At oral doses of 50 mg per kg of body weight per day, compound 2 suppressed Plasmodium berghei NK65 in infected BALB/c mice by 44%. This in vivo result for derivative 2 represents marked improvement over that obtained previously for natural product 1. Compound 2 was not detected in mouse blood 1 h after oral ingestion or in mixtures with mouse blood/blood plasma in vitro. However, it was detected after in vitro contact with human blood or blood plasma. Derivatives of 4-nerolidylcatechol exhibit parasite-specific modes of action, such as inhibition of isoprenoid biosynthesis and inhibition of hemozoin formation, and they therefore merit further investigation for their antimalarial potential. Copyright © 2015, American Society for Microbiology. All Rights Reserved

Reducing the global burden of cerebral venous thrombosis:An international research agenda

Background:Due to the rarity of cerebral venous thrombosis (CVT), performing high-quality scientific research in this field is challenging. Providing answers to unresolved research questions will improve prevention, diagnosis, and treatment, and ultimately translate to a better outcome of patients with CVT. We present an international research agenda, in which the most important research questions in the field of CVT are prioritized.Aims:This research agenda has three distinct goals: (1) to provide inspiration and focus to research on CVT for the coming years, (2) to reinforce international collaboration, and (3) to facilitate the acquisition of research funding.Summary of review:This international research agenda is the result of a research summit organized by the International Cerebral Venous Thrombosis Consortium in Amsterdam, the Netherlands, in June 2023. The summit brought together 45 participants from 15 countries including clinical researchers from various disciplines, patients who previously suffered from CVT, and delegates from industry and non-profit funding organizations. The research agenda is categorized into six pre-specified themes: (1) epidemiology and clinical features, (2) life after CVT, (3) neuroimaging and diagnosis, (4) pathophysiology, (5) medical treatment, and (6) endovascular treatment. For each theme, we present two to four research questions, followed by a brief substantiation per question. The research questions were prioritized by the participants of the summit through consensus discussion.Conclusions:This international research agenda provides an overview of the most burning research questions on CVT. Answering these questions will advance our understanding and management of CVT, which will ultimately lead to improved outcomes for CVT patients worldwide