Host Immunity and Francisella tularensis: A Review of Tularemia in Immunocompromised Patients

Tularemia, caused by the bacterium Francisella tularensis, is an infrequent zoonotic infection, well known in immunocompetent (but poorly described in immunocompromised) patients. Although there is no clear literature data about the specific characteristics of this disease in immunocompromised patients, clinical reports seem to describe a different presentation of tularemia in these patients. Moreover, atypical clinical presentations added to the fastidiousness of pathogen identification seem to be responsible for a delayed diagnosis, leading to a” loss of chance” for immunocompromised patients. In this article, we first provide an overview of the host immune responses to Francisella infections and discuss how immunosuppressive therapies or diseases can lead to a higher susceptibility to tularemia. Then, we describe the particular clinical patterns of tularemia in immunocompromised patients from the literature. We also provide hints of an alternative diagnostic strategy regarding these patients. In conclusion, tularemia should be considered in immunocompromised patients presenting pulmonary symptoms or unexplained fever. Molecular techniques on pathological tissues might improve diagnosis with faster results

Seven Years Leptospirosis Follow-Up in a Critical Care Unit of a French Metropolitan Hospital; Role of Real Time PCR for a Quick and Acute Diagnosis

International audience(1) Background: Leptospirosis infection can lead to multiple organ failure, requiring hospitalization in an intensive care unit for supportive care, along with initiation of an adapted antibiotic therapy. Achieving a quick diagnosis is decisive in the management of these patients. (2) Methods: We present here a review of leptospirosis cases diagnosed in the intensive care unit of our hospital over seven years. Clinical and biological data were gathered, and we compared the differences in terms of diagnostic method. (3) Results: Molecular biology method by Polymerase Chain Reaction (PCR) allowed quick and reliable diagnosis when performed in the first days after the symptoms began. Moreover, we identified that sampling blood and urine for PCR was more efficient than performing PCR on only one type of biological sample. (4) Conclusions: Our results confirm the efficiency of PCR for the quick diagnosis of leptospirosis and suggest that testing both blood and urine early in the disease might improve diagnosis

Réduction des risques de transferts de contaminants de sols pollués par phytostabilisation

Thème 3: Le génie des procédés pour répondre aux enjeux environnementaux du 21ème siècleInternational audienceMalgré des perspectives favorables, la gestion durable des sites et sols pollués par des déchets industriels (anciens ou actuels) demeure un défi. Le terme générique de laitier sidérurgique englobe plusieurs matériaux aux caractéristiques physico-chimiques différentes : il s’agit de matières minérales artificielles (classifiées en tant que déchets) produites en grande quantité (plusieurs millions de tonnes par an en France) par l’industrie du fer et de l’acier, la sidérurgie. Leur bonne gestion s’impose car les crassiers sidérurgiques peuvent couvrir des surfaces importantes (de plusieurs hectares) et représenter des volumes considérables (plusieurs milliers de mètres cubes). Lorsqu’elles sont stockées sur site, ces matières riches en métaux et en oxydes métalliques (Cr, Mo, W, etc.) représentent autant de sources de contaminations potentielles pour l’air, les sols, les eaux (superficielles et souterraines) et les écosystèmes. Il convient donc d’établir les bonnes pratiques pour l’aide à la décision afin de déterminer les vulnérabilités et réduire les risques

Réduction des risques de transferts de contaminants de sols pollués par phytostabilisation

Thème 3: Le génie des procédés pour répondre aux enjeux environnementaux du 21ème siècleInternational audienceMalgré des perspectives favorables, la gestion durable des sites et sols pollués par des déchets industriels (anciens ou actuels) demeure un défi. Le terme générique de laitier sidérurgique englobe plusieurs matériaux aux caractéristiques physico-chimiques différentes : il s’agit de matières minérales artificielles (classifiées en tant que déchets) produites en grande quantité (plusieurs millions de tonnes par an en France) par l’industrie du fer et de l’acier, la sidérurgie. Leur bonne gestion s’impose car les crassiers sidérurgiques peuvent couvrir des surfaces importantes (de plusieurs hectares) et représenter des volumes considérables (plusieurs milliers de mètres cubes). Lorsqu’elles sont stockées sur site, ces matières riches en métaux et en oxydes métalliques (Cr, Mo, W, etc.) représentent autant de sources de contaminations potentielles pour l’air, les sols, les eaux (superficielles et souterraines) et les écosystèmes. Il convient donc d’établir les bonnes pratiques pour l’aide à la décision afin de déterminer les vulnérabilités et réduire les risques

La phytostabilisation des grandes friches métallurgiques : quelle réduction des risques ?

National audienceA l'heure actuelle, les solutions les plus souvent proposées par les acteurs de la dépollution des sols sont la mise en décharge ou le confinement in situ à l'aide de membranes géosynthétiques couvertes de terre propre. Si ces méthodes sont efficaces et rapides, leur mise en œuvre reste couteuse et leur pertinence écologique est discutable. Une alternative simple consiste à implanter un couvert végétal homogène et pérenne afin de limiter les transferts des contaminants. Cette approche de phytostabilisation est toutefois rarement considérée, faute de retours d'expériences suffisamment nombreux et documentés. Ce travail propose un premier retour d'expérience sur la phytostabilisation d'un crassier métallurgique ; il évalue l'effet d'un couvert végétal sur les 3 voies potentielles de transfert des contaminants : les transferts éoliens, la lixiviation et la bioaccumulation par les plantes

La phytostabilisation des grandes friches métallurgiques : quelle réduction des risques ?

National audienceA l'heure actuelle, les solutions les plus souvent proposées par les acteurs de la dépollution des sols sont la mise en décharge ou le confinement in situ à l'aide de membranes géosynthétiques couvertes de terre propre. Si ces méthodes sont efficaces et rapides, leur mise en œuvre reste couteuse et leur pertinence écologique est discutable. Une alternative simple consiste à implanter un couvert végétal homogène et pérenne afin de limiter les transferts des contaminants. Cette approche de phytostabilisation est toutefois rarement considérée, faute de retours d'expériences suffisamment nombreux et documentés. Ce travail propose un premier retour d'expérience sur la phytostabilisation d'un crassier métallurgique ; il évalue l'effet d'un couvert végétal sur les 3 voies potentielles de transfert des contaminants : les transferts éoliens, la lixiviation et la bioaccumulation par les plantes

Contribution des zones d'échanges entre eau de surface et eau souterraine à la biodiversité des hydrosystèmes : exemple d'une rivière méditerranéenne, la Cèze

International audienc

Are surface water characteristics efficient to locate hyporheic biodiversity hotspots ?

International audienceLocation of river-groundwater exchange zones and biodiversity hotspot is essential for a river management plan,especially for Mediterranean karstic rivers. This location is often difficult and time-consuming when long riversectors are considered. We studied a 13 km-long sector of the Cèze River (Southern France) located in a karsticcanyon.We compared five indicators of river-groundwater exchanges: longitudinal profiles of temperature, electricalconductivity and 222Rn concentrations in the surface water of the river, chemical characteristics of thehyporheic water and hyporheic biodiversity. Upwelling zones occurred downstream of geomorphological heterogeneities(here at the tail of gravel bars). Surface water chemistry, especially electrical conductivity and222Rn concentrations, clearly traces large scale gaining sections, which were not associated to valley narrowingbut with lateral springs, suggesting a crucial role of the geological structuration of the karstic plateau ofMéjanne-le-Clap. Hyporheic water chemistry fits with the large-scale hydrological pattern, but with a high variabilitycorresponding to local heterogeneities. The stygobite fauna (obligate groundwater organisms) and benthicEPTC (Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera and Coleoptera) occurred preferentially in the gainingsections fed by groundwater, likely because of oligotrophicwater and cooler temperature. The spatial distributionof river-groundwater exchange zone and hyporheic biodiversity may be thus predicted using changes in surfacewater chemistry, especially for electrical conductivity and 222Rn concentrations

Les invertébrés aquatiques indicateurs des relations entre le karst et la rivière Exemple de la Cèze

International audienceThe aquatic fauna that lives in the karstic systems related to the Cèze River canyon was studied in two habitats (6 caves and 4 springs) together with the hyporheic fauna of the river (fauna living inside sediment interstices). The karstic fauna was poorly diversified, but probably under-estimate. The spatial heterogeneity was high between caves, between habitats (caves versus springs) and between micro-habitats inside a single cave. At the scale of the micro-habitat, the clay was more densely populated possibly because it represents at the same time a habitat for bioturbators and a source of food. The exchange between the caves and the springs were weak and only a few karstic species drift to the hyporheic habitat of the river. These organisms may represent good indicators of the origin of the hyporheic water and help for the choices in protection strategies.L’étude de la faune aquatique vivant dans les systèmes karstiques proches des gorges de la Cèze a été menée dans deux habitats (6 cavités et 4 sources) en complément de celle de la faune hyporhéique de la rivière (faune vivant dans les interstices des sédiments du lit). La faune du karst s’est révélée peu diversifiée, mais sans doute sous-évaluée. Sa distribution spatiale est fortement hétérogène, aussi bien entre cavités qu’entre habitats (cavités versus sources) ou entre micro-habitats au sein d’une même cavité. À l’échelle du micro-habitat, les zones riches en argile sont les plus peuplées, sans doute parce que l’argile représente à la fois un lieu de vie pour les organismes fouisseurs et une ressource alimentaire. Les échanges faunistiques entre les cavités et les sources sont faibles et seules quelques espèces karstiques dérivent vers le milieu hyporhéique de la rivière. Ces dernières peuvent nous renseigner sur l’origine de l’eau interstitielle et ainsi guider certains choix de gestion

Severe infections due to Francisella tularensis ssp. holarctica in solid organ transplant recipient: report of two cases and review of literature

Abstract Background Tularemia is a rare zoonotic infection caused by bacterium Francisella tularensis. It has been well described in immunocompetent patients but poorly described in immunocompromised patients notably in solid organ transplant recipients. Case presentations We report here two cases of tularemia in solid organ transplant recipients including first case after heart transplant. We also carried out an exhaustive review of literature describing characteristics of this infection in solid organ transplant recipients