Branched-chain amino acid database integrated in MEDIPAD software as a tool for nutritional investigation of mediterranean populations

Branched-chained amino acids (BCAA) are essential dietary components for humans and can act as potential biomarkers for diabetes development. To efficiently estimate dietary intake, we developed a BCAA database for 1331 food items found in the French Centre d'Information sur la Qualité des Aliments (CIQUAL) food table by compiling BCAA content from international tables, published measurements, or by food similarity as well as by calculating 267 items from Greek, Turkish, Romanian, and Moroccan mixed dishes. The database embedded in MEDIPAD software capable of registering 24 h of dietary recalls (24HDR) with clinical and genetic data was evaluated based on archived 24HDR of the Saint Pierre Institute (France) from 2957 subjects, which indicated a BCAA content up to 4.2 g/100 g of food and differences among normal weight and obese subjects across BCAA quartiles. We also evaluated the database of 119 interviews of Romanians, Turkish and Albanians in Greece (27⁻65 years) during the MEDIGENE program, which indicated mean BCAA intake of 13.84 and 12.91 g/day in males and females, respectively, comparable to other studies. The MEDIPAD is user-friendly, multilingual, and secure software and with the BCAA database is suitable for conducting nutritional assessment in the Mediterranean area with particular facilities for food administration

A systems-wide understanding of photosynthetic acclimation in algae and higher plants

The ability of phototrophs to colonise different environments relied on the robust protection against oxidative stress in phototrophs, a critical requirement for the successful evolutionary transition from water to land. Photosynthetic organisms have developed numerous strategies to adapt their photosynthetic apparatus to changing light conditions in order to optimise their photosynthetic yield, crucial for life to exist on Earth. Photosynthetic acclimation is an excellent example of the complexity of biological systems, in which highly diverse processes, ranging from electron excitation over protein protonation to enzymatic processes coupling ion gradients with biosynthetic activity interact on drastically different timescales, ranging from picoseconds to hours. An efficient functioning of the photosynthetic apparatus and its protection is paramount for efficient downstream processes including metabolism and growth. Modern experimental techniques can be successfully integrated with theoretical and mathematical models to promote our understanding of underlying mechanisms and principles. This Review aims to provide a retrospective analysis of multidisciplinary photosynthetic acclimation research carried out by members of the Marie Curie Initial Training Project “AccliPhot”, placing the results in a wider context. The Review also highlights the applicability of photosynthetic organisms for industry, particularly with regards to the cultivation of microalgae. It aims to demonstrate how theoretical concepts can successfully complement experimental studies broadening our knowledge of common principles in acclimation processes in photosynthetic organisms, as well as in the field of applied microalgal biotechnology

Amylose AL (contribution aux études cliniques et thérapeutiques et à la modélisation expérimentale)

Les amyloses appartiennent au groupe des maladies conformationnelles des protéines. Les mécanismes de la fibrillogénèse sont de mieux en mieux compris grâce à l utilisation de peptides capables de former des fibrilles mais également des microcristaux dont la structure est proche. Dans l amylose AL les dépôts sont formés de chaînes légères (et exceptionnellement de chaînes lourdes) monoclonales d immunoglobuline. La population B à l origine de la production des chaînes légères est le plus souvent plasmocytaire dans le cadre d une immunoglobuline monoclonale isolée ou d un myélome de stade I n évoluant pratiquement jamais vers un myélome de forte masse tumorale. Le traitement repose essentiellement sur les chimiothérapies visant à supprimer la production de la chaîne légère monoclonale. Nous présentons les résultats d un essai clinique multicentrique définissant le meilleur traitement actuel de première ligne et les voies d élaboration de modèles murins d amylose AL ainsi que l exploration de 2 voies originales d immunothérapie. Nous proposons une hypothèse expliquant la non évolutivité des proliférations plasmocytaires associées aux amyloses AL.LIMOGES-BU Médecine pharmacie (870852108) / SudocSudocFranceF

Régulation de l'expression des chaînes lourdes d'immunoglobulines (structure de la région 3' flanquante du locus)

LIMOGES-BU Sciences (870852109) / SudocSudocFranceF

Régulation concertée de l'expression des chaînes d'immunoglobulines et conséquences de ses anomalies en pathologie

La théorie de la sélection clonale postule que les lymphocytes B apparaissent en périphérie munis d'un récepteur unique capable de reconnaître et d'être activé spécifiquement par un antigène donné. Cette spécificité requiert une régulation fine et concertée de l'expression des deux loci de chaînes d'immunoglobulines. Les phénomènes d'exclusion allélique garantissent théoriquement l'expression par un clone donné d'un seul de ces loci et jouent donc un rôle majeur pour conditionner la réponse B à la stimulation d'un récepteur unique clonal. Même lorsque des réarrangements aberrants ont inactivé l'un de ces loci, il est important que l'expression du locus non fonctionnel n'aboutisse pas à la synthèse de protéines tronquées, susceptibles de perturber l'assemblage du BCR. Nous avons étudié ces phénomènes d'exclusion dans des situations physiologiques et nous nous sommes aussi intéressés à des pathologies au cours desquels la production excessive d'une chaîne légère joue un rôle pathogéniqueLIMOGES-BU Sciences (870852109) / SudocSudocFranceF

Vers l'utilisation des Immunoglobulines A humaines ou de leurs variants à des fins thérapeutiques

Parmi le nouvel ordre de médicaments représenté par les anticorps monoclonaux, la classe des immunoglobulines G occupe une place écrasante mais commence à révéler quelques limitations. Afin d'essayer de dépasser d'une façon originale ces limites, il nous est apparu judicieux de nous consacrer à une classe d'anticorps jusqu'ici peu étudiée sous l'angle d'applications thérapeutiques éventuelles : les IgA. Cette classe présente en effet des caractéristiques différentes et ainsi potentiellement complémentaires de celles des IgG. L'IgA est l'immunoglobuline la plus abondamment synthétisée dans l'organisme. Elle présente de plus un tropisme préférentiel pour les muqueuses, qui en fait un candidat médicament particulièrement intéressant pour cibler les nombreuses tumeurs à localisation muqueuse. Un autre argument plaidant pour le développement d'anticorps IgA thérapeutiques réside dans la récente mise en évidence du potentiel anti-tumoral des neutrophiles via une cytotoxicité médiée par le récepteur des IgA (FcaRI / CD89). Le travail présenté dans ce manuscrit concerne principalement l'évaluation in vitro et en phase 0 (à l'aide de modèles animaux) d'anticorps monoclonaux de classe IgA spécifiques de l'antigène CD20 (exprimé par la majorité des lymphomes B humains). Dans ce cadre, nous avons aussi étudié la fonction de divers glycanes portés par la chaîne lourde de l'IgA afin d'évaluer la possibilité de leur élimination au sein d'IgA variantes, dont la production et la caractérisation pourrait être facilitées. Ce travail identifie ainsi des modifications de la glycosylation potentiellement responsables de la formation de dépôts rénaux en cas d'administration in vivo. Il identifie aussi des variants hypoglycosylés des IgA gardant une innocuité apparente in vivo et dont les propriétés fonctionnelles sont intactes.Among the new order of drugs represented by monoclonal antibodies, IgG occupies an overwhelming land but begins to reveal some limitations. To try to overcome in an original way these limitations, we thought it wise to devote ourselves to a class of antibodies so far little studied in terms of potential therapeutic applications : IgA. IgA indeed has different characteristics and thus potentially complementary to those of IgG. IgA is the immunoglobulin most abundantly synthesized in the body. It has also a preferential tropism for mucous, making it a "candidate drug" of particular interest to target localization in many tumor mucosa. Another argument for the development of therapeutic antibodies IgA is the recent demonstration of anti-tumor potential of cytotoxicity mediated by neutrophils via the receptor for IgA (FcaRI / CD89). The work presented in this manuscript has evaluated in vitro and in "phase 0" (by using animal models) therapeutic potential of monoclonal antibody IgA specific antigen CD20 (expressed by the majority of human B lymphoma). In this context, we also studied the function of various glycans carried by the heavy chain of IgA for assess the possibility of their elimination in IgA variants and facilitated their production and characterization. This work identifies changes in IgA glycosylation potentially responsible for the formation of deposits in the kidney when administered in vivo. It also identifies variants hypoglycosylation IgA bearing an apparent safety in vivo and whose functional properties are intact.LIMOGES-BU Sciences (870852109) / SudocSudocFranceF

Anticorps anti BP 180 et système HLA dans les pemphigoïdes auto-immunes

LIMOGES-BU Médecine pharmacie (870852108) / SudocSudocFranceF

Modèles transgéniques pour l'étude de la fonction des récepteurs des cellules B et de leur glycosylation

La capacité des lymphocytes à répondre de manière spécifique à un grand nombre d antigènes étrangers, est le résultat d un processus de différenciation à l issue duquel chaque lymphocyte exprime un récepteur unique à l antigène. Une longue série de processus d activation et de coopération cellulaire faisant intervenir de nombreuses protéines glycosylées ou pas, est nécessaire avant d aboutir à la sécrétion d un anticorps spécifique par une cellule de la lignée lymphoïde B. Cette réponse présuppose l expression à la surface cellulaire d une forme membranaire de l immunoglobuline au sein du récepteur des cellules B pour l antigène (BCR), dont la spécificité est définie pour chaque clone B. Au cours de ma thèse, je me suis intéressée à la fonction même du BCR et notamment du BCR commuté vers IgA et IgE afin de savoir si une chaîne lourde a ou était capable de jouer un rôle similaire à celui d une chaîne lourde et de promouvoir au sein du récepteur B (soit de classe IgA soit de classe IgE) le développement des cellules jusqu au stade final du plasmocyte sécréteur d anticorps. Pour cela, nous avons réalisé plusieurs modèles de knock-in portant des BCR modifiés où le gène Ca1 humain dans un cas et C humain dans un autre, ont été intégrés par recombinaison homologue au niveau de la région switch afin d obtenir une lignée de souris transgéniques n exprimant que des IgA ou des IgE. Dans une autre perspective d étude des phénomènes pouvant modifier la réactivité des récepteurs de surface de la cellule B, nous nous sommes intéressés à la modulation au cours de la différenciation B des phénomènes de glycosylation, ceux-ci constituant les éléments majeurs de maturation post-traductionnelle des protéines et des lipides. Après une première étude glycotranscriptomique, mettant en valeur l expression de deux gènes distincts tous deux impliqués dans la biosynthèse des glycosaminoglycannes, CsGalNacT1 et Extl1, nous avons voulu étudier d une manière plus approfondie le rôle de ces enzymes in vivo au cours du développement B en réalisant des lignées de souris transgéniques surexprimant de façon B-spécifique ces deux gènes d intérêt.We studied the function of the antigen B receptor (BCR) upon class switchning to IgA or IgE in order to decipher whether the a or immunoglobulin heavy chain was able to substitute for the heavy chain during early B cell differenciation from stem cells. We also analysed how the IgA BCR can transduce signals that differ from those of the IgM BCR in mature B cells and can drive them more efficiently towards the plasma cell stage. To that goal, we established two different knock-in models by which either a human Ca1 gene or a human C gene was inserted through homologous recombination and replacde the S region of the IgH locus, thus yielding mice that only expressed IgA or IgE. Similar animals were also generated for the production of human IgG1 but were only studied preliminary with the aim of producing humanized IgG1 antibodies with biotechnological interest. We also studied how the glycolisation of proteins was modulated along the differenciation of the B celle lineage. A fisrt step consisted in a broad appreciation of the "glyco-transcriptome" and resulted in the identification of a set of genes which strongly varied in expression. Two of them varied in opposite ways and were both inivolved in the biosynthesis of glycosaminoglycans, CsGalNacT1 and Ext1. We wished to explore more thoroughly there role during in vivo B cell differenciation by designing transgenic models in which each of them was over-expressed in a B-cell specific manner. The modifications of B cell physiology resulting from this over-expression are reported in this manuscrit.LIMOGES-BU Sciences (870852109) / SudocSudocFranceF

History of IgA Nephropathy Mouse Models

International audienceIgA nephropathy (IgAN) is the most common primary glomerulonephritis in the world. It was first described in 1968 by Jean Berger and Nicole Hinglais as the presence of intercapillary deposits of IgA. Despite this simple description, patients with IgAN may present very broad clinical features ranging from the isolated presence of IgA in the mesangium without clinical or biological manifestations to rapidly progressive kidney failure. These features are associated with a variety of histological lesions, from the discrete thickening of the mesangial matrix to diffuse cell proliferation. Immunofluorescence on IgAN kidney specimens shows the isolated presence of IgA or its inconsistent association with IgG and complement components. This clinical heterogeneity of IgAN clearly echoes its complex and multifactorial pathophysiology in humans, inviting further analyses of its various aspects through the use of experimental models. Small-animal models of IgAN provide the most pertinent strategies for studying the multifactorial aspects of IgAN pathogenesis and progression. Although only primates have the IgA1 subclass, several murine models have been developed in which various aspects of immune responses are deregulated and which are useful in the understanding of IgAN physiopathology as well as in the assessment of IgAN therapeutic approaches. In this manuscript, we review all murine IgAN models developed since 1968 and discuss their remarkable contribution to understanding the disease

Sécrétion d'immunoglobulines A et polymorphisme de l'activateur transcriptionnel HS1,2 du gène a1

LIMOGES-BU Médecine pharmacie (870852108) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF