Transcriptomic characterisation and genomic glimpse into the toxigenic dinoflagellate Azadinium spinosum, with emphasis on polykeitde synthase genes

Background: Unicellular dinoflagellates are an important group of primary producers within the marine plankton community. Many of these species are capable of forming harmful algae blooms (HABs) and of producing potent phycotoxins, thereby causing deleterious impacts on their environment and posing a threat to human health. The recently discovered toxigenic dinoflagellate Azadinium spinosum is known to produce azaspiracid toxins. These toxins are most likely produced by polyketide synthases (PKS). Recently, PKS I-like transcripts have been identified in a number of dinoflagellate species. Despite the global distribution of A. spinosum, little is known about molecular features. In this study, we investigate the genomic and transcriptomic features of A. spinosum with a focus on polyketide synthesis and PKS evolution. Results: We identify orphan and homologous genes by comparing the transcriptome data of A. spinosum with a diverse set of 18 other dinoflagellates, five further species out of the Rhizaria Alveolate Stramelopile (RAS)-group, and one representative from the Plantae. The number of orphan genes in the analysed dinoflagellate species averaged 27%. In contrast, within the A. spinosum transcriptome, we discovered 12,661 orphan transcripts (18%). The dinoflagellates toxins known as azaspiracids (AZAs) are structurally polyethers; we therefore analyse the transcriptome of A. spinosum with respect to polyketide synthases (PKSs), the primary biosynthetic enzymes in polyketide synthesis.We find all the genes thought to be potentially essential for polyketide toxin synthesis to be expressed in A. spinosum,whose PKS transcripts fall into the dinoflagellate sub-clade in PKS evolution. Conclusions: Overall, we demonstrate that the number of orphan genes in the A. spinosum genome is relatively small compared to other dinoflagellate species. In addition, all PKS domains needed to produce the azaspiracid carbon backbone are present in A. spinosum. Our study underscores the extraordinary evolution of such gene clusters and, in particular, supports the proposed structural and functional paradigm for PKS Type I genes in dinoflagellates

Transcriptomic characterisation and genomic glimps into the toxigenic dinoflagellate Azadinium spinosum, with emphasis on polykeitde synthase genes

BACKGROUND: Unicellular dinoflagellates are an important group of primary producers within the marine plankton community. Many of these species are capable of forming harmful algae blooms (HABs) and of producing potent phycotoxins, thereby causing deleterious impacts on their environment and posing a threat to human health. The recently discovered toxigenic dinoflagellate Azadinium spinosum is known to produce azaspiracid toxins. These toxins are most likely produced by polyketide synthases (PKS). Recently, PKS I-like transcripts have been identified in a number of dinoflagellate species. Despite the global distribution of A. spinosum, little is known about molecular features. In this study, we investigate the genomic and transcriptomic features of A. spinosum with a focus on polyketide synthesis and PKS evolution. RESULTS: We identify orphan and homologous genes by comparing the transcriptome data of A. spinosum with a diverse set of 18 other dinoflagellates, five further species out of the Rhizaria Alveolate Stramelopile (RAS)-group, and one representative from the Plantae. The number of orphan genes in the analysed dinoflagellate species averaged 27%. In contrast, within the A. spinosum transcriptome, we discovered 12,661 orphan transcripts (18%). The dinoflagellates toxins known as azaspiracids (AZAs) are structurally polyethers; we therefore analyse the transcriptome of A. spinosum with respect to polyketide synthases (PKSs), the primary biosynthetic enzymes in polyketide synthesis. We find all the genes thought to be potentially essential for polyketide toxin synthesis to be expressed in A. spinosum, whose PKS transcripts fall into the dinoflagellate sub-clade in PKS evolution. CONCLUSIONS: Overall, we demonstrate that the number of orphan genes in the A. spinosum genome is relatively small compared to other dinoflagellate species. In addition, all PKS domains needed to produce the azaspiracid carbon backbone are present in A. spinosum. Our study underscores the extraordinary evolution of such gene clusters and, in particular, supports the proposed structural and functional paradigm for PKS Type I genes in dinoflagellates

Unterrichten in Zeiten von Corona. Praxistheoretische Untersuchung des Lehrhandelns während der Schulschließung

Die Corona-Krise und die damit verbundenen Schulschließungen stellen Lehrkräfte vor die Herausforderung, den Lernprozess der Schülerinnen online gestalten und begleiten zu müssen. In einer qualitativen Studie mit mehr als 60 Lehrkräften verschiedener Schulformen wurde aus einer praxistheoretischen Perspektive untersucht, wie die Krise das Unterrichtshandeln der Lehrkräfte beeinflusst. Dabei stand die Frage im Mittelpunkt, inwieweit sich aus den beschriebenen Praktiken eine Präferenz für bestimmte lerntheoretische Positionen ablesen lässt und in welcher Form die in der Krise gemachten Erfahrungen im Umgang mit digitalen Medien das praktische Lehrhandeln zukünftig bestimmen. Im Ergebnis konnte gezeigt werden, dass eingeübte Lehrpraktiken auch unter stark veränderten Rahmenbedingungen sehr wirkmächtig sind. Um diese zu ändern bedarf es einer Reflexion der in der Krise gemachten Erfahrungen um diese auch auf zukünftige Situationen beziehen zu können. (DIPF/Orig.

Social Media und Geschlecht in der Offenen Kinder- und Jugendarbeit

Social Media spielt in den Lebenswelten von Kindern und Jugendlichen bekanntermassen eine bedeutsame Rolle und die entsprechenden Plattformen können als sozialisationsrelevant begriffen werden. Um identitätsbildende Prozesse, etwa im Zusammenhang mit geschlechtlicher Selbstverortung oder sexueller Orientierung, nachvollziehen zu können, ist eine Auseinandersetzung mit den Medienpraktiken von Kindern und Jugendlichen von hoher Relevanz. Dies betrifft auch das pädagogische Handlungsfeld der Offenen Kinder- und Jugendarbeit, das jungen Menschen als ausserschulisches Tätigkeitsfeld Bildungsgelegenheiten bietet und dabei die Heterogenität der Zielgruppe bestmöglich zu berücksichtigen hat. In diesem Schnittfeld verortet sich der Beitrag, indem er nach der Bedeutung der Kategorien Geschlecht und Sexualität im Kontext der Nutzung von Social Media-Plattformen durch Jugendliche fragt und anhand einer qualitativen Studie relevante Aspekte herausarbeitet, welche Anknüpfungspunkte für eine sich als inklusiv verstehende Medienbildung bieten können

The Relevance of School Media Counsellors and School Management for Digitization-Related Cooperation

Im Mittelpunkt des Beitrags steht die Bedeutung von Kooperation und Unterstützung im Schulkollegium für die erfolgreiche und nachhaltige Implementation von digitalen Medien und Medienbildung in der Schule. Ergänzend zu der bisher in der Forschung dominierenden Perspektive auf Lehrpersonen wird auf der Basis einer rekonstruktiven Analyse von 21 Interviews mit verschiedenen schulischen Akteur:innen herausgearbeitet, dass und in welchen Formen die Lehrpersonenkooperation darüber hinaus eine wichtige Rolle spielt. In der Analyse wird deutlich, dass den Medienbeauftragten und Schulleitungen bei der Unterstützung der digitalisierungsbezogenen Lehrpersonenkooperation eine besondere Bedeutung zukommt. Medienbeauftragte sind demnach nicht nur häufig Teil der digitalisierungsbezogenen Lehrpersonenkooperation, sondern initiieren die Kooperation mit und prägen diese massgeblich. Zudem kann die Rolle der Schulleitung bei der Unterstützung schulischer Kooperationsformen sowohl bekräftigt als auch genauer beleuchtet werden. Der Beitrag liefert damit insgesamt ergänzende und aufschlussreiche Perspektiven auf das komplexe Zusammenspiel schulischer Akteur:innen bei der digitalisierungsbezogenen Lehrpersonenkooperation.The article focuses on the significance of the school staff’s cooperation and support for a successful and sustainable implementation of digital media and Media Education in schools. Complementary to the perspective on teachers that has dominated research so far, a reconstructive analysis of 21 interviews with various school actors is used to work out that and in what forms teacher cooperation continues to play an important role. The analysis shows that the media counsellors and school management are of particular importance in supporting the digitization-related cooperation between teachers. Media counsellors are therefore not only often part of the digitization-related teacher cooperation, but also initiate cooperation and significantly shape it. In addition, the role of the school management in supporting different forms of school cooperation can be confirmed and examined in more detail. This article, thus, provides further and insightful perspectives on the complex interaction of school actors in digitization-related teacher cooperation

Digitale Technologien und Schule. Ein Schulentwicklungsprozess aus der Perspektive der Akteur-Netzwerk-Theorie

Sozio-materielle Ansätze wie die Akteur-Netzwerk-Theorie (ANT) (Callon, 2006; Callon & Latour, 1981; Latour, 2007; Michael, 2017) eignen sich dazu, digitale Transformationsprozesse in Bildungseinrichtungen zu analysieren, indem z. B. Schulen als Teil von und als Netzwerke aus menschlichen und nicht-menschlichen Akteuren beschrieben werden, die miteinander interagieren. Der Beitrag zeigt Mehrwerte dieser Perspektive für ein besseres Verständnis der Gelingensbedingungen digitaler Transformation in Bildungseinrichtungen auf. Am Beispiel der Einführung von Tablets für Schülerinnen lässt sich damit sich eine Vielzahl von unterschiedlichen Akteuren und Subprozessen identifizieren, die es zu synchronisieren gilt, um die Digitalisierung erfolgreich voranzubringen. Der intensive Austausch- und Abstimmungsprozess innerhalb der Schule ist dabei für die Umsetzung des digitalisierten Unterrichts ein wesentlicher Aspekt. (DIPF/Orig.

Medienbildung für alle: Medienbildung inklusiv gestalten!

Bosse I, Haage A, Kamin A-M, Schluchter J-R. Medienbildung für alle: Medienbildung inklusiv gestalten!. In: Brüggemann M, Sabine E, Angela T, eds. Medienbildung für alle – Digitalisierung. Teilhabe. Vielfalt. München: kopaed; 2019: 207-219

Environmental conditions regulate the impact of plants on cloud formation

The terrestrial vegetation emits large amounts of volatile organic compounds (VOC) into the atmosphere, which on oxidation produce secondary organic aerosol (SOA). By acting as cloud condensation nuclei (CCN), SOA influences cloud formation and climate. In a warming climate, changes in environmental factors can cause stresses to plants, inducing changes of the emitted VOC. These can modify particle size and composition. Here we report how induced emissions eventually affect CCN activity of SOA, a key parameter in cloud formation. For boreal forest tree species, insect infestation by aphids causes additional VOC emissions which modifies SOA composition thus hygroscopicity and CCN activity. Moderate heat increases the total amount of constitutive VOC, which has a minor effect on hygroscopicity, but affects CCN activity by increasing the particles’ size. The coupling of plant stresses, VOC composition and CCN activity points to an important impact of induced plant emissions on cloud formation and climate