Sila Eukaryotic : ferramenta para anotação automática de genes eucariotos

Orientador : Prof. Dr. Roberto Tadeu RaittzCoorientador : Prof. Dr. Vinicius WeissDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Educação Profissional e Tecnológica, Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. Defesa: Curitiba, 30/09/2016Inclui referências : f. 58-62Resumo: A marcação e anotação de genomas são processos essenciais e fundamentais presentes na Bioinformática, necessários para a análise de sequências de DNA. Geralmente essas atividades exigem muito tempo de processamento e alto custo computacional, encarecendo o processo nos muitos projetos distintos ao qual estão presentes. Tais atividades consistem basicamente em comparar sequências de DNA com grandes bancos de dados, este contendo entre milhares e milhões de registros. Considerando a necessidade de melhoramento dessas atividades fundamentais nas pesquisas que envolvem a Biologia Molecular, consequentemente a Bioinformática, este trabalho apresenta um programa de computador, chamado Sila Eukariotic, implementado para a anotação automática de sequências de DNA provenientes de organismos eucarióticos, utilizando busca e comparação de similaridades entre sequências de proteínas. O Sila Eukariotic utiliza ferramenta para predição e marcação de genes (GeneMark-ES) em conjunto com uma ferramenta de buscas de sequências de proteínas em banco de dados (RAFTS3), sendo a predição opcional ao usuário, cabendo também a opção pelo banco de dados de comparação a ser utilizado (NR, SwissProt e outros em formato multi-fasta). Os resultados evidenciaram melhoras na anotação de genes eucarióticos com baixíssimo custo e tempo de processamento comparado a outros buscadores disponíveis. O pacote está disponível para download e poderá ser executado em computadores com relativamente poucos recursos de hardware. Palavras-chave: Anotação automática de genomas eucarióticos, Comparação de sequências, Alignment-free.Abstract: The genome annotations are important and essential processes present on Bioinformatics, necessary to analyse DNA's sequences. Usually these activities need a lot of processing time and have high computational costs, making the projects, which are present, remain expensives. These activities consisti, basically, in comparing DNA's sequences against big data banks, that contain between thousands to milions of records. Seeing the need to improve these activities, this work presents a computer's system, called Sila Eukaryotic, implemented to make the automatic annotation for sequences of eukaryotics organisms, using search and comparison of similarity between proteins sequences. Sila Eukaryotics uses a tool for gene prediction (GeneMark-ES) together with a search proteins tool (RAFTS3) at a biological data bank. The prediction is optional, as the data bank to be used (NR, SwissProt e others on fasta file format). The results showed improvements in annotation, quickly and low computational costs. This package is avaliable to download and can be executed in computers with few hardware resources. Key-words: Automated eukaryotic genome annotation, Sequence comparison, Alignmentfree

Tipologia municipal de classes sociocupacionais: uma nova dimensão para análise das desigualdades territoriais no Brasil

The main purpose of this work is to propose a new configuration for the Brazilian territory, providing a relevant dimension to analyze Brazilian social inequalities. The central hypothesis is that the social structure, which consists of a combination between labor market position (occupational class) and per capita income level (social stratum) of Brazilian families, is able to identify social patterns which play an import role in analyzing the huge inequalities of living condition in Brazil.social stratification, income distribution, regional disparities, Agricultural Finance, Public Economics, J82, R12, R23.,

TIPOLOGIA MUNICIPAL DE CLASSES SÓCIO-OCUPACIONAIS: UMA NOVA DIMENSÃO PARA ANÁLISE DAS DESIGUALDADES TERRITORIAIS NO BRASIL

O objetivo principal deste trabalho é propor uma nova configuração para o território brasileiro, fornecendo uma relevante dimensão para análise das desigualdades sociais brasileiras. A hipótese central é que a estrutura social, uma conjugação entre inserção no mercado de trabalho (classe ocupacional) e faixa de renda per capita (estrato social) das famílias brasileiras, é capaz de identificar padrões sociais que cumprem papel essencial nas análises sobre as condições de vida da população. Para cumprir tal objetivo, este trabalho foi estruturado em três partes principais: i) descrição da metodologia de estratificação social; ii) identificação dos grupos de municípios relativamente homogêneos de desenvolvimento da estrutura social (perfis sociais) e análise espacial desta configuração; iii) análise das desigualdades territoriais brasileiras utilizando o perfil social como variável de controle.---------------------------------------------The main purpose of this work is to propose a new configuration of Brazilian territory, providing a relevant dimension to the analysis of Brazilian social inequalities. The central hypothesis is that the social structure, which consists of a combination between job market (socio-occupational class) and per capita income band (socioeconomic segment) of Brazilian families, is capable of identifying social patterns which has an essential role in analysis of the life conditions of population. To reach such purpose, this work is structured in tree mains divisions: i) a description of the social stratification methodology; ii) identifying groups of relative homogeneity of social structure development (socials profiles) and spatial analysis of this configuration; iii) analysis of Brazilian territory inequalities using the social profile as control variable.estratificação social, renda - distribuição, disparidades regionais, social stratification, income distribution, regional disparities, Community/Rural/Urban Development, J82, R12, R23,

Gamification as a strategy for promoting child involvement: A study on spatial orientation in the 1st CEB

We' are living in an era of strong change that misaligns offerings, processes and interests. In the field of education, it is urgent to find strategies that foster the revitalization of energies capable of triggering student involvement and thus improving efforts, skills and behaviours facing the challenge. Within the scope of initial teacher education, more specifically in Supervised Teaching Practice, this study was carried out with the purpose of evaluating gamification as a positive impact driver design in the involvement of children in a spatial orientation class, with effects on school outcomes. It was based on the Gamification Framework [7]. With a mixed methodological approach and a study case, we used disparate data collection instruments: participant observation of the trainee teacher who performed the pre-test, the post-test and the multimodal narratives, sustained in dialogues and interactions of the children recorded during the sessions, an interview with the teacher and, for a better understanding of the results, an interview with two specialists, one being an Internet Risk specialist and the other an Educational Technology expert. The project involved 21 1st grade children from a 1st CEB School. Among other results, there was an improvement in student involvement. Regarding spatial orientation, the promotion of lateralization ability and the ability to locate spaces were stood out, taking into consideration reference points and to identify the position of figures present in a grid through their coordinates. The analysis of the results raises some questions concerning the humanist paradigm.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Sistema de planejamento e gerenciamento de eventos (SPGE)

Orientador : Razer Anthom Rizer Rojas Montaño.Monografia (graduação) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Educação Profissional e Tecnológica, Curso de Tecnologia em Análise e Desenvolvimento de Sistemas

A gestão estratégica do patrocínio esportivo : um estudo de caso da Caixa Econômica Federal

Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Faculdade de Comunicação, Comunicação Organizacional, 2014.O presente trabalho se propõe a estudar como o patrocínio esportivo ao futebol pode ser utilizado como ferramenta de marketing para empresas que desejam aumentar o valor de sua marca, agregando a ela valores e atributos admirados pelo público consumidor em geral. Para tanto, foi utilizada a Caixa Econômica Federal como exemplo para um estudo de caso, na intenção de buscar uma empresa que faz bom uso dessa estratégia, atuando em nível nacional. O trabalho passa por três temas que foram estudados mais a fundo, a saber: Estratégia, Marketing Esportivo e Patrocínio, áreas essas correlatas neste estudo. Com um bom embasamento sobre estes temas, foi analisado até que ponto as ações do banco estão de acordo com a teoria. Não se pretendeu, aqui, obter um panorama mais amplo sobre a atuação de outras empresas neste negócio. Porém, a atuação da organização estudada mostrou-se exemplar, trazendo bons retornos à imagem e aos cofres da instituição. Concluiu-se que uma empresa com uma atuação planejada no patrocínio esportivo possui grande potencial de sucesso

Insulin resistance and triglyceride/HDLc index are associated with coronary artery disease

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Insulin-resistance is associated with cardiovascular disease but it is not used as a marker for disease in clinical practice.</p> <p>Aims</p> <p>To study the association between the homeostatic model assessment (HOMA-IR) and triglyceride/HDLc ratio (TG/HDLc) with the presence of coronary artery disease in patients submitted to cardiac catheterization.</p> <p>Methods</p> <p>In a cross-sectional study, 131 patients (57.0 ± 10 years-old, 51.5% men) underwent clinical, laboratory and angiographic evaluation and were classified as No CAD (absence of coronary artery disease) or CAD (stenosis of more than 30% in at least one major coronary artery).</p> <p>Results</p> <p>Prevalence of coronary artery disease was 56.7%. HOMA-IR and TG/HDLc index were higher in the CAD <it>vs </it>No CAD group, respectively: HOMA-IR: 3.19 (1.70-5.62) vs. 2.33 (1.44-4.06), p = 0.015 and TG/HDLc: 3.20 (2.38-5.59) vs. 2.80 (1.98-4.59) p = 0.045) - median (p25-75). After a ROC curve analysis, cut-off values were selected based on the best positive predictive value for each variable: HOMA-IR = 6.0, TG/HDLc = 8.5 and [HOMA-IR×TG/HDLc] = 28. Positive predictive value for coronary artery disease for HOMA-IR>6.0 was 82.6%, for TG/HDLc>8.5 was 85.7% and for [HOMA-IR×TG/HDLc]>28 was 88.0%. Adjusted relative risk (age, gender, diabetes, body mass index, systolic blood pressure) for the presence of coronary artery disease was: for HOMA-IR>6.0, 1.47 (95.CI: 1.06-2.04, p = 0.027), for TG/HDLc>8.5, 1.46 (95% CI:1.07-1.98), p = 0.015) and for [HOMA-IR × TG/HDLc] >28, 1.64 (95%CI: 1.28-2.09), p < 0.001).</p> <p>Conclusions</p> <p>Increased HOMA-IR, TG/HDLc and their product are positively associated with angiographic coronary artery disease, and may be useful for risk stratification as a high-specificity test for coronary artery disease.</p

DIÁLOGOS EM SALA DE AULA: DINÂMICA DA MACROECONOMIA NACIONAL COMO FERRAMENTA DE APOIO À TOMADA DE DECISÃO

Este trabalho tem como objetivo demonstrar que o entendimento da dinâmica da macroeconomia é de fundamental importância para o direcionamento das organizações. A análise das empresas como um sistema aberto, que é influenciado por medidas externas, faz-se necessária num ambiente aberto à concorrência internacional, tornando a empresa nacional mais competitiva. Também será feita uma breve análise da situação econômica nacional avaliando como o governo se utiliza dos fatores que compõem a demanda agregada na definição de sua política econômica e como isso reflete nas organizações

A CORPORIFICAÇÃO DE ENTES QUÍMICOS EM PERFORMANCES MULTIMODAIS EM AULAS DE CIÊNCIAS

We started from the premise that the representation and the concept are directly related regarding the teaching and learning of Chemistry. In this article we analyze two episodes of teaching in which corporal performances were executed aiming to investigate the meanings produced in the classes where the body was used to represent a Chemical entity. These episodes were extracted from videos produced by two research groups in Chemistry teaching. The analyses evidenced the modal resources used by the teachers in the representation with the body and the possible meanings produced with the students. The analyses indicated that the students noticed the behavior of the chemical entity in the subjects that represented the atoms and that this embodiment presented affordances that helped the understanding of the concepts explored in the performance. The data lead us to argue that the body and the movements also produce learnings. Representing a chemical entity using the body showed to be a rational and affective strategy in the understanding of concepts, which brings implications to the training of teachers, in the sense of overcoming epistemological and affective obstacles.Se parte de la premisa de que la representación y el concepto están directamente relacionados a la enseñanza y aprendizaje de Química. En este artículo se analizan dos episodios didácticos en los que se realizaron performances corporales, con el objetivo de investigar los significados producidos en las clases en que se utilizó el cuerpo para representar una entidad química. Estos episodios provinieron de vídeos que fueron producidos por dos grupos de investigación en enseñanza de Química. El análisis evidenció los recursos modales utilizados por los profesores durante la representación con el cuerpo y los posibles significados que generaron a los alumnos. El análisis apuntó que los estudiantes percibieron el comportamiento de la entidad química en los sujetos que representaban los átomos y que esta corporificación presentó recursos que les ayudaron a comprender los conceptos planteados durante la performance. Los datos nos permiten concluir que el cuerpo y los movimientos también producen aprendizaje. La representación de una entidad química utilizando el cuerpo demostró ser una estrategia racional y afectiva para comprender los conceptos, lo que impacta en la formación del profesorado a superar obstáculos epistemológicos y afectivos.Partimos da premissa de que a representação e o conceito estão diretamente relacionados quando se trata de ensino e aprendizagem de Química. Neste artigo analisamos dois episódios de ensino nos quais foram executadas performances corporais com o objetivo de investigar os significados produzidos nas aulas em que o corpo foi empregado para representar um ente químico. Esses episódios foram extraídos dos vídeos produzidos por dois grupos de pesquisa em ensino de Química. Foram evidenciados nas análises os recursos modais empregados pelos professores durante a representação com o corpo e os possíveis significados produzidos junto aos estudantes. A análise indicou que os estudantes perceberam o comportamento do ente químico nos sujeitos que representavam os átomos e que essa corporificação apresentou affordances que auxiliaram no entendimento dos conceitos explorados durante a performance. Os dados nos levam a argumentar que o corpo e os movimentos também produzem aprendizagens. Representar um ente químico usando o corpo se mostrou uma estratégia racional e afetiva no entendimento dos conceitos, o que traz implicações para a formação de professores no sentido de superar obstáculos epistemológicos e afetivos

Tipologia municipal de classes sociocupacionais: uma nova dimensão para análise das desigualdades territoriais no Brasil

The main purpose of this work is to propose a new configuration for the Brazilian territory, providing a relevant dimension to analyze Brazilian social inequalities. The central hypothesis is that the social structure, which consists of a combination between labor market position (occupational class) and per capita income level (social stratum) of Brazilian families, is able to identify social patterns which play an import role in analyzing the huge inequalities of living condition in Brazil.O objetivo principal deste trabalho é propor uma nova configuração para o território brasileiro, fornecendo uma relevante dimensão para análise das desigualdades sociais no Brasil. A hipótese central é que a estrutura social, uma conjugação entre inserção no mercado de trabalho (classe ocupacional) e faixa de renda per capita (estrato social) das famílias brasileiras, é capaz de identificar padrões sociais que cumprem papéis essenciais nas análises sobre as extremas diferenças das condições de vida da população brasileiraO objetivo principal deste trabalho é propor uma nova configuração para o território brasileiro, fornecendo uma relevante dimensão para análise das desigualdades sociais no Brasil. A hipótese central é que a estrutura social, uma conjugação entre inserção no mercado de trabalho (classe ocupacional) e faixa de renda per capita (estrato social) das famílias brasileiras, é capaz de identificar padrões sociais que cumprem papéis essenciais nas análises sobre as extremas diferenças das condições de vida da população brasileira472389418The main purpose of this work is to propose a new configuration for the Brazilian territory, providing a relevant dimension to analyze Brazilian social inequalities. The central hypothesis is that the social structure, which consists of a combination between labor market position (occupational class) and per capita income level (social stratum) of Brazilian families, is able to identify social patterns which play an import role in analyzing the huge inequalities of living condition in Brazil