Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the seryl-tRNA synthetase from Candida albicans

The seryl-tRNA synthetase (SerRS) from Candida albicans exists naturally as two isoforms resulting from ambiguity in the natural genetic code. Both enzymes were crystallized by the sitting-drop vapour-diffusion method using 3.2-3.4 M ammonium sulfate as precipitant. The crystals belonged to the hexagonal space group P6(1)22 and contained one monomer per asymmetric unit, despite the synthetase existing as a homodimer (with a molecular weight of ∼116 kDa) in solution. Diffraction data were collected to 2.0 Å resolution at a synchrotron source and the crystal structures of unliganded SerRS and of its complexes with ATP and with a seryl-adenylate analogue were solved by molecular replacement. The structure of C. albicans SerRS represents the first reported structure of a eukaryotic cytoplasmic SerRS.publishe

Dente de um picnodontiforme (Actinopterygii, Neopterygii) da Formação Estiva, Cenomaniano-Turoniano da Bacia de Pernambuco, NE do Brasil

Ray-finned fishes (Actinopterigii) pycnodontiformes compounds a specialized group, small to medium-sized, with laterally compressed body and a batteries of flattened, peg-like teeth on the vomer, adapted for feeding on hard-shelled prey and by its life in near shore environments and/or characterized by reefs. Here is presented their first record to the carbonate deposits included in Estiva Formation, Maracaípe region, in the south of coastal Pernambuco Basin, considered Cenomanian-Turonian in age, where is also the first evidence of vertebrate rests. The record of fish remains open new perspective to this stratigraphic unit and to the basin in general, until the moment poorly known. Key words: pycnodontiformes, Cretaceous, Pernambuco Basin, Estiva Formation.Os actinopterígeos picnodontiformes são formas especializadas de peixes, por sua dentição adaptada à durofagia, o corpo alto e estreito e por se adaptarem a ambientes marinhos rasos e/ou recifais. O achado inédito de restos deste tipo de peixe na região de Maracaípe, porção sul da faixa costeira da Bacia de Pernambuco, bem como a primeira evidência da presença de vertebrados, é comunicado para os depósitos carbonáticos da Formação Estiva, de provável idade Cenomaniano-Turoniano. Com isto, se ampliam os estudos sobre o conteúdo fossilífero da bacia, cujo conhecimento ainda foi pouco explorado. Palavras-chave: dentes picnodontiformes, Cretáceo, Bacia de Pernambuco, Formação Estiva

METODOLOGIA FUZZY PARA AVALIAÇÃO DE ATIVOS INTANGÍVEIS EMPRESARIAIS

O objetivo desse artigo é apresentar uma metodologia que permita quantificar os ativos intangíveis empresariais, a fim de contribuir nas decisões sobre investimentos. Para tanto, a metodologia desenvolvida foi aplicada em grande empresa de navegação para medir seus indicadores de capital humano, estrutural e de relacionamento em sua área de tecnologia da informação. A Lógica Fuzzy foi empregada para quantificar a percepção dos grupos sobre os indicadores e reduzir as incertezas oriundas da linguagem natural. Os resultados representaram um apoio para tomadas de decisão sobre investimentos em ativos intangíveis. A aplicação periódica da metodologia permitirá avaliar os efeitos das decisões dos gestores em outros momentos, contribuindo para o planejamento e controle gerencial, e colaborando para a valorização dos ativos intangíveis da empresa. Os resultados obtidos são específicos da empresa estudada, mas validaram a aplicação e o uso da metodologia em outras empresas

Control of the Mexican bean weevil Zabrotes subfasciatus with vegetable oils, trashing residues, inert materials and malathion

Na busca de alternativas ao controle químico do caruncho Zabrotes subfasciatus (Coleoptera:Bruchidae), avaliou-se, em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), o efeito de três genótipos, cv. Carioca e duas linhagens contendo a proteína arcelina (Arc1 e Arc3), e da adição nos grãos armazenados de óleo de soja (Glycine max Merrill); óleo de nim (Azadirachta indica A. Juss.), munha (resíduo de trilha da colheita), calcário dolomítico e terra de formigueiro, comparativamente aos grãos não tratados e ao controle químico com malathion 500 CE. O experimento foi realizado no laboratório da Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão, localizado no Município de Santo Antônio de Goiás, GO, em condições não controladas. Na linhagem Arc1, constatou-se maior proteção aos danos do caruncho, observando-se redução do número de ovos e de adultos emergidos e da porcentagem de sementes danificadas em relação à Arc3 e à cv. Carioca. Quando os grãos foram tratados com malathion, óleo de nim e óleo de soja, observou-se menor número de ovos e de adultos emergidos e redução de danos, e não houve diferença na porcentagem de sementes danificadas entre o malathion e o óleo de nim. A mistura das sementes com terra de formigueiro conferiu baixa proteção ao caruncho, enquanto os tratamentos com munha e calcário dolomítico não apresentaram eficiência na redução da progênie e dos danos de Z. subfasciatus.The effects of malathion 500 CE, neem (Azadirachta indica A. Juss.) and soybean (Glycine max Merrill) oils, inert materials and trashing residues on the control of Zabrotes subfasciatus (Coleoptera:Bruchidae) were evaluated on bean seeds (Phaseolus vulgaris L.), using the cultivar Carioca and two lines containing the protein arcelin (Arc1 and Arc3). The experiment was carried in a laboratory at Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão, Santo Antônio de Goiás, GO, Brazil, under noncontrolled conditions. The highest levels of protection against Z. subfasciatus were observed in Arc1, with reduction in the number of eggs, number of emerged adults and percentage of damaged seeds than in Arc3 and Carioca cultivar. The number of eggs, number of emerged adults and the percentage of damaged seeds were reduced when the seeds were treated with malathion, neem and soybean oils. There was not difference in percentage of damaged seeds between malathion and neem oil. The treatment of the seeds using ant hill ground showed low efficiency, and trashing residues and dolomitic lime did not show reduction on the progeny and damage of Z. subfasciatus

Cálculo do fluxo de harmônicos em sistemas de potência trifásicos utilizando o método de injeção de correntes com solução iterativa

This work presents a methodology, based on the current injection equations (MICT), for the calculus of the harmonic power flow in three-phase, balanced and unbalanced, electric power systems (MICTH). The developed methodology uses the Newton-Raphson method to obtain the solution of a set of non-linear equations, where the matrix system is built in a blocked form for each harmonic frequency. This mathematical approach permits to represent the interaction between harmonic components of different frequencies. It was also developed models for the main linear and non-linear devices connected to the electric power systems. The MICTH (Three-Phase Harmonic Current Injection Method) and the devices models were implemented in C++ using object-oriented and sparse-matrix programming techniques. The simulation results of the MICTH, obtained in the frequency domain, were validated with simulation results of the ATP/EMTP (Alternative Transients Program of Electromagnetic Transients Program), obtained in the time domain.Este trabalho apresenta uma metodologia, baseada nas equações de injeção de correntes (MICT), para o cálculo do fluxo de potência harmônico trifásico em sistemas elétricos equilibrados e desequilibrados (MICTH). A metodologia desenvolvida emprega o método iterativo de Newton-Raphson para obter a solução do sistema de equações não-lineares, onde o sistema matricial é formado por blocos relativos às freqüências harmônicas investigadas. Dessa maneira é possível representar as interações entre as componentes harmônicas de diferentes freqüências. Em paralelo foram desenvolvidos modelos dos principais dispositivos lineares e não-lineares conectados aos sistemas elétricos de potência. O MICTH (Método de Injeção de Correntes Trifásicas Harmônicas) e os modelos de componentes foram implementados em C++, com programação orientada a objetos, e utilizando técnicas de programação esparsa. Os resultados das simulações, no domínio da freqüência, obtidos com o programa MICTH foram validados a partir de comparações com resultados de simulações, no domínio do tempo, obtidos com o programa ATP/EMTP (Alternative Transients Program of Electromagnetic Transients Program)

Effect of arcelin protein on the biology of Zabrotes subfasciatus (Boheman 1833), in dry beans

A arcelina é uma proteína encontrada em feijões silvestres (Phaseolus vulgaris) e que confere resistência ao caruncho-do-feijão, Zabrotes subfasciatus (Boheman 1833) (Coleoptera: Bruchidae). Estudos foram conduzidos com o objetivo de conhecer o efeito de quatro alelos da proteína arcelina (Arc1, Arc2, Arc3 e Arc4), na biologia de Z. subfasciatus. O experimento foi conduzido no laboratório da Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão, no município de Santo Antônio de Goiás, GO, em condições não controladas. O mais alto nível de antibiose a Z. subfasciatus foi constatado na linhagem portadora do alelo Arc1, observando-se redução do número de ovos produzidos, redução do número de adultos emergidos, redução da longevidade de adultos. Na linhagem Arc2 constatou-se redução apenas no número de adultos emergidos. As linhagens Arc3 e Arc4 apresentaram baixa efi-ciência na redução da progênie de Z. subfasciatus, não observando-se efeito na longevidade e no período ovo-adulto. A razão sexual do inseto não foi alterada pela presença na semente de Arc1, Arc2, Arc3 e Arc4.Arcelin is a seed protein found in wild beans (Phaseolus vulgaris) which gives resistance to Mexican bean weevil, Zabrotes subfasciatus (Boheman 1833) (Coleoptera: Bruchidae). Studies were carried out with the objective of estimating the effect of four alleles of protein arcelin (Arc1, Arc2, Arc3 and Arc4) on the biology of Z. subfasciatus. The experiment was carried out in laboratory at Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijão, in Santo Antônio de Goiás, GO, Brazil, under non controlled conditions. The highest levels of antibiosis to Z. subfasciatus were observed in Arc1, with reduction in the number of eggs, number of emerged adults, adults longevity. In the line Arc2 only reduction in the number of emerged adults was observed. The lines Arc3 and Arc4 showed low efficiency on the reduction of progeny of Z. subfasciatus and effects in the longevity and egg-adult cycle were not detected. Insect sexual ratio was not altered by the presence of Arc1, Arc2, Arc3 and Arc4 in the seeds

DISTRIBUIÇÃO LONGITUDINAL DE PLANTAS E RESISTÊNCIA MECÂNICA DO SOLO À PENETRAÇÃO EM SEMEADURA DE FEIJÃO

Seeders-fertilizers can present problems of direct seeding performance, which are related to soils with high clay contents. Mapping the spatial variability of soil attributes makes it possible to rationalize agricultural management and promote sustainable agriculture. The objective of this work was to evaluate the spatial variability of the longitudinal distribution of plants, and the mechanical resistance of the soil to penetration (RMSP) in sowing of beans grown under no-tillage. A sampling mesh with 112 points spaced 25 m was used, where the plant stand, the uniformity of spacing between seedlings and the RMSP were determined. Most of the area showed low levels of acceptable spacing (45 and 55%), and consequently high levels of double spacing (15 and 25%) and flaws (15 to 35%), showing that the arrangement of plants in the experimental area did not is adequate. The plant stand showed good uniformity throughout the area, with a predominance of 9 to 11 plants m-1. The Mechanical Resistance of Soil to Penetration in the layers of 0.00 - 0.10, 0.10 - 0.20, 0.20 - 0.30, 0.30 - 0.40 m are within the tolerable limits, not restricting plant development.As semeadoras-adubadoras podem apresentar problemas de desempenho de semeadura direta, sendo estes relacionados a solos com altos teores de argila. Com o mapeamento da variabilidade espacial de atributos do solo se torna possível racionalizar o manejo agrícola e promover uma agricultura sustentável. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade espacial da distribuição longitudinal de plantas, e a resistência mecânica do solo à penetração (RMSP) em semeadura de feijão cultivado em semeadura direta. Foi utilizada uma malha amostral com 112 pontos espaçados em 25 m, onde determinou-se o estande de plantas, a uniformidade de espaçamento entre plântulas e a RMSP. A Maior parte da área mostrou baixos níveis de espaçamentos aceitáveis (45 e 55%), e consequentemente altos níveis de espaçamentos duplos (15 e 25%) e falhos (15 a 35%), mostrando que o arranjo de plantas na área experimental não está adequado. O estande de plantas apresentou boa uniformidade ao longo da área, com predomínio da faixa de 9 a 11 plantas m-1. A Resistência Mecânica do Solo à Penetração nas camadas de 0,00 - 0,10, 0,10 - 0,20, 0,20 - 0,30, 0,30 - 0,40 m estão dentro dos limites toleráveis, não restringindo o desenvolvimento de plantas

Self-recycling and partially conservative replication of mycobacterial methylmannose polysaccharides

The steep increase in nontuberculous mycobacteria (NTM) infections makes understanding their unique physiology an urgent health priority. NTM synthesize two polysaccharides proposed to modulate fatty acid metabolism: the ubiquitous 6-O-methylglucose lipopolysaccharide, and the 3-O-methylmannose polysaccharide (MMP) so far detected in rapidly growing mycobacteria. The recent identification of a unique MMP methyltransferase implicated the adjacent genes in MMP biosynthesis. We report a wide distribution of this gene cluster in NTM, including slowly growing mycobacteria such as Mycobacterium avium, which we reveal to produce MMP. Using a combination of MMP purification and chemoenzymatic syntheses of intermediates, we identified the biosynthetic mechanism of MMP, relying on two enzymes that we characterized biochemically and structurally: a previously undescribed ?-endomannosidase that hydrolyses MMP into defined-sized mannoligosaccharides that prime the elongation of new daughter MMP chains by a rare ?-(1?4)-mannosyltransferase. Therefore, MMP biogenesis occurs through a partially conservative replication mechanism, whose disruption affected mycobacterial growth rate at low temperature