Paternity test in "Mangalarga-Marchador" equines by DNA-fingerprinting

Sondas moleculares de minissatélites CG-ricas isoladas do genoma humano têm apresentado pouca habilidade de individualização em cavalos. Neste trabalho foram isoladas novas seqüências de DNA, que podem ser utilizadas para teste de paternidade em cavalos. DNA genômico de cavalos Mangalarga-Marchador foi tratado com enzimas de restrição que digerem preferencialmente seqüências não-repetitivas, preservando, assim, a estrutura onde os mini e microssatélites estão localizados. Quatro clones (S01, S05, S07 and S09), selecionados a partir de uma livraria genômica com o oligonucleotídeo (TG)n, demonstraram um perfil de hibridização semelhante com bandas do tipo DNA "fingerprinting". Utilizando estas sondas, o poder de individualização obtido foi de 10-8, 105 vezes mais elevado do que o obtido com a M13, outra sonda do tipo GC-rica. Todos os clones foram eficientes para a determinação do parentesco em cruzamentos e apresentaram uma seqüência-consensus de 27 pb, GTTTCATTTATTATTCTTTGGAAGAAA, que estava repetida 12, 18, 11 e 21 vezes nos clones S01, S05, S07 e S09, respectivamente.GC-rich molecular minisatellite probes isolated from the human genome have presented a poor ability for individualization in horses. In this study new DNA sequences were isolated which could be used in paternity tests in horses. Genomic DNA from "Mangalarga-Marchador" horses was treated with restriction enzymes that preferentially digest non-repetitive sequences, so preserving the structure where mini and microsatellites are located. Four clones (S01, S05, S07 and S09) selected from a genomic library screened with a (TG)n oligonucleotide showed similar hybridization profiles generating bands of DNA-fingerprinting type. Using these probes the individualization power obtained was 10-8, which is 105-fold higher than that obtained with M13, another GC-rich type probe. All clones were efficient in parentage detection in crossbreedings and presented a 27 bp consensus sequence, GTTTCATTTATTATTCTTTGGAAGAAA, which was repeated 12, 18, 11 and 21 times in clones S01, S05, S07 and S09, respectively

Teste de paternidade em eqinos Mangalarga-Marchador pela técnica do DNA-"fingerprinting"

GC-rich molecular minisatellite probes isolated from the human genome have presented a poor ability for individualization in horses. In this study new DNA sequences were isolated which could be used in paternity tests in horses. Genomic DNA from "Mangalarga-Marchador" horses was treated with restriction enzymes that preferentially digest non-repetitive sequences, so preserving the structure where mini and microsatellites are located. Four clones (S01, S05, S07 and S09) selected from a genomic library screened with a (TG)n oligonucleotide showed similar hybridization profiles generating bands of DNA-fingerprinting type. Using these probes the individualization power obtained was 10-8, which is 105-fold higher than that obtained with M13, another GC-rich type probe. All clones were efficient in parentage detection in crossbreedings and presented a 27 bp consensus sequence, GTTTCATTTATTATTCTTTGGAAGAAA, which was repeated 12, 18, 11 and 21 times in clones S01, S05, S07 and S09, respectively.Sondas moleculares de minissatélites CG-ricas isoladas do genoma humano têm apresentado pouca habilidade de individualização em cavalos. Neste trabalho foram isoladas novas seqüências de DNA, que podem ser utilizadas para teste de paternidade em cavalos. DNA genômico de cavalos Mangalarga-Marchador foi tratado com enzimas de restrição que digerem preferencialmente seqüências não-repetitivas, preservando, assim, a estrutura onde os mini e microssatélites estão localizados. Quatro clones (S01, S05, S07 and S09), selecionados a partir de uma livraria genômica com o oligonucleotídeo (TG)n, demonstraram um perfil de hibridização semelhante com bandas do tipo DNA "fingerprinting". Utilizando estas sondas, o poder de individualização obtido foi de 10-8, 105 vezes mais elevado do que o obtido com a M13, outra sonda do tipo GC-rica. Todos os clones foram eficientes para a determinação do parentesco em cruzamentos e apresentaram uma seqüência-consensus de 27 pb, GTTTCATTTATTATTCTTTGGAAGAAA, que estava repetida 12, 18, 11 e 21 vezes nos clones S01, S05, S07 e S09, respectivamente

Plant diversity impacts forage mass of pastures established after soybean harvest in integrated crop-livestock system

Este trabalho teve como objetivo verificar se a produtividade do capim-paiaguas (Urochloa brizantha cv. Paiaguas) é suprimida em sistemas com múltiplas espécies forrageiras estabelecidas após a colheita da soja e, identificar se a espécie utilizada em pastagem mista melhora a massa de forragem total e a morfologia e composição bromatológica. Os tratamentos consistiram de diversidade de espécies: sem diversidade (capim-paiaguas em monocultivo), baixa diversidade (capim-paiaguas com Vigna unguiculata), média diversidade (capim-paiaguas com Vigna unguiculata e Guizotia abyssinica) e alta diversidade (capim-paiaguas com Vigna unguiculata, Fagopyrum esculentum, Raphanus sativus e Stylosanthes capitata e Stylosanthes macrocephala). As pastagens foram estabelecidas em março, em sucessão à soja, e avaliadas em junho. Não houve redução na massa de forragem com o aumento da diversidade, porém, houve redução na participação do capim-paiaguas na massa de forragem, sem alterar a composição morfológica. O aumento da diversidade de espécies reduziu os teores de cinzas e proteína bruta. Assim, o capim-paiaguas é suprimido devido ao aumento de espécies na pastagem mista, sem alteração da composição morfológica, mas com alteração da composição bromatológica.Pasture with multiple species is an option for integrated systems, but it is important that competition between forages does not interfere with the productivity of the pasture and, mainly, of the main grass. Therefore, this study aimed to verify if the Paiaguas palisade grass (Urochloa brizantha cv. Paiaguas) yield is suppressed in systems with multiple forage species established after soybean harvest and, identify if the species used in mixed pasture improves the total forage mass and, grass morphological and bromatological composition. Treatments consisted of species diversity: no diversity (Paiaguas palisade grass in monoculture), low diversity (Paiaguas palisade grass with Vigna unguiculata), medium diversity (Paiaguas palisade grass with Vigna unguiculata and Guizotia abyssinica), and high diversity (Paiaguas palisade grass with Vigna unguiculata, Fagopyrum esculentum, Raphanus sativus, and Stylosanthes capitata e Stylosanthes macrocephala). Pastures were established in March, in succession to soybean, and evaluated in June. There was no reduction in forage mass with increasing diversity, however, there was a reduction in the participation of Paiaguas palisade grass in the forage mass, without changing the morphological composition. The increase in species diversity reduced ash and crude protein levels. The increase in plant diversity in the system does not reduce the total available forage mass, however, it considerably reduces the Paiaguas palisade grass participation in the system, with no morphological change in the grass. The increase in diversity reduced the nutritional quality of the pasture, as there was a reduction in the crude protein content and an increase in neutral detergent fiber

Análise virológica da qualidade da água: uma revisão das metodologias de concentração e detecção viral

Many pathogenic viruses are excreted in human feces and urine, and water is one possible vehicle of transmission, representing a risk for public health. In some countries, these pathogens are already embedded in routine environmental monitoring. However, there is no consensus yet on the choice of an indicator viral agent, and about choosing a method to diagnose them, which often generate confusion and disagreement among the researchers themselves. The objective of this study was to conduct an updated review of the main methods that comprise the virological analysis (concentration and detection) of water. Despite the differences, we observe that the method of virus concentration is mainly based on the methods of microfiltration in polarized membrane, ultrafiltration and ultracentrifugation, with variations according to the type of water sample. Regarding the methods of detection, these are based mainly on the use of PCR and its variations.Muitos vírus patogênicos são excretados em fezes humanas e urina, e a água é um dos possíveis veículos de transmissão destes agentes, representando riscos para a saúde pública. Em alguns países, estes patógenos já são incorporados em rotinas de monitoramento ambiental. Todavia, ainda não há consenso em relação à escolha de um agente viral indicador, e nem em relação a um método padrão de detecção, o que muitas vezes gera divergências e confusões entre os próprios pesquisadores. Neste sentido, o objetivo deste estudo foi de realizar uma revisão atualizada dos principais métodos que compõem a análise virológica (concentração e detecção) da água. Apesar das divergências, constata-se que a metodologia de concentração é baseada sobretudo nos métodos de microfiltração em membranas polarizadas, ultrafiltração e ultracentrifugação, com variações de acordo com o tipo de amostra. Em relação aos métodos de detecção, estes baseiam-se sobretudo no uso da PCR e suas variações

RESSIGNIFICAÇÃO CULTURAL XOKLENG–LAKLÃNÕ APÓS O CONTATO DE 1914

Após o contato ocorrido em Santa Catarina no ano de 1914, entre os Xokleng/Laklãnõ e agentes do Serviço de Proteção ao Índio (SPI), esse grupo indígí ena passou por diversas transformações relacionadas a sua organização social e comunitária. Compreender esse processo, analisando os acontecimentos ocorridos nas duas décadas após o contato, bem como as diferentes perspectivas e os interesses que caracterizaram os anos iniciais após o contato é o principal objetivo do presente Projeto de pesquisa. A necessidade de conhecer essa história, bem como identificar as transformações da identidade cultural Xoklenk/Laklãnõ, através de uma perspectiva que considere a cultura como um processo em constante transformação, justifica a presente abordagem

Occurrence and seasonal monitoring of helminthes in the main rivers and lakes of Goiânia, Goiás, Brazil, 2007

Water constitutes one of the fundamental elements for human existence, which is demonstrated by its multiple uses, for public supply, industry, agriculture, livestock, recreation, and transportation. Nevertheless, contamination from various sources has been occurring for years impairing this resource and considerably increasing the risk of waterborne diseases caused mainly by bacteria, viruses, protozoa, and helminthes. Seasonal monitoring of helminthes is relevant to understand environmental contamination processes and provide information for decision-making measures to block the access of these parasites and other pathogens to man and animals. This study aimed at using parasitologic techniques to analyze the presence of helminthes and verify the water quality of the main bodies of water in Goiânia, the capital of the state of Goiás, Brazil. Samples were collected monthly from February 2006 to January 2007 in six pre-set points, in a total of 72 samples. Of these, 17 (23.61%) were positive for free-living larvae and 2 (2.77%) for Ascaris sp. and Hymenolepis diminuta. This study showed that the rivers and lakes of Goiânia are contaminated by eggs and/or larvae of helminthes

Molecular epidemiological investigation of Mayaro virus in febrile patients from Goiania City, 2017-2018.

Mayaro virus (MAYV) has historically been associated with sylvatic transmission; however, urban outbreaks have been reported in Brazil, including cases of co-detection with dengue virus (DENV). Therefore, we performed a molecular survey to investigate MAYV circulation and cocirculation with DENV within Goiania, a major city in Central-West Brazil. Among 375 subjects with arbovirus-like symptoms, 259 were positive for DENV and 26 for MAYV. Of these, 17 were coinfected with DENV-2, suggesting co-transmission of the viruses. The most common complaints at the time of inclusion were myalgia, headache, fever, arthralgia, retro-orbital pain, and skin rash. No specific symptoms were associated with MAYV when either detected alone or co-detected with DENV, compared to that when DENV was detected alone. Most MAYV-infected subjects were women with no recent travel history to rural/sylvatic areas. Phylogenetic reconstruction indicated that the MAYV identified in this study is closely related with a lineage observed in Peru, belonging to genotype D. Our results corroborate the growing circulation of MAYV in urban environments in Brazil and reinforce the need to implement laboratory diagnosis in the Unified Health System, considering that the clinical manifestations of Mayaro fever are similar to those of other arboviruses, particularly dengue. Furthermore, most cases occurred in association with DENV-2. Further phylogenetic studies are needed to evaluate MAYV, which has not been widely examined

Diversidade genética de Antilophia galeata (Passeriformes, Pipridae) em matas de galeria do bioma Cerrado

O Cerrado é uma das maiores zonas vegetacionais do continente sul americano. Varias estimativas de conversão dos ambientes naturais do Cerrado têm sido feitos, variando entre 35% a 55%. Como consequência, espécies mais exigentes com relação às condições ambientais podem ficar ilhadas em remanescentes de ambientes naturais. A espécie Antilophia galeata (Família Pipridae), é dependente de habitats florestais e é considerada endêmica do Cerrado. Utilizando técnicas de DNA fingerprinting o objetivo deste tabalho foi determinar e comparar a diversidade genética de populações de Antilophia galeata, em matas de galeria do Estado de Goiás e Distrito Federal. Foi possível constatar que em um dos remanescentes de mata de galeria no Distrito Federal, a população de A. galeata apresentou um coeficiente de compartilhamento bastante elevado, comparável a um grau de parentesco entre avós e meio irmãos e filhos e pai ou filhos e mãe, indicando a ocorrência de um processo de endogamia

Avaliação de métodos de concentração e detecção molecular de adenovírus em águas não tratadas - uma metanálise

Resumo: Metodologias moleculares baseadas em PCR têm sido utilizadas para detectar adenovírus (AdVs) em amostras ambientais. É consenso entre os pesquisadores que estas metodologias oferecem vantagens sobre os métodos tradicionais de isolamento viral por cultura celular, sendo mais sensíveis, específicas e propiciando menor tempo de diagnóstico; contudo, há divergências em relação ao método de concentração viral a ser utilizado em amostras ambientais. Assim sendo, realizou-se uma metanálise com o intuito de responder aos questionamentos concernentes à eficácia do uso de três metodologias de concentração viral associadas à detecção molecular de AdVs em amostras de águas não tratadas, para a qual foram selecionados 33 estudos. Concluiu-se que: a) PCR não deve ser o método de escolha para detectar AdVs em amostras ambientais, devendo-se priorizar qPCR ou Nested-PCR; b) para detectar AdVs em amostras de rios ou lagos, a metodologia de escolha deve ser a associação entre ultracentrifugação e Nested-PCR; c) é aconselhável utilizar associação entre microfiltração em membrana, ultrafiltração e qPCR para detectar AdVs em amostras de esgotos tratados e não tratados. Estudos adicionais são necessários para avaliar os métodos que foram empregados em um único estudo e/ou com número escasso de amostras.Evaluación de métodos para concentración y detección molecular de adenovirus en agua no tratada: un meta-análisis  Resumen: La detección de adenovirus (AdVs) en muestras ambientales se realiza por medio de metodologías moleculares basadas en PCR. Existe consenso entre los investigadores que estas metodologías ofrecen algunas ventajas en comparación con los métodos tradicionales de aislamiento de virus por medio de cultivos celulares; sin embargo, el método que se debe usar para concentrar los virus en muestras ambientales todavía es controversial. Por consiguiente, realizamos un meta-análisis dirigido a responder las preguntas respecto a la eficacia de tres métodos de concentración de virus asociados a la detección molecular de AdVs en muestras de agua no tratada, seleccionando 33 estudios. Concluimos que: a) el PCR no debe ser el método de elección para la detección de AdVs en muestras ambientales y que en vez debe usarse prioritariamente el método de qPCR o PCR-Anidada; b) para la detección de AdVs en muestras de agua tomadas de ríos o lagos, el método de elección debe ser una asociación de ultracentrifugación y PCR-Anidada; c) es aconsejable usar una asociación de membrana de microfiltración, ultrafiltración y qPCR para la detección de AdVs en muestras de aguas negras tratadas o no tratadas. Se necesitan más estudios para evaluar los métodos que se han usado en un solo estudio y/o con un número escaso de muestras.Assessment of methods for the concentration and molecular detection of adenovirus in untreated water: a meta-analysis  Abstract: Molecular methodologies based on PCR have been used for the detection of adenovirus (AdVs) in environmental samples. It is a consensus among researchers that these methodologies offer some advantages compared with traditional methods for the isolation of virus by cell culture, since they are more sensitive and specific and also require less processing time; however, the method to be used for virus concentration in environmental samples is still controversial. Consequently, we carried out a meta-analysis, aiming at responding the questions concerning the efficacy of three methods for virus concentration associated to the molecular detection of AdVs in untreated water samples, by selecting 33 studies. We concluded that: a) PCR should not be the method of choice for the detection of AdVs in environmental samples, and instead the use of qPCR or Nested-PCR should be prioritized; b) for the detection of AdVs in water samples collected in rivers or lakes, the method of choice should be an association of ultracentrifugation and Nested-PCR; c) it is advisable to use an association of microfiltration membrane, ultrafiltration, and qPCR for the detection of AdVs in treated and untreated sewage samples. Further studies are needed to evaluate the methods that have been used in only one study and/or with a limited number of samples