Paikka, tolppa, ellipsi ja muut - Taiteellinen tutkimus visuaalisista viikkoskeemoista

Tutkielmani aiheena ovat visuaaliset viikkoskeemat eli se, miten ihminen visuaalisesti hahmottaa viikkoja mielessään. Tutkimus oli taiteellinen, ja tutkimuskysymys “Miltä visuaaliset viikkoskeemat voivat näyttää, ja millaista tietoa taiteellinen työskentelyni niistä tuottaa?” Tavoitteenani oli siis löytää taiteellisin keinoin uutta tietoa visuaalisista viikkoskeemoista. Tutkimuksen teoriaosio jaoteltiin kolmeen lukuun, jotka ovat “Visuaalinen viikkoskeema”, “Kieli, kulttuuri ja aikakäsitys” sekä “Synestesiaa vai ei?” Visuaalista viikkoskeemaa käsiteltäessä pohjattiin Jean M. Mandlerin ja Cristóbal Pagán Cánovasin artikkelin ”On defining image schemas” (2014) teorioihin. Kielen ja kulttuurin merkitystä aikakäsitykselle tutkin Minerva Keltasen toimittaman teoksen ”Yhdestoista hetki – ajasta kiinni” (1999) ja Luna Filapovićin ja Kasia M. Jaszczoltin artikkelikokoelman ”Space and Time in Languages and Cultures: Language, Culture, and Cognition” (2012) avulla. Synestesia-luvussa Richard Cytowicin ja David Eagelmanin teos ” Wednesday is indigo blue: Discovering the brain of synesthesia” (2009) sekä Katariina Salmijärven opinnäytetyö ”Synestesia ja sen ilmeneminen kuvataiteessa” (2011) olivat tärkeimmät tiedonlähteeni. Taiteellisesta tutkimuksesta kirjoitin käyttäen apuna Mika Hannulan, Juha Suorannan ja Tere Vadénin teosta ”Otsikko uusiksi – taiteellisen tutkimuksen suuntaviivat” (2003). Tutkimusaineisto koostuu kolmesta eri päivinä toteutetusta, puolistrukturoidusta teemahaastattelusta. Fanni Tähtinen (22), Jukka Ahvenainen (53) ja Ritva Ketonen (81) valikoituivat haastatteluun, koska katsoin heidän pystyvän kertomaan avoimesti asioista haastattelun aikana ja koska halusin pitää ikä- ja sukupuolijakauma tasaisena. Luin haastateltaville ensin kaikille yhtenäisen alustuksen. Tämän jälkeen keskustelimme avoimesti, ja tarvittaessa esitin haastateltaville lisäkysymyksiä esim. heidän viikonpäiviensä väreistä, muodoista, liikkeistä ym. ominaisuuksista. Aineistoanalyysin toteutin taiteellisesti. Piirsin ja maalasin haastattelujen pohjalta kuvia eri tekniikoin. Kuvat pyrkivät kaikki näyttämään jonkin näkökulman haastateltavien visuaalisista viikkoskeemoista. Kaikki kuvat ovat yhtä tosia ja tarkoituksenmukaisia, sillä ne kaikki tavoittelevat mahdollisimman todenmukaista tietoa siitä, miltä haastateltavien visuaaliset viikkoskeemat voivat näyttää. Tuloksena syntyi yhteensä 12 kuvaa. Niitä tarkastelemalla voidaan todeta, että visuaalisiin viikkoskeemoihin vaikuttavat mm. kulttuuri, kieli ja iän karttuminen. Lisäksi kuvista välittyy tieto viikonlopun erityisyydestä arkipäiviin nähden, tutkijan omat lähtökohdat viikonpäivien hahmottamiseen sekä se, että tilallisuus liittyy visuaalisten viikkoskeemojen hahmottamiseen vahvasti. Johtopäätös on, että kuvat kertovat siitä, kuinka yksilöllisesti jokainen ihminen hahmottaa viikkonsa. Jatkotutkimuksena ehdotetaan esimerkiksi muiden visuaalisten järjestelmien ja skeemojen tutkimista

Histopatologisten kohdun leiomyoomavarianttien molekuläärinen tausta

Uterine leiomyomas are extremely common smooth muscle tumors affecting up to 70% of women during reproductive age. Even though leiomyomas are benign tumors, they can cause several difficult symptoms. The most common treatment for symptomatic leiomyomas is surgical intervention, which causes substantial morbidity for the patient and significant socioeconomic burden for society. Based on histopathology, 90% of leiomyomas display conventional morphology. The remaining 10% is divided into leiomyoma variants, which include bizarre nuclei, cellular, and mitotically active tumors. Leiomyoma research has largely focused on conventional tumors and their genetic background is well established. The variant tumors are, however, only superficially characterized and their molecular pathogenesis remains poorly understood. The possibility of variant leiomyomas undergoing malignant transformation and thus contributing to highly aggressive leiomyosarcoma pathogenesis is also under debate. The main aim of this thesis was to study the molecular background of uterine leiomyoma variant pathogenesis. The expression of ATRX/DAXX and telomere lengths was investigated in conventional and variant leiomyomas since ATRX/DAXX loss and elongated telomeres have been associated with leiomyosarcoma pathogenesis. With immunohistochemistry and telomere-specific FISH, we identified loss of ATRX/DAXX expression and elongated telomeres in leiomyoma variants, whereas conventional leiomyomas displayed normal expression and telomeres. Some patients with tumors expressing these alterations were later diagnosed with pulmonary smooth muscle tumors. The clonality of the uterine and pulmonary tumors from one case was investigated with high-throughput sequencing. We showed that benign uterine leiomyoma had metastasized, and subsequent malignant transformation resulted in pulmonary leiomyosarcomas. The results highlight the differences in the molecular pathogenesis of conventional leiomyomas and leiomyoma variants and raise concerns regarding the long-term malignant potential of a subset of leiomyoma variant tumors. The NRF2 pathway is one of the most commonly altered signaling pathways in human cancers. Leiomyomas with biallelic FH loss are characterized by activation of the NRF2 pathway and upregulation of one of its target gene AKR1B10. Here, we utilized immunohistochemistry and identified tumors that display AKR1B10 expression but no alterations in FH. Most of the tumors showed cellular histopathology. Whole-exome and whole-genome sequencing revealed biallelic mutations in key genes involved in neddylation. Unique molecular profile with upregulation of NRF2 target genes was confirmed with 3’RNA sequencing. These results reveal a new leiomyoma subgroup with distinct molecular and morphological features, and a novel mechanism –defective neddylation– for NRF2 activation. The second aim of the thesis was to investigate biomarkers to aid leiomyoma diagnostics. Most leiomyomas are sporadic, but a fraction of tumors develop via inherited predisposition due to a germline mutation in FH. Germline FH mutation causes hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC), which is a disorder characterized by uterine and cutaneous leiomyomas, and aggressive type 2 papillary renal cell cancer. Currently, there is no generally approved method that can reliably differentiate FH-deficient tumors from other leiomyomas. In this thesis, the performance of anti-2SC, anti-AKR1B10, and anti-FH antibodies to detect FH-deficiency was systematically analyzed using immunohistochemistry. Of the three antibodies tested, 2SC performed best with 100% sensitivity and specificity. AKR1B10 and FH performed relatively well, but they also displayed reduced specificity and/or sensitivity as well as intermediate staining, which challenges interpretation. These results suggest that when a clinical patient and/or tumor characteristics indicate FH-deficiency, 2SC immunohistochemistry should be performed. When 2SC-positive tumors are detected, patients can be directed to genetic counselling and targeted FH mutation screening.Kohdun leiomyoomat ovat erittäin yleisiä naisten gynekologisia sileälihaskasvaimia. Vaikka leiomyoomat ovat hyvänlaatuisia kasvaimia, ne saattavat aiheuttaa vakavia terveyshaittoja. Koska oireita aiheuttavien leiomyoomien hoito on tyypillisesti kohdunpoistoleikkaus, on niiden sosioekonominen vaikutus yhteiskunnalle merkittävä. Histopatologiaan perustuen 90 % leiomyoomista edustaa tavanomaista tyyppiä. Loput 10 % jaetaan leiomyoomien variantteihin. Suurin osa leiomyoomatutkimuksesta on keskittynyt tavanomaisten kasvainten tutkimiseen ja niiden kehittymisen taustalla olevat geneettiset muutokset ovatkin suurilta osin tunnistettuja. Varianttien syntymekanismi on kuitenkin vain pintapuolisesti karakterisoitu eikä niiden potentiaalia muuntua pahanlaatuiseksi leiomyosarkoomaksi tunneta. Väitöskirjan päätavoitteena oli tutkia kohdun leiomyoomavarianttien molekulaarista taustaa. Havaitsimme ATRX/DAXX:n puutoksen sekä pidentyneet telomeerit osassa variantteja. Nämä muutokset on yhdistetty tyypillisesti vain pahanlaatuisiin kasvaimiin. Osalla potilaista, joilla oli ollut variantteja näiden havaittujen muutosten kanssa, oli myöhemmin diagnosoitu keuhkojen sileälihaskasvain. Tutkimme yhden tällaisen potilaan tuumoreiden klonaalisuutta ja osoitimme, että kohdun leiomyooma oli lähettänyt etäpesäkkeitä keuhkoihin ja nämä olivat edelleen kehittyneet leiomyosarkoomiksi. Leiomyoomissa, joissa on FH:n bialleelinen puutos, NRF2-reitti on aktiivinen ja niissä yli-ilmennetään AKR1B10-geeniä. Väitöskirjassa löysimme ryhmän leiomyoomia, jotka ilmentävät AKR1B10-proteiinia, vaikka niissä oli normaali FH. Näytteissä havaittiin NRF2-reitin aktivaatio sekä bialleelisia mutaatioita geeneissä, jotka liittyvät neddylaatioon. Työssä osoitimme uuden leiomyoomien alaryhmän, joiden tuumorigeneesi aktivoituu NRF2-reitin kautta ja joilla on spesifisiä molekulaarisia ja morfologisia piirteitä. Tämän lisäksi tunnistimme kokonaan uuden mekanismin NRF2-reitin aktivoitumiseen kasvaimissa. Tämän lisäksi väitöskirjassa oli tavoitteena edesauttaa leiomyoomien kliinistä diagnostiikkaa validoimalla biomarkkeri leiomyoomille, joissa on FH:n puutos. Pieni osa leiomyoomista kehittyy perinnöllisen FH-mutaation seurauksena, jolloin potilas sairastaa periytyvää leiomyomatoosi ja munuaissyöpäsyndroomaa (HLRCC). Syndrooma altistaa leiomyoomien lisäksi aggressiiviselle tyypin 2 munuaissolukarsinoomalle. Työssä vertailimme 2SC-, AKR1B10-, ja FH-vasta-aineita ja osoitimme, että 2SC toimii parhaiten ollen 100 % sensitiivinen ja spesifinen. Jos potilaan kliininen kuva ja/tai kasvaimen ominaisuudet viittaavat FH:n puutteeseen, kasvainnäyte tulisi tutkia 2SC-värjäyksellä. Positiivinen värjäystulos edesauttaa potilaiden ohjaamista perinnöllisyysneuvontaan ja kohdennettuun FH-mutaatiotutkimukseen

Nanoskaalan rakenteellinen röntgentutkimus geneettisesti muunnellusta lituruohosta

Cellulose is the most abundant natural material on Earth. New ways to utilize the limited resources on Earth for the benefit of the human kind can be found by studying genetically modified plants. The nanoscale structure of organic matter is important to its macroscopic properties. Natural materials can be characterized by measuring the degree of crystallinity in the material and the average dimensions of the crystallites. The cellulose crystallites are helically wound as long fibrous microfibrils in which crystalline and less ordered (amorphous) regions alternate. The microfibril angle (MFA) is the angle of these microfibrils with respect to the cell axis and it is linked with the longitudinal stiffness of the material. A wide-angle X-ray scattering (WAXS) method can be used to study these nanoscale properties of the matter in a non-destructive manner. Arabidopsis thaliana (AT) is an important model system for plant biology. It is a widely spread small flowering plant with a short life cycle and a relatively small genome which has been fully sequenced. X-ray microtomography confirmed that the AT cells are generally round rather than rectangular unlike xylem cells. The cellular structure of the plants was not destroyed in the WAXS measurements. The resolution obtained from the measurements of samples with natural humidity was not sufficient hence all the samples were measured dry. A total of 62 samples were measured with the WAXS set-up, 15 of them wild type plants and the rest genetically modified. In this study the WAXS data analysis methods were enchanced for the benefit of the weakly scattering Arabidopsis samples. The mean crystallite width of all samples ranged from 26 to 30 Å. This is consistent with the crystallite width being determined during the biosynthesis of cellulose. The values for the degree of crystallinity ranged from approximately (20 30)% and all the average values were slightly above 25%. The mean microfibril angle varied greatly between the samples, all the way from 2 to 21 degrees. The mean values of different lines varied more for the MFA than for other properties. Statically significant differences between means of different lines were seen for one line in the degree of crystallinity, for one line in the MFA and for two lines in the crystallite width. Due to small sample sizes these differences should be considered mostly as indicative and not as conclusive evidence on the effects of the genetic modification.Selluloosa on yleisin luonnossa esiintyvä materiaali. Tutkimalla geenimuunneltuja kasveja voidaan löytää uusia tapoja käyttää Maapallon rajallisia resursseja ihmiskunnan hyväksi. Luonnonmateriaalin makroskooppisten ominaisuuksien kannalta on tärkeä tuntea sen rakenne nanometrin tarkkuudella. Materiaalia voidaan tutkia mittaamalla sen kiteisyysastetta ja näiden kiteiden kokoa. Selluloosakiteet ovat kiertyneet soluseinän ympärille pitkiksi kuitumaisiksi mikrofibrilleiksi, jotka muodostuvat kiteisen ja huonommin järjestäytyneen (amorfisen) selluloosan vuorottelevista alueista. Mikrofibrillikulma on se kulma, jonka nämä kuidut muodostavat solun akselin kanssa. Se korreloi materiaalin pitkittäissuuntaisen jäykkyyden kanssa. Laajakulmaröntgensirontamenetelmällä voidaan tutkia näitä nanotason ominaisuuksia näytettä vahingoittamatta. Arabidopsis thaliana (lituruoho) on tärkeä kasvibiologian mallisyystemi. Se on laajalle levinnyt pieni kukkiva kasvi, jolla on sekä lyhyt elämänkierto että suhteellisen pieni ja kauttaaltaan tunnettu genomi. Röntgenmikrotomografialla otetut kuvat vahvistivat, että Arabidopsiksen solut ovat yleisesti ottaen pyöreitä eivätkä suorakulmaisia kuten puusolut. Kasvien solukkorakenne ei tuhoutunut röntgensirontamittauksissa. Luonnollisen kosteuden omaavia näytteitä ei saatu mitattua riittävän tarkasti, joten kaikki näytteet mitattiin kuivina. Laajakulmaröntgensirontamenetelmällä mitattiin yhteensä 62 näytettä, joista 15 oli villin tyypin kasveja ja loput geneettisesti muunneltuja. Tutkimuksessa jatkokehitettiin tämän menetelmän data-analyysimetodeja heikosti sirottavalle lituruoholle sopiviksi. Kaikkien mitattujen näytteiden kiteenleveydet olivat välillä 26-30 Å. Havainto sopii sen kanssa, että kiteenleveydet määräytyvät selluloosan biosynteesissä. Kiteisyysasteen vaihteluväli oli noin (20 30)% ja näytesarjojen keskiarvot olivat hiukan yli 25%. Keskimääräinen mikrofibrillikulma puolestaan vaihteli paljon näytteiden välillä aina kahdesta asteesta 21:een asteeseen ja sarjojen keskiarvotkin vaihtelivat enemmän kuin muiden ominaisuuksien. Tilastollisesti merkittäviä eroja näytesarjojen keskiarvoissa löytyi yhden sarjan kohdalla kiteisyysasteissa, yhden keskimääräisissä mikrofibrillikulmissa ja kahden kohdalla kiteenleveyksissä. Pienen näytekoon takia näitä eroja voidaan pitää lähinnä jatkotutkimuksia ohjaavina eikä sitovina todisteina geenimuuntelun tuloksista

Kielelliset käytänteet Kymenlaakson alueen logistiikkayrityksissä

Kymenlaakson alueella toimii lukuisia logistiikka-alan yrityksiä, jotka harjoittavat ulkomaankauppaa. Yleisin käytetty kieli kansainvälisessä viestinnässä on englanti, mutta sen sujuva osaaminen ei vielä takaa yhteisymmärrystä osapuolten välillä. Käsillä oleva raportti selvittää paikallisten logistiikka-alan yritysten käyttämää kielipolitiikkaa, yritysten asettamia kielitaitovaatimuksia henkilöstölleen ja vieraisiin kieliin liittyviä ongelmia. Pääpainona on raportissa Venäjän-kauppaan ja sitä koskevaan viestintään liittyvät seikat, mutta myös muiden maiden ja kielien vaikutus paikallisten logistiikkayritysten toimintaan on tarkastelun kohteena. Tutkimus tehtiin Kymenlaakson ammattikorkeakoulun ja Cursor Oy:n yhteistoiminnassa toteuttaman LogIT-projektin sivututkimuksena

CA- and MA storage of carrot, cabbages and onion

Kasvisten varastoinnin aikana tärkeimpiä laatua alentavia tekijöitä on soluhengitys. Soluhengityksen hidastaminen yleensä parantaa kasvisten säilyvyyttä. Oikean varastointilämpötilan ohella kasvista ympäröivän kaasutilan muuntelu normaalista ilmasta poikkeavaksi on keino, jolla soluhengitystä voidaan hidastaa. Tästä syystä säätöilma- eli CA-varastointi, muunnetun ilmakehän varastointi eli MA-varastointi ja alipainevarastointi ovat mielenkiintoisia vaihtoehtoja normaalille kylmävarastoinnille. Katsaukseen on koottu tietoa näistä varastointitekniikoista, niiden teknisistä ratkaisuista ja varastoinnin kustannuksista. Yksinkertaisimmillaan MA-varastointi tarkoittaa sitä, että tuote pakataan kaasuja valikoivasti läpäisevään materiaaliin. Eniten kustannuksia aiheutuu pakkauskoneesta ja -materiaaleista sekä työvoimakuluista pakattaessa. CA-varastoinnissa suurimmat kustannukset aiheutuvat varaston tiivistämisestä ja kaasutus- ja mittalaitteista. CA ja MA-varastoinnin kustannusten vertailu keskenään on vaikeaa, koska ei ole riittävästi tietoa MA-varastoinnista eri kasviksilla. Käytön kannalta MA-varastointi pakkauksissa on joustavampi kuin CA-varastointi ja mahdollistaa suojaavan kaasukehän säilyttämisen tuotteen ympärillä myös varaston ulkopuolella. Katsauksen lopussa tarkastellaan CA- ja MA-varastoinnin tuomia mahdollisuuksia lähinnä porkkanan, kaalien ja sipulin laadun säilyttämisessä. CA- ja MA-varastointimenetelmät näyttävät lupaavimmilta kaaleille ja sipulille. Ennen kuin Suomessa kannattaa lähteä suuremmassa mitassa toteuttamaan joko CA- tai MA-varastointia tarvitaan kokeellista tutkimusta menetelmien antamista hyödyistä laadun ja jakelun kannalta.Respiration is one of the most important factors affecting the quality reduction of vegetables during storage. Retardation of respiration generally improves shelf-life. Proper storage temperature and the modification of atmosphere around produce are means to retard respiration. For this reason, controlled atmosphere (CA) storage and modified atmosphere storage (MA) are interesting options to normal cold storage. Information about these storage techniques, their technical solutions and storage costs have been compiled in this review. At its simplest, modified atmosphere storage can be implemented by packing produce in a material with proper gas permeability properties. Most costs derive from a packaging machine, packaging materials and labour. With regard to CA-storage, most costs come from the sealing up of a storage room, and gasification and measurement systems. Comparison of costs between CA and N4A storage is difficult, because there is not adequate information available regarding the MA storage of vegetables. From a use point of view, MA storage in packages is more flexible than CA storage, and makes possible a protective atmosphere around the produce after taking it from a storage room. At the end of the review, the possibilities offered by CA and MA storage regarding the quality retention of carrots, cabbages and onions are considered. CA and MA storage appear to be more promising techniques for cabbages and onion than for carrots. Before these techniques are deemed worth implementing in the storage of vegetables in Finland, experimental research about the benefits from a quality and distribution point of view is needed.vokMyynti MTT tietopalveluyksikkö. Yksikön huom.: Kirjasto Aj-

Comparison of sample crystallinity determination methods by X-ray diffraction for challenging cellulose I materials

Cellulose crystallinity assessment is important for optimizing the yield of cellulose products, such as bioethanol. X-ray diffraction is often used for this purpose for its perceived robustness and availability. In this work, the five most common analysis methods (the Segal peak height method and those based on peak fitting and/or amorphous standards) are critically reviewed and compared to two-dimensional Rietveld refinement. A larger () and more varied collection of samples than previous studies have presented is used. In particular, samples () with low crystallinity and small crystallite sizes are included. A good linear correlation () between the five most common methods suggests that they agree on large-scale crystallinity differences between samples. For small crystallinity differences, however, correlation was not seen for samples that were from distinct sample sets. The least-squares fitting using an amorphous standard shows the smallest crystallite size dependence and this method combined with perpendicular transmission geometry also yielded values closest to independently obtained cellulose crystallinity values. On the other hand, these values are too low according to the Rietveld refinement. All analysis methods have weaknesses that should be considered when assessing differences in sample crystallinity.Peer reviewe

"Energiayhteisöjen houkuttelevuuden parantaminen markkinoinnin työkaluilla"

Tässä tutkielmassa tutkitaan energia-alaa, energiayhteisöjä sekä käynnissä olevaa energiamurrosta. Energia-ala on alati uudistumassa kohti ekologisempia ja kuluttajaystävällisempiä vaihtoehtoja. Energia-ala on uusine innovaatioineen etenemässä kohti suurta muutosta, mikä tekee aiheesta mielenkiintoisen ja ajankohtaisen. Tutkimuksen ensisijaisena tarkoituksena on tutkia energiayhteisöjä kerrostaloissa ja selvittää, mitä tulee ottaa huomioon niiden rakentamisessa, kehittämisessä ja etenkin markkinoinnissa. Aihetta on syytä tutkia erityisesti sen ajankohtaisuuden vuoksi. Aihetta ei myöskään ole tutkittu kovin paljoa, joten lisää tutkimustietoa ilmiöstä kaivataan. Energia-ala tulee oletettavasti muuttumaan kuluvien vuosien aikana huomattavasti ja on mielenkiintoista seurata, millaisia ratkaisuja alalle tulee syntymään turvataksemme energiansaannin jatkuvuuden. Tutkimuksen tavoitteena on oppia tunnistamaan niitä markkinoinnin työkaluja, jotka kerrostalon energiayhteisöissä vaikuttavat parhaiten arvonluonnin maksimoimiseksi kuluttajille ja syventää ymmärrystä energiayhteisöjen houkuttelevuudesta. Tavoitteena on myös saada tietoa uusista innovaatioista koskien energia-alaa ja energiayhteisöjä. Päällimmäiseksi strategiaksi päätettiin hyödyntää Account Based Marketing -markkinointistrategiaa, joka valikoitui erityisesti strategian kohdennettavuuden ansiosta. Tutkielman tavoitteiden ja tarkoituksen saavuttamiseksi aihetta lähestytään ensin teoreettisesta näkökulmasta, jonka jälkeen tehdään määrällinen eli kvantitatiivinen tutkimus. Tutkimuksessa käytettiin aineistona kyselylomaketta. Tutkimuksessa aineistoa on kerätty osin tavallisten kuluttajien sekä energiayhteisön jäsenten ja niistä tietävien keskuudesta. Menetelmän käyttö tiedonkeruussa voi lisätä tutkimuksen luotettavuutta. Aineiston keräämisessä käytetään osin harkinnanvaraista otantaa. Tutkimusongelmana on ymmärtää, miten energiayhteisöjen houkuttelevuutta saadaan lisättyä kuluttajille. Tutkielmassa käydään läpi energia-alan markkinointiin liittyviä ongelmia sekä niiden ratkaisumetodeja. Johtopäätöksinä tutkimuksen tuloksista pystytään toteamaan, että kannustava ja avoin organisaatiokulttuuri on valtava osa houkuttelevan energiayhteisön rakentamista. Vuorovaikuttaminen kuluttajien ja energiayhtiöiden välisessä viestinnässä lisää energiayhteisöjen houkuttelevuutta. Tuloksista voidaan myös päätellä, että energia-ala on kehittynyt huimasti viime vuosina, mutta kehitettävää on vielä paljon ja ala on jatkuvasti muutoksen alla

Mobile Crowdsourcing of News Content – Participation Preferences and Implications for Design

Citizens participate increasingly in hyperlocal news content creation. In order to make content creation more meaningful to reader reporters and more interesting to a wider audience, it is necessary to examine the factors that influence participation and carrying out mobile assignments. This thesis has been carried out at Tampere University of Technology, Unit of Human-Centered Technology (IHTE) in 2012. The research was carried out as part of the Next Media programme by TIVIT and funded by TEKES. The trial was conducted in co-operation with Sanoma Kaupunkilehdet. The goal of the research was to study participation preferences and motivations of readers participating in news content co-creation process. The study included a five-week mobile crowdsourcing trial with photo assignments using Scoopshot application. The participants in the study were 104 readers of omakaupunki.fi hyperlocal news portal. Information on the factors affecting participation was collected via a web survey open for all participants and interviews of five participants. The results of the study indicate that the participants’ willingness to put effort to carrying out assignments is high and the trial was found a positive experience. Still the degree of activity was low. Many young people were participating and more suitable topics for them were wished for. The activity seems to be pleasant pastime. It is considered as a challenge or a game. Photo assignment was found the most pleasant assignment type. Also video assignments and information acquisition were of interest. Based on the results of this study and the related literature, implications for designing mobile tasks for news content co-creation were formed. They can be adapted to other types of crowdsourcing, too

Sodankäynti, johtaminen, viestiyhteydet ja yhtymän viestijärjestelmä, YVI-jääkäriprikaatissa

Johdannon mukaan artikkelissa "tarkastellaan sodankäyntiä, viestiyhteyksien merkitystä, viestijärjestelmille asetettavia vaatimuksia sekä niiden valossa jääkäriprikaatin pääviestijärjestelmää, yhtymän viestijärjestelmää, yvi:ä. Ensimmäisessä luvussa tarkastellaan kokonaisuutta, johon viestiyhteydet liittyvät Toisessa luvussa tarkastellaan viestiyhteyksien merkitystä ja niille asetettavia vaatimuksia. Kolmannessa luvussa tarkastellaan viestiyhteyksiä vihollisen toiminnan kohteena. Neljännessä luvussa esitellään yhtymän viestijärjestelmä ja sen ominaisuudet ja niistä seuraavat vaikutukset mm. johtamiseen."Yhteenvedossa todetaan muun muassa, että "Nykyaikaisen sodankäynnin vaatima nopeus ja varmuus tiedonkäsittelyssä ja - välityksessä ei ole mahdollista ilman hyvin toimivia viestiyhteyksiä Miltei kaikki sodankäynnin osajärjestelmät, ase-, valvonta-, tiedustelu- ja johtamisjärjestelmät ovat erittäin riippuvaisia viestiyhteyksistä. Yhtymän viestijärjestelmäautomaattisena, alueellisena kaikkia aselajeja palvelevana integroituna viestijärjestelmänä on oikeansuuntainen." Kirjoittaja kritisoi kuitenkin keskusten pientä lukumäärä ja linkkien roolia ainoana siirtotienä sekä järjestelmän taistelunkestävyyttäISBN: 951-96314-1-

Ubiquitin-specific protease 14 in Huntington's disease

Huntington's disease (HD) is a progressive neurodegenerative disorder that causes involuntary muscle movements, deteriorates muscle coordination and cognitive decline. Typical onset age of the disease is in mid age, although a juvenile form of HD is also known. The disease is inherited in an autosomal dominant manner via a mutation in the huntingtin gene (HTT). The characteristic mutation in HTT is an expansion of the glutamine stretch at the 5 end of the gene. Excessive amounts of glutamine residues alters the conformation and chemical features of the huntingtin protein (HTT) leading to accumulation of cellular aggregates. Although to date there are several known alterations in the cell that contribute to the disease, the pathogenesis of HD is not fully understood. Ubiquitin proteasome system (UPS) dismantles proteolytically unneeded or damaged proteins, which are targeted to proteolysis when ubiquitin tags are added to them. Deubiquitinating enzymes (DUB) recycle ubiquitin molecules by releasing them from proteasome substrates. Recycling of ubiquitin is critical to a cell as it maintains the free pool of the targeting molecule. Ubiquitin-specific protease 14 (USP14) is one of the DUB family enzymes and its distinctive function is to remove ubiquitin molecules from the tip of the ubiquitin chain and thus antagonize protein degradation. Although the specific function of the protein is unclear, it seems that USP14 operates as a fine regulator of protein turnover rate and in ER stress both in catalytic and non catalytic manner. The role of USP14 is especially emphasized in the nervous system, as it regulates synaptic transmission and neuronal development. Although it is suggested that dysfunction of UPS is involved in the pathogenesis of HD, the role of USP14 in the disease remains to be unknown. IU1 is a novel inhibitor of the catalytic domain of USP14. Studies with IU1 indicate that inhibition of USP14 enhances the clearance of aggregate prone proteins. The approach of this thesis was aimed to elucidate the routes of HD pathogenesis from diverse approaches. The general aim of the thesis was to investigate the role of USP14 in the wild-type PC6.3 cell model, and in the pathogenesis of HD by expressing HTT proteins with different lengths of glutamine stretches in PC6.3 cells. The specific aim of the study was to examine by western blot and microscopy analysis the pathogenic routes of HD that involve ER stress, oxidative stress, autophagy and mutant HTT aggregate dynamics. The function of USP14 was studied with overexpression of USP14, or by inhibiting its catalytic activity by IU1. The findings of this thesis show that overexpression of USP14 enhances the clearance of mutant HTT aggregates, and this effect is obtained in catalytic activity dependent manner. I show that upregulated USP14 is connected to improved clearance of mutant HTT and inhibition of autophagy, suggesting that the degradation is mediated via UPS. The catalytic activity of USP14 might also be important in ER stress regulation, as the results indicate that IU1 activates phosphorylation of both JNK and eIF2α. I was also able to establish a connection between USP14 and GADD34, as I show that GADD34 upregulates USP14. Finally, I show that catalytic inhibition of USP14 decreases the expression of antioxidant SOD2. The data in this thesis is lacking statistical significance, and it can be considered solely as a guideline. However, together these results indicate that the deubiquitinating activity of USP14 increases survival in PC6.3 cells in both a healthy and a HD model.Huntingtonin tauti (HD) on progressiivinen hermostorappeumatauti, joka aiheuttaa pakkoliikkeitä, lihaskoordinaation rappeutumista sekä kognition heikkenemistä. Vaikka tyypillisesti oireet alkavat keski iässä, Huntingtonin taudista tunnetaan myös nuoruudessa puhkeava muoto. Tautia aiheuttava mutaatio huntingtiini geenissä (HTT) periytyy vallitsevasti kromosomissa 4. HTT-geenin 5 päässä oleva mutaatio aiheuttaa CAG toistojakson monistuman. Mutaatio muuttaa huntingtiini proteiinin (HTT) laskostumista sekä kemiallisia ominaisuuksia, mikä johtaa solun sisäisten HTT-aggregaattien kerääntymiseen. Vaikka tiedetään, että Huntingtonin tautiin liittyvät useat solun sisäiset muutokset, sen syntymekanismia ei tarkalleen tunneta. Ubikitiini proteasomi systeemi (UPS) hajottaa solussa proteolyyttisesti tarpeettomia tai vaurioituneita proteiineja, jotka on kohdennettu systeemiin ubikitiinimolekyyleillä. Ubikitiinia poistavat entsyymit (DUB) irrottavat ubikitiinia proteiinisubstraateista ja vapauttavat sen solulimaan. Ubikitiinin kierrätys on tärkeä prosessi solun aineenvaihdunnassa, sillä se ylläpitää vapaan ubikiitinin määrää. Ubikitiinille spesifinen proteaasi 14 (USP14) kuuluu DUB proteiiniperheeseen ja poistaa ketjuuntunutta ubikitiinia sen distaalisesta päästä yksi kerrallaan hidastaen proteolyysiä. Vaikka tiedetään, että USP14 toimii proteiinien hajotuksen hienosäätelijänä sekä katalyyttisesti että ei katalyyttisesti, sen tarkkaa mekanismia ei vielä tunneta. On myös osoitettu, että USP14 estää ER-stressiä katalyyttisen ja ei katalyyttisen mekanismin avulla. Tiedetään, että USP14-proteiinilla on tärkeä rooli hermostossa, sillä se säätelee synaptista välitystä ja hermoston kehittymistä. USP14-proteiinin roolia ei ole tutkittu Huntingtonin taudissa, vaikka oletetaan, että UPS:n toimintahäiriöt liittyvät taudin patogeneesiin. IU1 on uusi USP14 proteiinin katalyyttisen alayksikön estäjä. Tutkimukset ovat osoittaneet, että USP14 proteiinin katalyyttinen estäminen IU1-molekyylillä tehostaa proteiiniaggregaattien hajottamista solussa. Tämän Pro gradu tutkielman ja siihen liittyvien kokeiden tavoitteena oli tutkia Huntingtonin taudin patogeneesiä useista eri lähtökohdista. Yleinen tavoite oli tutkia tautia USP14 proteiinin viitekehyksestä sekä villityypin PC6.3 soluilla että HD mallin soluilla, joissa ilmennettiin eripituisia CAG toistojaksoja huntingtiini plasmidien avulla. Pro gradu -tutkielmassa keskityttiin erityisesti tutkimaan Huntingtonin taudin patogeneettisistä reiteistä ER stressiä, oksidatiivista stressiä, autofagiaa ja mutantti HTT proteiinin aggregaattidynamiikkaa. Menetelminä käytettiin western blot menetelmää ja mikroskooppianalyysiä. USP14-proteiinin toimintaa tutkittiin yli ilmentämisellä tai estämällä sen katalyyttinen aktiivisuus IU1-molekyylillä. Tutkielmassa olevat löydöt osoittavat, että USP14-proteiinin yli ilmentäminen tehostaa mutantti HTT proteiinin hävittämistä solusta mekanismilla, joka on riippuvainen katalyyttisestä aktiivisuudesta. Korkeampi USP14 proteiinin määrä on yhteydessä sekä tehostuneeseen mutantti-HTT proteiinin hajoitukseen että autofagian estämiseen. Tämä viittaa siihen, että mutantti-HTT-proteiinin vähentyminen on kytkeytynyt UPS:iin. Tutkielmassani näytän myös, että USP14-proteiinin katalyyttinen aktiivisuus voi olla tärkeä ER-stressin säätelyssä, sillä IU1 aktivoi ER-stressiproteiinien JNK ja eIF2α fosforylaatiota. Tulokseni osoittavat lisäksi, että GADD34 yli ilmentäminen PC6.3-soluissa lisää USP14-proteiinin määrä. On mahdollista, että USP14 vaikuttaa myös antioksidanttitasolla solussa, sillä tulosteni perusteella USP14-proteiinin katalyyttinen estäminen vähentää SOD2 proteiinin ilmentymistä. Tutkielmassa esitetyistä tuloksista puuttuu tilastollista varmuutta ja niitä voidaan pitää lähinnä suuntaa antavina. Yhdessä nämä tulokset kuitenkin osoittavat, että USP14-proteiinin ubikitiinia poistava aktiivisuus lisää solun selviytymismahdollisuuksia sekä terveessä solussa että HD solumallissa