Pneumocystis jiroveci Dihydropteroate Synthase Genotypes in Immunocompetent Infants and Immunosuppressed Adults, Amiens, France

To date, investigations of Pneumocystis jiroveci circulation in the human reservoir through the dihydropteroate synthase (DHPS) locus analysis have only been conducted by examining P. jirovecii isolates from immunosuppressed patients with Pneumocystis pneumonia (PCP). Our study identifies P. jirovecii genotypes at this locus in 33 immunocompetent infants colonized with P. jirovecii contemporaneously with a bronchiolitis episode and in 13 adults with PCP; both groups of patients were monitored in Amiens, France. The results have pointed out identical features of P. jirovecii DHPS genotypes in the two groups, suggesting that in these two groups, transmission cycles of P. jirovecii infections are linked. If these two groups represent sentinel populations for P. jirovecii infections, our results suggest that all persons parasitized by P. jirovecii, whatever their risk factor for infection and the form of parasitism they have, act as interwoven circulation networks of P. jirovecii

Distinction entre pneumonie et colonisation à pneumocystis jirovecii (intérêt des nouveaux outils biologiques)

L objectif de notre travail a été de discriminer, d un point de vue biologique, les pneumonies à P.jirovecii (PPC) et les colonisations. Pour cela, nous avons travaillé de manière rétrospective sur 59 prélèvements respiratoires et 29 échantillons sériques provenant de 17 patients développant une PPC et de 36 patients colonisés par le champignon, hospitalisés au CHU d Amiens entre le 10 janvier 2008 et le 8 janvier 2009. Les prélèvements respiratoires correspondaient à 44 lavages broncho-alvéolaires, neuf expectorations spontanées, cinq aspirations bronchiques et un lavage oro-pharyngé. La distinction des cas de PPC et de colonisation a été établie par l analyse des dossiers cliniques. La quantification de P.jirovecii dans les prélèvements respiratoires a été réalisée à l aide d une technique de PCR ( polymerase chain reaction ) en temps réel. Dans la mesure où les prélèvements respiratoires étaient de nature différente, la quantité d ADN de P.jirovecii amplifié a ensuite été rapportée à la quantité d ADN humain amplifié. Parallèlement, le taux sérique de (1-3) b-D-glucane a été mesuré à l aide d une technique ELISA. La quantité moyenne d ADN de P.jirovecii était significativement plus importante dans les prélèvements respiratoires des patients présentant une PPC que dans ceux des patients colonisés (8,25.106 vs 5,27.102, p<0,05). Le seuil moyen de détection de l ADN de P.jirovecii rapporté au seuil moyen de détection de l ADN humain était significativement plus bas chez les patients présentant une PPC que chez les patients colonisés (1,07 vs 1,49, p<0,05). Le taux sérique moyen de (1-3) b-D-glucane était significativement plus élevé chez les patients présentant une PPC que chez les patients colonisés (1467 vs 77 pg/mL, p<0,05). Au total, la détection quantitative de P.jirovecii, ajustée à la nature du prélèvement respiratoire et associée à la détermination du taux sérique de (1-3) b-D-glucane, apporte de nouvelles données biologiques visant à distinguer les PPC et les colonisations. Ces données, complétées par les éléments cliniques, devraient permettre d adapter au mieux la prise en charge médicale des patients infectés par P.jirovecii.The aim of this study was to develop a method for distinguishing PCP and pulmonary colonisation with P.jirovecii, using a quantitative real time PCR assay for the fungus detection in pulmonary specimens combined with the quantification of (1-3) b-D-glucans in sera. Fifty three patients, who were hospitalized to Amiens University Hospital (Amiens, France) between January 2008 and January 2009, were retrospectively enrolled in the study. They were initially diagnosed with PCP (17 patients) and pulmonary colonization with P.jirovecii (36 patients) based on the detection of the fungus in pulmonary specimens using microscopy or a conventional PCR assay, the clinical presentation of the pulmonary disease and the outcome. Archival pulmonary specimens of the patients were assayed using a quantitative real time PCR assay amplifying the mtLSUrRNA gene of P.jirovecii and a human house keeping gene. A ratio P.jirovecii DNA/human DNA was established. (1-3) b-D-glucans were quantified in patients sera using a commercially available ELISA. P.jirovecii DNA levels were significantly higher in PCP patients than those in colonized patients (8.25.106 vs 5.27.102, p<0.05). The ratio P.jirovecii DNA/human DNA in PCP patients was significantly lower than those in colonized patients (1.05 vs 1.49, p<0.05). (1-3) b-D-glucan levels was significantly higher in PCP patients than those in colonized patients (814.2 pg/mL vs 149 pg/mL, p<0.05). The results show that the quantitative detection of P.jirovecii DNAs correlated with the quantitative detection of human DNAs in pulmonary specimens combined with the quantification of (1 3) b-D-glucans in sera appears as a discriminative method for PCP and pulmonary colonisation diagnoses.AMIENS-BU Santé (800212102) / SudocSudocFranceF

Détection et génotypage de pneumocystis jirovecii chez les patients présentant une bronchopneumopathie chronique obstructive

Le genre Pneumocystis désigne un groupe de champignons opportunistes présentant une étroite spécificité d'hôte et déterminant lors d'immunodépression sévère une infection grave, la pneumocystose. Le concept d'un réservoir humain pour Pneumocystis jirovecii (P.jirovecii), forme spécifique retrouvée chez l'Homme, est la base de notre travail. A l'aide d'une technique de nested PCR, nous avons évalué la fréquence de colonisation par P.jirovecii chez les patients présentant une bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO) à 16%. Nous avons de plus établi un lien statistique entre BPCO et colonisation par P.jirovecii. L'analyse des séquences des espaceurs transcrits internes 1 et 2 de l'opéron ARN ribosomique nucléaire et du gène de la dihydroptéroate synthétase a permis de montrer que les isolats de P.jirovecii retrouvés chez les patients bronchopathes chroniques présentaient des caractéristiques génotypiques identiques à ceux rapportés chez les adultes immunodéprimés développant une pneumocystose. Cette communauté génotypique est en faveur de l'unicité du réservoir humain de P.jirovecii. La fréquence de la BPCO dans la population générale, combinée à la fréquence de P.jirovecii chez les patients bronchopathes chroniques, suggèrent que ces patients représentent une part essentielle de ce réservoirAMIENS-BU Santé (800212102) / SudocSudocFranceF

CONTRIBUTION A L'ETUDE DE L'EPIDEMIOLOGIE DE LA PNEUMOCYTOSE. POLYMORPHISME GENOMIQUE ET VIABILITE DE PNEUMOCYSTIS CARINII F.SP. HOMINIS CHEZ LE NOURRISSON

AMIENS-BU Santé (800212102) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Impact épidémiologique de l'infection à Pneumocystis jirovecii chez le nourrisson (apport des études moléculaires)

Le genre Pneumocystis désigne un groupe de champignons opportunistes présentant une étroite spécificité d'hôte et déterminant lors d'immunodépression sévère une infection grave, la pneumocystose. Le concept d'un réservoir humain pour Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii), forme spécifique retrouvée chez l'Homme, est la base de ce travail de recherche. A l'aide de deux techniques de PCR, une nested-PCR et une PCR en temps réel, nous avons mis en évidence une forte prévalence de P. jirovecii chez les nourrissons immunocompétents développant une bronchiolite. En raison de cette forte prévalence, l'infection à P. jirovecii chez le nourrisson pourrait représenter la forme la plus commune des infections à P. jirovecii dans les populations humaines. Cette infection chez le nourrisson correspond à une primo-infection, soit attestée par les données sérologiques, soit fortement suspectée en raison du jeune âge des sujets. L'analyse des séquences des ''Internal Transcribed Spacers'' 1 et 2 de l'opéron nucléaire de l'ARN ribosomique a permis de montrer que les isolats de P. jirovecii retrouvés chez les nourrissons présentaient des caractéristiques génotypiques identiques à ceux rapportés chez les adultes immunodéprimés développant une pneumocystose. Cette communauté génotypique est en faveur de l'unicité du réservoir humain de P. jirovecii. Les résultats de l'analyse d'un second locus, le locus de la dihydroptéroate synthétase, renforcent cette hypothèse puisqu'ils suggèrent l'existence d'une circulation de P. jirovecii entre les deux populations d'individus infectés. Dans le but de tester l'hypothèse que ces patients puissent être une source de micro-organismes transmissibles, un test de viabilité basé sur une technique de RT-PCR ayant pour séquence cible l'ARNm du gène Phsb1 de la HSP 70 a été développé. Les résultats positifs obtenus suggèrent que P. jirovecii puisse rester vivant en situation de transit dans les voies aériennes supérieures des nourrissons et que ceux-ci puissent en conséquence représenter des sources de P. jirovecii potentiellement pathogène pour des individus contacts susceptiblesAMIENS-BU Santé (800212102) / SudocSudocFranceF

The Fascinating Echinocandin-Treated Mouse Model of Pneumocystis murina To Understand Pneumocystis jirovecii

International audienc

« Oh les jolis veaux ! »

International audienc

« Une histoire d’éperon »

International audienceDescription Un jeune garçon de 15 ans est hospitalisé pour malaise et perte de connaissance à la suite d'une dispute avec sa famille d'accueil temporaire. Le bilan étiologique complet, comprenant notamment un scanner cérébral injecté et un électroencéphalogramme, est sans particularité. Au cours de l'hospitalisation, on découvre une hématurie macroscopique, associée à des douleurs scrotales. Le reste de l'examen clinique est normal. Le patient est, par ailleurs, apyrétique et en parfait état général. À l'interrogatoire, on apprend qu'il est originaire de Côte d'Ivoire, qu'il vit le reste de l'année dans un foyer pour mineurs en Seine-Saint-Denis (93), et que son dernier séjour dans son pays natal remonte à cinq ans. Le bilan sanguin montre une légère hyperéosinophilie (1,1 G/L ; N inférieur à 0,5 G/L) sans aucune autre anomalie. Un examen cytobactériologique des urines confirme l'hématurie, accompagnée d'une leucocyturie. La culture est négative. Une échographie vésicale est pratiquée, montrant un épaississement pseudo-polypoïde isoéchogène sur la paroi postérieure de la vessie. Un examen parasitologique des urines est alors réalisé. Outre la présence d'hématies, plusieurs éléments attirent l'attention du microscopiste (figures 1A et 1B). La barre représente 50 μm