Automated identification of cell organelles by deep learning convolutional neural networks

Abstract

Las proteínas en nuestro organismo son las encargadas de formar tejidos, transportar sustancias y defender al organismo contra infecciones o agentes patógenos, entre otras funciones. Conociendo la ubicación y el transporte de la proteína en el interior de la célula se puede conocer mucha información sobre su funcionalidad y los mecanismos de las enfermedades. Así, la identificación automatizada de los orgánulos celulares sirve de gran importancia para caracterizar los genes recién descubiertos o con una función desconocida. Las proteínas serían marcadas fluorescentemente para poder identificar el orgánulo donde residen y la identificación automatizada se puede realizar fácilmente con redes neuronales convolucionales mediante Inteligencia Artificial. En este trabajo, haciendo uso de un conjunto de imágenes de microscopía de fluorescencia de células HeLa, se utilizan distintos modelos basados en redes neuronales convolucionales para identificar y clasificar los distintos orgánulos celulares. Asimismo, se presenta la precisión y el error de cada modelo y se elige el modelo más acorde a solucionar este problema

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