Validation of digital microscopy in the histopathological diagnoses of oral diseases

Orientador: Alan Roger dos Santos SilvaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de PiracicabaResumo: A microscopia digital (MD) expandiu-se nos últimos anos em ambientes educacionais e profissionais para interconsulta, telepatologia, armazenamento e relatórios anatomopatológicos, colocando sistemas whole slide imaging (WSI) na posição privilegiada de dispositivos inovadores para interpretação de diagnósticos primários, aplicação previamente concebida com receio. Esta é uma consequência direta da falta de regulamentação desses dispositivos. É necessário reunir evidências sobre o desempenho da MD, para estabelecer se esta tecnologia pode ser usada para fornecer diagnóstico primário com segurança. O primeiro capítulo apresentado no presente estudo teve como objetivo fornecer informações sobre o desempenho de sistemas WSI, avaliando concordância intra-observador como melhor evidência. Uma busca eletrônica nas bases Scopus, MEDLINE/PubMed e Embase foi conduzida. As características metodológicas, a concordância entre a microscopia convencional (MC) e a MD e as razões para a ocorrência de diagnósticos discordantes foram analisadas. Um total de 13 artigos foram incluídos. As concordâncias intra-observadores variaram de 90% a 98,3% (intervalo de confiança de ? = 0,8-0,98). A dificuldade do caso foi o principal motivo de discordância (46,15%), seguido por dificuldades na identificação de microrganismos (15,38%). 58,84% enfatizam que o desempenho do método digital não está relacionado com a ocorrência de discordâncias. Apenas 25% das discordâncias tinham diagnósticos preferenciais por WSI. 15,38% dos estudos incluídos apresentaram alto risco de viés devido à seleção da amostra e 15,38% devido à ausência de especificação de um limiar de positividade. Todos os estudos foram classificados como baixa risco em relação à aplicabilidade. Esta revisão sistemática demonstrou uma alta concordância entre os diagnósticos por WSI e CLM. É possível confirmar que essa tecnologia pode ser usada para fornecer diagnóstico primário em várias especialidades da patologia humana. O segundo capítulo apresentado neste estudo teve como objetivo validar um sistema WSI para fins de diagnóstico de doenças bucais, utilizando a variabilidade intraobservador como a principal forma de análise. Setenta (n = 70) lâminas de vidro coradas em H&E de biópsias orais foram escaneadas pelo Aperio Digital Pathology System (Aperio Technologies Inc., Vista, CA, EUA) em uma magnificação de 20x. Dois patologistas experientes analisaram cegamente todos os casos com MLC e, após 3 meses de washout, com WSI. Informações clínicas foram fornecidas em ambas as análises. A concordância intraobservador entre os métodos foi de 97% para ambos os patologistas. Entre os casos discordantes, a maioria dos diagnósticos preferidos foi por MLC. Ambos os patologistas tiveram as mesmas discordâncias em diferentes casos. A dificuldade de alguns casos, que possibilitou interpretações controversas, e a pouca quantidade de tecido para análise foram consideradas razões principais de desacordo em detrimento dos métodos de diagnóstico. O valor de tempo (mediana) foi maior apenas com MLC para um patologista e, a melhoria do tempo com WSI está relacionada com o melhor fluxo de trabalho provido pelo sistema WSI. Os valores máximos de tempo ocorreram em casos discordantes e em outros casos considerados difíceis. Este estudo fornece evidências originais de um alto desempenho do sistema WSI para fins de diagnóstico na prática clínica, patologia de rotina e diagnóstico primário no campo da patologia oralAbstract: Digital microscopy (DM) has expanded recently in professional settings for interconsultations, telepathology, storage and routine reporting, what puts whole-slide imaging (WSI) systems in the privileged position of innovative devices for interpretation of primary diagnoses, application previously conceived with fear. This is a direct consequence of the lack of regulation of these devices. It is necessary to assemble evidence regarding the performance of the DM, in order to establish whether this technology can be used to provide primary diagnosis. The first chapter presented in this study aimed to provide information regarding the performance of whole slide imaging (WSI) devices, evaluating intraobserver agreement as the best evidence to elucidate whether digital microscopy (DM) is reliable for primary diagnostic purposes. Scopus, MEDLINE/PubMed and Embase were searched electronically. The methodological characteristics, the intraobserver agreement between conventional light microscopy (CLM) and WSI and the reasons for discordant diagnoses were analysed. Thirteen articles were included. The intraobserver agreements showed an excellent concordance, with values ranging from 90% to 98,3%, (? coef?cient range 0.8¿0.98). Challenging cases were the main reasons for disagreements (46.15%) followed by difficulties in the identification of microorganisms (15.38%). 58,84% emphasize that the performance of the digital method is not related to the occurrence of disagreements. Only 25% of discordant cases had preferred WSI diagnosis. 15.38% presented high risk of bias due to unclear sample selection, and 15.38% due to the absence of specification of a threshold. Regarding to applicability, all studies were classified as a low concern. This systematic review showed a high concordance between diagnoses achieved by using WSI and CLM. These studies were also optimally designed to validate WSI for general clinical use and, most importantly, it is possible to confirm that this technology can be used to provide primary diagnosis in several specialties of human pathology.Second chapter of this study intended to validate a WSI system for diagnostic purposes of oral diseases, using the intraobserver variability as the primary form of analysis. Seventy (n = 70) H&E-stained glass slides of oral biopsies were scanned by the Aperio Digital Pathology System (Aperio Technologies Inc., Vista, CA, USA) at a magnification of 20x. Two experienced pathologists blindly analysed all cases with CLM and, after 3 months washout, with WSI. Clinical information was provided in both analyses. The intraobserver agreement between CLM and WSI system diagnoses was 97% for both pathologists. Among discordances, the majority of preferred diagnoses were by CLM. Both pathologists had the same discordances in different cases. Difficult cases, which allowed controversial interpretations, and the lack of tissue for analyses, were considered main reasons for disagreement rather than the diagnostic methods. Median time was higher only in CLM for one pathologist and the improvement of time in WSI was related to better workflow of WSI. Time outliers occurred in discordant cases and other difficult cases. This study provides original evidence for the high-performance of WSI for diagnostic purposes in clinical practice, routine pathology and primary diagnosis in the field of oral pathologyMestradoEstomatologiaMestra em Estomatopatologia33003033009P4CAPE

Visual Analisys of Educational Data: A Gender Study in Computer Courses in University of Brasilia

The presence of women in technology-related courses is declining every year, reaching in 2016 less than 20% of the total student body in the Department of Computer Science in UnB (Universidade de Bras´ılia). This paper uses visualization techniques to analyze and identify profile patterns in girls on undergraduate courses in the computing field. Dimensionality reduction technique (PCA), HeatMap and Parallel Coordinates were used for the visual data analysis process, considering the students’ situation in relation to UnB (active, drop out or graduated). In this work, the existing correlations between variables were evidenced, with more in-depth analysis of the association between entrance period and the nature of the university departure form and period of the university attendance. Also, the students participating in the quota schema were analysed and the study suggests that there is no correlation between students enrolled under the quota system and the form of departure from the course.&nbsp

Movimentos de ocupação : a relação entre o vivido e o viver

Esta Tese trata da organização de movimentos de ocupação na dialética vivido e viver, a partir de uma análise crítica da vida cotidiana. Os três objetos de análise foram: a ocupação dos estudantes na Escola de Administração da UFRGS contra a PEC do Teto dos Gastos; a Ocupação Mulheres Mirabal de luta pelo fim da violência contra mulher; e a Ocupação Lanceiros Negros de luta por moradia digna. O conceito guia para analisar a organização foi o do Grupo de Pesquisa Organização e Práxis Libertadora (2014, p. 312), segundo o qual “organização é a expressão de processos e práticas orientadas pela razão estratégico-crítica para realizar a ação transformadora”. Essa definição é inspirada na Filosofia da Libertação de Enrique Dussel (2000), que tem como princípio ético-material a produção e reprodução da vida humana em comunidade. A organização, nesse sentido, é uma necessidade para viabilizar o que o autor define como práxis da libertação. Além desse conceito, A Crítica da Vida Cotidiana de Henri Lefebvre (2014) foi a fundamentação teórica que possibilitou reconhecer e apreender empiricamente esses processos e práticas organizacionais em suas coerências e, mesmo, contradições. A partir desse aporte, as categorias utilizadas para análise foram: ambiguidade, vivido e viver, organização e razão estratégico crítica. A ambiguidade é a característica do cotidiano pela qual as aparências e o real se confundem, as contradições e as possibilidades não são perceptíveis. O vivido é o conjunto de experiências sociais, enquanto o viver é contexto e o horizonte do vivido, suas expectativas e possibilidades. Indissociáveis, entre os dois se estabelece uma relação dialética que implica a consciência e a práxis. No cotidiano ambíguo, o vivido se torna confuso e opaco e se afasta de viver. A razão estratégico crítica, por sua vez, é a razão de mediações no nível prático, tendo como fim a mediação da vida humana. Para analisar esses movimentos, primeiramente, buscou-se reconstituir, a partir de observações e vivências, a história das ocupações, realizando uma análise crítica da vida cotidiana nesses espaços, identificando, nas práticas e processos organizacionais, elementos que dão significado às vivências individuais e coletivas (vivido) e orientação aos grupos (viver). Nesses três processos organizacionais foi constatada a ruptura da ambiguidade: os estudantes que se conscientizaram da importância do investimento em educação pública para a soberania de um povo; as mulheres da violência patriarcal; os sem teto da lógica urbana subordinada ao capital. Na sua ruptura, o cotidiano se aproxima do vivido, e o vivido se aproxima do viver, abrindo o campo das possibilidades de práxis criativa e ações transformadoras. A experiência da Ocupa EA proporcionou aos estudantes viver práticas pedagógicas horizontais e dialógicas que evidenciaram as possibilidades de uma educação problematizadora e libertadora. A experiência na Mulheres Mirabal permitiu às acolhidas viver em um ambiente seguro e protegido, possibilitando vislumbrar uma vida diferente, longe do ciclo de violência ao qual estavam submetidas. Na Lanceiros Negros, a experiência de morar na área central urbana e de modo coletivo possibilitou novos modos de ser e estar na cidade, com mais acessos e oportunidades. Assim, o argumento aqui defendido é que a práxis da libertação, mediada pela organização estratégica-crítico, passa pela dialética vivido e viver, sendo a vida cotidiana a esfera em que esse movimento acontece.This Thesis is about the organization of occupy movements in the dialectic of lived and living, from a critical analysis of everyday life. The three objects of analysis were: student occupy at Administration School in UFRGS against PEC do Teto dos Gastos; the Mulheres Mirabal Occupy struggle for the end of violence against women; and the Lanceiros Negros occupy struggle for decent housing. The guiding concept for analyzing the organization was that of the Research Group Organização e Práxis Libertadora (2014, p. 312), according to which “organization is the expression of processes and practices guided by strategic-critical reason to carry out transformative action”. This definition is inspired by Enrique Dussel's Philosophy of Libertation (2000), which has as its ethical-material principle the production and reproduction of human life in community. The organization, in this sense, is a necessity to make possible what the author defines as libertarian praxis. In addition to this concept, Henri Lefebvre's The Critique of Everyday Life (2014) was the theory that made possible to recognize and empirically apprehend these organizational processes and practices in their coherence and even contradictions. From this theoretical contribution, the categories used for analysis were: Ambiguity, Lived and Living, Organization and Critical Strategic Reason. Ambiguity is the characteristic of daily life in which appearances and the real are confused, contradictions and possibilities are not noticeable. The lived is the set of social experiences, while the living is context and the horizon of the lived, its expectations and possibilities. Inseparable, between both is established a dialectical relationship that implies the consciousness and praxis. In the ambiguous daily life, the lived becomes confused and opaque and moves away from living. The critical strategic reason, in turn, is the reason for mediations at the practical (technical) level with the aim of mediating human life. To analyze these movements, first sought to reconstruct, from observations and experiences, the history of occupations, performing a critical analysis of daily life in these spaces, identifying, in organizational practices and processes, elements that give meaning to individual and collective experiences (lived) and groups orientation (living). In these three organizational processes the ambiguity was broken: students who became aware of the importance of investing in public education for the sovereignty of a people; the women of patriarchal violence; the homeless of the urban logic subordinated to capital. In its rupture, daily life get closer to the lived, and the lived close to the living, opening the field of possibilities of creative praxis and transformative actions. The experience of Ocupa EA enable the students live horizontal and dialogic pedagogical practices that highlighted the possibilities of a problematizing and libertarian education. The experience at Mulheres Mirabal allowed the women live in a safe and protected environment, allowing them to see a different life away from the cycle of violence to which they were subjected. At Lanceiros Negros, the experience of living in the central urban area and in community enabled new ways of being in the city, with more access and opportunities. In this sense, the argument defended here is that the libertarian praxis, mediated by the strategic-critical organization, passes through the dialectic lived and living, and the everyday life is the sphere in which this movement takes place

A ocupaçao urbana em Almirante Tamandaré : um desafio r sustentabilidade

Orientadora: Olga Lúcia Castreghini de Freitas FirkowskiDissertaçao (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciencias da Terra, Programa de Pós-Graduaçao em Geografia. Defesa: Curitiba, 2005Inclui bibliografi

Perfil Sócio Econômico Dos Estudantes Concluintes No Centro De Ensino Médio Cem Professor Florêncio Aires Em Porto Nacional - To

The good academic performance of a student depends on the result of the interaction of several factors intrinsic and extrinsic to the person, and the performance presented by the student during the school learning process depends, on other factors, such as social conditions, personal relationships and psychological conditions. Thus, the objective of this work was to describe the socioeconomic profile of high school seniors at Escola Cem Professor Florêncio Aires in Porto Nacional- TO. Field research was used as a methodology. A total of 33 students participated in the survey, which was carried out between October 18th and 25th, 2021, through the application of an electronic form created in Google Forms. The results show that 18 (55%) are female; (46%) consider themselves of mixed ethnicity, followed by white (36%); 34% of students walk to school; 33% by car; 24% by bicycle and 9% by motorcycle; 97% of students live with their parents and 3% with a grandmother(ô). The most prevalent type of residence was own (70%), rented (27%) and loaned (3%). In the end, it was concluded that none of the students receive benefits from the federal government's social programs and stated that they intended to attend higher education after completing high school.O bom desempenho acadêmico de um aluno depende do resultado da interação de vários fatores intrínsecos e extrínsecos à pessoa, sendo que o rendimento apresentado pelo estudante durante o processo de aprendizagem escolar depende, de outros fatores, como é o caso das condições sociais, relações pessoais e condições psicológicas. Desta maneira, o objetivo deste trabalho foi descrever o perfil socioeconômico de estudantes concluintes do ensino médio da Escola Cem Professor Florêncio Aires do município de Porto Nacional-TO. Utilizou-se como metodologia a pesquisa de campo. Participaram da pesquisa um total de 33 alunos, sendo a mesma realizada entre os dias 18 a 25 de outubro de 2021, através da aplicação de um formulário eletrônico elaborado no Google Forms.Os resultados apontam que 18 alunos são do sexo feminino; (46%) consideram-se de etnia parda, seguido da branca (36%); 34% dos alunos se deslocam para a escola a pé; 33% de carro; 24 % de bicicleta e 9% de moto; 97% dos alunos residem com os pais e 3% com avó(ô). O tipo de residência que mais prevaleceu foi a própria, seguida da alugada e da cedida. Ao final concluiu-se que nenhum dos alunos recebem benefícios de programas sociais do governo federal e afirmaram ter pretensão de cursarem nível superior ao concluírem o ensino médio

Obtenção de nanotubos de carbono a partir da reação de decomposição catalítica do metano sobre catalisadores de ferro, cobalto e níquel suportados em alumina

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2013.Este trabalho teve como objetivo a obtenção de nanotubos de carbono através da reação de decomposição catalítica do metano realizada sobre catalisadores contendo 5% ou 10% de ferro, cobalto ou níquel suportados em alumina. Foram testadas diferentes condições de ativação dos catalisadores, diferentes fluxos reacionais e diferentes temperaturas reacionais (somente para os catalisadores de níquel). O método de impregnação utilizado no preparo dos materiais foi o método de impregnação úmida, o qual mostrou-se efetivo através das análises de Absorção Atômica e Energia Dispersiva. Os catalisadores foram caracterizados através de Fisissorção de Nitrogênio, Difração de Raios X, Redução a Temperatura Programada e Microscopia Eletrônica de Varredura, e o material depositado sob os catalisadores foi caracterizado através de Análise Termogravimétrica, Espectroscopia Raman e Microscopia Eletrônica de Transmissão. Os rendimentos mostraram-se dependentes do fluxo de metano, sendo que, com o fluxo baixo, os catalisadores apresentaram baixo rendimento. Os catalisadores foram capazes de depositar nanotubos de carbono independentemente da condição de ativação empregada, sendo que o catalisador contendo 10% Co na condição de ativação 1, e o catalisador contendo 10% Fe na condição de ativação 2 formaram nanotubos de carbono de paredes simples. Os demais catalisadores formaram nanotubos de paredes múltiplas em ambas as condições. Os rendimentos para os catalisadores de níquel mostraram-se dependentes da temperatura reacional, apresentando maior rendimento a 700°C, porém, formando nanotubos de menor qualidade. Abstract : This study aimed to obtain carbon nanotubes by catalytic decomposition of methane held on catalysts containing 5% or 10% iron, cobalt or nickel supported on alumine. It were tested different conditions of activation of the catalysts, different flows and different temperature?s reactions (only for nickel catalysts). The impregnation method used in the preparation of materials was the wet impregnation method, which proved to be effective by Atomic Absorption and Energy Dispersive analysis. The catalysts were characterized by Nitrogen Physisorption, X-ray Diffraction, Temperature Programmed Reduction and Scanning Electron Microscopy, and the material deposited on the catalysts was characterized by Thermogravimetric Analysis, Raman Spectroscopy and Transmission Electron Microscopy. The yields were dependent on the methane flow, while with the low flow rate, the catalysts showed low yield. The catalysts were able to deposit carbon nanotubes regardless of activation conditions employed, where the catalyst containing 10% Co in the activation condition 1, the catalyst containing 10% Fe in the activation condition 2 formed single-walled carbon nanotubes. The other catalysts formed multi-walled nanotubes in both conditions. The yields for nickel catalysts were dependent on the reaction temperature, with higher yields at 700°C, however, formed low-quality nanotubes

Vinte anos do projeto de saúde bucal no colégio de aplicação da ufsc: relato de experiência

TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências da Saúde. Odontologia.RESUMO O Colégio de Aplicação (CA), fundado em 1961, proporciona diversas experiências pedagógicas e estágio supervisionados para muitos cursos de graduação da universidade, e atende a política da UFSC de Ensino, Pesquisa e Extensão. O presente trabalho, de caráter descritivo-analítico, teve como principal objetivo analisar como o Projeto de Saúde Bucal do CA da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) atuou durante o período de 2000 a 2020, descrevendo como foram realizadas as atividades lúdicas, de promoção de saúde, e os atendimentos clínicos odontológicos. O Projeto de Saúde Bucal conta com a participação de alunos da graduação (bolsistas e voluntários), professores do curso de odontologia da UFSC, estudantes e professores do CA e alunos de pós-graduação em odontologia. Como metodologia de pesquisa, procedeu-se à aplicação de questionários a uma amostra intencional de 40 participantes, divididos em dois grupos: grupo 1 sendo alunos, ex-alunos, professores e funcionários do CA, e grupo 2 sendo alunos, ex-alunos, professores e pós-graduandos do curso de odontologia da UFSC que participaram do projeto. Foi também realizado um relato das atividades lúdicas educativas (como são planejadas e realizadas), e dos atendimentos clínicos odontológicos (número de crianças atendidas, necessidades avaliadas e procedimentos realizados). Os resultados demonstraram um número elevado de participantes no projeto, além de muitos diferenciais, como um grande número de atividades focadas na educação e promoção da saúde, e na prevenção de doenças bucais. O número não tão elevado de atendimentos clínicos curativos, deve-se ao fato de essas atividades de prevenção realmente surtirem efeito, e apesar de existirem procedimentos odontológicos realizados na clínica do CA, os mesmos tem como base a mínima intervenção, prezando pela odontologia conservadora. Pode-se perceber a importância de uma Escola Promotora de Saúde, seu papel na construção de ensinamentos e hábitos cotidianos para a saúde da população. Além de influenciar nos bons hábitos da comunidade escolar, o projeto impacta na melhoria da qualificação dos profissionais formados, pois conseguem, ainda, disseminar os conhecimentos adquiridos na faculdade. Concluiu-se que existindo uma constância nesse tipo de prática e acompanhamentos a longo prazo tem-se bons resultados na avaliação da saúde bucal dos indivíduos e na qualidade de prevenção de doenças. Além disso, foi possível perceber que projetos comunitários como este contribuem na formação do cirurgião-dentista, construindo uma visão prática do todo e não apenas da resolução da doença bucal.ABSTRACT The Colégio de Aplicação (CA), founded in 1961, provides several supervised pedagogical experiences and internships for many undergraduate courses at the university, and meets Universidade Federal de Santa Catarina’s (UFSC) Teaching, Research and Extension policy. The present work, of a descriptive-analytical character, had as main objective to analyze how the Oral Health Project of the CA of the UFSC acted during the period from 2000 to 2020, describing how the playful activities were carried out, health promotion, and clinical dental care. The Oral Health Project has the participation of undergraduate students (scholarship holders and volunteers), professors from the UFSC dentistry course and students and professors from CA. As a research methodology, in addition to applying questionnaires to an intentional sample of 40 participants, divided into two groups: group 1 being students, alumni, professors and employees of the CA, and group 2 being students, alumni, teachers and graduate students from the UFSC dentistry course who participated in the project. An account was made of the educational play activities (as they are planned and performed), and of the dental clinical care (number of children attended, needs assessed and procedures performed). The results demonstrated a high number of participants in the project, in addition to many differences, such as a large number of diverse activities focused on prevention, which in addition to influencing students to have new habits, impact the lives of their families. The not-so-high number of curative clinical care is due to the fact that these prevention activities really have an effect, and although there are dental procedures performed at the clinic present at the school, they are based on minimal intervention and cherishing conservative dentistry. One can perceive the importance of a Health Promoting School, its role in the construction of teachings and daily habits for the population's health. In addition to influencing the good habits of the school community, the project has an impact on improving the qualification of trained professionals, as they are also able to disseminate the knowledge acquired in college. It was concluded that there is a constancy in this type of practice and long-term follow-up, it has good results in the evaluation of the oral health of individuals and in the quality of disease prevention. In addition, it was possible to perceive that community projects like this contribute to the training of dentists, building a practical view of the whole and not just the resolution of oral disease

Estudo da reação de decomposição do etanol para formação de hidrogênio e nanotubos de carbono sobre catalisadores de Ni/Al2O3 e Co/Al2O3

TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Curso de Química.A crescente demanda pela substituição de combustíveis fósseis por fontes de energia que sejam renováveis e não-poluentes tem proporcionado um crescimento tecnológico. Um exemplo disso é o crescente interesse do uso do hidrogênio como combustível limpo, e o etanol aparece como uma boa alternativa renovável de fonte de hidrogênio. A reação de decomposição do etanol apresenta a vantagem de formar, além de H2, nanotubos de carbono, os quais possuem alto valor agregado. Neste trabalho foram preparados e caracterizados catalisadores à base de níquel e cobalto impregnados em alumina comercial e em alumina em esferas – método desenvolvido pelo grupo LABOCATH - para produção de hidrogênio e nanotubos de carbono na reação de decomposição catalítica do etanol. O método de preparação do suporte em esferas mostrou-se eficiente, apresentando resultados próximos aos do suporte comercial. A caracterização dos catalisadores mostrou diferentes propriedades texturais conforme o tipo de suporte. Ambos apresentaram atividade frente à produção de hidrogênio e formaram carbonos nanoestruturados, confirmados por análise termogravimétrica, microscopia eletrônica de transmissão e espectroscopia Raman