Reverse Engineering of an Aspirin-Responsive Transcriptional Regulator in Escherichia coli

Bacterial transcription factors (TFs) are key devices for the engineering of complex circuits in many biotechnological applications, yet there are few well-characterized inducer-responsive TFs that could be used in the context of an animal or human host. We have deciphered the inducer recognition mechanism of two AraC/XylS regulators from Pseudomonas putida (BenR and XylS) for creating a novel expression system responsive to acetyl salicylate (i.e., aspirin). Using protein homology modeling and molecular docking with the cognate inducer benzoate and a suite of chemical analogues, we identified the conserved binding pocket of BenR and XylS. By means of site-directed mutagenesis, we identified a single amino acid position required for efficient inducer recognition and transcriptional activation. Whereas this modification in BenR abolishes protein activity, in XylS, it increases the response to several inducers, including acetyl salicylic acid, to levels close to those achieved by the canonical inducer. Moreover, by constructing chimeric proteins with swapped N-terminal domains, we created novel regulators with mixed promoter and inducer recognition profiles. As a result, a collection of engineered TFs was generated with an enhanced response to benzoate, 3-methylbenzoate, 2-methylbenzoate, 4-methylbenzoate, salicylic acid, aspirin, and acetylsalicylic acid molecules for eliciting gene expression in E. coli.Fil: Monteiro, Lummy Maria Oliveira. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Arruda, Leticia Magalhães. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Sanches Medeiros, Ananda. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Martins Santana, Leonardo. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Alves, Luana de Fátima. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Defelipe, Lucas Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; ArgentinaFil: Turjanski, Adrian Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; ArgentinaFil: Guazzaroni, Mara Eugenia. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: de Lorenzo, Victor. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centro Nacional de Biotecnología; EspañaFil: Silva Rocha, Rafael. Universidade de Sao Paulo; Brasi

Efeitos da realidade virtual no desempenho motor do membro superior em adultos após acidente vascular encefálico: revisão integrativa da literatura / Effects of virtual reality on upper limb motor performance in adults after stroke: integrative literature review

Introdução: O Acidente Vascular Encefálico (AVE) é considerado uma das principais causas de comprometimento neurológico no âmbito global. A recuperação da função motora após o AVE é considerada desafiadora, devido à gravidade do comprometimento e a redução ou ausência da capacidade de movimento voluntário do paciente. Assim, de acordo com os avanços tecnológicos, vêm surgindo novos recursos sendo considerados aliados à reabilitação de pacientes com AVE, como a Realidade Virtual (RV). Objetivo: O presente estudo visa verificar na literatura, os efeitos da inserção da realidade virtual no desempenho motor do MS de adultos após AVE. Métodos: Trata-se de um estudo de caráter qualitativo de revisão integrativa da literatura. Com o propósito de desenvolver a questão norteadora desta revisão, aplicaram-se os domínios da estratégia PICo, resultando na questão: “Quais são os efeitos da realidade virtual na função motora em adultos após AVE?” Realizou-se um levantamento bibliográfico em fevereiro de 2022 nas bases de dados: Embase via Cochrane Library, IBECS, LILACS via BVS e MEDLINE via PubMed. As estratégias de busca foram formuladas a partir dos descritores mencionados em português e inglês, interligadas pelos operadores booleanos “AND” e “OR”. Resultados e Discussão: Conforme a utilização das estratégias de busca indexadas nas bases de dados, foram inicialmente identificados 142 estudos científicos. Após a aplicação dos critérios de elegibilidade e exclusão, foram excluídos 107 estudos, restando 35 artigos selecionados com base no título, destes, 20 foram excluídos após leitura criteriosa dos resumos, e 15 estudos foram lidos na íntegra. Destes, somente oito atenderam ao objetivo proposto para compor a revisão. A RV é considerada um recurso lúdico e dinâmico, de baixo custo e seguro que promove mecanismos psicológicos e efeitos fisiológicos que proporcionam avanços na recuperação motora dos pacientes após o AVE. Conclusão: A partir da análise criteriosa das evidências científicas selecionadas neste estudo, a maioria dos achados apresentaram resultados satisfatórios quanto ao uso da realidade virtual no desempenho motor do membro superior. Entretanto, são necessárias novas pesquisas na área

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear un derstanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5–7 vast areas of the tropics remain understudied.8–11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world’s most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepre sented in biodiversity databases.13–15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may elim inate pieces of the Amazon’s biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological com munities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple or ganism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region’s vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most ne glected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lostinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear understanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5,6,7 vast areas of the tropics remain understudied.8,9,10,11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world's most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepresented in biodiversity databases.13,14,15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may eliminate pieces of the Amazon's biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological communities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple organism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region's vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most neglected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lost

Reverse Engineering of an Aspirin-Responsive Transcriptional Regulator in Escherichia coli

Bacterial transcription factors (TFs) are key devices for the engineering of complex circuits in many biotechnological applications, yet there are few well-characterized inducer-responsive TFs that could be used in the context of an animal or human host. We have deciphered the inducer recognition mechanism of two AraC/XylS regulators from Pseudomonas putida (BenR and XylS) for creating a novel expression system responsive to acetyl salicylate (i.e., aspirin). Using protein homology modeling and molecular docking with the cognate inducer benzoate and a suite of chemical analogues, we identified the conserved binding pocket of BenR and XylS. By means of site-directed mutagenesis, we identified a single amino acid position required for efficient inducer recognition and transcriptional activation. Whereas this modification in BenR abolishes protein activity, in XylS, it increases the response to several inducers, including acetyl salicylic acid, to levels close to those achieved by the canonical inducer. Moreover, by constructing chimeric proteins with swapped N-terminal domains, we created novel regulators with mixed promoter and inducer recognition profiles. As a result, a collection of engineered TFs was generated with an enhanced response to benzoate, 3-methylbenzoate, 2-methylbenzoate, 4-methylbenzoate, salicylic acid, aspirin, and acetylsalicylic acid molecules for eliciting gene expression in E. coli.R.S.-R. and M.-E.G. were supported by Young Research Awards, grant nos. 2012/22921-8 and 2015/04309-1, São Paulo Research Foundation (FAPESP). L.M.O.M., A.S.-M., L.M.-S., and L.F.A. were supported by FAPESP Ph.D. Fellowships (grant nos. 2016/19179-9, 2016/06323-4, 2017/17924-1, and 2018/04810-0)

FIBROMA EM EUPSITTULA CACTORUM NO SERTÃO PARAIBANO

Relata-se um caso de fibroma em Eupsittula cactorum proveniente do município de Sousa. Foi atendido no HVASA-IFPB, um psitacídeo, macho, com sete anos de idade,que apresentava um nódulo cutâneo na asa direita, aderido ao osso. Após a remoção cirúrgica por nodulectomia, observou-se um nódulo com área avermelhada e ulcerada, e ao corte a superfície com tecido amarelado e friável. Microscopicamente, observaram-se células fusiformes distribuídas em feixes aleatórios e em redemoinhos com citoplasma moderado e eosinofílico, com núcleos alongados, cromatina frouxa à condensada e nucléolos evidentes, além de áreas multifocais de hemorragia. Com base nos achados clínicos, macroscópicos e microscópicos realizou-se o diagnóstico de fibroma.Apesar de ser uma neoplasia comum em psitacídeos, não há trabalhos caracterizando-o no sertão paraibano

ANÁLISE DE IMUNIZAÇÕES E SEU IMPACTO NAS INTERNAÇÕES POR FEBRE AMARELA NO SUS NO PERÍODO DE 2016 A 2022 NO BRASIL

Introdução: A Febre Amarela (FA) é uma doença infecciosa febril aguda causada por um arbovírus. Em geral, o quadro clínico é brando, porém, em evoluções desfavoráveis, a FA pode cursar com manifestações hemorrágicas, insuficiência renal e hepática. Nesses casos, o manejo ocorre sob internação hospitalar, muitas vezes em Unidade de Terapia Intensiva. A vacinação é o principal meio de prevenção e controle da doença e apresenta eficácia acima de 95%. O objetivo do presente estudo foi analisar o impacto da imunização contra FA no número de internações pela doença no SUS entre 2016 e 2022. Métodos: Estudo transversal, descritivo e com abordagem quantitativa, realizado com coleta de dados no Sistema de Morbidade Hospitalar do SUS e do Sistema de Informação do Programa Nacional de Imunizações vinculados ao DATASUS, segundo as variáveis de sexo, idade, ano e região relacionadas ao número de internação por FA entre janeiro de 2016 e dezembro de 2022 no Brasil. Foram coletados também dados segundo as variáveis ano, região e cobertura vacinal para a FA e aplicada estatística descritiva por meio do software Microsoft Excel. Resultados: No período de 2016 a 2022, 2.002 pacientes foram internados e 312 faleceram em decorrência da FA. No país, o número de internações aumentou 26 vezes entre 2016 e 2017 e 33,5% entre 2017 e 2018. Em seguida, reduziu 91,3% de 2018 para 2019 e 65,5% de 2019 para 2022. O pico de internações nos anos de 2017 e 2018 se deve a casos na região Sudeste, que acumulou 1.691 internamentos, correspondendo a 88,4% de todas as internações no país no período. O sexo masculino representou 77,9% das internações e a faixa etária de 20 a 59 anos, 70,5%. A cobertura vacinal média no período deste estudo foi de 55,7%. A variação dessa cobertura contou com aumento de 2,7% entre 2016 e 2017, 12,1% entre 2017 e 2018 e 2,9% em 2018 e 2019, mas reduziu 1,7% entre 2019 e 2022. A região Sudeste apresentou a maior variação da cobertura vacinal: de 39,4% em 2017 para 66,3% em 2018. Conclusão: O aumento das internações entre 2016 e 2018 tem relação com o surto de FA ocorrido na região Sudeste nesse período, provavelmente pela associação entre baixa cobertura vacinal e fatores ambientais. Percebe-se uma predominância do sexo masculino nos casos. Houve aumento da cobertura vacinal, principalmente entre 2017 e 2018, com destaque para a região Sudeste, o que possivelmente contribuiu para significativa redução do número de internações pela doença em 2018 e 2019