Automated identification of cell organelles by deep learning convolutional neural networks

Las proteínas en nuestro organismo son las encargadas de formar tejidos, transportar sustancias y defender al organismo contra infecciones o agentes patógenos, entre otras funciones. Conociendo la ubicación y el transporte de la proteína en el interior de la célula se puede conocer mucha información sobre su funcionalidad y los mecanismos de las enfermedades. Así, la identificación automatizada de los orgánulos celulares sirve de gran importancia para caracterizar los genes recién descubiertos o con una función desconocida. Las proteínas serían marcadas fluorescentemente para poder identificar el orgánulo donde residen y la identificación automatizada se puede realizar fácilmente con redes neuronales convolucionales mediante Inteligencia Artificial. En este trabajo, haciendo uso de un conjunto de imágenes de microscopía de fluorescencia de células HeLa, se utilizan distintos modelos basados en redes neuronales convolucionales para identificar y clasificar los distintos orgánulos celulares. Asimismo, se presenta la precisión y el error de cada modelo y se elige el modelo más acorde a solucionar este problema

Exploring the Gain of Function Contribution of AKT to Mammary Tumorigenesis in Mouse Models

Elevated expression of AKT has been noted in a significant percentage of primary human breast cancers, mainly as a consequence of the PTEN/PI3K pathway deregulation. To investigate the mechanistic basis of the AKT gain of function-dependent mechanisms of breast tumorigenesis, we explored the phenotype induced by activated AKT transgenes in a quantitative manner. We generated several transgenic mice lines expressing different levels of constitutively active AKT in the mammary gland. We thoroughly analyzed the preneoplastic and neoplastic mammary lesions of these mice and correlated the process of tumorigenesis to AKT levels. Finally, we analyzed the impact that a possible senescent checkpoint might have in the tumor promotion inhibition observed, crossing these lines to mammary specific p53(R172H) mutant expression, and to p27 knock-out mice. We analyzed the benign, premalignant and malignant lesions extensively by pathology and at molecular level analysing the expression of proteins involved in the PI3K/AKT pathway and in cellular senescence. Our findings revealed an increased preneoplastic phenotype depending upon AKT signaling which was not altered by p27 or p53 loss. However, p53 inactivation by R172H point mutation combined with myrAKT transgenic expression significantly increased the percentage and size of mammary carcinoma observed, but was not sufficient to promote full penetrance of the tumorigenic phenotype. Molecular analysis suggest that tumors from double myrAKT;p53(R172H) mice result from acceleration of initiated p53(R172H) tumors and not from bypass of AKT-induced oncogenic senescence. Our work suggests that tumors are not the consequence of the bypass of senescence in MIN. We also show that AKT-induced oncogenic senescence is dependent of pRb but not of p53. Finally, our work also suggests that the cooperation observed between mutant p53 and activated AKT is due to AKT-induced acceleration of mutant p53-induced tumors. Finally, our work shows that levels of activated AKT are not essential in the induction of benign or premalignant tumors, or in the cooperation of AKT with other tumorigenic signal such as mutant p53, once AKT pathway is activated, the relative level of activity seems not to determine the phenotype

Baby's first microbes: The microbiome of human milk

At the beginning of the twenty-first century, microbiological studies on human milk started to describe the existence of its own microbiota. Hygienically collected milk samples from healthy women contain a relatively low bacterial load consisting mostly of Staphylococcus, Streptococcus, and other Gram-positive bacteria (Corynebacterium, Propionibacterium, Lactobacillus and Bifidobacterium). DNA from strict anaerobic bacteria is also detected in human milk samples. Colostrum and milk bacteria may play a key role in driving the development of the infant gut microbiota, the correct maturation of the infant immune system and the improvement of tolerance mechanisms. A well-balanced human milk microbiota is also relevant for maternal breast health. The origin of human milk bacteria still remains largely unknown. Infant’s oral cavity and maternal skin may contaminate milk. Additionally, selected bacteria of the maternal digestive microbiota may access the mammary glands through oral- and entero-mammary pathways by involving mononuclear cells for their transport. These pathways would provide new opportunities for manipulating maternal-fetal microbiota, reducing the risk of preterm birth or infant diseases

El huerto escolar : recurso educativo del geocentro

El trabajo obtuvo un premio de la Modalidad A de los Premios Tomás García Verdejo a las buenas practicas educativas en la Comunidad Autónoma de Extremadura para el curso 2011-2012Se describe un proyecto que consistió en crear un huerto escolar con el que se quería enfatizar la importancia de la protección del medio ambiente y fomentar el respeto y el amor por la naturaleza, valorando su importancia e interdependencia con la vida de los seres humanos. Se detallan las actividades llevadas a cabo dirigidas tanto a alumnos de infantil como de primariaExtremaduraES

VI Premio Nacional de Educación Para el Desarrollo "Vicente Ferrer" 2014 : buenas prácticas

La AECID junto con el Minis¬terio de Educación, Cultura y Deporte convoca anualmente los premios de educación para el desarrollo que están dirigidos a todos los centros docentes españoles sostenidos con fondos públicos que impartan educación infantil, educación primaria, educación secundaria obligatoria, bachillerato y for-mación profesional. Se recogen las buenas prácticas de los docen¬tes premiados en esta sexta edición. Docentes que en el ejercicio de su función educadora han con¬vertido el proceso educativo en un proceso diná¬mico e interactivo que permite al alumnado desarrollar un conocimiento crítico de nuestro mundo. Profesores y profe¬soras que han estimulado la participación del alum¬nado en la construcción de estructuras sociales más justas y solidarias, y han promovido actuaciones ba¬sadas en el principio de la corresponsabilidad de todos los actores implicados. El premio reconoce el esfuerzo realizado por centros educativos que establecen y creen en un modelo educativo que propone resaltar el papel de las personas y generar conciencias de carácter global que permitan al alumnado ser pieza clave de la ciudadanía del futuro, con un dinamismo que afronte las nuevas realidades desde una perspectiva más humana y responsable con el territorio en el que se ubican.ES

La vuelta al día en 24 mundos

El trabajo obtuvo un Premio Tomás García Verdejo a las buenas prácticas educativas en la Comunidad Autónoma de Extremadura para el curso académico 2015/2016. Modalidad ASe presenta un proyecto llevado a cabo entre varios centros educativos de la provincia de Cáceres que consistió en hacer actividades de fomento y animación a la lectura ligadas a los continentes del globo terrestre. Los objetivos del proyecto fueron: fomentar la relación y convivencia entre los centros; promover el trabajo colaborativo; propiciar ambientes que fomenten valores como la responsabilidad, el esfuerzo, la igualdad entre géneros y el respesto; conocer y disfrutar las diferentes formas literarias como relatos, poemas y obras dramáticas a través de la lectura, la escucha y la propia creación y recreación; comprender y respetar las diferentes culturas y las diferencias entre las personas; iniciarse en el uso de las nuevas tecnologías desarrollando un espíritu crítico ante los mensajes que reciben y elaboran y utilizar diferentes representaciones y expresiones artísticas e iniciarse en la construcción de propuestas visuales y audiovisualesExtremaduraES

Nuevos escenarios para la innovación educativa : el Grupo CREA (Centros en Red para las Enseñanza Activas) y la renovación metodológica de los centros educativos

Convocatoria Proyectos de innovación de Extremadura 2018/2019Proyecto que agrupa a cinco centros educativos: el IES Jaranda (Jarandilla de la Vera, Cáceres), el IESO Sierra la Mesta (Santa Amalia, Badajoz), el IES Albarrega (Mérida, Badajoz), el IESO Val de Xálima (Valverde del Fresno, Badajoz), IESO Matías Ramón Martínez (Burguillos del Cerro, Badajoz) que conforman el Grupo CREA y que comparten una trayectoria común: el uso de metodologías educativas activas. A las iniciativas innovadoras llevadas a cabo colectivamente se suman las individuales de cada centro debido a la particularidad de cada uno de ellos. Los objetivos principales del proyecto son: la creación de una estructura organizativa y de coordinación entre los distintos centros participantes que permita la planificación y puesta en marcha de acciones educativas conjuntas; la introducción de cambios organizativos, funcionales, espaciales y metodológicos para llevar a cabo aprendizajes basados en proyectos, orientados al servicio a la comunidad y a los problemas sociales, centrados en el aprendizaje cooperativo, etc.; el diseño y desarrollo de programas de innovación coordinados entre los distintos centros educativos participantes; el establecimiento de mecanismos de coordinación para hacer efectiva la comunicación, el intercambio de información, el análisis y la reflexión del profesorado participante en los programas de innovación de cada uno de los centros; la formación conjunta del profesorado; el desarrollo de proyectos conjuntos para los alumnos participantes, su conexión en entornos virtuales, el intercambio de experiencias en encuentros periódicos, etc. y la generación y fomento de una nueva red creando un portal web y un espacio de comunicación e intercambio de documentaciónExtremaduraES