Manejo de hongos de suelo patógenos de Solanáceas ornamentales: Integración de prácticas sustentables

Tesis para optar al grado de Doctor de la Universidad Nacional de La Plata, en 2023La floricultura es una actividad intensiva que coexiste con la horticultura en áreas periurbanas. En Argentina hay 2.500 ha destinadas a esta producción, 25 % de las cuales se realizan bajo invernadero, con alta dependencia de fungicidas, fertilizantes y reguladores de crecimiento que pueden contaminar el ambiente. El Instituto de Floricultura INTA ha generado 29 variedades ornamentales con germoplasma nativo. Calibrachoa es un género emparentado con Petunia del que se han obtenido las variedades Pampa Salmón, Overá Fucsia INTA e INTA 06575. Nierembergia es otro género Solanáceo ornamental. La producción en contenedores es muy afectada por hongos de suelo. Trichoderma es un género con aptitudes tanto para la protección contra fitopatógenos como para la promoción del crecimiento vegetal. Como alternativas para el manejo integrado de enfermedades, se encuentran el uso de genotipos resistentes que podría complementarse aplicaciones de hongos benéficos y quitosano. Los objetivos de este trabajo fueron: a) aislar hongos asociados a pudriciones basales y comprobar su patogenicidad; b) obtener aislados rizosféricos de Trichoderma spp., evaluar su capacidad antagónica frente a los patógenos principales, caracterizar los mecanismos de acción, evaluar su capacidad para promover el crecimiento vegetal y desarrollar técnicas de multiplicación del inóculo sobre sustratos sólidos; c) evaluar la eficiencia del quitosano para el control de los patógenos de suelo en estudio y su compatibilidad con cepas de Trichoderma sp. preseleccionadas; d) comparar el comportamiento de las distintas variedades frente a la infección por los fitopatógenos de suelo prevalentes y; e) ensayar estrategias de integración combinando: variedad-Trichoderma. Entre mayo de 2017 y octubre de 2019 se colectaron calibrachoas con pérdida de turgencia y clorosis. En todos los casos se obtuvieron aislados fúngicos, de los cuales el 80 % perteneció al género Fusarium, el 10 % a Sclerotinia y el 10 % a Rhizoctonia. De los nueve aislados de Fusarium, cinco fueron identificados como F. oxysporum, tres como F. proliferatum y uno como F. fujikuroi. Su comportamiento frente a las distintas variedades de calibrachoa fue muy diverso. INTA IF-535 (F. proliferatum) fue constante en la generación de daños aéreos y radicales y en la disminución del peso seco radical. INTA IF-536 (F. proliferatum) también causó importantes daños en la parte aérea y radical y disminuyó el peso aéreo y radical. INTA IF-559, INTA IF-566 e INTA IF-567 (F. oxysporum) produjeron daños aéreos o radicales de menor magnitud. F. proliferatum INTA IF-534, 535 y 536 y F. oxysporum INTA IF-559 se comportaron, además, como patógenos de petunia mientras que F. oxysporum INTA IF-559 y 566 fueron patógenos de nierembergia. Sclerotinia sclerotiorum INTA IF-533 fue capaz de infectar nierembergia y petunia sin causar enfermedad en tomate y coral. Ceratobasidium sp. AG-A INTA IF-568 afectó a nierembergia sin generar daños en petunia, tomate y coral. En octubre de 2019, plantas de calibrachoa desarrollaron manchas 6 foliares de color marrón, irregulares, más frecuentes en las hojas basales. El patógeno se identificó como Nigrospora oryzae INTA IF-540. Por otro lado, de muestras de suelo rizosférico de calibrachoa provenientes de distintas zonas del país, se obtuvieron 38 aislados de Trichoderma sp. Con 31 de ellos se realizaron evaluaciones in vitro e in vivo frente a F. proliferatum INTA IF-535 y 536. Los aislados INTA IF-549, 612, 613, 614 y 630 sobresalieron como controladores in vitro, INTA IF-613 y 630 como controladores in vivo, INTA IF-549, 612, 613, 614 y 630 por su capacidad para colonizar un sustrato comercial e INTA IF-613 por la promoción de crecimiento de calibrachoa. Los aislados INTA IF-549, 612 y 630 presentan homología con Trichoderma longibrachiatum e INTA IF-613 y 614 con T. koningiopsis. El comportamiento de las variedades de calibrachoa frente a F. proliferatum fue variado. La más resistente (mayor peso seco de las raíces y menor severidad de daño aéreo) fue Pampa Salmón-INTA. En cuanto al quitosano, el pH influyó en su actividad. A pH 4 inhibió el crecimiento de Sclerotium rolfsii, a pH 6 inhibió el de S. sclerotiorum y disminuyó el de S. rolfsii, F. oxysporum y Rhizoctonia solani. En relación con su compatibilidad con los aislados de Trichoderma, en líneas generales no inhibió el crecimiento. En síntesis, este trabajo permitió conocer las enfermedades más prevalentes en el cultivo de calibrachoa y determinar la patogenicidad de los microorganismos sobre calibrachoa, nierembergia y petunia. A partir de la caracterización de la agresividad de los aislados y la respuesta de los cultivares se obtuvo información útil para planteos con diferente presión de enfermedad. Se determinó la capacidad del quitosano para el biocontrol y su inocuidad sobre Trichoderma sp. Se aislaron y categorizaron cepas de Trichoderma con 6actividad de biocontrol y promoción del crecimiento de calibrachoa que pueden ser una herramienta clave para disminuir el uso de insumos químicos en las producciones florícolas.Instituto de FloriculturaFil: Borrelli, Nicolás Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentin

Ceratobasidium sp. AG-A, root pathogen of Calibrachoa hybrida

Calibrachoa (Calibrachoa hybrida, Solanaceae) is an annual flowering ornamental plant, which is widely used in landscape design. In October 2019, 5% of the plants grown in a greenhouse in Buenos Aires, Argentina, showed a sudden wilt characterized by chlorosis, loss of turgor, and root rot. The objective of this study was to identify the causal agent of the disease. Five morphologically identical isolates developed from the roots of wilting plants. One of the isolates was selected and identified using morphological and molecular markers, while its pathogenicity was confirmed by Koch’s postulates. The obtained results allow concluding that Ceratobasidium sp. AG-A (anamorph Rhizoctonia sp.) is the causal agent of the disease. To the best of the authors’ knowledge, this is the first report of Ceratobasidium sp. as pathogen of calibrachoa in the world.Fil: Borrelli, N.P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía, ArgentinaFil: Moreno, María Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biología Funcional y Biotecnología; Argentina. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Area Microbiología; ArgentinaFil: Stenglein, Sebastian Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biologia Funcional y Biotecnología; Argentina. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; ArgentinaFil: Stancanelli, Santiago. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instuto de Floricultura; ArgentinaFil: Wright, Eduardo Roberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Rivera, Marta Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentin

Glandularia. Plagas y manejo

Glandularia es un género exclusivamente americano, emparentado con Verbena, de amplia distribución geográfica. En Argentina existen 36 especies y una variedad botánica. Desde su creación, el Instituto de Floricultura de INTA ha trabajado en el desarrollo de variedades nacionales de glandularia como fruto del mejoramiento genético de germoplasma nativo. Tanto es así, que nuestro mercado florícola cuenta hasta el momento con 8 variedades nacionales de glandularia. Las variedades de glandularia desarrolladas por INTA son plantas herbáceas, perennes, de bajo requerimiento nutricional y poco mantenimiento. Florecen en primavera-verano en forma muy abundante, con un pico en noviembre-diciembre. Ofrecen néctar a visitantes florales, son muy vigorosas y de amplia cobertura del espacio, muy recomendables para ser utilizadas en diseños de paisaje en espacios abiertos a pleno sol, en canteros y borduras (Figura 1). A continuación se presenta una breve descripción de las mismas. Algunas de ellas se agrupan en series, por similitud en sus características.Fil: Rivera, Marta Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Alderete, L.M. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Bologna, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Borrelli, N.P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Fernández, M.N. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Karlanian, Mónica N. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Garcia Lager, E. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentin

Calibrachoa: Plagas y manejo

Calibrachoa es un género exclusivamente americano, afín a Petunia, de distribución predominan temente sub-tropical atlántica entre los paralelos 18 y 37 ºS. En la Argentina existen 13 especies nativas presentes principalmente en la Mesopotamia. Se las encuentra creciendo en ambientes abiertos con suelo arenoso o pedregoso de buen drenaje de Entre Ríos y Corrientes, o en suelos rojizos ácidos de Misiones o norte de Corrientes. Desde su creación, el Instituto de Floricultura de INTA ha trabajado en el desarrollo de variedades nacionales de calibrachoa como fruto del mejoramiento genético de germoplasma nativo. Tanto es así, que el mercado florícola argentino cuenta con tres variedades nacionales: Overá fucsia INTA y Pampa salmón INTA (inscriptas en el Registro Nacional de Cultivares del Instituto Nacional de Semillas) e INTA 06575 (patentada en la Patent and Trademark Office de Estados Unidos). Las variedades de calibrachoa desarrolladas por INTA son plan tas herbáceas perennes, de pleno sol y comportamiento anual. Florecen constantemente desde la primavera hasta el otoño en forma muy abundante, con un pico entre el fin de la primavera y el inicio del verano. Ofrecen néctar a visitantes florales, son vigo rosas y con amplia cobertura del espacio, recomendables para ser plantadas en macetas colgantes o macetas grandes (Figura 1) o utilizadas en espacios abiertos a pleno sol, en canteros y borduras (Figura 2). Son de fácil mantenimiento. La variedad Overá fucsia INTA (Figura 3) es de porte erecto, compacta, con floración abundante. Sus flores son de color fucsia y aparecen en forma temprana, independientemente del fotoperio do. Prefiere suelos o sustratos levemente ácidos (pH 5,5-6,5). Es ideal para cultivo en macetas, pero también presenta un buen comportamiento en canteros o borduras. La variedad Pampa salmón INTA (Figura 4) es de porte semierecto. Sus flores son de color salmón. La floración es más tardía que en otras variedades, requiere de fotoperiodo mayor a 12 horas y alta iluminación para florecer plenamente. Es ideal para espacios abiertos como canteros o borduras a pleno sol. A diferencia de las otras variedades, no es tan exigente de suelos o sustratos ácidos. La variedad INTA 06575 (Figura 5) es la de crecimiento más vigoroso. Sus flores son de color púr pura. Al igual que las de Overá fucsia INTA, aparecen en forma temprana, independientemente del fotoperiodo. Prefiere suelos o sustratos mediana a ligeramente ácidos (pH 5,5-6,5) y tolera las altas temperatura del verano. Es ideal para espacios abiertos, en canteros o borduras a pleno sol.Fil: Borrelli, N.P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Martinez, M.A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; ArgentinaFil: Rivera, Marta Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Alderete, Marisol. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Hagiwara, Juan Carlos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Diaz, Beatriz Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; ArgentinaFil: Karlanian, Mónica N. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Fernández, Martín Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Garcia Lager, Eduardo Antonio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Tombion, Leticia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentin

Manejo de hongos de suelo patógenos de Solanáceas ornamentales: Integración de prácticas sustentables

La floricultura es una actividad intensiva que coexiste con la horticultura en áreas periurbanas. En Argentina hay 2.500 ha destinadas a esta producción, 25 % de las cuales se realizan bajo invernadero, con alta dependencia de fungicidas, fertilizantes y reguladores de crecimiento que pueden contaminar el ambiente. El Instituto de Floricultura INTA ha generado 29 variedades ornamentales con germoplasma nativo. Calibrachoa es un género emparentado con Petunia del que se han obtenido las variedades Pampa Salmón, Overá Fucsia INTA e INTA 06575. Nierembergia es otro género Solanáceo ornamental. La producción en contenedores es muy afectada por hongos de suelo. Trichoderma es un género con aptitudes tanto para la protección contra fitopatógenos como para la promoción del crecimiento vegetal. Como alternativas para el manejo integrado de enfermedades, se encuentran el uso de genotipos resistentes que podría complementarse aplicaciones de hongos benéficos y quitosano. Los objetivos de este trabajo fueron: a) aislar hongos asociados a pudriciones basales y comprobar su patogenicidad; b) obtener aislados rizosféricos de Trichoderma spp., evaluar su capacidad antagónica frente a los patógenos principales, caracterizar los mecanismos de acción, evaluar su capacidad para promover el crecimiento vegetal y desarrollar técnicas de multiplicación del inóculo sobre sustratos sólidos; c) evaluar la eficiencia del quitosano para el control de los patógenos de suelo en estudio y su compatibilidad con cepas de Trichoderma sp. preseleccionadas; d) comparar el comportamiento de las distintas variedades frente a la infección por los fitopatógenos de suelo prevalentes y; e) ensayar estrategias de integración combinando: variedad-Trichoderma. Entre mayo de 2017 y octubre de 2019 se colectaron calibrachoas con pérdida de turgencia y clorosis. En todos los casos se obtuvieron aislados fúngicos, de los cuales el 80 % perteneció al género Fusarium, el 10 % a Sclerotinia y el 10 % a Rhizoctonia. De los nueve aislados de Fusarium, cinco fueron identificados como F. oxysporum, tres como F. proliferatum y uno como F. fujikuroi. Su comportamiento frente a las distintas variedades de calibrachoa fue muy diverso. INTA IF-535 (F. proliferatum) fue constante en la generación de daños aéreos y radicales y en la disminución del peso seco radical. INTA IF-536 (F. proliferatum) también causó importantes daños en la parte aérea y radical y disminuyó el peso aéreo y radical. INTA IF-559, INTA IF-566 e INTA IF-567 (F. oxysporum) produjeron daños aéreos o radicales de menor magnitud. F. proliferatum INTA IF534, 535 y 536 y F. oxysporum INTA IF-559 se comportaron, además, como patógenos de petunia mientras que F. oxysporum INTA IF-559 y 566 fueron patógenos de nierembergia. Sclerotinia sclerotiorum INTA IF-533 fue capaz de infectar nierembergia y petunia sin causar enfermedad en tomate y coral. Ceratobasidium sp. AG-A INTA IF-568 afectó a nierembergia sin generar daños en petunia, tomate y coral. En octubre de 2019, plantas de calibrachoa desarrollaron manchas foliares de color marrón, irregulares, más frecuentes en las hojas basales. El patógeno se identificó como Nigrospora oryzae INTA IF-540. Por otro lado, de muestras de suelo rizosférico de calibrachoa provenientes de distintas zonas del país, se obtuvieron 38 aislados de Trichoderma sp. Con 31 de ellos se realizaron evaluaciones in vitro e in vivo frente a F. proliferatum INTA IF-535 y 536. Los aislados INTA IF-549, 612, 613, 614 y 630 sobresalieron como controladores in vitro, INTA IF-613 y 630 como controladores in vivo, INTA IF-549, 612, 613, 614 y 630 por su capacidad para colonizar un sustrato comercial e INTA IF-613 por la promoción de crecimiento de calibrachoa. Los aislados INTA IF-549, 612 y 630 presentan homología con Trichoderma longibrachiatum e INTA IF-613 y 614 con T. koningiopsis. El comportamiento de las variedades de calibrachoa frente a F. proliferatum fue variado. La más resistente (mayor peso seco de las raíces y menor severidad de daño aéreo) fue Pampa Salmón-INTA. En cuanto al quitosano, el pH influyó en su actividad. A pH 4 inhibió el crecimiento de Sclerotium rolfsii, a pH 6 inhibió el de S. sclerotiorum y disminuyó el de S. rolfsii, F. oxysporum y Rhizoctonia solani. En relación con su compatibilidad con los aislados de Trichoderma, en líneas generales no inhibió el crecimiento. En síntesis, este trabajo permitió conocer las enfermedades más prevalentes en el cultivo de calibrachoa y determinar la patogenicidad de los microorganismos sobre calibrachoa, nierembergia y petunia. A partir de la caracterización de la agresividad de los aislados y la respuesta de los cultivares se obtuvo información útil para planteos con diferente presión de enfermedad. Se determinó la capacidad del quitosano para el biocontrol y su inocuidad sobre Trichoderma sp. Se aislaron y categorizaron cepas de Trichoderma con 6actividad de biocontrol y promoción del crecimiento de calibrachoa que pueden ser una herramienta clave para disminuir el uso de insumos químicos en las producciones florícolas.Doctor de la Facultad de Ciencias Agrarias y ForestalesUniversidad Nacional de La PlataFacultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Efecto inhibitorio in vitro de extractos de ricino (Ricinus commonis) sobre el crecimiento de Alternaria tenuissima = In vitro inhibitory effect of castor bean (Ricinus communis) leaf extracts on the growth of Alternaria tenuissima

El objetivo de este estudio fue evaluar el potencial inhibitorio de extractos acuosos y etanólicos de hojas de Ricinus communis sobre el crecimiento de una cepa de Alternaria tenuissima, especie fitopatógena que afecta a gran variedad de cultivos ornamentales y alimenticios. Este trabajo derivó de una investigación etnobotánica sobre plantas tóxicas del partido de Vicente López (Buenos Aires, Argentina), en el que el ricino, planta invasora y exótica, sobresalió como una de las especies más conocidas de la zona y de mayor consenso en cuanto a su potencial tóxico. Los extractos se obtuvieron mediante maceración de las hojas de R. communis durante 24 h en los siguientes solventes: agua destilada, etanol al 25% y etanol al 50%. El efecto inhibitorio de los extractos contra A. tenuissima se evaluó utilizando la técnica del medio de cultivo envenenado a cuatro concentraciones: 25, 12, 6 y 3%. A los 8 días de cultivo se registró y contrastó el crecimiento micelar (áreas colonizadas) en cada caso. Los extractos acuosos de las hojas de R. communis presentaron efecto inhibitorio sobre el crecimiento de la cepa evaluada, con un máximo del 55%. El etanol, tanto al 25% como al 50%, tuvo un efecto completamente inhibitorio y por tanto no fue posible evaluar el efecto de los extractos etanólicos de ricino. Los resultados indican que tanto las mezclas etanol-agua como los extractos acuosos de hojas de ricino son alternativas prometedoras para la protección vegetal, evaluando previamente sus parámetros ecotoxicológicos.The purpose of this study was to evaluate the inhibitory potential of aqueous and ethanolic extracts from leaves of Ricinus communis against a strain of Alternaria tenuissima, a phytopathogenic species that affects a great variety of ornamental and food crops. This work arose from an ethnobotanical research on toxic plants carried out in Vicente López district (Buenos Aires, Argentina), in which R. communis, an exotic and invasive plant, appeared as one of the most known species and with major consensus regarding its toxic potential. The extracts were obtained by maceration of the leaves for 24 h in the following solvents: distilled water, 25% ethanol and 50% ethanol. The inhibitory effect of the different extracts against A. tenuissima was evaluated using the poisoned medium technique at four concentrations: 25, 12, 6 and 3%. After 8 days of culture, micellar growth (colonized areas) was registered for each treatment. The aqueous extracts from leaves of R. communis showed an inhibitory effect against the growth of the evaluated strain, with a maximum of 55%. Ethanol, at both 25% and 50%, had a total inhibitory effect, thus it was not possible to evaluate the effect of the ethanolic extracts. Results suggest that the mixtures ethanol-water as well as the aqueous extracts from leaves of R. communis are promising alternatives for plant protection, with a previous evaluation of ecotoxicological parameters.Instituto de FloriculturaFil: Valerio, Federico. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental (DBBE). Grupo de Etnobiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Herrero Cano, Anahí N. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental (DBBE). Grupo de Etnobiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Majul, Leonardo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular. Laboratorio de Agrobiotecnología, Laboratorio de Micología Experimental; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Micología y Botánica; ArgentinaFil: Borrelli, N.P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía, ArgentinaFil: Rivera, Marta Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Suárez, María Eugenia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular. Laboratorio de Agrobiotecnología, Laboratorio de Micología Experimental; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Micología y Botánica; Argentin

Leaf spots of Calibrachoa caused by Nogrospora oryzae

Calibrachoa hybrida (calibrachoa, million bells) is a flowering ornamental with increasing importance due to the existence of many successful cultivars for growing indoors in containers and planting in the garden and landscape. The outstanding characteristic is a profuse flowering and intense colour. In October 2019, a fungal isolate was obtained from basal calibrachoa leaves with irregular brown leaf spots, in plants cultivated in Buenos Aires, Argentina. The aim of the present study was to identify the cause of the disease in this ornamental genus, to expand knowledge about prevalent pathologies. The isolate was identified using morphological and molecular markers, and the pathogenicity tests were fulfilled. This paper reports that Nigrospora oryzae is pathogenic to calibrachoa, which seems to be the first record of this leaf spot disease in the world.Calibrachoa hybrida (calibrachoa ou falsa-petúnia) é uma planta ornamental com importância crescente no mercado devido a existência de inúmeras variedades que podem ser cultivadas em vasos, jardins e paisagismo. A característica marcante é sua floração abundante e de cores vibrantes. Em outubro de 2019, foi obtido um isolado de fungo em folhas basais de calibrachoa, com manchas foliares marrons e irregulares, em plantas cultivadas em Buenos Aires, Argentina. O objetivo do presente estudo foi identificar o agente causal das manchas foliares em calibrachoa para expandir o conhecimento sobre as doenças prevalentes nesta importante planta ornamental. O isolado foi identificado por meio de marcadores morfológicos e moleculares, bem como a sua patogenicidade foi comprovada por meio do postulado de Koch. O fungo foi identificado como Nigrospora oryzae, sendo que presente artigo, além de relatar a sua patogenicidade, parece ser o primeiro registro desta doença em calibrachoa no mundo.Fil: Borrelli, N.P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Stancanelli, Santiago. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instuto de Floricultura; ArgentinaFil: Papone, Mirta Leonor. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Moreno, María Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biología Funcional y Biotecnología; Argentina. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Area Microbiología; ArgentinaFil: Stenglein, Sebastian Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biologia Funcional y Biotecnología; Argentina. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; ArgentinaFil: Wright, Eduardo Roberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Hagiwara, Juan Carlos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; ArgentinaFil: Rivera, Marta Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Floricultura; Argentin

A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance

We present a global atlas of 4,728 metagenomic samples from mass-transit systems in 60 cities over 3 years, representing the first systematic, worldwide catalog of the urban microbial ecosystem. This atlas provides an annotated, geospatial profile of microbial strains, functional characteristics, antimicrobial resistance (AMR) markers, and genetic elements, including 10,928 viruses, 1,302 bacteria, 2 archaea, and 838,532 CRISPR arrays not found in reference databases. We identified 4,246 known species of urban microorganisms and a consistent set of 31 species found in 97% of samples that were distinct from human commensal organisms. Profiles of AMR genes varied widely in type and density across cities. Cities showed distinct microbial taxonomic signatures that were driven by climate and geographic differences. These results constitute a high-resolution global metagenomic atlas that enables discovery of organisms and genes, highlights potential public health and forensic applications, and provides a culture-independent view of AMR burden in cities.Funding: the Tri-I Program in Computational Biology and Medicine (CBM) funded by NIH grant 1T32GM083937; GitHub; Philip Blood and the Extreme Science and Engineering Discovery Environment (XSEDE), supported by NSF grant number ACI-1548562 and NSF award number ACI-1445606; NASA (NNX14AH50G, NNX17AB26G), the NIH (R01AI151059, R25EB020393, R21AI129851, R35GM138152, U01DA053941); STARR Foundation (I13- 0052); LLS (MCL7001-18, LLS 9238-16, LLS-MCL7001-18); the NSF (1840275); the Bill and Melinda Gates Foundation (OPP1151054); the Alfred P. Sloan Foundation (G-2015-13964); Swiss National Science Foundation grant number 407540_167331; NIH award number UL1TR000457; the US Department of Energy Joint Genome Institute under contract number DE-AC02-05CH11231; the National Energy Research Scientific Computing Center, supported by the Office of Science of the US Department of Energy; Stockholm Health Authority grant SLL 20160933; the Institut Pasteur Korea; an NRF Korea grant (NRF-2014K1A4A7A01074645, 2017M3A9G6068246); the CONICYT Fondecyt Iniciación grants 11140666 and 11160905; Keio University Funds for Individual Research; funds from the Yamagata prefectural government and the city of Tsuruoka; JSPS KAKENHI grant number 20K10436; the bilateral AT-UA collaboration fund (WTZ:UA 02/2019; Ministry of Education and Science of Ukraine, UA:M/84-2019, M/126-2020); Kyiv Academic Univeristy; Ministry of Education and Science of Ukraine project numbers 0118U100290 and 0120U101734; Centro de Excelencia Severo Ochoa 2013–2017; the CERCA Programme / Generalitat de Catalunya; the CRG-Novartis-Africa mobility program 2016; research funds from National Cheng Kung University and the Ministry of Science and Technology; Taiwan (MOST grant number 106-2321-B-006-016); we thank all the volunteers who made sampling NYC possible, Minciencias (project no. 639677758300), CNPq (EDN - 309973/2015-5), the Open Research Fund of Key Laboratory of Advanced Theory and Application in Statistics and Data Science – MOE, ECNU, the Research Grants Council of Hong Kong through project 11215017, National Key RD Project of China (2018YFE0201603), and Shanghai Municipal Science and Technology Major Project (2017SHZDZX01) (L.S.