Climate Change and Its Impacts in Mali

Citation correct de ce document / Correct citation of this document: Birama, D. (2020). Les changements climatiques au Mali et impacts. In N'Diaye, I. et al. (eds.) Adaptation de l'Agriculture et de l'Élevage au Changement Climatique au Mali: Résultats et leçons apprises au Sahel. Bamako, Mali: Institut d'Economie Rurale. pp. 15-34.Le livre complet est accessible sur le site internet suivant / The complete book can be accessed from the following link https://hdl.handle.net/11250/2687372Résumé: Le Mali est un vaste pays sahélien avec un climat de type tropical sec caractérisé par une période humide de 4 à 3 mois et une période sèche de 6 à 9 mois. L’économie du pays repose sur des ressources provenant essentiellement de l’agriculture, de l’élevage, des formations forestières naturelles et de la pêche, d’où l’extrême vulnérabilité de ce pays et de son économie au climat et à ses variabilités et ses changements potentiels. L’environnement et les ressources naturelles ont connu au Mali, ces dernières décennies, une forte dégradation en relation avec l’augmentation importante de la population conjuguée à la persistance de conditions climatiques défavorables et à des systèmes d’exploitation pour la plupart extensifs et inadaptés. Au cours des 70 dernières années (1941-2010), la pluviosité a diminué dans tout le pays par rapport à la période de référence de 1941 à 1970 avec un déficit global entre 10 et 28 %. Il faut noter que l’isohyète 1 200 mm n’existe plus au Mali. La température a évolué de 0,2°C à 0,8°C depuis la fin des années 1970 et cette hausse se poursuit. Par ailleurs, le Mali dispose de ressources en eau de surface non pérennes importantes pour les régions éloignées des fleuves. Elles permettent de prolonger la durée ou de retarder le tarissement des nappes, d’augmenter par épandage d’eau les surfaces irriguées, de constituer des réserves pour les besoins humains et du cheptel, de faciliter le maraîchage de contre-saison. D’après les scénarios climatiques, on assisterait à une diminution de la pluviosité qui se traduirait par un déplacement des isohyètes vers le Sud et les températures seraient par contre en hausse dans toutes les localités du Mali. Les risques climatiques restent très importants avec la persistance de la sécheresse et les impacts seront davantage perceptibles sur la majorité des activités socio-économiques avec une réduction significative de plus de 30 % du niveau d’eau des fleuves, surtout pour le fleuve Niger à Koulikoro. Des propositions de solutions sont faites pour pallier les risques des effets de changements climatiques notamment à travers l’adaptation.Abstract: Mali is a vast Sahelian country with a dry tropical climate characterized by a 3-to-4-month rainy season and a 6-to-9-month dry season. The country’s economy relies on resources mainly derived from agriculture, livestock and fisheries. Therefore, Mali and its economy are extremely vulnerable to climate and its variability and potential changes. In the past few decades, Mali’s environmental conditions and natural resources have experienced a sharp decline in relation to the significant increase in population, combined with the persistence of adverse climatic conditions and largely extensive and unsuitable farming systems. Over the last 70 years (1941-2010), rainfall levels have declined throughout the country, compared with the baseline levels of 1941-1970, with an overall deficit estimated at 10-28%. It should be noted that the 1200 mm isohyet no longer exists in Mali. The temperature has been rising from 0.2° C to 0.8° C since the late 1970s and continues to soar. In addition, Mali has significant non-perennial surface water resources in areas remote from rivers. These allow for the extension of the duration of aquifers or the delay of their drying up, the expansion of irrigated areas through water spreading and the creation of water reserves for human and livestock needs, and facilitate offseason market gardening. Climate scenarios predict a decrease in rainfall, resulting in a southward displacement of isohyets, while the temperatures would be rising in all the localities of Mali. Climatic risks remain very high with the persistence droughts and their impacts will be more perceptible on a majority of socioeconomic activities, due to a significant decline (by more than 30%) of river water levels, especially in the Niger River in Koulikoro. Some solutions are suggested to mitigate the risks associated with climate change effects, particularly through adaptation

Plantes médicinales de l’Afrique de l’Ouest pour la prise en charge des affections respiratoires pouvant se manifester au cours de la Covid-19

Dans le cadre de contribuer à la prise en charge symptomatique des affections respiratoires pouvant se manifester pendant la Covid-19, la présente étude a été entreprise pour recenser les plantes médicinales Africaines actives contre ces manifestations. Une étude bibliographique a été effectuée pour recenser les espèces végétales utilisées dans la prise en charge des maladies respiratoires en Afrique de l’Ouest. La fréquence de citation et un score de convergence d’usage des espèces ont été également calculés. Un total de 318 recettes issues de 145 espèces végétales a été inventorié à travers différentes publications. Guiera senegalensis, Sterculia setigera, Bridelia ferruginea, Euphorbia hirta et Terminalia avicennioides étaient les plantes les plus citées avec les meilleurs scores de convergence d’usage. Les feuilles de ces espèces étaient les plus citées tandis que la toux était la plus indiquée. Les résultats de cette étude pourraient servir de base de données des espèces végétales utilisées dans la prise en charge des maladies du tractus respiratoire en Afrique de l’ouest.Mots clés : Plantes médicinales, Affections respiratoires, Covid-19, Afrique de l’Ouest. English Title: Medicinal plants from West Africa for the management of respiratory diseases that may appear during the Covid-19 As part of contributing to the symptomatic management of respiratory conditions that may manifest during Covid-19, the current study was undertaken to identify African medicinal plants active against these manifestations. A bibliographic study was carried out to identify the plant species used in the management of respiratory diseases in West Africa. The frequency of citation and a convergence score for the use of the species were also calculated. A total of 318 recipes from 145 plant species were inventoried through various publications. Guiera senegalensis, Sterculia setigera, Bridelia ferruginea, Euphorbia hirta and Terminalia avicennioides were the most cited plants with the best usage convergence scores. Leaves from these species were most cited while the cough was more indicated. The results of this study could serve as a database of plant species used in the management of respiratory tract diseases in West Africa.Keywords: Medicinal plants, Respiratory Affections, Covid-19, West Africa

Hernie inguinale en Afrique subsaharienne: quelle place pour la technique de Shouldice?

L'objectif était d'étudier l'aspect épidémio-clinique et thérapeutique de la hernie inguinale selon la technique de Shouldice. Nous avons réalisé une étude  rétrospective, portant sur les patients opérés pour hernie inguinale selon la technique de Shouldice dans le service de chirurgie B du CHU du Point G, Bamako, Mali. Il a été  enregistré 225patients opérés selon la technique de Shouldice. L'âge moyen était de 49 ans +/- 17,7. Il y avait 90,7% (204) hommes soit un sex-ratio de 9,7. Les cultivateurs, les ménagères et les ouvriers ont représenté 51,1% (115). Dans 75,2% (169) les patients ont consulté pour tuméfaction inguinale. En pré opératoire, la hernie était compliquée chez 82 (36,4%) patients dont 24 cas de récidive. L'étranglement herniaire a été la principale complication pré opératoire  58,5% (48/82). Les suites opératoires à un an ont été simples chez 94,2%(210) des patients; elles étaient marquées par 8 cas de récidive, 4 cas de névralgie, 2  cas d'atrophie testiculaire, 1 cas de chéloïde. La technique de Shouldice est la technique de choix pour la cure de la hernie inguinale dans les pays en voie de  développement à cause du bon résultat et son coût peu onéreux par rapport aux autres techniques utilisant des dispositifs médicaux.Key words: Hernie inguinale, technique de Shouldice, récidive

Criblage Phytochimique et Activités Biologiques de Quatre Plantes Utilisées au Mali dans la Prise en Charge du Paludisme Chez les Enfants

Contexte : Selon les résultats d’une enquête menée dans différentes zones écologiques et culturelles au Sud du Mali, beaucoup de plantes médicinales sont utilisées dans la prise charge du paludisme chez les enfants, dont Annona senegalensis, Flueggea virosa, Gymnosporia senegalensis et Vitex doniana. Nous avons approfondi les études sur la composition phytochimique, la sécurité d’emplois et les activités contre les symptômes du paludisme. Objectifs : Caractériser les métabolites secondaires, déterminer la toxicité aiguë, vérifier l’activité hémolytique et évaluer les propriétés antalgiques, antipyrétiques et antiinflammatoires des quatre plantes. Méthodologie : La composition phytochimique a été déterminée par des réactions colorées en tube. L’activité hémolytique a été évaluée par CCM, révélée par le sang humain. La toxicité aigüe et les activités biologiques ont été déterminées in vivo chez les souris et les rats. Résultats : Les coumarines, stérols, tri terpènes, tanins et flavonoïdes ont été caractérisés dans les extraits aqueux des quatre plantes. Ces extraits n’ont pas présenté de constituants qui provoquent l’hémolyse. Les décoctés administrés par voie orale à la dose de 2000 mg /Kg chez des souris n’ont pas provoqués d’effets toxiques et de mortalité. Les décoctés administrés par voie orale à la dose de 100 et 200 mg /Kg chez des souris ont montré des remarquables activités antalgique, antiinflammatoire et chez les rats l’activité antipyrétique. Conclusion: Ces résultats préliminaires valident l’utilisation traditionnelle des quatre plantes dans la prise en charge des symptômes du paludisme chez les enfants.Introduction: According to the results of a survey conducted in different ecological and cultural areas in southern Mali, many medicinal plants are used by traditional paediatricians in taking charge of malaria in children. The survey highlighted the use of four plants, which we decided to carry out further study on phytochemical composition, safety of use and activity against symptoms of malaria. Objectives: To characterize secondary metabolites, to determine acute toxicity, to check haemolytic activity, and to evaluate the analgesic, antipyretic and anti-inflammatory properties of Annona senegalensis, Flueggea virosa, Gymnosporia senegalensis, and Vitex doniana. Methods: The phytochemical composition of the aqueous extracts of the leafy twigs of the four plants was determined by coloured tube reactions. Haemolytic activity was assessed by TLC and revealed by human blood. Acute toxicity and biological activities were determined in vivo in mice and rats. Results: Coumarins, sterols, tri-terpenes, tannins and flavonoids were characterized in the aqueous extracts of the leafy twigs of the four plants. These decocts did not show any constituents that cause haemolysis. Decoctions given orally at the dose of 2000 mg / kg in mice did not cause toxic effects and mortality. Decoctions administered orally at the dose of 100 and 200 mg / kg showed remarkable analgesic, anti-inflammatory (in mice), and antipyretic (in rat) activities. Conclusion: These preliminary results validate the traditional use of the four plants in the management of malaria symptoms in children

Diagnostic moléculaire du Cytomégalovirus (CMV), de l’herpès virus humain de type 6 (HHV6) et d’Epstein-Barr virus (EBV) par PCR en temps réel chez les femmes enceintes VIH séropositives et séronégatives à Ouagadougou, Burkina Faso

Introduction: les herpès virus EBV, CMV et HHV-6 sont des virus qui évoluent sous le modèle pandémique et sont responsables d’infections congénitales pouvant provoquer des séquelles graves chez les nouveau-nés. L’objectif de cette étude était de déterminer les prévalences de CMV, EBV et HHV-6 chez les femmes enceintes VIH(+) et VIH(-) à Ouagadougou. Méthodes: dans cette étude 200 échantillons de plasma sanguin de femmes enceintes dont 100 femmes VIH(+) et 100 femmes VIH(-) ont été diagnostiqués par PCR multiplex en temps réel pour les trois infections (EBV, CMV et HHV-6). Résultats: sur l’ensemble des 200 échantillons analysés, 18 (9,0%) étaient positifs à au moins un des trois virus, 12 (6,0%) étaient positifs au EBV, 13 (6,5%) au CMV et 12 (6,0%) positifs au HHV-6. Parmi les 18 cas d’infections, nous avons trouvé 10 cas (55,6%) de coïnfections dont 90,0% (9/10) d’infection multiple EBV/CMV/HHV6 et 10,0% de coinfection EBV/HHV6. Le taux d’infection HHVs était plus élevé chez les femmes VIH(-) que celles VIH(+) (12,0% versus 6,0%). Parmi les VIH(+), la PCR a révélé 7,1% (soit 6/85) d’infection HHVs chez celles qui n’étaient pas sous ARV contre 0% chez celles sous ARV. Conclusion: les herpès virus sont fréquents chez les femmes enceintes au Burkina Faso et pourraient constituer une menace chez ces dernières à cause des complications et des risques d’infection pour le nouveau-né.The Pan African Medical Journal 2016;2

Molecular diagnosis of Shigella, Salmonella and Campylobacter by multiplex Real-time PCR in stool culture samples in Ouagadougou (Burkina Faso)

ABSTRACT:Background: Bacteriological diagnosis of Campylobacter spp, Salmonella spp and Shigella spp could be necessary in the case of infectious gastroenteritis syndrome.The objective of this study was to diagnose concomitantly the three enteropathogenic bacteria by multiplex Real-Time PCR in stool culture samples in Ouagadougou (Burkina Faso).Materials and Methods: The study was conducted from February 5th to March 9th, 2013. Two hundred stool samples were received during the study period. The bacteria were identified by bacterial culture following by multiplex Real-Time PCR.Results: Shigella spp and Campylobacter spp were sought by culture in all 200 samples. Enteropathogenic E. coli was sought only in 37 samples from all children under 2 years old. The bacterial culture was positive in 12 stool samples. Shigella spp and Salmonella spp. were isolated respectively in 5 (2.5%) and 3 samples (1.5%). Enteropathogenic E. coli was isolated in 10.8% (4/37) of the samples tested.The multiplex real-time PCR identified bacteria in 20 patients, including 17 cases of Shigella spp., 1 case of Salmonella spp. and 2 cases of Campylobacter spp.Conclusions: This study has highlighted the low frequency of 3 sought bacterial genera in stool samples. It has also demonstrated a significant difference between the culture and the multiplex Real-Time PCR method in the diagnosis of Shigella

Prevention of mother-to-child transmission of hepatitis B virus in Burkina Faso: Screening, vaccination and evaluation of post-vaccination antibodies against hepatitis B surface antigen in newborns

The low rate of screening for hepatitis B virus (HBV) in pregnant women is a highrisk factor for its vertical transmission. The objectives of this study were: i) to screen pregnant women for HBV infection; ii) vaccinate all children from birth against HBV regardless their mother HBV status; and iii) evaluate after 7 months of birth the level of their AbHBs among babies who received HBV vaccine at birth. Serological markers of HBV (HBsAg, HBeAg, AbHBs, AbHBe, and AbHBc) were determined on venous blood samples from 237 pregnant women and their children using the Abon Biopharm Kit. One hundred and two (102) children received the three doses of the EUVAX B® vaccine respectively at birth, two months and four months of life. Seven months after delivery, venous blood samples were collected from mothers and their children. Antibodies against hepatitis B surface antigen (AbHBs) were measured in vaccinated children using the ELISA Kit AbHBs Quantitative EIA. DNA extraction was performed on samples from HBV-seropositive mothers and their children using the Ribo Virus (HBV Real-TM Qual) Kit and for Real Time PCR, the HBV Real-TM Qual Kit was used. Serological diagnosis in pregnant women revealed 22 (9.28%) hepatitis B surface antigen (HBsAg) positive samples of which 21 were positive for viral DNA by real-time PCR. Among the 22 HBsAg+ women, five (05) transmitted the virus to their children with a vertical transmission rate of 22.73%. A transmission rate of 23.81% (5/21) was found with the PCR method. Analysis of AbHBs levels revealed that 98.31% of the children had an average concentration of 218.07 ± 74.66 IU/L, which is well above the minimum threshold for protection (11 IU/L). This study has confirmed that vertical transmission of HBV is a reality in Burkina Faso and that vaccination at birth would significantly reduce this transmission

INSIGHTS INTO THE INTERPLAY BETWEEN KIR GENE FREQUENCIES AND CHRONIC HBV INFECTION IN BURKINA FASO

Background/Objective: The receptors of natural killer cells "Killer Cell Immunoglobulin-Like Receptor" (KIR) regulate the activity of Natural killer cells in the innate response against viral infections. To date there is no accurate method to identify high risk groups for cirrhosis and HCC in Sub-Saharan Africa. Therefore, this investigation was undertaken to assess the association between KIR genes frequencies and chronic infection HBV infection in Burkina Faso’s population. Methods: Chronic HBV carriers and healthy patients were selected for this study. The viral load for HBV were performed to confirm the serological status for HBV of the studied cohort. In addition, SSP-PCR was used to characterize the frequencies of KIR genes. Results: The study suggested that inhibitory genes KIR2DL2, KIR2DL3 and activator gene KIR2DS2 (p˂0.001 for all and OR = 2.82; 2.48 and 3.84 respectively) might be associated with chronic stages of HBV infection.  While inhibitory genes KIR3DL1 (p = 0.0018 OR = 0.49), KIR3DL2 (p = 0.005 OR = 0.40), the activator gene KIR2DS1 (p = 0.014 OR = 0.47) and the pseudo gene KIR2DP1 (p = 0.011 OR = 0.49) could be associated with immunity against HBV infection. Patients who carried the KIR3DL2 gene had a high HBV viral load compared to the rest of the study population. Conclusion: Our data showed an evidence of correlation between the propensity of developing chronic HBV infection and certain KIR gene frequencies and that KIR3DL1, KIR3DL2, KIR2DS1 and KIR2DP1 might confer a protective status against chronic HBV infection in Burkina Faso’s patients